ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
ポル2C 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 5IYC、5IY6、5IYD、5IY8、5IY7、5IY9、5IYA、5IYB、%%s5IYD、5IY8、5IYC、5IY6、5IY7、5IYA、5IY9、5IYB
識別子 エイリアス POLR2C 、RPB3、RPB31、hRPB33、hsRPB3、ポリメラーゼ（RNA）IIサブユニットC、RNAポリメラーゼIIサブユニットC 外部ID オミム ：180663; MGI : 109299; ホモロジーン : 2017; ジーンカード ：POLR2C; OMA :POLR2C - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体8（マウス） [2] バンド 8|8 C5 始める 95,584,078 bp [2] 終わり 95,600,163 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 ランゲルハンス島 二次卵母細胞 下垂体前葉 心室帯 腓腹筋 左卵巣 膝窩動脈 脛骨動脈 右卵巣 胸部大動脈下行
トップの表現 小腸上皮 腸絨毛 回腸上皮 胚 卵黄嚢 胚 心室帯 太ももの筋肉 神経節隆起 神経管
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合 タンパク質二量体化活性 RNAポリメラーゼII活性 DNA指向性5'-3' RNAポリメラーゼ活性 タンパク質結合 細胞成分
微小管細胞骨格 RNAポリメラーゼII、コア複合体 核 核質 細胞質 細胞質 生物学的プロセス
スプライソソームを介したmRNAスプライシング RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写伸長 7-メチルグアノシンmRNAキャッピング 転写連動ヌクレオチド除去修復 RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始 RNAポリメラーゼIIによるsnRNA転写 線維芽細胞増殖因子受容体シグナル伝達経路 RNAポリメラーゼIIによる転写 RNA代謝プロセス miRNAによる遺伝子サイレンシングの制御 転写、DNAテンプレート 体性幹細胞集団の維持 ウイルス転写の正の制御 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
DNA指向性RNAポリメラーゼIIサブユニットRPB3 は、ヒトでは POLR2C 遺伝子によってコードされる 酵素 である 。 [5]
関数 この遺伝子は、真核生物におけるメッセンジャーRNA の合成を担うポリメラーゼである RNAポリメラーゼII の3番目に大きいサブユニットをコードしている。この遺伝子の産物はシステインに富む領域を含み、別のポリメラーゼサブユニット POLR2J とヘテロ二量体として存在する 。これら2つのサブユニットは、ポリメラーゼのコアサブアセンブリユニットを形成する。 偽遺伝子は 染色体21上に同定されている。 [6]
インタラクション POLR2C は以下と相互作用する ことが示されています :
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000102978 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031783 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Acker J、Mattei MG、Wintzerith M、Roeckel N、Depetris D、Vigneron M、Kedinger C (1994 年 8 月)。「ヒト RNA ポリメラーゼ II サブユニット遺伝子の染色体局在」。Genomics . 20 ( 3): 496–9. doi :10.1006/geno.1994.1208. PMID 8034326。 ^ 「Entrez Gene: POLR2C ポリメラーゼ (RNA) II (DNA 指向) ポリペプチド C、33kDa」。 ^ デ・アンジェリス R、イエッツィ S、ブルーノ T、コルビ N、ディ・パドヴァ M、フロリディ A、ファンシウリ M、パッサナンティ C (2003 年 7 月)。 「RNA ポリメラーゼ II のサブユニット 3 (RPB3) と転写因子 4 (ATF4) の機能的相互作用」。 FEBS レット 。 547 (1-3): 15-9。 土井 ：10.1016/s0014-5793(03)00659-8。 PMID 12860379。S2CID 33230891 。 ^ Corbi N、Bruno T、De Angelis R、Di Padova M、Libri V、Di Certo MG、Spinardi L、Floridi A、Fanciulli M、Passananti C (2005 年 9 月)。「RNA ポリメラーゼ II サブユニット 3 は、尋常性乾癬の候補遺伝子産物である HCR との相互作用により細胞質内に保持される」。J . Cell Sci . 118 (Pt 18): 4253–60。doi : 10.1242/ jcs.02545。PMID 16141233 。 ^ ab Corbi N、Di Padova M、De Angelis R、Bruno T、Libri V、Iezzi S、Floridi A、Fanciulli M、Passananti C (2002 年 10 月)。「アルファ様 RNA ポリメラーゼ II コアサブユニット 3 (RPB3) は、筋原性因子ミオジェニンとの相互作用を介して組織特異的転写および筋肉分化に関与している」。FASEB J. 16 ( 12): 1639–41. doi : 10.1096/fj.02-0123fje . PMID 12207009. S2CID 30243193. ^ abcdefghi アッカー J、デ グラーフ M、シェイネル I、カザク V、ケディンガー C、ヴィニュロン M (1997 年 7 月)。 「ヒトRNAポリメラーゼIIサブユニット間の相互作用」。 Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学 。 272 (27): 16815–21。 土井 ： 10.1074/jbc.272.27.16815 。 PMID 9201987。 ^ Bertolotti A、Melot T、Acker J、Vigneron M、Delattre O、Tora L (1998 年 3 月)。「EWS は、EWS-FLI-1 とは異なり、TFIID と RNA ポリメラーゼ II の両方と関連している: TET ファミリーの 2 つのメンバーである EWS と hTAFII68 と、TFIID および RNA ポリメラーゼ II 複合体のサブユニットとの相互作用」。Mol . Cell. Biol . 18 (3): 1489–97. doi :10.1128/mcb.18.3.1489. PMC 108863. PMID 9488465 。
さらに読む
Jeang KT (1998). 「Tat、Tat関連キナーゼ、および転写」 J. Biomed. Sci . 5 (1): 24–7. doi :10.1007/BF02253352. PMID 9570510. Yankulov K, Bentley D (1998). 「転写制御: Tat 補因子と転写伸長」. Curr. Biol . 8 (13): R447–9. Bibcode :1998CBio....8.R447Y. doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . PMID 9651670. S2CID 15480646. Romano G、Kasten M、De Falco G、Micheli P、Khalili K、Giordano A (2000)。「HIV tat トランス活性化経路遺伝子発現における Cdk9 とサイクリン T1 の調節機能」。J . Cell. Biochem . 75 (3): 357–68. doi :10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. PMID 10536359. S2CID 43685090. Marcello A、 Zoppé M、Giacca M (2002)。「HIV-1 Tatトランスアクチベーターによる転写制御の複数のモード」。IUBMB Life。51 ( 3 ): 175–81。doi : 10.1080 / 152165401753544241。PMID 11547919。S2CID 10931640 。 Stevens M、De Clercq E、Balzarini J (2007)。「HIV-1転写の制御：化学療法介入の分子標的」。Med Res Rev . 26 (5): 595–625. doi :10.1002/med.20081. PMC 7168390 . PMID 16838299。 Harrich D、McMillan N、Munoz L、Apolloni A 、 Meredith L (2007)。「多様な Tat 相互作用は、新しい抗レトロウイルス薬のターゲットにつながるか?」 Current Drug Targets。7 (12): 1595–606。doi : 10.2174 /138945006779025338。PMID 17168834 。 Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, Chen CH, Rosen CA, Roeder RG (1992). 「HIV-1 Tat は細胞伸長因子と連携して in vitro でプロセッシビティ因子として機能する」。 Genes Dev . 6 (4): 655–66. doi : 10.1101/gad.6.4.655 . PMID 1559613。 Pati UK、Weissman SM (1990)。「ヒトRNAポリメラーゼII 33-kDaサブユニットhRPB 33のアミノ酸配列は真核生物間で高度に保存されている」。J . Biol. Chem . 265 (15): 8400–3. doi : 10.1016/S0021-9258(19)38900-8 . PMID 2187864。 Southgate C、 Zapp ML 、Green MR (1990)。「別のタンパク質を介して新生RNAに結合したHIV-1 Tatタンパク質による転写の活性化」。Nature。345 ( 6276 ): 640–2。Bibcode :1990Natur.345..640S。doi :10.1038/ 345640a0。PMID 2190099。S2CID 4233742 。 Wu-Baer F、Sigman D、 Gaynor RB (1995)。「RNAポリメラーゼIIのヒト免疫不全ウイルストランス活性化領域RNAへの特異的結合は、細胞補因子とTatによって制御される」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 92 (16): 7153–7。Bibcode : 1995PNAS ... 92.7153W。doi : 10.1073 / pnas.92.16.7153。PMC 41297。PMID 7638159 。 Herrmann CH、Rice AP (1995)。「レンチウイルス Tat タンパク質は、RNA ポリメラーゼ II の大きなサブユニットのカルボキシル末端ドメインを過剰リン酸化させる細胞タンパク質キナーゼ TAK と特異的に結合し、Tat 補因子の候補となる」。J . Virol . 69 (3): 1612–20. doi :10.1128/JVI.69.3.1612-1620.1995. PMC 188757. PMID 7853496 。 Keen NJ、Gait MJ、Karn J (1996)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型 Tat は活性化転写伸長複合体の不可欠な構成要素である」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 93 ( 6 ): 2505–10。Bibcode : 1996PNAS ...93.2505K。doi : 10.1073/ pnas.93.6.2505。PMC 39827。PMID 8637904 。 Yang X、Herrmann CH、Rice AP (1996)。「ヒト免疫不全ウイルス Tat タンパク質は、生体内で TAK と特異的に結合し、機能には RNA ポリメラーゼ II のカルボキシル末端ドメインを必要とする」。J . Virol . 70 (7): 4576–84. doi :10.1128/JVI.70.7.4576-4584.1996. PMC 190394. PMID 8676484 。 Agostini I、Navarro JM、Rey F、Bouhamdan M、Spire B、Vigne R、Sire J (1996)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型 Vpr トランスアクチベーター: プロモーター結合アクチベータードメインとの連携および TFIIB への結合」。J . Mol. Biol . 261 (5): 599–606. doi :10.1006/jmbi.1996.0485. PMID 8800208。 Zhou Q、Sharp PA (1996)。「Tat-SF1: HIV-1 Tat による転写伸長の刺激のための補因子」。Science . 274 ( 5287): 605–10。Bibcode : 1996Sci ...274..605Z。doi : 10.1126/science.274.5287.605。PMID 8849451。S2CID 13266489 。 Okamoto H, Sheline CT, Corden JL, Jones KA, Peterlin BM (1996). 「ヒト免疫不全ウイルス Tat タンパク質によるトランス活性化には RNA ポリメラーゼ II の C 末端ドメインが必要」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (21): 11575–9. Bibcode :1996PNAS...9311575O. doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . PMC 38099. PMID 8876177 . Chun RF、Jeang KT (1996)。「ヒトレトロウイルス、ヒトT細胞リンパ向性ウイルスIおよびHIV-1の活性化転写におけるRNAポリメラーゼIIカルボキシル末端ドメインの要件」。J . Biol. Chem . 271 (44): 27888–94. doi : 10.1074/jbc.271.44.27888 . PMID 8910388。 Parada CA、Roeder RG (1996)。「Tat 誘導によるカルボキシ末端ドメインのリン酸化によって誘発される RNA ポリメラーゼ II のプロセッシビティの強化」。Nature。384 ( 6607 ) : 375–8。Bibcode : 1996Natur.384..375P。doi : 10.1038/384375a0。PMID 8934526。S2CID 4278432。 García-Martínez LF、Ivanov D、Gaynor RB (1997)。「精製されたHIV-1およびHIV-2転写開始前複合体とTatの関連」。J . Biol. Chem . 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383。
