ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
サート3 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2DO4、5JJW、5JJX、5CTT、5CTR、5JPZ、5CTQ
識別子 エイリアス SART3 、DSAP1、P100、RP11-13G14、TIP110、p110、p110(nrb)、T細胞が認識する扁平上皮癌抗原3、T細胞が認識する扁平上皮癌抗原3、スプライソソーム関連因子3、U4/U6リサイクリングタンパク質 外部ID オミム ：611684; MGI : 1858230; ホモロジーン : 40977; ジーンカード ：SART3; OMA :SART3 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 5番染色体（マウス） [2] バンド 5|5 女性 始める 113,880,507 bp [2] 終わり 113,910,571 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 内皮細胞 二次卵母細胞 上腕二頭筋の腱 腓骨神経 アキレス腱 乳首 内淡蒼球 小脳半球 小脳虫部 結腸上皮
トップの表現 胎児の尾 受精卵 網膜の神経層 卵母細胞 一次卵母細胞 二次卵母細胞 性器結節 胚葉上層 心室帯 脊髄の腰椎部分
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
U6atac snRNA結合 ヒストン結合 U4 snRNA結合 タンパク質結合 核酸結合 ユビキチン特異的プロテアーゼ結合 U6 snRNA結合 RNA結合 細胞成分
細胞質 カハールボディ 核の粒 U4/U6 x U5 トリスnRNP複合体 核質 U4/U6 snRNP ウ6atac snRNP U4atac/U6atac snRNP 核 ASAPコンプレックス 生物学的プロセス
スプライソソームを介したmRNAスプライシング ヌクレオソームアセンブリ RNA処理 スプライソソームトリ-snRNP複合体の組み立て 細胞数の恒常性 ヒストン脱ユビキチン化の正の制御 造血幹細胞の増殖 mRNA処理 スプライソソーム snRNP アセンブリ 細胞形態形成 RNAスプライシング 遺伝子発現の調節 スプライソソームを介した選択的mRNAスプライシングの制御 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_016926 NM_001356621 NM_001356623
RefSeq (タンパク質) NP_058622 NP_001343550 NP_001343552
場所 (UCSC) 12 章: 108.52 – 108.56 Mb 5 章: 113.88 – 113.91 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
T細胞によって認識される扁平上皮癌抗原3は 、ヒトでは SART3 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
この遺伝子によってコードされるタンパク質 は 、腫瘍拒絶 抗原 であるRNA結合核タンパク質である。この抗原は、癌患者において HLA-A24 拘束性および腫瘍特異的細胞傷害性 Tリンパ球 を誘導することができる腫瘍 エピトープを有しており、特異的 免疫療法 に有用である可能性がある。この遺伝子産物は、 HIV-1 遺伝子発現およびウイルス複製にとって重要な細胞因子であることがわかっている。また、スプ ライソソーム サイクルのリサイクル段階で U6およびU4/U6 snRNPと一時的に会合する。このコードされたタンパク質は、 mRNA スプライシングの調節に関与していると考えられている 。 [7]
インタラクション SART3はRNPS1 [8] および アンドロゲン受容体 [9] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000075856 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000018974 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikawa K, Nomura N (1995年8月). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。IV. ヒト細胞株KG-1からのcDNAクローンの分析によって推定された40個の新しい遺伝子（KIAA0121-KIAA0160）のコード配列」 。DNA 研究 。2 （ 4）：167–74、199–210。doi ： 10.1093/ dnares /2.4.167。PMID 8590280 。 ^原田 功、山田 明、峯 孝 、川越 暢、高須 秀、伊藤 功 (2000 年 2 月)。「腫瘍拒絶抗原をコードするヒト SART3 遺伝子のマウスホモログ」。 日本 癌 学会誌 。91 (2): 239–47。doi : 10.1111/j.1349-7006.2000.tb00937.x。PMC 5926322。PMID 10761712 。 ^ ab 「Entrez Gene: T細胞によって認識されるSART3扁平上皮癌抗原3」。 ^ Harada K, Yamada A, Yang D, Itoh K, Shichijo S (2001年9月). 「SART3腫瘍拒絶抗原のpre-mRNAスプライシング因子RNPS1への結合：複合体形成によるスプライシングの制御の可能性」 International Journal of Cancer . 93 (5): 623–8. doi : 10.1002/ijc.1391 . PMID 11477570. S2CID 24724555. ^ Liu Y、Kim BO、Kao C、Jung C、Dalton JT、He JJ (2004 年 5 月)。「アンドロゲン受容体 (AR) 転写活性化の負の調節因子としての 110 kDa のヒト免疫不全ウイルス 1 型 (HIV-1) Tat 相互作用タンパク質 Tip110」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 21): 21766–73。doi : 10.1074/ jbc.M314321200。PMID 15031286 。
さらに読む
Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング: 真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Yang D、Nakao M、Shichijo S、Sasatomi T、Takasu H、Matsumoto H、Mori K、Hayashi A、Yamana H、Shirouzu K、Itoh K (1999 年 8 月)。「癌患者において HLA-A24 拘束性細胞傷害性 T リンパ球を誘導できる共有腫瘍エピトープを有するタンパク質をコードする遺伝子の同定」。Cancer Research。59 ( 16 ): 4056–63。PMID 10463607 。 田中 誠、津田 暢、河野 健、坂本 正之、西田剛 、橋本 剛、七条 聡、加村 剛、伊藤 健 (2000 年 11 月)。「婦人科癌における腫瘍拒絶抗原の発現」。 日本 癌 学会誌 。91 (11): 1177–84。doi :10.1111/ j.1349-7006.2000.tb00902.x。PMC 5926290。PMID 11092984 。 Harada K, Yamada A, Yang D, Itoh K, Shichijo S (2001 年 9 月)。「SART3 腫瘍拒絶抗原の pre-mRNA スプライシング因子 RNPS1 への結合: 複合体形成によるスプライシングの制御の可能性」。International Journal of Cancer。93 ( 5 ) : 623–8。doi : 10.1002/ijc.1391。PMID 11477570。S2CID 24724555 。 笹富哲、末藤裕、松永和、山名裕、宮城裕、荒木裕、緒方裕、伊藤和、白水和（2002年3月）。 「結腸直腸癌における腫瘍拒絶抗原の発現」。 癌 。 94 (6): 1636–41。 土井 ： 10.1002/cncr.10421 。 PMID 11920522。S2CID 33045822 。 Liu Y、Li J、Kim BO、Pace BS、He JJ (2002 年 6 月)。「HIV-1 Tat タンパク質を介した HIV-1 長末端反復プロモーターのトランス活性化は、110 kDa の新しい核 Tat 相互作用タンパク質 Tip110 によって強化される」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 26): 23854–63。doi : 10.1074/ jbc.M200773200。PMID 11959860 。 Bell M、Schreiner S、Damianov A、Reddy R 、 Bindereif A (2002 年 6 月)。「p110、新規ヒト U6 snRNP タンパク質および U4/U6 snRNP リサイクル因子」。EMBO ジャーナル 。21 (11): 2724–35。doi : 10.1093 / emboj /21.11.2724。PMC 126028。PMID 12032085 。 Nottrott S、Urlaub H、 Lührmann R (2002 年 10 月)。「U4/U6 snRNA と の 階層的かつクラスター化されたタンパク質相互作用: U4/U6 タンパク質の生化学的役割」。EMBO ジャーナル 。21 ( 20): 5527–38。doi :10.1093 / emboj/cdf544。PMC 129076。PMID 12374753 。 Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2002 年 11 月). 「巨大タンパク質間のタンパク質間相互作用: 長い cDNA で構成された機能的に分類されたライブラリを使用した 2 ハイブリッド スクリーニング」. Genome Research . 12 (11): 1773–84. doi :10.1101/gr.406902. PMC 187542. PMID 12421765 . Stanĕk D、Rader SD、Klingauf M、Neugebauer KM (2003 年 2 月)。「U4/U6 小型核 RNP アセンブリ因子 SART3/p110 の Cajal 体への標的化」。The Journal of Cell Biology。160 ( 4): 505–16。doi :10.1083/ jcb.200210087。PMC 2173746。PMID 12578909 。 Damianov A 、Schreiner S、Bindereif A (2004 年 2 月)。「U12 型スプライソソームのリサイクルには、U6atac snRNP の構成要素である p110 が必要」。 分子 細胞 生物学 。24 (4): 1700–8。doi :10.1128/ MCB.24.4.1700-1708.2004。PMC 344176。PMID 14749385 。 Liu Y、Kim BO、Kao C、Jung C、Dalton JT、He JJ (2004 年 5 月)。「アンドロゲン受容体 (AR) 転写活性化の負の調節因子としての 110 kDa のヒト免疫不全ウイルス 1 型 (HIV-1) Tat 相互作用タンパク質、Tip110」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 21): 21766–73。doi : 10.1074/jbc.M314321200。PMID 15031286 。 Brandenberger R、Wei H、Zhang S、Lei S、Murage J、Fisk GJ、Li Y、Xu C、Fang R、Guegler K、Rao MS、Mandalam R、Lebkowski J、Stanton LW (2004 年 6 月)。「トランスクリプトーム特性評価により、ヒト ES 細胞の成長と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明」。Nature Biotechnology。22 ( 6 ) : 707–16。doi :10.1038/nbt971。PMID 15146197。S2CID 27764390 。 Medenbach J、Schreiner S、Liu S、Lührmann R、Bindereif A (2004 年 9 月)。「ヒト U4/U6 snRNP リサイクリング因子 p110: 変異解析により、リサイクリングにおけるテトラトリコペプチド繰り返しドメインの機能が明らかに」。 分子 細胞 生物 学 。24 (17): 7392–401。doi :10.1128/ MCB.24.17.7392-7401.2004。PMC 506986。PMID 15314151 。 Stanĕk D、Neugebauer KM (2004 年 9 月) 。 「蛍光共鳴エネルギー移動によるカハール体における snRNP アセンブリ中間体の検出」。The Journal of Cell Biology。166 ( 7): 1015–25。doi : 10.1083 /jcb.200405160。PMC 2172029。PMID 15452143 。
