ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
NFYA 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス NFYA 、CBF-A、CBF-B、HAP2、NF-YA、核転写因子Yサブユニットα 外部ID オミム :189903; MGI : 97316; ホモロジーン : 32114; ジーンカード :NFYA; OMA :NFYA - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 17番染色体(マウス) [2] バンド 17 C|17 23.99 cM 始める 48,693,913 bp [2] 終わり 48,716,934 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 頬粘膜細胞 神経節隆起 右精巣 左精巣 精子 二次卵母細胞 睾丸 骨髄細胞 ランゲルハンス島 単球
トップの表現 二次卵母細胞 一次卵母細胞 受精卵 性器結節 胎児の尾 神経節隆起 胸腺 顆粒球 卵黄嚢 胎盤
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合転写因子活性
DNA結合
コアプロモーター配列特異的DNA結合
タンパク質結合
RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
細胞成分
CCAAT結合因子複合体
タンパク質-DNA複合体
核
核質
RNAポリメラーゼII転写調節因子複合体
生物学的プロセス
転写の正の制御、DNAテンプレート
転写の調節、DNAテンプレート
RNAポリメラーゼIIによる転写
転写、DNAテンプレート
リズミカルなプロセス
コレステロール生合成プロセスの調節
RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001110832 NM_010913 NM_001347401 NM_001347402 NM_001374803
RefSeq (タンパク質) NP_001104302 NP_001334330 NP_001334331 NP_035043 NP_001361732
場所 (UCSC) 6 章: 41.07 – 41.1 Mb 17章: 48.69 – 48.72 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
核転写因子Yサブユニットα は、ヒトでは NFYA 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、三量体複合体 NF-Y の 1 つのサブユニットであり、さまざまな遺伝子のプロモーター領域にある CCAAT モチーフに結合する高度に保存された転写因子を形成します。 [7] サブユニット NFYA は、NFYB サブユニットと NFYC サブユニットで構成される密な二量体と結合し、高い特異性と親和性で DNA に結合する三量体を形成します。複合体の配列特異的な相互作用は NFYA サブユニットによって行われるため、調節サブユニットとしての役割が示唆されます。さらに、この遺伝子産物には、タンパク質分解または翻訳の制御による転写後調節の証拠があります。さらなる調節は、グルタミンに富む活性化ドメインの選択的スプライシングによって表され、2 つのアイソフォームに対する組織特異的な好みが明確に示されています。 [8]
NF-Y複合体は クロマチン アクセシビリティを促進し、 他の共局在する細胞型特異的転写因子を促進する 先駆因子として機能します。 [9]
NF-Yは動物における 転写 開始部位(TSS)選択 において中心的な役割を果たすことも示唆されている 。 [10] NF-Yはヌクレオソーム枯渇領域の完全性とタンパク質コード遺伝子 プロモーター におけるPICの局在を保護する。
インタラクション
NFYAは血清応答因子 [11] および ZHX1 [11]と 相互作用する ことが示されている 。 [ 12] NFYA、NFYBおよびNFYCはNFY複合体を形成し、NFY複合体はクロマチンアクセシビリティを促進して他の共局在する細胞型特異的転写因子を促進するパイオニア因子として機能することが示されている。 [7]
構造
dsDNAと複合したNFYヘテロ三量体の原子構造は、 X線結晶構造解析 によって解明された(PDB ID 4awl)。 [13] NFYA アルファヘリックス の1つをテンプレートとして使用し、構造に着想を得た ステープルペプチドが設計され、NFYAがNFYB/C ヘテロ二量 体に結合するのを防ぐことでNFYヘテロ三量体の形成を阻害する 。 [14]
参考文献
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さらに読む
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外部リンク
この記事には、 パブリックドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。