ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| SH3KBP1 |
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| 利用可能な構造 |
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| 電子データ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2BZ8、2K6D、2K9G、2O2O、2YDL、5ABS、2N64 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SH3KBP1、CD2BP3、CIN85、GIG10、HSB-1、HSB1、MIG18、SH3ドメイン含有キナーゼ結合タンパク質1、IMD61、AGMX2 |
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| 外部ID | OMIM : 300374; MGI : 1889583; HomoloGene : 10971; GeneCards : SH3KBP1; OMA :SH3KBP1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | X染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | X|X F4 | 始める | 158,410,268 bp [2] |
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| 終わり | 158,761,065 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 二次卵母細胞
- 左心室の心筋
- 回腸粘膜
- 視床の外側核群
- 腕の皮膚
- 右心房の心筋組織
- 迷走神経下神経節
- 視床下核
- 血
- 白血球
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| | トップの表現 | - 胸腺
- 受精卵
- 心室の心筋
- 右心室
- 顆粒球
- 心筋
- 房室弁
- 二次卵母細胞
- 骨髄間質
- 外眼筋
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 細胞質
- 膜
- 細胞間結合
- 焦点接着
- 細胞膜
- エンドサイトーシス小胞
- シナプス
- 細胞接合
- ニューロン投影
- 細胞骨格
- 細胞質小胞膜
- 細胞質小胞
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- 上皮成長因子受容体シグナル伝達経路の負の調節
- エンドサイトーシス
- 細胞間シグナル伝達
- 細胞骨格の構成
- 細胞形状の調節
- 細胞移動
- アポトーシス過程
- 膜組織
- 軸索誘導
- アクチンフィラメント組織
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001024666 NM_001184960 NM_031892 NM_001353890 NM_001353891
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NM_001353892 NM_001353893 NM_001353894 NM_001353895 NM_001353897 |
| NM_001135727 NM_001135728 NM_001290661 NM_001290664 NM_021389
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NM_001374701 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001019837 NP_001171889 NP_114098 NP_001340819 NP_001340820
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NP_001340821 NP_001340822 NP_001340823 NP_001340824 NP_001340826 |
| NP_001129199 NP_001129200 NP_001277590 NP_001277593 NP_067364
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NP_001361630 |
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| 場所 (UCSC) | クロノスX: 19.53 – 19.89 Mb | 染色体X: 158.41 – 158.76 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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SH3ドメイン含有キナーゼ結合タンパク質1(同義語:CIN85 [5] 、げっ歯類ではRuk [6] )は、ヒトではSH3KBP1遺伝子によってコードされるアダプタータンパク質である。[7] [8]
関数
CBL (MIM 165360) は、SH3 ドメイン含有タンパク質と恒常的に相互作用し、チロシンリン酸化により SH2 ドメイン含有タンパク質と相互作用する。SH3KBP1 遺伝子は、腫瘍壊死因子 (MIM 191160) を介したアポトーシス細胞死を促進する 85 kD の CBL 相互作用タンパク質をコードする (Narita et al., 2001)。[OMIM 提供] [9]
インタラクション
SH3KBP1はB細胞リンカー[ 10 ]、Grb2 [11]、[12]、SH3GLB2 [13]、[14 ]、 SH3GL3 [13]、 SH3GL2 [ 14]、BCAR1 [10]、上皮成長因子受容体[14]、 [15]、 CBLB [15] 、 Cbl遺伝子[10]、[12 ]、 [13] 、 [14]、[15]、SOS1、[ 10]、CRK [10]、PAK2 [16]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000147010 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000040990 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
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- ^ Adams MD、Kerlavage AR、Fleischmann RD、Fuldner RA、Bult CJ、Lee NH、Kirkness EF、Weinstock KG、Gocayne JD、White O (1995 年 9 月)。「8,300 万ヌクレオチドの cDNA 配列に基づくヒト遺伝子の多様性と発現パターンの初期評価」( PDF )。Nature。377 ( 6547 Suppl): 3–174。PMID 7566098 。
- ^ 「Entrez Gene: SH3KBP1 SH3ドメインキナーゼ結合タンパク質1」。
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- ^ Gout I、Middleton G、Adu J、Ninkina NN、Drobot LB、Filonenko V、Matsuka G、Davies AM、Waterfield M、Buchman VL (2000 年 8 月)。「新規アダプタータンパク質 Ruk による PI 3-キナーゼの負の制御」。The EMBO Journal。19 ( 15 ) : 4015–25。doi : 10.1093/emboj/19.15.4015。PMC 306608。PMID 10921882。
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さらに読む
- Salvatore P、Hanash CR、Kido Y、Imai Y、Accili D (1998 年 3 月)。「Grb-2 および FYN と関連する、インスリン調節性の新規 SH3 結合タンパク質 SIRM の同定」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 12): 6989–97。doi : 10.1074/jbc.273.12.6989。PMID 9507006。
- Li J、Nishizawa K、An W、Hussey RE、Lialios FE、Salgia R、Sunder-Plassmann R、Reinherz EL (1998 年 12 月)。「cdc15 様アダプタータンパク質 (CD2BP1) は CD2 細胞質ドメインと相互作用し、CD2 誘導接着を制御する」。EMBOジャーナル。17 ( 24 ) : 7320–36。doi :10.1093/ emboj /17.24.7320。PMC 1171078。PMID 9857189。
- Take H、Watanabe S、Takeda K 、 Yu ZX、Iwata N、Kajigaya S (2000 年 2 月)。「c-Cbl と相互作用する新規アダプタータンパク質 CIN85 のクローニングと特性評価」。生化学および生物物理学的研究通信。268 (2): 321–8。doi :10.1006/bbrc.2000.2147。PMID 10679202 。
- Chen B、Borinstein SC、Gillis J、Sykes VW、Bogler O (2000 年 6 月)。「神経膠腫関連タンパク質 SETA は AIP1/Alix および ALG-2 と相互作用し、アストロサイトのアポトーシスを調節する」。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 25): 19275–81。doi : 10.1074/ jbc.M908994199。PMID 10858458。
- Gout I、Middleton G、Adu J、Ninkina NN、Drobot LB、Filonenko V、Matsuka G、Davies AM、Waterfield M、Buchman VL (2000 年 8 月)。「新規アダプタータンパク質 Ruk による PI 3-キナーゼの負の制御」。EMBOジャーナル。19 ( 15 ) : 4015–25。doi :10.1093/emboj/19.15.4015。PMC 306608。PMID 10921882。
- 渡辺 誠、武 浩、武田 憲、Yu ZX、岩田 暢、梶ヶ谷 聡 (2000 年 11 月)。「CIN85 アダプタータンパク質の特性評価と CIN85 複合体に関与する成分の同定」。生化学および生物物理学的研究通信。278 (1): 167–74。doi : 10.1006 /bbrc.2000.3760。PMID 11071869 。
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