ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| PP1B について |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | PPM1B、PP2C-beta、PP2C-beta-X、PP2CB、PP2CBETA、PPC2BETAX、タンパク質ホスファターゼ、Mg2+/Mn2+依存性1B |
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| 外部ID | オミム:603770; MGI : 101841;ホモロジーン: 2027;ジーンカード:PPM1B; OMA :PPM1B - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 17番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 17 E4|17 55.13 cM | 始める | 85,264,169 bp [2] |
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| 終わり | 85,331,419 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 二次卵母細胞
- 脈絡叢上皮
- 網膜色素上皮
- 腓腹筋
- 上腕二頭筋
- 腹直筋の骨格筋組織
- 太ももの筋肉
- 上腕二頭筋の骨格筋組織
- 三角筋
- 臀筋
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| | トップの表現 | - 網膜の神経層
- 足首
- 精子細胞
- 太ももの筋肉
- 二腹筋
- 側頭筋
- 球形嚢
- 胸鎖乳突筋
- 大腿骨体
- 小脳皮質
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- マグネシウムイオン結合
- マンガンイオン結合
- タンパク質セリン/スレオニンホスファターゼ活性
- リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性
- 触媒活性
- 陽イオン結合
- 加水分解酵素活性
- 金属イオン結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- タンパク質の脱リン酸化
- I-κBキナーゼ/NF-κBシグナル伝達の負の制御
- ウイルスに対する防御反応の負の調節
- N末端タンパク質ミリストイル化
- ペプチジルスレオニン脱リン酸化
- インターフェロンβ産生の抑制
- NIK/NF-kappaBシグナル伝達の負の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001033556 NM_001033557 NM_002706 NM_177968 NM_177969 |
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NM_001159496 NM_001159497 NM_001159498 NM_011151 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001028729 NP_002697 NP_808907 NP_808908 |
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NP_001152968 NP_001152969 NP_001152970 NP_035281 |
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| 場所 (UCSC) | 2 章: 44.17 – 44.24 Mb | 17章: 85.26 – 85.33 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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タンパク質ホスファターゼ1Bは、ヒトではPPM1B遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、Ser/Thrタンパク質ホスファターゼのPP2Cファミリーのメンバーです。PP2Cファミリーのメンバーは、細胞ストレス応答経路の負の調節因子として知られています。このホスファターゼはサイクリン依存性キナーゼ(CDK)を脱リン酸化することが示されており、したがって細胞周期制御に関与している可能性があります。このホスファターゼの過剰発現は、細胞増殖停止または細胞死を引き起こすことが報告されています。選択的スプライシングにより、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが生成されます。追加の転写バリアントが記述されていますが、現在のところ完全長配列を表していません。[6]
インタラクション
PPM1B は以下と相互作用することが示されています:
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000138032 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000061130 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Marley AE、Kline A、Crabtree G、Sullivan JE、Beri RK(1998年8月)。「ヒトPP2Cbetaのクローニング発現と組織分布」。FEBS Lett . 431 ( 1):121–4。doi : 10.1016/S0014-5793(98)00708-X。PMID 9684878。S2CID 84075989 。
- ^ ab 「Entrez Gene: PPM1B タンパク質ホスファターゼ 1B (旧称 2C)、マグネシウム依存性、ベータアイソフォーム」。
- ^ ab Cheng A、Kaldis P、Solomon MJ (2000 年 11 月)。「タンパク質ホスファターゼ 2C 型アルファおよびベータ 2 アイソフォームによるヒトサイクリン依存性キナーゼの脱リン酸化」。J . Biol. Chem . 275 (44): 34744–9. doi : 10.1074/jbc.M006210200 . PMID 10934208。
- ^ abc Prajapati S、Verma U、Yamamoto Y、Kwak YT、Gaynor RB (2004 年 1 月)。「タンパク質ホスファターゼ 2Cbeta と IkappaB キナーゼ複合体の関連は NF-kappaB 活性の制御に関与している」。J . Biol. Chem . 279 (3): 1739–46. doi : 10.1074/jbc.M306273200 . PMID 14585847。
- ^ Hanada M, Ninomiya-Tsuji J, Komaki K, Ohnishi M, Katsura K, Kanamaru R, Matsumoto K, Tamura S (2001年2月). 「タンパク質ホスファターゼ2CによるTAK1シグナル伝達経路の調節」. J. Biol. Chem . 276 (8): 5753–9. doi : 10.1074/jbc.M007773200 . PMID 11104763.
- ^ タスデレン I、ファン ビークム O、ゴルベンコ O、フレケンス V、ニュージャージー州ファン デン ブローク、コッペン A、ハマーズ N、バーガー R、コッファー PJ、ブレンクマン AB、カルクホーフェン E (2013)。 「セリン/スレオニンホスファターゼ PPM1B (PP2Cβ) は PPARγ 活性を選択的に調節します。」生化学。 J. 451 (1): 45–53。土井:10.1042/BJ20121113。PMID 23320500。
さらに読む
- Hishiya A, Ohnishi M, Tamura S, Nakamura F (1999). 「タンパク質ホスファターゼ2Cはヒト血小板モエシンのF-アクチン結合を不活性化する」J. Biol. Chem . 274 (38): 26705–12. doi : 10.1074/jbc.274.38.26705 . PMID 10480873.
- Cheng A、Ross KE、Kaldis P、Solomon MJ (2000)。「2C型タンパク質ホスファターゼによるサイクリン依存性キナーゼの脱リン酸化」。Genes Dev . 13 (22): 2946–57. doi :10.1101/gad.13.22.2946. PMC 317162. PMID 10580002 。
- Cheng A、Kaldis P、Solomon MJ (2000)。「タンパク質ホスファターゼ2C型αおよびβ2アイソフォームによるヒトサイクリン依存性キナーゼの脱リン酸化」。J . Biol. Chem . 275 (44): 34744–9. doi : 10.1074/jbc.M006210200 . PMID 10934208。
- Hanada M, Ninomiya-Tsuji J, Komaki K, Ohnishi M, Katsura K, Kanamaru R, Matsumoto K, Tamura S (2001). 「タンパク質ホスファターゼ2CによるTAK1シグナル伝達経路の調節」J. Biol. Chem . 276 (8): 5753–9. doi : 10.1074/jbc.M007773200 . PMID 11104763.
- Parvari R、Brodyansky I、Elpeleg O、Moses S、Landau D、Hershkovitz E (2001)。「シスチン尿症およびミトコンドリア病に関連する染色体2p16の劣性連続遺伝子欠失」。Am . J. Hum. Genet . 69 (4): 869–75. doi :10.1086/323624. PMC 1226072 . PMID 11524703。
- Seroussi E、Shani N、Ben-Meir D、Chajut A、Divinski I、Faier S、Gery S、Karby S、Kariv-Inbal Z、Sella O、Smorodinsky NI、Lavi S (2001)。「独自に保存された非翻訳領域は、タンパク質ホスファターゼ 2Cbeta の 2 つの主要な転写産物の生成に関与している」。J . Mol. Biol . 312 (3): 439–51. doi :10.1006/jmbi.2001.4967. PMID 11563908。
- Prajapati S、Verma U、Yamamoto Y、Kwak YT、Gaynor RB (2004)。「タンパク質ホスファターゼ2CbetaとIkappaBキナーゼ複合体の関連はNF-kappaB活性の制御に関与している」。J . Biol. Chem . 279 (3): 1739–46. doi : 10.1074/jbc.M306273200 . PMID 14585847。
- Parvari R、Gonen Y、Alshafee I、Buriakovsky S、Regev K、Hershkovitz E (2005)。「2p21欠失症候群:転写内容の特徴」。ゲノミクス。86 ( 2): 195–211。doi :10.1016/ j.ygeno.2005.04.001。PMID 15913950 。
- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實=岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S、 Sequerra R、Doucette-Stamm L、Cusick ME、Hill DE、Roth FP、Vidal M (2005)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.