ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
POU2F1 さん 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1CQT、1E3O、1GT0、1HF0、1O4X、1OCT、1POG
識別子 エイリアス POU2F1 、OCT1、OTF1、oct-1B、POU クラス 2 ホメオボックス 1、Oct1Z 外部ID オミム : 164175; MGI : 101898; ホモロジーン : 37658; ジーンカード ：POU2F1; OMA :POU2F1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体1（マウス） [2] バンド 1 H2.3|1 73.21 cM 始める 165,692,723 bp [2] 終わり 165,830,247 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 頬粘膜細胞 二次卵母細胞 腓骨神経 生殖腺 睾丸 アキレス腱 小脳虫部 腹直筋の骨格筋組織 上腕二頭筋の腱 結腸上皮
トップの表現 吻側回遊流 受精卵 胎児の尾 性器結節 二次卵母細胞 原始的な線 一次卵母細胞 腎小体 毛様体 胚
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
配列特異的DNA結合 タンパク質結合 RNAポリメラーゼIIコアプロモーター配列特異的DNA結合 RNAポリメラーゼII一般転写開始因子活性 DNA結合 DNA結合転写因子活性 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 細胞成分
小胞体 核 細胞内膜で囲まれた細胞小器官 核質 RNAポリメラーゼII転写調節因子複合体 生物学的プロセス
転写の負の調節、DNAテンプレート 転写の調節、DNAテンプレート 転写、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによるsnRNA転写 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 サイトカインを介したシグナル伝達経路 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001198783 NM_001198786 NM_002697 NM_001365848 NM_001365849
NM_011137 NM_198932 NM_198933 NM_198934 NM_001368808
RefSeq (タンパク質) NP_001185712 NP_001185715 NP_002688 NP_001352777 NP_001352778
NP_035267 NP_945150 NP_945151 NP_945152 NP_001355737
場所 (UCSC) 1 章: 167.22 – 167.43 Mb 1 章: 165.69 – 165.83 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
POUドメイン、クラス2、転写因子1 は、ヒトでは POU2F1 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
インタラクション POU2F1 は以下と相互作用する ことが示されています :
参照
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000143190 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026565 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Roberts SB、Segil N、Heintz N (1991 年 10 月)。「細胞周期中の転写因子 Oct1 の異なるリン酸化」。Science . 253 ( 5023): 1022–6. doi :10.1126/science.1887216. PMID 1887216. S2CID 23291453。 ^ 「Entrez 遺伝子: POU2F1 POU ドメイン、クラス 2、転写因子 1」。 ^ Nie J, Sakamoto S, Song D, Qu Z, Ota K, Taniguchi T (1998年3月). 「Oct-1とポリ(ADP-リボース)合成酵素の自己修飾ドメインとの相互作用」. FEBS Lett . 424 (1–2): 27–32. Bibcode :1998FEBSL.424...27N. doi : 10.1016/s0014-5793(98)00131-8 . PMID 9537509. S2CID 872132. ^ ab Préfontaine GG、Walther R、Giffin W、Lemieux ME、Pope L、Haché RJ (1999 年 9 月)。「ステロイドホルモン受容体のオクタマー転写因子への選択的結合が、マウス乳がんウイルスプロモーターにおける転写相乗効果を決定する」。J . Biol. Chem . 274 (38): 26713–9. doi : 10.1074/jbc.274.38.26713 . PMID 10480874。 ^ Wang JM、Préfontaine GG、Lemieux ME、Pope L、Akimenko MA、Haché RJ (1999 年 10 月)。「グルココルチコイド受容体 DNA 結合ドメインの異所性発現の発達への影響は、ホメオドメイン結合を妨げるアミノ酸置換によって軽減される」。Mol . Cell. Biol . 19 (10): 7106–22. doi :10.1128/mcb.19.10.7106. PMC 84705. PMID 10490647 。 ^ Préfontaine GG、Lemieux ME、Giffin W、Schild-Poulter C、Pope L、LaCasse E、Walker P、Haché RJ (1998 年 6 月)。「グルココルチコイド受容体によるオクタマー転写因子の DNA へのリクルートメント」。Mol . Cell. Biol . 18 (6): 3416–30. doi :10.1128/mcb.18.6.3416. PMC 108923. PMID 9584182 。 ^ ab McKnight S (2003年7月). 「代謝酵素による遺伝子スイッチング - 招待リストに載るにはどうしたらいいですか?」. Cell . 114 (2): 150–2. doi : 10.1016/s0092-8674(03)00563-4 . PMID 12887915. S2CID 895360. ^ La Boissière S、 Hughes T、O'Hare P (1999年1月)。「VP16のHCF依存性核内輸入」。EMBO J. 18 (2): 480–9. doi :10.1093/emboj/18.2.480. PMC 1171141. PMID 9889203 。 ^ Kristie TM、Sharp PA（1993年3月）。「単純ヘルペスウイルスα-トランス誘導因子（VP16）によるOct-1ホメオドメインの安定した認識に必要な細胞C1因子の精製」。J . Biol. Chem . 268 （ 9）：6525–34。doi ： 10.1016 /S0021-9258（18）53282-8。PMID 8454622 。 ^ Schild-Poulter C、Pope L、Giffin W、Kochan JC、Ngsee JK、Traykova-Andonova M、Haché RJ (2001 年 5 月)。「Ku 抗原のホメオドメインタンパク質への結合は、DNA 依存性タンパク質キナーゼによるリン酸化を促進する」。J . Biol. Chem . 276 (20): 16848–56. doi : 10.1074/jbc.M100768200 . PMID 11279128。 ^ Matheos D、Ruiz MT、Price GB、Zannis-Hadjopoulos M (2002 年 10 月)。「Ku 抗原は、複製タンパク質と関連する起源特異的結合タンパク質であり、哺乳類の DNA 複製に必要である」。Biochim . Biophys. Acta . 1578 (1–3): 59–72. doi :10.1016/s0167-4781(02)00497-9. PMID 12393188。 ^ Inamoto S, Segil N, Pan ZQ, Kimura M, Roeder RG (1997 年 11 月). 「サイクリン依存性キナーゼ活性化キナーゼ (CAK) アセンブリ因子 MAT1 は、オクタマー転写因子の POU ドメイン上の CAK 活性を標的とし、それを強化する」. J. Biol. Chem . 272 (47): 29852–8. doi : 10.1074/jbc.272.47.29852 . PMID 9368058. ^ 柿澤 孝文、宮本 孝文、市川 健、武田 孝文、鈴木 誠、森 淳、熊谷 正治、山下 功文、橋爪 功文 (2001 年 3 月)。「レチノイドおよび甲状腺ホルモン受容体のサイレンシングメディエーターはオクタマー転写因子 1 と相互作用し、転写抑制因子として機能する」。J . Biol. Chem . 276 (13): 9720–5. doi : 10.1074/jbc.M008531200 . PMID 11134019。 ^ ab Wong MW、Henry RW、Ma B、Kobayashi R、Klages N、Matthias P、Strubin M、Hernandez N (1998 年 1 月)。「基礎転写因子 SNAPc の大サブユニットは Oct-1 と相互作用する Myb ドメインタンパク質である」。Mol . Cell. Biol . 18 (1): 368–77. doi :10.1128/mcb.18.1.368. PMC 121507. PMID 9418884 。 ^ Chasman D、Cepek K、Sharp PA、Pabo CO (1999 年 10 月)。「Oct-1 POU ドメイン/オクタマー DNA 複合体に結合した OCA-B ペプチドの結晶構造: タンパク質-DNA 界面の特異的認識」。Genes Dev . 13 (20): 2650–7. doi :10.1101/gad.13.20.2650. PMC 317104. PMID 10541551 。 ^ Lee L、Stollar E、Chang J、Grossmann JG、O'Brien R、Ladbury J、Carpenter B、Roberts S、Luisi B (2001 年 6 月)。「Oct-1 転写因子の発現と Bob1 コアクチベーターとの相互作用の特性」。 生化学 。40 ( 22 ): 6580–8。doi :10.1021/bi010095x。PMID 11380252 。 ^ van Heel DA、Udalova IA、De Silva AP、McGovern DP、Kinouchi Y、Hull J、Lench NJ、Cardon LR、Carey AH、Jewell DP、Kwiatkowski D (2002 年 5 月)。「炎症性腸疾患は、OCT1 と NF(-kappa)B 転写因子間の相互作用に影響を与える TNF 多型と関連している」。Hum . Mol. Genet . 11 (11): 1281–9. doi : 10.1093/hmg/11.11.1281 . PMID 12019209。 ^ 柿澤 孝文、宮本 孝文、市川 健、金子 明生、鈴木 聡、原 正治、長澤 孝文、武田 孝文、森 治、熊谷 正治、橋爪 健 (1999 年 7 月)。「Oct-1 とレチノイド X 受容体の機能的相互作用」。J . Biol. Chem . 274 (27): 19103–8. doi : 10.1074/jbc.274.27.19103 . PMID 10383413。 ^ Hovde S、Brooks A、Strong K、Geiger JH (2002 年 3 月)。「Oct-1/SNAP190 ペプチド/DNA 複合体の結晶化」。Acta Crystallogr. D . 58 (Pt 3): 511–2。doi : 10.1107 /s0907444901021461。PMID 11856838 。 ^ Ström AC、Forsberg M、Lillhager P、Westin G (1996 年 6 月)。「転写因子 Sp1 と Oct-1 は物理的に相互作用してヒト U2 snRNA 遺伝子発現を制御する」。Nucleic Acids Res . 24 (11): 1981–6. doi :10.1093/nar/24.11.1981. PMC 145891 . PMID 8668525。 ^ Gunther M、Laithier M、Brison O (2000 年 7 月)。「2 ハイブリッド スクリーニングで特定された転写因子 Sp1 と相互作用するタンパク質のセット」。Mol . Cell. Biochem . 210 (1–2): 131–42. doi :10.1023/A:1007177623283. PMID 10976766. S2CID 1339642. ^ Zwilling S、Annweiler A、Wirth T (1994 年 5 月)。「Oct1 および Oct2 転写因子の POU ドメインは TBP との特異的相互作用を媒介する」。Nucleic Acids Res . 22 (9): 1655–62. doi :10.1093/nar/22.9.1655. PMC 308045 . PMID 8202368。
さらに読む
Hsieh CL、Sturm R、Herr W、Francke U (1990)。「普遍的なオクタマー結合タンパク質 Oct–1 の遺伝子は、ヒト染色体 1、領域 cen-q32 にあり、マウス染色体 1 では Ly-22 と Ltw-4 の近くにある」。Genomics . 6 ( 4): 666–72. doi : 10.1016/0888-7543(90)90502-L . PMID 2341156。 Sturm RA、Das G、Herr W (1989)。「普遍的なオクタマー結合タンパク質 Oct–1 には、ホメオボックスサブドメインを持つ POU ドメインが含まれています」。Genes Dev . 2 (12A): 1582–99. doi : 10.1101/gad.2.12a.1582 . PMID 2905684。 Nakshatri H、Nakshatri P、Currie RA (1995)。「Oct–1 と TFIIB の相互作用。リポタンパク質リパーゼプロモーターの近位オクタマー部位を介して誘発される新しい応答の示唆」。J . Biol. Chem . 270 (33): 19613–23。doi : 10.1074 /jbc.270.33.19613。hdl : 1805 / 18867。PMID 7642649 。 コックス M、ファン ティルボルグ PJ、デ ラート W、ボーレンズ R、ファン レーウェン HC、ファン デル ブリート PC、キャプテン R (1995)。 「NMRと拘束された分子動力学によって決定されたOct-1 POUホメオドメインの溶液構造」。 Ｊ．Ｂｉｏｍｏｌ． NMR 。 6 (1): 23-32。 土井 ：10.1007/BF00417488。 PMID 7663141。S2CID 26063646 。 Jeang KT、Chun R、Lin NH、Gatignol A、Glabe CG、Fan H (1993)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型 Tat タンパク質と Sp1 転写因子の in vitro および in vivo 結合」。J . Virol . 67 (10): 6224–33. doi :10.1128/JVI.67.10.6224-6233.1993. PMC 238044. PMID 7690421 。 Zwilling S, König H, Wirth T (1995). 「高移動度グループタンパク質2はオクタマー転写因子のPOUドメインと機能的に相互作用する」. EMBO J. 14 ( 6): 1198–208. doi :10.1002/j.1460-2075.1995.tb07103.x. PMC 398197. PMID 7720710 . Sturm RA、Eyre HJ、Baker E、 Sutherland GR (1995)。「CD3Z 遺伝子と重複するヒト OTF1 遺伝子座は 1q22→q23 に位置する」 。Cytogenet。Cell Genet。68 ( 3–4 ): 231–2。doi :10.1159/000133919。PMID 7842742 。 Klemm JD、Rould MA、Aurora R、Herr W、Pabo CO (1994)。「オクタマー部位に結合した Oct-1 POU ドメインの結晶構造: 連結された DNA 結合モジュールによる DNA 認識」。Cell . 77 (1): 21–32. doi :10.1016/0092-8674(94)90231-3. PMID 8156594. S2CID 36371069 . Zwilling S、Annweiler A、Wirth T (1994)。「Oct1 および Oct2 転写因子の POU ドメインは TBP との特異的相互作用を媒介する」。Nucleic Acids Res . 22 (9): 1655–62. doi :10.1093/nar/22.9.1655. PMC 308045 . PMID 8202368。 Kristie TM、Sharp PA (1993)。「単純ヘルペスウイルスα-トランス誘導因子（VP16）によるOct-1ホメオドメインの安定した認識に必要な細胞C1因子の精製」。J . Biol. Chem . 268 (9): 6525–34. doi : 10.1016/S0021-9258(18)53282-8 . PMID 8454622。 Assa-Munt N、Mortishire-Smith RJ、Aurora R、Herr W、Wright PE (1993)。「Oct–1 POU 特異的ドメインの溶液構造は、バクテリオファージ ラムダ リプレッサー DNA 結合ドメインとの驚くべき類似性を示す」。Cell . 73 (1): 193–205. doi :10.1016/0092-8674 ( 93)90171-L. PMID 8462099. S2CID 24276357. Dekker N, Cox M, Boelens R, Verrijzer CP, van der Vliet PC, Kaptein R (1993). 「Oct–1 の POU 特異的 DNA 結合ドメインの溶液構造」. Nature . 362 (6423): 852–5. Bibcode :1993Natur.362..852D. doi :10.1038/362852a0. PMID 8479524. S2CID 21540451. Ström AC、Forsberg M、Lillhager P、Westin G (1996)。「転写因子 Sp1 と Oct–1 は物理的に相互作用してヒト U2 snRNA 遺伝子発現を制御する」。Nucleic Acids Res . 24 (11): 1981–6. doi :10.1093/nar/24.11.1981. PMC 145891 . PMID 8668525。 Inamoto S, Segil N, Pan ZQ, Kimura M, Roeder RG (1997). 「サイクリン依存性キナーゼ活性化キナーゼ (CAK) アセンブリ因子 MAT1 は、オクタマー転写因子の POU ドメインを標的とし、CAK 活性を増強する」 J. Biol. Chem . 272 (47): 29852–8. doi : 10.1074/jbc.272.47.29852 . PMID 9368058. Wong MW、Henry RW、Ma B、Kobayashi R、Klages N、Matthias P、Strubin M、Hernandez N (1998)。「基礎転写因子 SNAPc の大サブユニットは Oct–1 と相互作用する Myb ドメインタンパク質である」。Mol . Cell. Biol . 18 (1): 368–77. doi :10.1128/mcb.18.1.368. PMC 121507. PMID 9418884 。 Nie J, Sakamoto S, Song D, Qu Z, Ota K, Taniguchi T (1998). 「Oct–1 とポリ (ADP-リボース) 合成酵素の自己修飾ドメインの相互作用」. FEBS Lett . 424 (1–2): 27–32. Bibcode :1998FEBSL.424...27N. doi : 10.1016/S0014-5793(98)00131-8 . PMID 9537509. S2CID 872132. Préfontaine GG、Lemieux ME、Giffin W、Schild-Poulter C、Pope L、LaCasse E、Walker P、Haché RJ (1998)。「グルココルチコイド受容体によるオクタマー転写因子のDNAへのリクルートメント」。Mol . Cell. Biol . 18 (6): 3416–30. doi : 10.1128/MCB.18.6.3416. PMC 108923. PMID 9584182. La Boissière S、 Hughes T、O'Hare P (1999)。「VP16 の HCF 依存性核内輸入」。EMBO J. 18 (2): 480–9. doi :10.1093/emboj/18.2.480. PMC 1171141. PMID 9889203 。
外部リンク POU2F1+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館 医学件名表 (MeSH)
