ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
SMARCB1 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス SMARCB1 、BAF47、INI1、MRD15、PPP1R144、RDT、RTPS1、SNF5、SNF5L1、SWNTS1、Sfh1p、Snr1、hSNFS、CSS3、SWI/SNF関連、マトリックス関連、クロマチンのアクチン依存性調節因子、サブファミリーb、メンバー1、INI-1 外部ID オミム ：601607; MGI : 1328366; ホモロジーン : 2310; ジーンカード ：SMARCB1; OMA :SMARCB1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体10（マウス） [2] バンド 10|10 C1 始める 75,732,603 bp [2] 終わり 75,757,451 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 神経節隆起 心室帯 小脳の右半球 子宮内膜間質細胞 鼻粘膜の嗅覚領域 ランゲルハンス島 左精巣 左卵巣 右精巣 右卵巣
トップの表現 吻側回遊流 心室帯 神経節隆起 外頸動脈 内頸動脈 胚葉上層 パネートセル 回腸上皮 胚 内側神経節隆起
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 DNA結合 RNAポリメラーゼIコアプロモーター配列特異的DNA結合 転写活性化因子活性 p53結合 Tatタンパク質結合 タンパク質結合 ヌクレオソームDNA結合 細胞成分
核質 核染色体 核小体 核 原線維中心 細胞内膜小器官 SWI/SNF 複合体 npBAF複合体 nBAF複合体 タンパク質含有複合体 ブラフマーコンプレックス 生物学的プロセス
グルコースを介したシグナル伝達経路の正の調節 クロマチンリモデリング 転写の調節、DNAテンプレート DNA統合 ヒストンH3-K9アセチル化の正の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 RNAポリメラーゼIによる核小体の大きなrRNAの転写の正の制御 DNA結合転写因子活性の正の調節 転写、DNAテンプレート 神経系の発達 ヌクレオソーム分解 ヒストンH4のアセチル化の正の制御 二本鎖DNA中間体を介した一本鎖ウイルスRNAの複製 細胞周期 ヒストンH3-K9トリメチル化の負の制御 ヒストンH4-K16のアセチル化の制御 ウイルスプロセス ヒストンH3-K9ジメチル化の負の制御 DNA修復 ウイルス転写の宿主による正の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 細胞集団増殖の負の調節 細胞分化 RNAポリメラーゼI開始前複合体の組み立て クロマチン組織 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ENSG00000099956 ENSG00000275837
ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001007468 NM_003073 NM_001317946 NM_001362877
RefSeq (タンパク質) NP_001007469 NP_001304875 NP_003064 NP_001349806
場所 (UCSC) 22章: 23.79 – 23.84 Mb 10 章: 75.73 – 75.76 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
SWI/SNF 関連マトリックス関連アクチン依存性クロマチン調節因子サブファミリーBメンバー1は、ヒトでは SMARCB1 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
関数 この遺伝子によってコードされるタンパク質は、抑制的なクロマチン 構造を緩和する複合体の一部であり 、転写機構がより効率的に標的にアクセスできるようにします。コードされる 核タンパク質は、 HIV-1インテグラーゼ に結合してDNA結合活性を高める可能性もあります。この遺伝子は 腫瘍抑制因子 であることが判明しており 、その 変異は悪性 ラブドイド腫瘍 に関連しています 。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが発見されています。 [8]
インタラクション SMARCB1 は以下と相互作用する ことが示されています :
参考文献
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さらに読む
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外部リンク 
