酵素のメカニズム この反応は以下の段階を経て進行すると考えられている。
Fe(II)-OO-BH 4 ブリッジの形成。 OO結合のヘテロリティック開裂によりフェリルオキソ水酸化中間体Fe(IV)=Oが生成する Fe(IV)=Oへの攻撃によりフェニルアラニン基質がチロシンに水酸化される。[ 7 ] PAHのメカニズム、パートI 鉄-ペルオキシプテリン架橋の形成と切断。 証拠は、Fe(IV)=O が水酸化中間体であることを強く支持しているが、[ 8 ] ヘテロリティック切断の前にFe(II)-OO-BH4 架橋が形成されるメカニズムの詳細は依然として 議論の的となっている。鉄とプテリン補因子の近接性および触媒作用中に鉄に配位すると想定される水分子の数が異なるモデルに基づいて、2 つの経路が提案されている。1 つのモデルによれば、鉄二酸素錯体が最初に形成され、Fe2+O2 と Fe3+O2− の共鳴混成体として安定化される。 活性 化 された O2が BH4を 攻撃 し、電子不足のプテリン環と電子豊富な二酸素種との間の電荷分離を特徴とする遷移状態を形成する。 [ 9 ] その後、 Fe(II)-OO-BH4架橋 が形成される。一方、この架橋の形成は、BH4 が鉄の第一配位殻に位置し、鉄がどの水分子にも配位していないと仮定してモデル化されている。このモデルは、プテリンラジカルとスーパーオキシドが重要な中間体となる別のメカニズムを予測している。[ 10 ] いったん形成されると、Fe(II)-OO-BH4架橋 は、OO 結合のヘテロリティック開裂によって Fe(IV)=O と 4a-ヒドロキシテトラヒドロビオプテリンに切断される。したがって、分子状酸素は、プテリン環とフェニルアラニンを水酸化するために使用される両方の酸素原子の供給源となる。
PAHのメカニズム、パートII フェリルオキソ中間体によるフェニルアラニンの水酸化。 このメカニズムには、ペルオキシプテリンではなく Fe(IV)=O 水酸化中間体が関与するため、BH 4 補因子の酸化とフェニルアラニンの水酸化は分離され、BH 4の非生産的な消費と H 2 O 2 の生成につながる。[ 7 ] ただし、生産的な場合、Fe(IV)=O 中間体は求電子芳香族置換反応でフェニルアラニンに付加され、鉄をフェリル状態から二価鉄状態に還元する。[ 7 ] 当初はアレンオキシドまたはラジカル中間体が提案されていたが、関連するトリプトファンおよびチロシン水酸化酵素の分析により、この反応は代わりに、Fe(IV)=O がヒドロキソ基ではなく水配位子に配位する必要があるカチオン中間体を経由して進行することが示唆されている。[ 7 ] [ 11 ] このカチオン中間体はその後、1,2-ヒドリドNIH転位を起こし、ジエノン中間体を生成し、それが互変異性化してチロシン生成物を形成する。[ 12 ] プテリン補因子は、PAHのカルビノールアミン生成物の水和によってキノノイドジヒドロビオプテリン(qBH 2 )に再生され、その後、BH 4 に還元される。[ 13 ]
構造 PAHモノマー(51.9 kDa)は、3つの異なるドメインから構成されています。Phe結合ACTサブドメインを含む調節N末端ドメイン(残基1~117)、触媒ドメイン(残基118~427)、および同一モノマーのオリゴマー化に関与するC末端ドメイン(残基428~453)です。特にプテリンと鉄が配位した触媒ドメインについて、活性部位を調べるために広範な結晶学的解析が行われました。N末端調節ドメインの構造も決定され、相同チロシンヒドロキシラーゼC末端四量体化ドメインの解明された構造とともに、四量体PAHの構造モデルが提案されました。[ 13 ] X線結晶構造解析を使用して、ラットPAH全長の構造が実験的に決定され、酵素の自己阻害型または休止状態が示されました。[ 16 ] 静止状態型 (RS-PAH) は、活性化型 (A-PAH) とは構造的に異なります。[ 17 ] A-PAH の全長構造は現在不明ですが、A-PAH に特徴的な Phe で安定化された ACT-ACT インターフェースが決定されており、SAXS 解析に基づく A-PAH の構造モデルが提案されています。[ 18 ] [ 19 ]
PAHの活性部位がBH4、鉄(II)、およびフェニルアラニン類似体に結合したモデル。(PDB 1KW0より)フェニルアラニン類似体 、BH4 、鉄 、Fe(II)配位HisおよびGlu残基
触媒ドメイン 触媒ドメインの結晶構造解析によると、活性部位は主に疎水性残基で裏打ちされた開放的で広々としたポケットで構成されているが、3つのグルタミン酸残基、2つのヒスチジン、およびチロシンも存在し、鉄と結合している。[ 13 ] 活性部位内の二価鉄原子の配位状態とBH4への近接性については矛盾する証拠が存在する。結晶学的解析によると、Fe(II)は八面体形状で水、His285、His290、およびGlu330(2-ヒスチジン-1-カルボキシレート面三重配置)によって配位されている。[ 20 ] 結晶構造にPheアナログを含めると、鉄は単一の水分子とGlu330への二座配位を伴う6配位状態から5配位状態に変化し、酸素が結合する部位が開く。 BH4 は同時に鉄原子の方へ移動するが、プテリン補因子は第 2 配位圏にとどまる。[ 21 ] 一方、NMR と分子モデリング解析に基づく競合モデルでは、触媒サイクル中にすべての配位水分子が活性部位から押し出され、BH4 が鉄に直接配位すると示唆されている。[ 22 ] 上述のように、この矛盾を解消することは、PAH 触媒作用の正確なメカニズムを決定する上で重要となる。
N末端調節ドメイン N末端ドメイン(残基1~117)の調節的性質は、その構造的柔軟性によってもたらされる。[ 23 ] 水素/重水素交換分析によると、Pheのアロステリック結合はPAHのコンフォメーションを全体的に変化させ、調節ドメインと触媒ドメイン間の界面が溶媒にますます露出するにつれて活性部位の閉塞が少なくなる。[ 23 ] [ 24 ] [ 25 ] この観察は、全長PAHのチロシン形成の初期速度が低いことを示す速度論的研究と一致している。ただし、N末端ドメインを欠く切断PAH、または全長酵素をPheとプレインキュベートした場合は、この遅延時間は観察されない。N末端ドメインの欠失は遅延時間も解消し、Pheに対する親和性をほぼ2倍に増加させる。テトラヒドロビオプテリン補因子のVmaxまたはKmには違いは観察さ れない 。[ 26 ] Ser16 によって追加の調節が行われます。この残基のリン酸化は酵素の立体構造を変化させませんが、アロステリック活性化に必要な Phe の濃度を低下させます。[ 25 ] この N 末端調節ドメインは細菌 PAH では観察されませんが、セリン生合成経路の酵素であるホスホグリセリン酸デヒドロゲナーゼの調節ドメインとかなりの構造的相同性を示します。[ 25 ]
四量体化ドメイン 原核生物のPAHは単量体であるのに対し、真核生物のPAHはホモ四量体とホモ二量体の平衡状態にある。[ 7 ] [ 13 ] 二量体化界面は、同一の単量体を連結する対称性に関連したループで構成されており、重なり合うC末端四量体化ドメインは、触媒ドメインと四量体化ドメインの相対的な配向が異なる構造的に異なる二量体の会合を媒介する(Flatmark、Erlandsen)。結果として生じる四量体対称性の歪みは、二量体化界面の表面積の差に顕著に現れ、PAHを四量体対称のチロシンヒドロキシラーゼと区別する。[ 13 ] 二量体から四量体の形成を媒介するドメインスワッピング機構が提案されており、C末端αヘリックスが柔軟なC末端5残基ヒンジ領域の周りで相互にコンフォメーションを変化させてコイルドコイル構造を形成し、平衡を四量体形態にシフトさせる。[ 7 ] [ 13 ] [ 27 ] PAHのホモ二量体とホモ四量体の両方とも触媒活性があるが、両者は異なる反応速度と調節を示す。二量体は触媒効率の低下に加えて、L-Phe(高濃度では酵素を活性化する)に対する正の協同性を示さないことから、L-Pheが二量体間の相互作用に影響を与えることでPAHをアロステリックに調節していることが示唆される。[ 27 ]
疾患との関連性 PAH の変異による PAH 活性の欠損は高フェニルアラニン血症 (HPA)を引き起こし、血中フェニルアラニン濃度が正常濃度の 20 倍を超えると、代謝性疾患であるフェニルケトン尿症 (PKU) が発症する。[ 28 ] PKU は遺伝子型と表現型の両方で不均一である。300 を超える異なる病原性変異が同定されており、その大部分は触媒ドメインにマッピングされるミスセンス変異に対応する。[ 13 ] [ 20 ] 同定された PAH 変異体のコホートを組換えシステムで発現させたところ、酵素は反応速度の変化や安定性の低下を示し、これらの変異が酵素の触媒ドメインと四量体化ドメインの両方に構造的にマッピングされていることと一致した。[ 13 ] BH4 4 は薬理学的治療として投与されており、遺伝子型が残存 PAH 活性をもたらすものの BH4 4 合成や再生に欠陥のない PKU 患者の一部において、血中フェニルアラニン濃度を低下させることが示されている。追跡調査では、特定の PAH 変異体の場合、過剰な BH4 4が 薬理学的シャペロン として働き、四量体形成が破壊され、タンパク質分解切断や凝集に対する感受性が高まった変異酵素を安定化させることが示唆されている。[ 30 ] PAH 遺伝子座で同定された変異は、フェニルアラニン水酸化酵素遺伝子座知識ベース (PAHdb、https://web.archive.org/web/20130718162051/http: //www.pahdb.mcgill.ca/ ) に記録されている。
フェニルケトン尿症は不可逆的な損傷を引き起こす可能性があるため、フェニルアラニン水酸化酵素の欠損を早期に発見することが不可欠です。当初は、ガストリー試験として知られる細菌阻害アッセイを用いて診断が行われていました。現在では、多くの国で 新生児スクリーニング の一環としてPKUが検査されており、出生直後にタンデム質量分析 法を用いてフェニルアラニン値の上昇が測定されます。フェニルアラニンを少なく、チロシンを多く含む食事療法を行うことで、長期的な発達障害を防ぐことができます。
PAHノックアウトモデル Pah -KOマウスモデルを作成する最初の試みは、2021年に発表された研究論文で報告された。[ 31 ] このノックアウトマウスは、 CRISPR / Cas9 を使用してC57BL/6J系統内で開発され、ホモ接合体となった。[ 32 ] Pah 遺伝子のコドン7、GAGは、終止コドンTAGに変更され、意図的な点突然変異 を示した。生後2~6ヶ月の雄のホモ接合体マウスは、行動および生化学的アッセイ、MRI、組織病理学などの科学的方法によって研究された。ホモ接合体マウスは、野生型 マウスと同様のフェニルアラニンおよびチロシンレベルを供給するのに十分なPAH酵素活性を発現する、年齢および性別が一致するヘテロ接合体Pah -KOマウスである対照マウスと定期的に比較された。
Pah -KOマウスモデルは、ヘテロ 接合 体マウスと比較して、血中フェニルアラニン濃度が高くチロシン濃度が低く、低コレステロール血症、脳内フェニルアラニン濃度が高く神経伝達物質とチロシン濃度が低く、髄鞘形成不全、脳と体重の低下、眼病理のグレードが高い、色素沈着低下 、および進行性の行動障害を示した。[ 31 ] ホモ接合体マウスを終了させた後、ウェスタンブロット 分析により肝臓のPAHタンパク質は検出されなかった。[ 33 ] ホモ接合体マウスの全脳ホモジネート中のフェニルアラニンの増加量はPKU患者と同様であった。両マウスの毛色は毛幹のメラニン色素量に依存しており、ホモ接合体マウスはメラニンが少ないため、より薄い茶色になりがちであった。マウスの行動は巣作りアッセイでテストされた。[ 31 ]
このモデルは、PKU患者に類似したPKU生物学の広範な研究や、PKU治療のための最新の治療戦略の評価の可能性を切り開くものである。
フェニルアラニン水酸化酵素は、他の2つの酵素と密接に関連している。
これら3つの酵素は相同性があり、つまり、同じ古代のヒドロキシラーゼから進化したと考えられている。
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