タンパク質コード遺伝子
| ポルム |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2HTF、4LZD、4M04、4M0A、4YCX、4YD1、4YD2、2DUN |
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| 識別子 |
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| エイリアス | POLM、Pol Mu、Tdt-N、DNA ポリメラーゼ ミュー、ポリメラーゼ (DNA) ミュー |
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| 外部ID | オミム:606344; MGI : 1860191;ホモロジーン:41170;ジーンカード:POLM; OMA :POLM - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 11番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 11|11 A1 | 始める | 5,777,860 bp [2] |
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| 終わり | 5,788,016 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 顆粒球
- 甲状腺の右葉
- 脾臓
- 甲状腺の左葉
- 血
- 右子宮管
- 肝臓の右葉
- リンパ節
- 眼底
- 胃粘膜
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| | トップの表現 | - 受精卵
- 回腸上皮
- 二次卵母細胞
- 顆粒球
- 嗅周囲皮質
- 乳腺
- 嗅内皮質
- 一次卵母細胞
- リップ
- 第四脳室脈絡叢
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- トランスフェラーゼ活性
- DNA結合
- DNA指向性DNAポリメラーゼ活性
- ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性
- タンパク質結合
- 金属イオン結合
- DNAポリメラーゼ
- DNAポリメラーゼ活性
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 免疫グロブリン遺伝子の体細胞高頻度変異
- B細胞の分化
- DNA組み換え
- 非相同末端結合による二本鎖切断の修復
- DNA損傷刺激に対する細胞反応
- DNA修復
- DNAの生合成プロセス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001284330 NM_001284331 NM_013284 NM_001362683 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001271259 NP_001271260 NP_037416 NP_001349612 |
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| 場所 (UCSC) | 7 章: 44.07 – 44.08 Mb | 11 章: 5.78 – 5.79 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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DNAポリメラーゼμは真核生物に見られるポリメラーゼ 酵素である。ヒトでは、このタンパク質はPOLM遺伝子によってコードされている。[5]
関数
Pol μは、 DNAポリメラーゼのXファミリーのメンバーです。DNA修復の非相同末端結合(NHEJ)経路中に、損傷または欠損したヌクレオチドの再合成に関与します。[6] Pol μは、NHEJに関与するKuおよびDNAリガーゼIV と相互作用します。[7] Pol μ は構造的および機能的にpol λに関連しており、pol λと同様に、pol μは他のDNA修復タンパク質との相互作用を媒介すると考えられているBRCTドメインを持っています。 [8] ただし、pol λとは異なり、pol μは、二本鎖切断の反対側の端にあるオーバーハングによってテンプレート化された平滑末端に塩基を付加する独自の能力を持っています。[9] Pol μは、V(D)J組換え中にDNA末端にランダムなヌクレオチドを付加する特殊なDNAポリメラーゼである末端デオキシヌクレオチド転移酵素(TdT)とも密接に関連しています。V(D)J組換えは、脊椎動物の免疫系でB細胞およびT細胞受容体の多様性が生成されるプロセスです。TdTと同様に、pol μはV(D)J組換えに関与しますが、軽鎖再構成中にのみ関与します。[10] これは、重鎖再構成に関与するpol λとは異なります。[11]
POLM変異マウス
ポリメラーゼμ変異マウスでは、いくつかの末梢および骨髄細胞集団で造血細胞の発達に欠陥があり、いくつかの造血系統を含む骨髄細胞数が約40%減少しています。[12] 造血前駆細胞の増殖能も低下しています。これらの特徴は、造血組織における二重鎖切断の修復能力の低下と相関しています。ポリメラーゼμ変異マウスの全身ガンマ線照射は、ポリメラーゼμが造血組織とは無関係の他の組織における二重鎖切断の修復にも役割を果たしていることを示しています。このように、ポリメラーゼμは造血組織と非造血組織における遺伝的安定性の維持に重要な役割を果たしています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000122678 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000020474 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: POLM ポリメラーゼ (DNA 指向)、mu」。
- ^ Daley JM、Laan RL、Suresh A、Wilson TE (2005 年 8 月)。「非相同末端結合における pol X ファミリーポリメラーゼ作用の DNA 結合依存性」。J . Biol. Chem . 280 (32): 29030–7 . doi : 10.1074/jbc.M505277200 . PMID 15964833。
- ^ Mahajan KN、Nick McElhinny SA、Mitchell BS、Ramsden DA (2002 年 7 月)。「DNA ポリメラーゼ mu (pol mu) と Ku およびリガーゼ IV の関連: 末端結合二本鎖切断修復における pol mu の役割」。Mol . Cell. Biol . 22 (14): 5194– 202. doi :10.1128/MCB.22.14.5194-5202.2002. PMC 139779. PMID 12077346 。
- ^ Nick McElhinny SA、Ramsden DA (2004 年 8 月)。「兄弟間の競争: V(D)J 組み換えと一般的な二本鎖切断修復における Pol X ファミリー メンバー間の競争」。Immunol . Rev. 200 : 156–64。doi : 10.1111 / j.0105-2896.2004.00160.x。PMID 15242403。S2CID 36516952 。
- ^ Nick McElhinny SA、Havener JM、Garcia-Diaz M、他 (2005 年 8 月)。「テンプレート依存性の勾配が、非相同末端結合におけるファミリー X ポリメラーゼの明確な生物学的役割を定義する」。Mol . Cell . 19 (3): 357– 66. doi : 10.1016/j.molcel.2005.06.012 . PMID 16061182。
- ^ Bertocci B、De Smet A、Berek C、Weill JC、 Reynaud CA (2003年8月)。「DNAポリメラーゼμ欠損マウスでは免疫グロブリンκ軽鎖遺伝子の再配列が損なわれる」。免疫。19 ( 2): 203–11。doi : 10.1016 /S1074-7613(03) 00203-6。PMID 12932354。
- ^ Bertocci B、De Smet A、Weill JC、Reynaud CA (2006 年 7 月)。「生体内での免疫グロブリン V(D)J 組み換え中の DNA ポリメラーゼ mu、lambda、および末端デオキシヌクレオチド転移酵素の非重複機能」 ( PDF)。免疫。25 (1): 31– 41。doi : 10.1016/ j.immuni.2006.04.013。PMID 16860755。
- ^ Lucas D、Escudero B、Ligos JM、Segovia JC、Estrada JC、Terrados G、Blanco L、Samper E、Bernad A (2009 年 2 月)。「DNA ポリメラーゼ mu を欠くマウスの造血の変化は、二本鎖切断修復の効率が悪いためである」。PLOS Genet . 5 (2): e1000389. doi : 10.1371/journal.pgen.1000389 . PMC 2638008 . PMID 19229323。
外部リンク