翼鰓綱ミトコンドリアコード(翻訳表24)は、 Rhabdopleura compacta(翼鰓綱)のミトコンドリアゲノムが使用する遺伝コードである。翼鰓綱は、半索動物門の2つのグループのうちの1つであり、棘皮動物門および脊索動物門とともに後口動物の3大系統を形成する。AUAは、棘皮動物門および腸状動物門と同様にRhabdopleuraではイソロイシンに翻訳され、脊索動物門ではメチオニンをコードする。AGGのリジンへの割り当ては、後口動物のミトコンドリアの他の場所では見られないが、節足動物のいくつかの分類群で見られる。[1]このコードは他の多くのミトコンドリアコードと同様に、UGA STOPをトリプトファンに、AGGとAGAをアルギニン以外のアミノ酸に再割り当てしています。Rhabdopleura compactaの開始コドンはATGとGTGです。[1]
コード24は翼鰓類のミトコンドリアコード33と非常によく似ている。 [2]
コード
AAs = FFLLSSSSYY**CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSSKVVVVAAAADDEEGGGGStarts = ---M---------------M---------------M---------------M------------Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGBase2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGBase3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
塩基:アデニン(A)、シトシン(C)、グアニン(G)、チミン(T) またはウラシル(U)。
アミノ酸:アラニン(Ala、A)、アルギニン(Arg、R)、アスパラギン(Asn、N)、アスパラギン酸(Asp、D)、システイン(Cys、C)、グルタミン酸(Glu、E)、グルタミン(Gln、Q)、グリシン(Gly、G)、ヒスチジン(His、H)、イソロイシン(Ile、I)、ロイシン(Leu、L)、リジン(Lys、K)、メチオニン(Met、M)、フェニルアラニン(Phe、F)、プロリン(Pro、P)、セリン(Ser、S)、トレオニン(Thr、T)、トリプトファン(Trp、W)、チロシン(Tyr、Y)、バリン(Val、V)
標準コードとの違い
参照
参考文献
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。 [3]
- ^ ab Perseke, Marleen; Hetmank, Joerg; Bernt, Matthias; Stadler, Peter F; Schlegel, Martin; Bernhard, Detlef (2011-05-20). 「Rhabdopleura compacta(Pterobranchia) の謎のミトコンドリアゲノムは、効率的な tRNA システムの選択に関する洞察を明らかにし、Ambulacraria の単系統性を支持する」BMC Evolutionary Biology . 11 (1): 134. doi : 10.1186/1471-2148-11-134 . ISSN 1471-2148. PMC 3121625 . PMID 21599892.
- ^ Li, Yuanning; Kocot, Kevin M.; Tassia, Michael G.; Cannon, Johanna T.; Bernt, Matthias; Halanych, Kenneth M. (2019-01-01). 「ミトゲノミクスにより半索動物の新しい遺伝コードが明らかに」.ゲノム生物学と進化. 11 (1): 29–40. doi :10.1093/gbe/evy254. PMC 6319601. PMID 30476024.
- ^ Elzanowski A、Ostell J、Leipe D、Soussov V.「遺伝コード」。分類ブラウザ。国立生物工学情報センター(NCBI)、米国国立医学図書館。2014年6月28日閲覧。
