ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
RNPS1 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス RNPS1 、E5.1、セリンリッチドメイン1を持つRNA結合タンパク質 外部ID オミム ：606447; MGI : 97960; ホモロジーン : 40648; ジーンカード ：RNPS1; OMA :RNPS1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 17番染色体（マウス） [2] バンド 17|17 A3.3 始める 24,633,539 bp [2] 終わり 24,644,875 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 生殖腺 小脳半球 小脳の右半球 右前頭葉 神経節隆起 小脳の傍小葉 前帯状皮質 心室帯 腓腹筋 ブロードマン領域10
トップの表現 胎児の尾 性器結節 心室帯 胚 受精卵 卵黄嚢 胚 網膜の神経層 桑実胚 リップ
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
mRNA 3'-UTR結合 タンパク質結合 RNA結合 核酸結合 細胞成分
細胞質 細胞質 核の粒 エクソン-エクソン接合複合体 核質 ASAPコンプレックス 核 生物学的プロセス
スプライソソームを介したmRNAスプライシング RNAポリメラーゼII転写の終結 mRNA処理 スプライソソームを介した選択的mRNAスプライシングの制御 核からのmRNAの輸出 転写、DNAテンプレート スプライソソームを介したmRNAスプライシングの負の制御 RNAスプライシング アポトーシス過程の正の調節 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解 mRNA 3'末端処理 核からのRNAの輸出 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001286625 NM_001286626 NM_001286627 NM_006711 NM_080594
NM_001080127 NM_001080128 NM_009070 NM_001357626
RefSeq (タンパク質) NP_001273554 NP_001273555 NP_001273556 NP_006702 NP_542161
NP_001073596 NP_001073597 NP_033096 NP_001344555
場所 (UCSC) 16章: 2.25 – 2.27 Mb 17章: 24.63 – 24.64 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
セリンリッチドメイン1を有するRNA結合タンパク質は、 ヒトでは RNPS1 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
関数 この遺伝子は、スプライシング後の多タンパク質複合体である エクソンジャンクション複合体 の一部であるタンパク質をコードしており、mRNAの核外輸送とmRNA監視の両方に関与している。mRNA監視は、短縮されたオープンリーディングフレームを持つ輸送されたmRNAを検出し、ナンセンス介在mRNA分解（NMD）を開始する。最後のエクソン-エクソンジャンクションの上流で翻訳が終了すると、NMDがトリガーされ、未熟な終止コドンを含むmRNAが分解される。このタンパク質はmRNAに結合し、核外輸送後も結合したままで、核質間輸送タンパク質として機能する。このタンパク質には多くのセリン残基が含まれている。この遺伝子には2つのスプライスバリアントが見つかっており、両方のバリアントは同じタンパク質をコードしている。 [7]
インタラクション RNPS1はSART3 [8] および ピニン [9] [10] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
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さらに読む
Burn TC、Connors TD、Van Raay TJ、Dackowski WR、Millholland JM、Klinger KW、Landes GM (1996 年 6 月)。「ヒト染色体 16p3.3 上の多発性嚢胞腎 1 型 (PKD1) および結節性硬化症 2 型 (TSC2) 疾患遺伝子を囲む 700 kb 領域の転写マップの生成」。 ゲノム 研究 。6 ( 6): 525–37。doi : 10.1101/ gr.6.6.525。PMID 8828041 。 Wilson KF、Fortes P、Singh US、Ohno M、Mattaj IW、Cerione RA (1999 年 2 月)。「核キャップ結合複合体は、成長因子受容体結合シグナル伝達の新たな標的である」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 7): 4166–73。doi : 10.1074/ jbc.274.7.4166。PMID 9933612 。 Mayeda A、Badolato J、Kobayashi R、Zhang MQ 、 Gardiner EM、Krainer AR (1999 年 8 月)。「ヒト RNPS1 の精製と特性: pre-mRNA スプライシングの一般的な活性化因子」。EMBO ジャーナル 。18 ( 16): 4560–70。doi :10.1093 / emboj/ 18.16.4560。PMC 1171530。PMID 10449421 。 Le Hir H、Izaurralde E、Maquat LE、Moore MJ (2000 年 12 月)。「スプライソソームは、mRNA エクソン間ジャンクションの 20 ～ 24 ヌクレオチド上流に複数のタンパク質を沈着させる」。EMBO ジャーナル 。19 ( 24): 6860 ～ 9。doi : 10.1093 / emboj/19.24.6860。PMC 305905。PMID 11118221 。 Harada K, Yamada A, Yang D, Itoh K, Shichijo S (2001 年 9 月)。「SART3 腫瘍拒絶抗原の pre-mRNA スプライシング因子 RNPS1 への結合: 複合体形成によるスプライシングの制御の可能性」。International Journal of Cancer。93 ( 5 ) : 623–8。doi : 10.1002/ijc.1391。PMID 11477570。S2CID 24724555 。 Kim VN、Kataoka N、Dreyfuss G (2001 年 9 月)。「スプライシング依存性エクソン-エクソン接合複合体におけるナンセンス変異介在性崩壊因子 hUpf3 の役割」。Science . 293 ( 5536): 1832–6。Bibcode : 2001Sci ... 293.1832K。doi :10.1126/science.1062829。PMID 11546873。S2CID 12018200 。 Lykke-Andersen J、Shu MD、Steitz JA (2001 年 9 月)。 「タンパク質RNPS1による、エクソン-エクソン接合部の位置のmRNA監視機構への伝達」。 科学 。 293 (5536): 1836 ～ 1839 年。 Bibcode :2001Sci...293.1836L。 土井 ：10.1126/science.1062786。 PMID 11546874。S2CID 389385 。 Lejeune F、Ishigaki Y、Li X、Maquat LE (2002 年 7 月)。「哺乳類細胞ではエクソン ジャンクション複合体は CBP80 結合 mRNA で検出されるが、eIF4E 結合 mRNA では検出されない: mRNP リモデリングのダイナミクス」。EMBO ジャーナル 。21 ( 13 ) : 3536–45。doi :10.1093 / emboj/cdf345。PMC 126094。PMID 12093754 。 McCracken S、Longman D 、Johnstone IL、Cáceres JF、Blencowe BJ (2003 年 11 月)。「エクソン ジャンクション複合体の形成とは独立して機能する 3' 末端処理における SRm160 の進化的に保存された役割」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 45): 44153–60。doi : 10.1074/ jbc.M306856200。PMID 12944400 。 Li C、Lin RI、Lai MC、Ouyang P、Tarn WY (2003 年 10 月)。「核 Pnn/DRS タンパク質はスプライスされた mRNP に結合し、RNPS1 との相互作用を介して mRNA の処理とエクスポートに関与する」。 分子 細胞 生物 学 。23 (20): 7363–76。doi : 10.1128 /MCB.23.20.7363-7376.2003。PMC 230327。PMID 14517304 。 Kataoka N、Dreyfuss G (2004 年 2 月)。 「 in vitro スプライシングのためのシンプルな全細胞ライセートシステムにより、エクソン-エクソン接合複合体の段階的な組み立てが明らかになりました」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 8): 7009–13。doi : 10.1074/ jbc.M307692200。PMID 14625303 。 Sakashita E, Tatsumi S, Werner D, Endo H, Mayeda A (2004 年 2 月)。「ヒト RNPS1 とその関連因子: 生体内での多用途な代替プレ mRNA スプライシング制御因子」。 分子 細胞 生物学 。24 ( 3 ): 1174–87。doi : 10.1128/MCB.24.3.1174-1187.2004。PMC 321435。PMID 14729963 。 Nott A、Le Hir H、 Moore MJ (2004 年 1 月)。「スプライシングは哺乳類細胞における翻訳を促進する : エクソンジャンクション複合体の追加機能」。 遺伝子と発達 。18 (2): 210–22。doi : 10.1101 /gad.1163204。PMC 324426。PMID 14752011 。 Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、Villén J、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP (2004 年 8 月)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。101 (33): 12130–5。Bibcode : 2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073 / pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935 。 Jin J、Smith FD、Stark C、Wells CD、Fawcett JP、Kulkarni S、Metalnikov P、O'Donnell P、Taylor P、Taylor L、Zougman A、Woodgett JR、Langeberg LK、Scott JD、Pawson T (2004 年 8 月)。「細胞骨格調節と細胞組織化に関与する生体内 14-3-3 結合タンパク質のプロテオーム、機能、およびドメインベースの分析」。Current Biology。14 ( 16 ) : 1436–50。Bibcode : 2004CBio ...14.1436J。doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051。PMID 15324660。S2CID 2371325 。
外部リンク 
