武藤敬司

武藤は1990年3月に新日本プロレスに復帰するとすぐにランクを上げた。4月27日、蝶野正洋と組んで橋本真也と斉藤正を破りIWGPタッグ王座を獲得し、新日本プロレスに復帰。武藤は2度目の同タイトル獲得となった。彼と蝶野は6ヶ月以上タイトルを保持したが、11月1日に長谷弘と佐々木健介に敗れタイトルを失った。この間、武藤は6月12日に九州カップトーナメントにも出場し、蝶野を破って決勝に進出したが、橋本に敗れた。9月7日、武藤はサムライ・シロとの試合で初めてグレート・ムタのリングネームを披露し、勝利した。武藤は主要な試合ではムタのギミックを時折使用し、通常の試合では本名で出場した。9月30日、ムタはリッキー・スティームボートから大きな勝利を収めた。

武藤は1991年3月21日、WCWと新日本プロレスが共同プロモートした東京ドームのスターケードでグレート・ムタの異名を復活させ、スティングを破った。同年、武藤と蝶野は橋本とともに、 8月11日に行われた第1回G1クライマックス決勝でアントニオ猪木、藤波辰巳、長州力を超え、新日本プロレスの次世代としての地位を確固たるものにした。彼はスコット・ノートンに敗れたものの、ブロックで藤波辰巳とビッグバン・ベイダーを破り、蝶野との決勝に進出した。決勝は30分に及ぶ壮絶な試合となり、武藤は蝶野に敗れたが、橋本とともに3人はリング上で勝利を祝い、その後、正式に新日本プロレスの「三銃士」と呼ばれるようになった。 10月、武藤は長谷弘とタッグを組み、1991年スーパータッグリーグに出場した。トーナメント戦では3勝3敗と勝ち越し、惜しくも決勝トーナメント進出を逃した。しかし、トーナメント直後の11月5日、武道館で行われた試合でリック・スタイナーとスコット・ノートンを破り、IWGPタッグ王座を獲得した。

1992年1月4日、武藤はグレート・ムタとして東京ドームで開催されたスーパー・ウォリアーズ大会のメインイベントに出場し、スティングと初めてタッグを組んでスタイナー・ブラザーズを破った。これは1月4日東京ドーム大会の初開催であり、その後数年間、新日本プロレスの看板イベントとなる。3月1日に行われた新日本プロレス20周年記念大会では、武藤と長谷はビッグバン・ベイダーとクラッシャー・バム・バム・ビガロにIWGPタッグ王座を奪われた。武藤はシングル選手として成長を続け、5月17日には長州力とのIWGPヘビー級王座戦で初挑戦したが、勝利には至らなかった。武藤は1992年のG1クライマックスに出場し、空位となっていたNWA世界ヘビー級王座をかけて戦った。8月6日に静岡で行われた1回戦でバリー・ウィンダムを破り、8月10日の準々決勝でスティーブ・オースティンを破ったが、8月11日の準決勝で最終的に優勝した蝶野正洋に敗れた。

8月16日、武藤はグレート・ムタとして日本のレジェンド、長州力に勝利し、グレイテスト18クラブ選手権とIWGPヘビー級選手権を初獲得、プロレスラーとしてのキャリアで初の世界タイトルを獲得した。9月23日には橋本真也を相手に両タイトルを防衛し、その後グレイテスト18クラブ選手権を引退し、IWGPヘビー級選手権の防衛に専念した。10月18日にはスコット・ノートン、11月22日にはスティングを相手にタイトルを防衛した。12月14日、武藤は長谷弘と対戦し勝利を収めた。この試合では、1990年9月14日の対戦で武藤が長谷の額を流血させたことへの報復として、長谷が凶器を使って武藤の額を殴打するという有名な試合が行われた。武藤は刃物で長谷の額を深く切りつけた。その結果、武田は試合の残りの時間、大量に出血し、今でもその切り傷の跡が残っている。

1993年1月4日、武田は東京ドームで開催されたファンタスティック・ストーリー（北米ではWCW/新日本スーパーショーIIIとして知られる）で蝶野正洋とのタイトルマッチを制し、IWGPヘビー級王座を防衛するとともにNWA世界ヘビー級王座を獲得した。これにより、武田は藤波辰巳に次いで、両タイトルを同時に保持した2人目の選手となった。WCWでNWA王座を失った後、武田は年間を通してタイトルマッチやエキシビションマッチで様々な挑戦者と対戦した。武藤は5月のレスリングどんたくでハルク・ホーガンに敗れ、6月15日にはグレート・カブキを相手にIWGP王座を防衛した。1年以上王座を保持した後、9月20日に橋本真也に敗れ王座を失った。この王座喪失と9月23日のホーガンとヘルレイザーズ（ホーク・ウォリアーとパワー・ウォリアー）との試合の後、武藤は主に本名で試合を行い、一部の試合で武藤名を復活させた。12月10日、武藤はIWGPヘビー級王座をかけて橋本との再戦に臨んだが、勝利することはできなかった。

武藤は1993年秋に長谷弘と再びタッグを組み、 1994年1月4日のバトルフィールドでシュタイナー・ブラザーズと対戦したが敗北した。武藤は5月のレスリングどんたくで伝説のアントニオ猪木との夢の対決のためにグレート・ムタのリングネームを再び名乗ったが、敗北した。10月、武藤と長谷はスーパーグレード・タッグリーグに出場し、トーナメントで2敗しただけで残りの試合に勝利し、14ポイントを獲得して10月30日の決勝に進出した。決勝では蝶野正洋とスーパーストロングマシンを破って優勝し、11月25日にヘルレイザーズとのIWGPタッグ王座戦に挑戦する権利を得た。武藤と長谷は勝利し、タッグチームとして2度目の王座獲得、武藤にとっては4度目の個人タッグ王座獲得となった。彼らは1995年1月4日に行われたバトル7で、シュタイナー・ブラザーズを相手に初防衛戦を成功させ、タイトルを防衛した。

2月3日、武藤はIWGPヘビー級王座挑戦者決定戦でスコット・ノートンに敗れた。しかし、 5月3日のレスリングどんたくで橋本真也とのタイトルマッチの機会を得て、橋本を破り2度目のIWGPヘビー級王座を獲得。その後、3日後の5月6日にIWGPタッグ王座を返上し、IWGPヘビー級王座の防衛に専念した。武藤は6月14日に天山広吉、7月13日にホーク・ウォリアーを相手にタイトルを防衛し、 8月にはG1クライマックスで優勝。決勝で橋本を破り、2000年に佐々木健介が達成するのと同じく、IWGPヘビー級王者としてG1クライマックスを制覇した2人のうちの1人となった。武藤はその後もIWGP王座を保持し続けた。9月25日、武藤は平田純二を相手にタイトルを防衛した。その後、武藤は新日本プロレスを率いて、高田延彦とUWF-i軍との抗争の幕開けを飾り、10月9日の4度目の防衛戦で高田を破った。武藤は12月11日、越中史朗を相手に5度目の防衛に成功し、その年を締めくくった。武藤は1996年1月4日、レスリングワールドで高田に敗れ、ついにタイトルを失った。

1996年後半、武藤は蝶野正洋のオオカミ軍団と対戦し、それが蝶野率いるnWoジャパンとの抗争へと発展した。その過程で、武藤はnWo側に寝返る可能性を匂わせ始め、アントニオ猪木の真の後継者だと宣言し、試合中に「偶然」自分のパートナーを攻撃した。この時期、武藤はビッグマッチで長いスランプに陥り、nWoのメンバーだけでなく、 1997年1月4日のレスリングワールドでのパワーウォリアーや6月5日のIWGPヘビー級王座戦での橋本真也など、新日本プロレスの仲間にも敗れた。寝返りは何度も匂わせられた。武藤はnWoのシャツを着て、数日後に蝶野軍への加入を拒否すると宣言することさえあった。武藤は抗争の両陣営で行動することでさらに混乱を招いた。本名で新日本プロレスのメンバーとして、またnWo Japanではグレート・ムタとして活動し、1997年に数ヶ月間はグレート・ムタとしてフルタイムで活動した。完全な転向は1997年9月に起こり、武藤はnWoのチームメイトを裏切ることをほのめかした後、佐々木健介と山崎和夫を裏切り、ムタという名前を封印し、正式に自身としてnWo Japanに加入した。その直後、彼と蝶野は新日本プロレスのタッグチームシーンを席巻し、10月19日に山崎と佐々木を破って2度目のIWGPタッグ王座を獲得し、王座の伝統に対する敬意を欠く行為としてベルトのプレートを黒くスプレー塗装した。彼らはタッグチーム部門での支配を続け、 12月8日の決勝で中西学と橋本真也を破ってスーパーグレードタッグリーグを制覇した。

1998年1月4日、武藤は東京ドームのファイナルパワーホールでメインイベントを務め、IWGPヘビー級王座をかけて佐々木健介に挑戦したが敗れた。4月21日、武藤と蝶野はIWGPタッグ王座を返上せざるを得なくなった。長年ムーンサルトプレスを使い続けた結果、武藤が膝を負傷したためである。この間、武藤は試合から一時的に離れ、1998年のG1クライマックス直前に復帰したが、1回戦で天龍源一郎に敗退した。復帰後も武藤はこの慢性的な怪我に悩まされ、1998年の残りの期間と1999年を通して痛みに耐えながら戦い続けた。1998年末、蝶野が首を負傷して試合に出られなくなったため、武藤はnWoジャパンのリーダーとなり、nWoをベビーフェイスのユニットに変えた。その後、武藤はチームメイトの小島聡とタッグを組み、12月6日の決勝で橋本真也と藤波辰巳を破り、スーパーグレードタッグリーグで優勝を果たした。

1999年1月4日のレスリングワールドで、武藤は蝶野正洋の右腕の一人であるスコット・ノートンを破り、3度目のIWGPヘビー級王座を獲得した。翌月、蝶野正洋が新日本プロレスに復帰し、武藤の哲学とnWoジャパンのリーダーシップについて意見が合わず、グループを離脱した。武藤は蝶野とnWoの名称を巡って抗争し、武藤、天山広吉、小島聡が率いるnWoと、蝶野自身、ドン・フライ、スーパーJ 、そして旧世代のnWoメンバーからなる蝶野の新チーム2000との間で抗争が勃発した。武藤はセントバレンタインデー大虐殺で佐々木健介、ストロングスタイルシンフォニーでチーム2000のドン・フライ、5月5日に天龍源一郎、7月20日に小島聡を相手にIWGPヘビー級王座を防衛した。

8月、武藤はG1クライマックスに出場し、藤波辰巳に1敗した以外はブロック内の他の試合に勝利し、中西学との決勝に進出したが敗北し、ファイナルドームで武藤と中西のIWGPヘビー級王座戦が行われ、武藤が防衛した。8月28日の神宮クライマックスで、武藤はグレート・ムタのキャラクターを復活させ、グレート・ニタとのノーロープ爆発有刺鉄線バリケード爆発地雷ダブルヘルデスマッチで勝利した。翌月、武藤は同門のスコット・ノートンと共にスーパーグレードタッグリーグに出場し、決勝で中西学と永田裕志を破って優勝した。12月10日、武藤はついに天龍源一郎にIWGPヘビー級王座を奪われた。 2000年のレスリングワールドイベントで、武藤は蝶野に敗れ、蝶野と武藤の抗争に敗れた。武藤はその後、負傷した膝のリハビリのため長期休養を取り、代わりにWCWでの最後のアメリカ遠征に専念した。こうしてnWoジャパンは蝶野のチーム2000に統合され、解散した。

レスリングワールド2001でFMWのハヤブサとのタッグマッチが予定されていたが、ハヤブサが両肘を負傷し再建手術が必要になったため中止となり、武藤はキャリアにおいて混乱した岐路に立たされたように見えた。しかし、彼はイメージを完全に変えることを選び、頭を丸刈りにし（2000年の大半は生え際がかなり後退していた）、顎鬚を伸ばし、長期間海外にいた新日本プロレスのレスラー、大谷晋二郎と組むことにした。2人は2001年1月4日のレスリングワールドで新日本に復帰し、中西学と獣神サンダー・ライガーをあっという間に倒した。その後まもなく、武藤は全日本プロレスにも出場し始め、キングスロード・ニューセンチュリーで太陽ケアを破ってデビューした。 2月18日、武藤は新トレードマーク技「シャイニングウィザード」を初披露し、村上和成を破った。この技は誕生以来、太平洋の両岸で武藤の仲間、ライバル、そしてファンによって非常に人気のある技となった。武藤は新日本プロレスとパートタイムで全日本プロレスの両方に出場し始め、ドン・フライ、大谷晋二郎と共に新たなユニットを結成し、後にバッドアス・トランスレート・トレーディング（BATT）として知られるようになった。^{[ 11 ]}彼らのメンバーには、全日本プロレスの太陽ケアとみちのくプロレスの新崎人生が加わった。武藤は4月14日のチャンピオン・カーニバル・ワンナイト・スペシャルで、全日本プロレスのベテラン、川田利明との夢の対決を制した。スーパーフォース・グループ宣言で、武藤は当時全日本プロレスのメンバーだった長谷弘を破り、長谷もBATTに加入した。

武藤はその後、2001年のG1クライマックスに出場し、小島聡に敗れた以外はブロックの全試合に勝利し、8月11日の準決勝に進出。準決勝では安田忠雄に勝利したが、翌日の決勝で永田裕志に敗れた。武藤はその後、9月23日にスコット・ホールを相手に新日本プロレスで初めて三冠ヘビー級王座の防衛戦を行い、王座を防衛した。武藤と長谷はその後、インディケート・オブ・ネクストで永田裕志と秋山準に敗れた。

武藤は10月22日、同門の太陽ケアと共に全日本プロレス世界タッグ王座を獲得し、さらにタイトルを積み重ねた。この試合では天龍源一郎と安城洋司が勝利した。武藤は10月27日、全日本プロレスの大会で蝶野正洋を相手に三冠ヘビー級王座を防衛した。翌日、新日本プロレスの大会で武藤とケアは西村修と藤波辰巳をタイトルマッチで破り、IWGPタッグ王座も獲得し、武藤は同時に6つのベルトを保有することになった。^{[ 12 ]}武藤とケアはその年のリアルワールドタッグリーグ決勝で永井光也と川田利明を破り優勝した。武藤は12月11日、新日本プロレスの大会で藤波辰巳を相手に三冠ヘビー級王座を防衛し、その年を締めくくった。

武藤は2002年1月4日、レスリングワールド2002で新日本プロレス所属選手として最後の試合を行い、チームメイトの長谷弘と共に西村修と藤波辰爾組を破った。その後、武藤は全日本プロレスに完全移籍し、その結果、2月2日にKeaと共にIWGPタッグ王座を剥奪された。

1990年11月のクラッシュ・オブ・ザ・チャンピオンズXIIIで、グレート・ムタが翌月のスターケード'90:コリジョンコースでワールド・チャンピオンシップ・レスリングに復帰し、ミスター・サイトーとタッグを組むことが発表された。スターケードでは、ムタはパット・オコナー記念タッグチームトーナメントでサイトーとタッグを組んだ。2人は準々決勝でニュージーランド・ミリシアを破り、準決勝ではビクター・ザンギエフとサルモン・ハシミコフ（ソ連代表）を破った。ムタとサイトーは決勝で当時のUSタッグチームチャンピオン、スタイナー・ブラザーズに敗れた。 ^{[ 13 ]}

武藤は1991年中、新日本プロレスで定期的に試合をしながら、WCWにも散発的に出場し続けた。彼はレッスルウォー91に出席している姿が映し出され、その後、1991年3月21日に東京で開催された新日本プロレスとWCWの合同イベント「スターケード」で、長年のライバルであるスティングを破った。武藤は、WCW世界ヘビー級王座のナンバーワン・コンテンダーを決めるため、ユナイテッドステイツ・ヘビー級王者レックス・ルーガーとの試合に出場した。6月12日のクラッシュ・オブ・ザ・チャンピオンズXVで、武藤はルーガーにピンフォール負けを喫し、ザ・グレート・アメリカン・バッシュ'91でリック・フレアーに挑戦する権利を獲得した。彼はその月にいくつかのハウスショーに出場した後、日本に戻った。^{[ 14 ]}

5月、彼は再びWCWに戻り、ハウスショーでニキータ・コロフと組んでビッグ・バン・ベイダーとリック・ルードとタッグマッチを行い始めた。 ^{[ 15 ]}彼は5月30日のWCWサタデーナイトでテレビに復帰し、3番勝負でブラッド・アームストロングを破った。6月7日、ムタはジョージア州アトランタのオムニで行われたハウスショーでスコット・スタイナーにピンフォール負けした。彼は連続ハウスショーでラリー・ジビスコと対戦して短い期間を終え、新日本プロレスに戻った。12月25日、彼はWCWに戻り、フロリダ州ジャクソンビルで行われたノンタイトルマッチでスティングに敗れ、再び短い期間を始めた。彼はハウスショーサーキットで再びスティングやスティーブ・オースティンと対戦した。12月28日、彼は4年連続でスターケードに出場し、バリー・ウィンダムと組んでブライアン・ピルマンと2コールド・スコーピオを破った。その夜遅く、ムタはウィンダムを破り、スターケード'92：バトルボウル – ザ・リーサル・ロッテリーIIバトルボウルで優勝した。

1994年4月17日、武藤はWCWに復帰し、スプリング・スタンピードでスタニング・スティーブ・オースチンとWCWユナイテッドステイツ王座をかけて対戦した。オースチンは反則勝ちを収めた。これが武藤の米国での最後の登場となり、その後約1年間は米国に姿を見せることはなかった。1995年2月19日、スーパーブロールIVの観客席に姿を見せるまで、武藤はWCWに復帰することはなかった。1995年5月21日、武藤はスラムボリー'95：レジェンド・リユニオンでポール・オーンドーフを破り、WCWに復帰した。

2000年初頭に膝を負傷した後、武藤は新日本プロレスを一時離れ、2000年半ばにWCWに復帰し、ヴァンピロとタッグを組んだ。しかし、WCWの末期のブッキングの悪さと衰退のため、武藤は1980年代後半から1990年代前半にかけての以前の人気を取り戻すことはできなかった。彼は2000年7月11日のサンダーのエピソードでテレビに復帰し、ザ・ジャング・ドラゴンズと組んでスリー・カウントとタンク・アボットと対戦した。1週間後、彼はニトロに登場し、ユナイテッドステイツ・ヘビー級選手権トーナメントの準々決勝でヴァンピロを破った。その夜遅く、彼は準決勝でマイク・オーサムにピンフォール負けした。 ^{[ 16 ]}彼はニュー・ブラッド・ライジングでヴァンピロと共にクロニックを破り、WCW世界タッグチーム選手権を獲得した。彼らは翌日のニトロでレイ・ミステリオとフベントゥード・ゲレーラのチームに敗れ、タイトルを失った。彼がWCWで最後に試合をしたのは、2000年9月23日にテキサス州ラボックで行われたハウスショーで、対戦相手はスティングだった。

WCWを退団した後、WCWとの契約に含まれていた競業避止条項により、彼はワールド・レスリング・フェデレーション（WWF）で試合に出場することができなかった。

新日本プロレス所属の武藤は、2001年に全日本プロレスにもパートタイムで出場し、ペイ・パー・ビューで川田利明や“ドクター・デス”スティーブ・ウィリアムズとシングルマッチで対戦した。2001年は、武藤が新日本プロレスでBATTを結成したことに加え、6月8日に全日本プロレスの三冠ヘビー級王座をかけて天龍源一郎に挑戦し、勝利したことで、武藤にとって新たな年となった。7月14日の武藤の初防衛戦では、ペイ・パー・ビューのメインイベントでスティーブ・ウィリアムズが武藤に三冠ヘビー級王座をかけて敗れ、乱闘騒ぎとなった。バックステージを去ったウィリアムズは、ゴミ箱を蹴り、泣きそうになり、アームパッドを地面に投げつけながら再び罵声を浴びせ、激しい罵詈雑言を浴びせた。^{[ 17 ]}こうした場面は従来の全日本プロレスでは見られず、ヴィンス・ルッソの脚本の「クラッシュTV」スタイルの特徴であった。これが最終的に武藤とウィリアムズの因縁の対決につながり、2002年まで続いた。

2002年1月11日、新日本プロレスとの1年間にわたるクロスプロモーションのアングルが終了した後、武藤敬司は小島聡と剣道嘉信を連れて全日本プロレスに専属選手として移籍し、日本のプロレス界に衝撃を与えた。全日本プロレス契約選手としての最初の試合で、武藤は1月14日に大洋ケアと共にマイク・バートンとジム・スティールを相手に世界タッグ王座を防衛した。その後、武藤は2月24日に川田利明に三冠ヘビー級王座を奪われた。スティーブ・ウィリアムズとの因縁の対決が再開し、武藤はペイ・パー・ビューでウィリアムズとシングルマッチを行ったが、ウィリアムズが勝利し、前年の敗北の雪辱を果たした。^{[ 18 ]} 4月、武藤は2002年チャンピオンカーニバルに参加し、ブロックで2敗しただけで残りの試合に勝利し、4月10日のノックアウトステージに進出した。準決勝で小島聡を、決勝でマイク・バートン（バート・ガン）を破り、トーナメントで優勝した。3日後のグランドチャンピオンカーニバルで、武藤は川田が負傷によりタイトルを返上せざるを得なくなったため空位となった三冠ヘビー級王座をかけて天龍源一郎と対戦した。武藤はこの試合に敗れた。翌月の5月12日、武藤はジョージ・ハインズ、カズ・ハヤシとタッグを組み、ジャイアント馬場6人タッグカップで優勝した。7月17日、武藤とケアはクロニックに世界タッグ王座を奪われた。

7月20日の日本武道館では、武藤は3つの異なるキャラクターで試合を行った。第2試合では「国士無双」としてカズ・ハヤシを破り、中盤の6人タッグマッチでは自身で試合を行い、最後から2番目の試合では「グレート・コージ」として小島聡を破り、グレート・ムタとして試合を行った。9月30日、有名な東京シティホテルで行われた全日本プロレス30周年記念パーティーで、馬場茂琴は武藤を全日本プロレスの新社長に正式に任命し、馬場家の全株式を武藤に譲渡した。^{[ 11 ] [ 19 ]}しかし、この地位にもかかわらず、武藤はプロモーションでフルタイムで試合を続けた。

10月27日のロイヤルロード30ジャイアントバトル・イン・ブドーカンファイナルバトルで、武藤はグレート・ムタの名で天龍源一郎を破り、2度目の三冠ヘビー級王座を獲得した。翌月、レスル1でノンタイトルマッチでボブ・サップに敗れた。その後、武藤はアニマル・ウォリアーと共にリアルワールドタッグリーグに参戦したが、トーナメントで勝ち進むことはできなかった。2003年1月13日、武藤は初防衛戦でザ・グラディエーターを破り、タイトルを防衛した。1月19日、武藤はゴールドバーグとタッグを組み、クロニックをタッグマッチで破ったが、この試合でクロニックは負傷し、引退を余儀なくされた。2月23日、武藤は橋本真也に三冠ヘビー級王座を奪われた。

タイトルを失った直後、武藤は2003年のチャンピオン・カーニバルに出場し、準々決勝でジョン・テンタを破ったものの、準決勝で嵐に敗れた。6月8日、武藤は嵐と組んで、空位となっていた世界タッグ王座決定トーナメントに出場し、準決勝でギガンテスとザ・グラディエーターを、決勝でジミー・ヤンと小島聡を破って優勝した。7月13日、武藤は川田利明に敗れ、トリプルクラウンヘビー級王座の挑戦者1位になれなかった。タッグ王座を防衛した後、武藤と嵐はリアルワールドタッグリーグに出場したが、トーナメントで勝ち進むことはできなかった。12月27日、武藤はアメリカに戻り、全日本プロレス対ROHの団体間対戦カードの一環として、団体間の「夢の」対戦カードが組まれたリング・オブ・オナーの興行に出場した。メインイベントでは、武藤はグレート・ムタとしてのペルソナに戻り、嵐とタッグを組んでプロフェシーのクリストファー・ダニエルズとダン・マフを破った。武藤と嵐は、2004年1月18日にカズ・ハヤシとサトシ・コジマにタッグタイトルを奪われた。

武藤はその後、全日本プロレスとラフリー・オブセス・アンド・デストロイの抗争を支援し、2003年秋から2004年秋にかけてはRO&Dメンバーとの試合に数多く出場した。2004年にはチャンピオン・カーニバルに出場し、4月20日の準決勝で大森孝雄、決勝で佐々木健介を破り優勝を果たし、成功を収めた。バトル・バンケットでは西村修に大勝利を収めた。11月には西村とタッグを組み、2004年リアルワールド・タッグリーグに出場したが、ブロックを勝ち進むことはできなかった。2005年にはリアライズで新日本プロレスの弟子である棚橋弘至を破った。7月26日には三冠ヘビー級王座をかけて小島聡に挑戦したが、タイトル獲得には至らなかった。 RO&Dとの抗争を続ける一方で、武藤と全日本プロレス所属の支持者たちはブードゥー・マーダーズとも抗争を始めた。11月、武藤は曙とタッグを組み、 2005年リアルワールドタッグリーグに出場。決勝でチーム3Dと対戦したが、敗れた。

2006年3月10日、武藤はグレート・ムタの異名を復活させ、三冠ヘビー級王座をかけて小島聡に挑戦したが敗れた。武藤は2006年のチャンピオン・カーニバルで敗れ、その年を通してブードゥー・マーダーズとの抗争を続けた。年末、武藤は川田利明と組んで2006年のリアルワールド・タッグリーグに出場し、総当たり戦で小島聡と天山広吉と8ポイントで同点となり、12月2日に両チームが決勝戦の対戦相手を決める試合を行った。この試合で武藤と川田は敗れた。12月15日、武藤は神無月と組んで天山広吉と原口昭正を破り、初代F-1タッグ王者となった。

武藤は2007年1月12日、イギリスデビューを果たし、ロンドンのベスナル・グリーンにあるヨーク・ホールで行われたリアル・クオリティ・レスリングの試合で、ノンタイトル戦でRQWヘビー級王者マーティン・ストーンを破った。2月17日、武藤はグレート・ムタとしてタッグマッチに出場し、田尻智と組んでゴールドダスティンと白使を破った。3月、武藤は2007チャンピオン・カーニバルに参加し、ブロックAで合計6ポイントを獲得。 3月30日の決勝で川田利明を破り、3度目の優勝を果たした。プロレスリング・ラブ・イン・ヨコハマでは、武藤は三冠ヘビー級王座をかけて鈴木みのるに挑戦したが、敗れた。

同年秋、武藤とパートナーのジョー・ドーリングは2007リアルワールドタッグリーグに出場し、12月9日の決勝で小島聡と諏訪魔を破り優勝した。これにより、2008年1月3日に小島とTARUを相手に世界タッグ王座戦に挑戦する権利を獲得し、武藤とドーリングは勝利した。4月、武藤は2008チャンピオンカーニバルに出場したが、2勝しか挙げられず、総当たり戦を突破できなかった。武藤とドーリングは5ヶ月間保持した世界タッグ王座を、6月28日に鈴木みのると太陽ケアに奪われた。

武藤は2008年初頭に新日本プロレスでIWGPヘビー級王座を獲得し、全日本プロレスのプロレスリング・ラブ・イン・両国 Vol.5で後藤洋央紀を相手にタイトル防衛に成功した。9月29日、武藤はグレート・ムタとして諏訪魔を破り、三冠ヘビー級王座を3度目の獲得を果たし、小島聡に次いで三冠ヘビー級王座とIWGPヘビー級王座を同時に保持した2人目のレスラーとなった。武藤はプロレスリング・ラブ・イン・両国 Vol.6で鈴木みのるを相手にタイトル防衛に成功した。武藤は浜良太と共に2008年のリアルワールドタッグリーグに出場したが、成功には至らなかった。

2009年、武藤は空位となっていたオールアジアタッグ王座決定トーナメントに林和也と組んで出場し、準々決勝で浜良太と近藤修司を破ったものの、準決勝で鈴木みのると野沢論外に敗れた。3月14日、武藤は三冠ヘビー級王座を高山善弘を相手に防衛した。武藤はトレードマークであるように高山をひどく流血させ、バリケード上でシャイニングウィザードを放った。しかし、試合中にマスクが剥がれ、大量に出血した。試合終盤、高山は武藤を圧倒したが、武藤はキックをドラゴンスクリューに切り返し、アジアンミストを仕掛けようとしたが、高山はそれを阻止し、エベレストスープレックスピンで武藤を倒し、試合に勝利した。武藤はその後、何が起こったのかショックを受けながらリングを後にした。

タイトルを失った後、武藤は2009年のチャンピオン・カーニバルに参加し、ブロックの5試合中4試合に勝利し、唯一敗北したのはカズ・ハヤシだった。その結果、武藤はトーナメントの準決勝に進出したが、そこで鈴木みのるに敗れた。武藤は1年間を通して、全日本プロレス代表としてブードゥー・マーダーズ、東京グレンタイ、F4と対戦した。11月、武藤は船木誠勝とタッグを組み、 2009年のリアルワールド・タッグリーグに参加した。この2人は河野正幸と諏訪魔を破り、トーナメントで優勝した。

2009年のリアルワールドタッグリーグ優勝により、武藤と船木正勝は2010年1月3日に鈴木みのる、太陽ケアとの世界タッグチーム王座戦に出場し、武藤と船木が勝利した。1月30日、武藤はグレート・ムタのギミックで、レッスルリユニオン4の週末にカリフォルニア州ロサンゼルスのプロレスリングゲリラに特別出演し、カイとタッグを組んでジョーイ・ライアンとスコット・ロストのチームを破った。^{[ 20 ]} 3月9日、武藤と船木は、武藤が膝の再建手術を受け、その年の残りの期間リングに上がれなかったため、タイトルを返上せざるを得なくなった。武藤は8月にプロレスリングラブ・イン・両国Vol.10でグレート・ムタとして全日本プロレスに復帰したが、テーブル、ラダー、チェアマッチでケンソーに敗れた。 9月10日、武藤はかつてのタッグパートナーである船木正勝とスペシャルリターンマッチで対戦し、30分時間切れ引き分けに終わった。^{[ 21 ]} 10月24日、武藤はカズ・ハヤシの持つ世界ジュニアヘビー級王座に挑戦したが、敗れた。12月12日、武藤と神無月は4年間保持していたF-1タッグ王座を浜良太と長州耕力に奪われた。

武藤は2011年1月1日と3日に後楽園ホールで行われたジュニアヘビー級とヘビー級のバトルロイヤルで優勝した。プロレスリングラブイン両国Vol.12では、武藤とケンソーがSMOP（曙と浜良太）を破り、世界タッグ王座を獲得。武藤にとって5度目にして最後の王座戴冠となった。オールトゥギャザーでは、武藤は小橋建太と組んで飯塚隆と矢野通をタッグマッチで破った。10月23日、武藤とケンソーはダーク・クエルボとダーク・オズに世界タッグ王座を奪われ、武藤の全日本プロレスでの最後の王座戴冠は幕を閉じた。

2011年6月7日、武藤は全日本プロレスの社長を辞任し、現役レスラーおよび監査役会メンバーとして団体に留まることを発表した。^{[ 19 ] [ 22 ]}武藤の決断は、全日本プロレスの興行のバックステージでタルが平井伸和を襲撃し、平井が試合後に脳卒中を起こしたという実際の事件に端を発している。武藤はこの事件の責任を取り、全日本プロレスはタルだけでなく、襲撃現場に居合わせた正田和彦、河野正幸、田中実も出場停止処分とした。 ^{[ 23 ]} 2011年の大半をミッドカードで大きな抗争もなく過ごした後、武藤は諏訪魔から三冠王座を奪取したノアの秋山準のメインチャレンジャーとなった。武藤はオール・トゥギャザーで小橋建太と再会し、秋山と大森隆男を破った。秋山は武藤にタイトルマッチを挑み、2012年3月20日に試合が行われたが、武藤は最終的に敗れた。

6月1日、武藤は米国に戻り、ニュージャージー州ラーウェイのプロレスリングシンジケート（PWS）に出場し、カイと組んでアンソニー・ニーズとサミ・キャラハンをタッグマッチで破った。^{[ 24 ]} 2012年11月、武藤とビジネスパートナーは、全日本プロレスの全株式をスピードパートナーズ株式会社に2億円で売却した。 [ ^{19 ] [ 25 ] [ 26 ] 2013}年6月1日、スピードパートナーズ社長の白石信夫が全日本プロレスの新社長に就任し、その過程で武藤の長年の右腕であった前社長の内田正幸を解任した。これにより武藤は2013年6月30日付けで同団体を辞任した。^{[ 19 ] [ 27 ] [ 28 ]}

武藤は2004年1月4日、レスリングワールドで全日本プロレスの一員として新日本プロレスに復帰し、ボブ・サップとタッグを組んで長天を破った。武藤は次にプロレスラー最強の大会に登場し、西村修とタッグを組んだが、棚橋弘至と中邑真輔組に敗れた。武藤は2005年に新日本プロレスでネクセスVIに1試合のみ出場し、ロン・ウォーターマンを破った。

その後、彼は2007年のレッスルキングダムIに登場し、かつてのパートナーでありライバルでもある蝶野正洋と再会し、新日本プロレスと全日本プロレスのレスラーが対戦する「スーパードリームタッグマッチ」で天コジを破った。

2008年1月4日、東京ドームで開催されたレッスルキングダムIIで、グレート・ムタとして後藤洋央紀を破った。4月27日、ムタは中邑真輔を破り、4度目のIWGPヘビー級王座を獲得した。これは2008年に新日本プロレスに2度目の出場であり、この勝利の8年4ヶ月前にタイトルを保持していなかった。中西学と真壁刀義を相手にタイトルを防衛した後、ムタは10月13日のデストラクションで元王者中邑真輔を相手にタイトルを防衛し、フランケンシュタイナーで防衛した。^{[ 29 ]} 2009年1月4日のレッスルキングダムIIIで、棚橋弘至が得意技のハイフライフローを2回使ってピンフォール勝ちし、元弟子の棚橋弘至にタイトルを奪われた。^{[ 30 ]}試合後、武藤は舞台裏で、半年以上かけてタイトルの価値を高めるために最善を尽くした末に棚橋に帯を渡し、新日本プロレスを退団して会社の発展に貢献したいと示唆した。^{[ 30 ]}武藤は10月12日、蝶野正洋のプロレスデビュー25周年を記念して新日本プロレスに2度目の登場を果たし、蝶野、小橋建太と組んで秋山準、中西学、小島聡の6人タッグマッチで勝利した。

2012年1月4日、武藤は新日本プロレスに復帰し、東京ドームで開催されたレッスルキングダムVIで内藤哲也とシングルマッチで対戦し勝利した。^{[ 31 ]} 1年後、同じく東京ドームで開催されたレッスルキングダム7で、武藤は負傷した橋本大地の代役として大谷晋二郎とタッグを組み、天山広吉と小島聡組に敗れた。^{[ 32 ]} 1年後、武藤は再び新日本プロレスに復帰し、東京ドームで開催されたレッスルキングダム8でグレート・ムタとしてタッグマッチに出場し、矢野通と組んで鈴木軍（鈴木みのる、シェルトン・エックス・ベンジャミン）に勝利した。試合で唯一のベビーフェイスだった武藤は、試合終盤に矢野を裏切ったが、誤って緑色の霧が鈴木に当たり、矢野がピンフォール勝ちを収めた。^{[ 33 ] [ 34 ]}

武藤は、グレート・ムタとして、 2019年4月6日に開催されたG1スーパーカードショーのオナーランブルに最後に出場した。これは彼にとって5年ぶりの同団体への出場となった。2020年2月19日、武藤はタイガー服部引退興行に登場し、同じく新日本プロレス出身の長州力、ザ・グレート・カブキ、長谷弘らと共演した。

2022年1月8日、レッスルキングダム16で、武藤は清宮海斗とタッグを組み、メインイベントでオカダ・カズチカと棚橋弘至組に敗れた。11月20日、武藤はグレート・ムタとして、ヒストリックX-オーバー大会で新日本プロレスでの最後から2番目の試合に出場した。同大会で、武藤はCHAOS（オカダ・カズチカと矢野通）とタッグを組み、ユナイテッド・エンパイア（グレート・オー・カーン、ジェフ・コブ、アーロン・ヘナーレ）を破った。2023年1月4日、レッスルキングダム17ナイト1で、武藤は棚橋弘至と海野翔太とタッグを組み、ロス・インゴベルナブレス・デ・ハポン（内藤哲也、SANADA、BUSHI）を破り、新日本プロレスでの最後の試合に出場した。武藤はレッスルキングダム17の2日目に登場し、ノア主催の武藤敬司グランドファイナルプロレス「ラストラブ」イベントの一環として、内藤に引退試合を挑んだ。