輸送タンパク質ファミリー
PKD1 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス PKD1 、PBP、Pc-1、TRPP1、ポリシスチン1、一過性受容体電位チャネル相互作用、PC1 外部ID オミム :601313; MGI : 97603; ホモロジーン :250; ジーンカード :PKD1; OMA :PKD1 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 17番染色体(マウス) [2] バンド 17 A3.3|17 12.4 cM 始める 24,549,834 bp [2] 終わり 24,596,508 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 小脳の右半球 下垂体前葉 右前頭葉 胃粘膜 上行大動脈 胸部大動脈下行 S状結腸の筋層 子宮体部 右冠動脈 膝窩動脈
トップの表現 小脳皮質 網膜の層 網膜の神経層 一次視覚野 視床下部 上前頭回 ランゲルハンス島 子宮 嗅球 神経軸の線条体
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
膜貫通トランスポーター結合
タンパク質ドメイン特異的結合
カルシウムチャネル活性
タンパク質結合
タンパク質キナーゼ結合
炭水化物結合
細胞成分
細胞質
膜の不可欠な構成要素
ゴルジ体
細胞投影
側方細胞膜
膜
ゴルジ膜
細胞膜
細胞膜の不可欠な構成要素
繊毛
細胞表面
基底外側細胞膜
毛様体膜
ゴルジ体小胞膜
細胞外エクソソーム
核
ポリシスチン複合体
運動繊毛
生物学的プロセス
カルシウム非依存性細胞マトリックス接着
カルシウムイオン輸送
プロテアソームタンパク質分解過程の調節
中腎尿細管の発達
腎臓系の発達
JAK-STATを介した受容体シグナル伝達経路
後腎遠位尿細管の形態形成
有糸分裂紡錘体の組織化の調節
中腎管の発達
腎臓の発達
転写因子の細胞質隔離
細胞質カルシウムイオン濃度の正の調節
解剖学的構造の形態形成
胎盤血管の発達
胎児胎盤の発達
子宮内胎児発育
流体せん断応力に対する応答
性器の発達
後腎上行性細肢の発達
後腎近位尿細管の発達
心臓の発達
軟骨の発達
細胞接着の調節
窒素化合物代謝プロセス
血管の発達
カルシウムイオン膜輸送
ペプチジルセリンリン酸化
リンパ管の形態形成
神経管の発達
核からのタンパク質の輸出
機械的刺激の検出
細胞極性の確立
脊髄の発達
後腎集合管の発達
肝臓の発達
タンパク質結合の正の調節
消化管の発達
細胞-マトリックス接着
肺上皮の発達
上皮管の分岐形態形成
軟骨凝縮
RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
皮膚の発達
細胞膜接着分子を介した同種親和性細胞接着
細胞間接着
出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
ポリシスチン1 ( PC1 )は、 ヒト では PKD1 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6] PKD1 の変異は 、腎嚢胞の発達と重度の腎機能障害を特徴とする重度の 遺伝性 腎臓 疾患である常染色体優性多発性嚢胞腎 の ほとんどの症例と関連している 。 [7]
タンパク質の構造と機能
PC1 は細胞質コイルドコイルドメインを介して ポリシスチン 2 と相互作用します。
PC1は、長さ4303 アミノ酸 の膜結合タンパク質で 、主に 一次繊毛、 頂端膜 、 接着結合 、 デスモソーム に発現しています。 [8] PC1は、11の膜 貫通ドメイン 、大きな細胞外N末端ドメイン、および短い(約200アミノ酸) 細胞質 C末端ドメインを持っています。 [8] [9] この細胞内ドメインには コイルドコイルドメイン が含まれており、PC1はこれを介して膜結合Ca 2+ 透過性 イオンチャネルである ポリシスチン2 (PC2)と相互作用します 。
PC1はGタンパク質共役受容体 として機能することが提案されている 。 [8] [10] C末端ドメインはさまざまな方法で切断される可能性がある。ある例では、マウスの腎臓 の体液流量の減少に反応して、尾部の約35 kDaの部分が 細胞核に蓄積することがわかっている。 [11] 別の例では、15 kDaの断片が生成され、転写活性化因子および共活性化因子 STAT6 および p100 、または標準的な Wntシグナル伝達経路 の構成要素と阻害的に相互作用する可能性がある。 [12] [13]
ヒトPKD1-PKD2複合体の構造はクライオ電子顕微鏡 によって解明されており、その構造ではPKD1とPKD2の比率が1:3であることが示されています。PKD1は、PKD2と相互作用する 電位依存性イオンチャネル フォールドで構成されています 。 [14]
PC1は 腎上皮の一次繊毛による流体の流れの 機械感覚と 関節軟骨 の機械的変形を媒介する。 [15]
遺伝子
PKD1 には異なるアイソフォームをコードするスプライスバリアントが注目されている 。この遺伝子は、 染色体16p上の既知の重複領域にある6つの 偽遺伝子と密接に関連している。 [16]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000008710 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000032855 – Ensembl 、2017 年 5 月
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^ 「Entrez Gene: PKD1 多発性嚢胞腎 1 型 (常染色体優性)」.
外部リンク
GeneReviews/NIH/NCBI/UW の常染色体優性多発性嚢胞腎に関するエントリ