ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
RN216 翻訳 識別子 エイリアス RNF216 、CAHH、TRIAD3、U7I1、UBCE7IP1、ZIN、リングフィンガータンパク質216 外部ID オミム ：609948; MGI : 1344349; ホモロジーン : 19442; ジーンカード ：RNF216; OMA :RNF216 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 5番染色体（マウス） [2] バンド 5|5 G2 始める 142,976,648 bp [2] 終わり 143,098,749 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 睾丸 右精巣 左精巣 伏在静脈 精子 子宮内膜間質細胞 卵母細胞 顆粒球 アキレス腱 二次卵母細胞
トップの表現 精子細胞 手 胎児の尾 精母細胞 性器結節 耳小胞 受精卵 顆粒球 二次卵母細胞 桑実胚
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質結合 金属イオン結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 トランスフェラーゼ活性 細胞成分
細胞質 核 核質 細胞質 シャッファー側枝 - CA1シナプス シナプス後エンドサイトーシス領域 グルタミン酸シナプス 生物学的プロセス
タンパク質K48結合ユビキチン化 I型インターフェロン産生の抑制 ウイルスプロセス インターフェロンβ産生の調節 タンパク質のユビキチン化 宿主によるウイルスに対する防御反応の調節 プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス アポトーシスの過程 タンパク質分解プロセス、シナプス伝達の調節 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_019011 NM_207111 NM_207116 NM_001377156
NM_080561 NM_207110 NM_001359851
RefSeq (タンパク質) NP_996994 NP_996999 NP_001364085
NP_542128 NP_996993 NP_001346780
場所 (UCSC) 7 章: 5.62 – 5.78 Mb 5 章: 142.98 – 143.1 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
E3ユビキチンタンパク質リガーゼRNF216 は、ヒトでは RNF216 遺伝子によってコードされる 酵素 である 。 [5]
この遺伝子は、セリン/スレオニンタンパク質キナーゼである受容体相互作用タンパク質 (RIP) と特異的に共局在し相互作用する細胞質タンパク質をコードします。コードされたタンパク質のジンクフィンガードメインは、RIP との相互作用と、TNF および IL1 誘導性 NF-κB 活性化経路の阻害に必要です。コードされたタンパク質は、E2 ユビキチン結合酵素からユビキチンを受け取り、基質に転送する E3 ユビキチンタンパク質リガーゼとしても機能する可能性があります。この遺伝子座には、いくつかの選択的スプライシング転写バリアントが記述されていますが、全長の性質がわかっているのはほんの一部です。 [5]
参照
インタラクション RNF216はTLR9 [6] および RIPK1 [7] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
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さらに読む
Lake JA、Carr J、Feng F、et al. (2003)。「HIV-1感染時のVifの役割：新規宿主細胞因子との相互作用」。J . Clin. Virol . 26 (2): 143–52. doi :10.1016/S1386-6532(02)00113-0. PMID 12600646。 Matoba R, Okubo K, Hori N, et al. (1994). 「3'指向性cDNAライブラリーへの5'コーディング情報の追加は遺伝子発現の解析を改善する」 Gene . 146 (2): 199–207. doi :10.1016/0378-1119(94)90293-3. PMID 8076819. van der Reijden BA、Erpelinck-Verschueren CA、Löwenberg B、Jansen JH (1999)。「TRIAD: 新規のシステインに富むシグネチャを持つ新しいクラスのタンパク質」。Protein Sci . 8 (7): 1557–61. doi :10.1110/ps.8.7.1557. PMC 2144383 . PMID 10422847。 Wang X, Stollar BD (1999). 「ヒトの老化における免疫グロブリン VH 遺伝子発現」. Clin. Immunol . 93 (2): 132–42. doi :10.1006/clim.1999.4781. PMID 10527689. Hartley JL、Temple GF、Brasch MA (2001)。「in vitro 部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 。 Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、他 (2001)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて：ヒトcDNAをコードする500個の新規完全タンパク質の配列決定および分析」。Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 。 Simpson JC、Wellenreuther R、Poustka A、et al. (2001)。「大規模cDNAシーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 。 Chen D、Li X、Zhai Z、Shu HB (2002)。「新規ジンクフィンガータンパク質は受容体相互作用タンパク質 (RIP) と相互作用し、腫瘍壊死因子 (TNF) および IL1 誘導性 NF-κB 活性化を阻害する」。J . Biol. Chem . 277 (18): 15985–91. doi : 10.1074/jbc.M108675200 . PMID 11854271。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Hillier LW 、 Fulton RS、Fulton LA、他 (2003)。「ヒト染色体7のDNA配列」。Nature 424 ( 6945 ) : 157–64。Bibcode : 2003Natur.424..157H。doi : 10.1038/nature01782。PMID 12853948 。 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。 Chuang TH、Ulevitch RJ (2004)。「Triad3A、Toll様受容体を制御するE3ユビキチンタンパク質リガーゼ」。Nat . Immunol . 5 (5): 495–502. doi :10.1038/ni1066. PMID 15107846. S2CID 39773935. Feng F、Davis A、Lake JA、他(2004)。 「薬指タンパク質 ZIN はヒト免疫不全ウイルス 1 型 Vif と相互作用します。」 J. ヴィロル 78 (19): 10574–81。 土井 ：10.1128/JVI.78.19.10574-10581.2004。 PMC 516435 。 PMID 15367624。 Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクスパイプライン」 Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336 . Oh JH、Yang JO、Hahn Y、et al. (2006)。「ヒト胃癌のトランスクリプトーム解析」。Mamm . Genome . 16 (12): 942–54. doi :10.1007/s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278. Mehrle A、Rosenfelder H、 Schupp I 、 他 (2006)。「2006 年の LIFEdb データベース」。Nucleic Acids Res . 34 (データベース号): D415–8。doi : 10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901 。 Fearns C、Pan Q、Mathison JC、Chuang TH (2006)。「Triad3A は Hsp90 結合の破壊後に RIP1 のユビキチン化とプロテアソーム分解を制御する」。J . Biol. Chem . 281 (45): 34592–600. doi : 10.1074/jbc.M604019200 . PMID 16968706。
外部リンク RNF216+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館 医学件名表 (MeSH) 
