マイクロプロセッサ複合体サブユニット DGCR8

ＤＧＣＲ８
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	1X47、2YT4、3LE4、5B16
識別子
エイリアス	DGCR8、C22orf12、DGCRK6、Gy1、pasha、Pasha、DGCR8 マイクロプロセッサ複合体サブユニット、マイクロプロセッサ複合体サブユニット
外部ID	オミム：609030; MGI : 2151114;ホモロジーン: 11223;ジーンカード：DGCR8; OMA :DGCR8 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体22（ヒト）
終わり	20,111,877 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	小脳の右半球; ; 腓骨神経; ; 右精巣; ; 左精巣; ; 子宮体部; ; 右卵巣; ; 甲状腺の右葉; ; 膵臓の体; ; 左卵巣; ; 心の頂点;
	該当なし
	参照表現データの詳細
	; ; ; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	一次miRNA結合; リボヌクレアーゼIII活性; 二本鎖RNA結合; タンパク質結合; ヘム結合; タンパク質ホモ二量体化活性; 金属イオン結合; RNA結合; 同一のタンパク質結合;
細胞成分	細胞質; マイクロプロセッサ複合体; 核小体; 核; 核質; シナプス後密度;
生物学的プロセス	幹細胞増殖の調節; 一次miRNA処理; RNAホスホジエステル結合加水分解、エンドヌクレアーゼ; RNAホスホジエステル結合加水分解; miRNA代謝プロセス;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	54487
	94223
	ENSG00000128191
	ENSMUSG00000022718
	翻訳
	翻訳
	NM_001190326 ; NM_022720
	NM_033324
	NP_001177255 ; NP_073557
	NP_201581
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

マイクロプロセッサ複合体サブユニットDGCR8 （ディジョージ症候群の重要な領域8）は、ヒトではDGCR8遺伝子によってコードされるタンパク質です。^[4]他の動物、特に一般的なモデル生物であるキイロショウジョウバエと線虫では、このタンパク質はPasha （ Droshaのパートナー）として知られています。 ^[5]これはRNA干渉経路の必須コンポーネントです。

関数

サブユニット DGCR8 は細胞核に局在し、マイクロ RNA (miRNA) の処理に必要である。これは、RNase III 酵素である他のサブユニットDroshaに結合してマイクロプロセッサ複合体を形成し、pri-miRNA と呼ばれる一次転写産物をpre-miRNA と呼ばれる特徴的なステムループ構造に切断し、その後酵素Dicerによって miRNA フラグメントにさらに処理される。DGCR8 にはRNA結合ドメインが含まれており、pri-miRNA に結合して Drosha による処理のために安定化させると考えられている。^[6]

DGCR8 は、いくつかの種類の DNA 修復にも必要です。転写連動ヌクレオチド除去修復 (TC-NER)中の UV 誘発 DNA光産物の除去は、 DGCR8 のセリン153の JNK リン酸化に依存します。 ^[7] DGCR8 はマイクロ RNA の生合成で機能することが知られていますが、この活性は DGCR8 依存性の UV 誘発光産物の除去には必要ありません。^[7]ヌクレオチド除去修復は、過酸化水素( H ₂ O ₂ )による酸化 DNA 損傷の修復にも必要であり、DGCR8 が枯渇した細胞はH ₂ O ₂に敏感です。^[7]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000128191 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「Entrez Gene: DGCR8 ディジョージ症候群の重要な領域遺伝子8」。
^ Denli AM、Tops BB、Plasterk RH、Ketting RF、Hannon GJ (2004 年 11 月)。「マイクロプロセッサ複合体によるプライマリマイクロ RNA の処理」。Nature . 432 ( 7014 ) : 231–5。Bibcode : 2004Natur.432..231D。doi :10.1038/nature03049。PMID 15531879。S2CID 4425505。
^ Yeom KH、Lee Y、Han J、Suh MR、Kim VN (2006)。「一次miRNA処理におけるDroshaの必須補因子であるDGCR8/Pashaの特性評価」。核酸研究。34 ( 16 ): 4622–9。doi : 10.1093/nar/gkl458。PMC 1636349。PMID 16963499。
^ abc Calses PC、Dhillon KK、Tucker N、Chi Y、Huang JW、川澄 M、Nghiem P、Wang Y、Clurman BE、Jacquemont C、Gafken PR、菅沢 K、西條 M、谷口 T (2017)。「DGCR8 は RNA プロセシングとは独立して UV 誘発 DNA 損傷の修復を仲介する」。セル担当者19 (1): 162–174。土井：10.1016/j.cellrep.2017.03.021。PMC 5423785。PMID 28380355。

さらに読む

Simpson JC、Wellenreuther R、 Poustka A、Pepperkok R、Wiemann S (2000 年 9 月)。「大規模 cDNA シーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO レポート。1 ( 3 ): 287–92。doi :10.1093/embo-reports/kvd058。PMC 1083732。PMID 11256614。
塩浜明、佐々木剛、野田聡、箕島聡、清水暢 (2003 年 4 月)。「ディジョージ症候群染色体領域に位置する新規遺伝子 DGCR8 の分子クローニングと発現解析」。生化学および生物物理学的研究通信。304 (1): 184–90。doi :10.1016/S0006-291X(03)00554-0。PMID 12705904 。
グレゴリー RI、ヤン KP、アムサン G、チェンドリマダ T、ドラトタージ B、クーチ N、シーハッタール R (2004 年 11 月)。「マイクロプロセッサ複合体はマイクロRNAの生成を媒介する」。自然。432 (7014): 235-40。Bibcode :2004Natur.432..235G。土井：10.1038/nature03120. PMID 15531877。S2CID 4389261 。
Han J、Lee Y、Yeom KH、Kim YK、Jin H、Kim VN (2004 年 12 月)。「一次マイクロ RNA 処理における Drosha-DGCR8 複合体」。遺伝子と発達。18 ( 24): 3016–27。doi : 10.1101 /gad.1262504。PMC 535913。PMID 15574589。
Landthaler M、Yalcin A 、 Tuschl T (2004 年 12 月)。「ヒト DiGeorge 症候群の重要な領域遺伝子 8 とその D. melanogaster ホモログは miRNA の生合成に必要である」。Current Biology。14 ( 23 ): 2162–7。Bibcode : 2004CBio ...14.2162L。doi :10.1016/j.cub.2004.11.001。hdl : 11858/ 00-001M -0000-0012- EB83-3。PMID 15589161。S2CID 13266269 。
Han J、Lee Y、Yeom KH、Nam JW、Heo I、Rhee JK、Sohn SY、Cho Y、Zhang BT、Kim VN (2006 年 6 月)。「Drosha-DGCR8 複合体によるプライマリマイクロ RNA の認識の分子的基礎」。Cell . 125 ( 5): 887–901. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.043 . PMID 16751099。
フォールラー M、マツナガ M、イン S、ルー JA、郭 F (2007 年 1 月)。「ヘムはマイクロRNAのプロセシングに関与している」。自然の構造および分子生物学。14 (1): 23-9。土井：10.1038/nsmb1182。PMID 17159994。S2CID 17463646 。
Sohn SY、Bae WJ、Kim JJ、Yeom KH、Kim VN、Cho Y (2007 年 9 月)。「ヒト DGCR8 コアの結晶構造」。Nature Structural & Molecular Biology。14 ( 9) : 847–53。doi :10.1038/nsmb1294。PMID 17704815。S2CID 18561478 。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000128191 – Ensembl、2017 年 5 月

[2] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[3] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[entrez-4] 「Entrez Gene: DGCR8 ディジョージ症候群の重要な領域遺伝子8」。

[5] Denli AM、Tops BB、Plasterk RH、Ketting RF、Hannon GJ (2004 年 11 月)。「マイクロプロセッサ複合体によるプライマリマイクロ RNA の処理」。Nature . 432 ( 7014 ) : 231–5。Bibcode : 2004Natur.432..231D。doi :10.1038/nature03049。PMID 15531879。S2CID 4425505。

[6] Yeom KH、Lee Y、Han J、Suh MR、Kim VN (2006)。「一次miRNA処理におけるDroshaの必須補因子であるDGCR8/Pashaの特性評価」。核酸研究。34 ( 16 ): 4622–9。doi : 10.1093/nar/gkl458。PMC 1636349。PMID 16963499。

[Calses-7] Calses PC、Dhillon KK、Tucker N、Chi Y、Huang JW、川澄 M、Nghiem P、Wang Y、Clurman BE、Jacquemont C、Gafken PR、菅沢 K、西條 M、谷口 T (2017)。「DGCR8 は RNA プロセシングとは独立して UV 誘発 DNA 損傷の修復を仲介する」。セル担当者19 (1): 162–174。土井：10.1016/j.cellrep.2017.03.021。PMC 5423785。PMID 28380355。