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高橋和希氏によって創作された『遊☆戯☆王』シリーズには、数多くのキャラクターが登場し、その多くはシリーズの舞台となる日本の架空の都市、ドミノシティの出身者である。物語の多くの要素がエジプトとその神話に影響を受けているため、エジプトのキャラクターも登場する。
『遊☆戯☆王』は、ゲーム好きでいじめられっ子の内気な少年、武藤遊戯を主人公とする物語です。千年パズルと呼ばれる古代の遺物を解いた後、遊戯の体はギャンブラーのような性格を持つ謎の精霊、闇遊戯の宿主となります。遊戯や仲間たちが心の闇を抱えた者たちに脅かされると、闇遊戯は姿を現し、相手の心の真の姿を明らかにする「闇のゲーム」を挑みます。敗者は「罰ゲーム」と呼ばれる暗黒の罰を受けることになります。シリーズを通して、遊戯とその仲間である城之内克也（ジョーイ・ウィーラー）、真崎杏子（ティー・ガードナー）、本田ヒロト（トリスタン・テイラー）、そして後に獏良了は、このもう一人の遊戯が、記憶を失った古代エジプト時代の名もなきファラオの精霊であることを知ることになります。彼らはファラオの記憶を取り戻す手助けをしようとする中で、試練にさらされる。謎めいた千年アイテムや、闇のゲームの力を持つ者たちと対峙し、命を賭けることになるのだ。
VIZ Mediaが出版した原作マンガの英語版では、ほとんどの人間キャラクターは元の日本語名を使用していますが、他の英語版遊☆戯☆王メディアでは名前が変更されています。日本語名（名字が姓字より先にくる）と英語マンガ名が最初に記載され、該当する場合は英語アニメ名が2番目に記載されます。また、4Kidsの英語吹き替え版では、暴力や性的描写が検閲または編集されており、キャラクターは死ぬ代わりに闇の領域に送られたり、一部のデザインが変更されたりしています。
声優：緒方恵美（1998年～1999年）、風間俊介（2000年～現在）（日本語版）、ダン・グリーン（4Kids版）（英語版）
武藤遊戯（むとう ゆぎ、英語アニメでは「 Muto」と表記。名前はおそらく遊戯（ゆぎ、ゲーム）に由来）は、物語のタイトルにもなっている共同主人公。彼は、古代エジプトの七つの千年アイテムの一つであり、古代エジプトのファラオの魂を宿す古代エジプトの遺物である千年パズル（せんねんパズル）を身につけている。彼は当初、このもう一つの人格を恐れていたが、時が経つにつれて彼を親しい友人と考えるようになる。また、彼は人格的にも成長し、闇遊戯の助けなしに敵を倒すことができるようになり、千年パズルに選ばれるにふさわしい人物であることを証明している。
彼の切り札は「ブラック・マジシャン」だ。
声優：緒方恵美（1998年～1999年）、風間俊介（2000年～現在）（日本語版）、ダン・グリーン（4Kids版）（英語版）
闇遊戯（あみ遊戯、英語アニメ版では「Yami Yugi」）は、本名アテム（アテム）で、物語のタイトルにもなっている共同主人公です。遊戯が千年パズルを解いた後、彼は遊戯の体に宿るようになります。遊戯や仲間が危険にさらされると、彼はパズルから現れ、遊戯の体を乗っ取って彼らを守ります。対戦相手に闇のゲームを挑み、勝利した場合や不正行為があった場合は罰としてペナルティゲームを与えます。シリーズを通して、彼は最終的にライバルとなる海馬瀬人と出会い、学校での最初の戦いとデス・Tで彼を倒します。また、シャディや闇バクラなど、他の千年アイテムの使い手とも出会います。
デュエリストキングダム編では、ダーク遊戯がペガサスとのビデオテープデュエルでタイマー切れで負けた後、ペガサスは双六の魂を奪ってデュエリストキングダムに来るように仕向け、双六は双六と対決して奪われた魂を取り戻すためにデュエリストキングダムにやって来る。そこで彼は複数の対戦相手と戦い、その後、試作型デュエルディスクを使って海馬とデュエルする。このデュエルでは、それぞれがスターチップを5枚ずつ賭ける。海馬のブルーアイズ・アルティメットドラゴンが倒された後、海馬は勝利するために自爆攻撃に訴えるが、遊戯が介入して海馬への攻撃を止めたため、ダーク遊戯は敗北する。海馬は城に入り、ダーク遊戯に助けられたお礼として追加のスターチップを受け取った舞が城に入るのを手伝う。舞を倒した後、ダーク遊戯はキースを倒した城之内と対決する。ペガサスとの戦いの最中、遊戯と闇遊戯はペガサスに心を読まれないように「マインドシャッフル」という戦術を考案し、ペガサスに千年アイテムに選ばれた者だけが耐えられる闇のゲームを開始させることに成功する。
遊戯が闇のゲームの影響で倒れた後、闇遊戯が支配権を握り、遊戯とその仲間たちの助けを借りて勝利する。彼らは「目」の力を封じ込めたのだ。その後、ペガサスは闇遊戯の要求に従い、盗まれた魂を解放するが、アイテムには邪悪な知性が宿っていると告げる。島を去る際、遊戯は闇遊戯に、出自に関わらず、彼は自分たちにとってかけがえのない友人だと伝え、自身の正体と出自を探る旅に出る。
最終的に、彼は元々は古代エジプトのファラオであるアテム（アテム）であり、ミレニアムパズル（元々はペンダントとして知られていた）の所有者であったことが明らかになる。彼はクル・エルナの破壊後、自身とゾークをその中に封印した。遊戯との最後のデュエルの後、彼は死後の世界へと旅立つが、『遊☆戯☆王 THE DARK SIDE OF DIMENSIONS』では、ディーヴァとの戦いで彼を助けるために戻ってくる。
声：森川智之（1998年 - 1999年）、高橋広樹（2000年 - 現在）（日本語）。ウェイン・グレイソン(4Kids) (英語)
城之内克也（じょうのうち 克也）は遊戯の親友。潮に殴られた城之内と本田を遊戯がかばったことで、城之内は自分が遊戯の「宝物」に嫉妬していたことに気づく。その夜、城之内は千年パズルの最後のピースを取り戻し、遊戯の家に持ち帰る。遊戯はパズルを完成させ、シリーズ最初の闇のゲームで潮に勝負を挑む。城之内は遊戯の行動に感動し、二人は親友となり、城之内自身の「宝物」となる。
素手での格闘に長けており、バンディット・キースのような自分より体格の大きい相手にも通常は立ち向かえるが（アニメ『遊☆戯☆王デュエルモンスターズ』では敗北）、ブルース・リュウのような相手には自らハンデを背負ってしまう。シリーズを通して、遊戯の助けを借りてドミノとデュエルモンスターズの腕を磨き、怒りを暴力ではなくゲームにぶつけることを学ぶ。その後、海馬が何かを企んでいると疑い、妹のためにデュエリストキングダムトーナメントとバトルシティトーナメントに参加する。優しく自己犠牲的な性格だが、時に傲慢で軽率な一面があり、超常現象を恐れている。
彼の切り札は「レッドアイズ・ブラック・ドラゴン」で、デュエリストキングダムで「恐竜」竜崎（レックス・ラプター）から勝ち取ったものです。
声優：和和由美（1998年～1999年）、斎藤真希（2000年～現在）（日本語）、 エイミー・バーンバウム（4Kids）（英語）
真崎杏子（まざきあず）は、遊戯の幼馴染で親友。運動神経抜群で、協力的で、学校への愛校心が強く、闇遊戯に片思いしている。遊戯ほどゲームが得意ではないが、RPGゲームには詳しく、城之内が熟練のデュエリストになる前は、学校で城之内を打ち負かしていた。アメリカでプロのダンサーになることを夢見ながら、密かにファストフード店「バーガーワールド」でアルバイトをしている。遊戯と城之内は、最初は彼女が選挙運動に参加していると思い込んで後をつけ、これらの秘密を知る。しかし、彼女は二人が自分を支え、秘密を守ってくれることに敬意を抱くようになる。
声優：置鮎龍太郎（1998年～1999年）、近藤孝之（2000年～2001年、2016年）、菊池秀弘（2001年～2004年）（日本語）； サム・リーゲル（第1話～第10話）、グレッグ・アビー（第11話～第224話／その他のメディア；第1話～第9話ノーカット版吹き替え）（英語）
本田ヒロト（Hiroto Honda / Tristan Taylor ）は、童実野高校1年B組の生徒で、遊戯、城之内、杏子、バクラと友達になる。漫画では、城之内のチンピラ仲間として登場し、野坂美穂に片思いしている。東映アニメでは、学校の美容科主任で、遊戯が自分と城之内を潮から救ったにもかかわらず、遊戯を嫌っている。野坂美穂への愛を城之内に告白した後、城之内に遊戯に頼んで、パズルの形で美穂へのラブレターを書くように説得する。蝶野先生がパズルを没収し、秘密のファンが白状しなければ美穂を罰すると脅すと、遊戯と城之内は自分たちが書いたと主張して城之内をかばう。蝶野さんは送り主を突き止めるためパズルを解こうと決意するが、闇遊戯は密かにそれを闇のゲームに変え、罰ゲームとして彼女の美しい顔を粉々に砕いてしまう。その後、本田は遊戯と親しくなるが、後に遊戯が直接デートに誘った際に美穂に断られてしまう。
アニメ『遊☆戯☆王デュエルモンスターズ』では、彼は城之内（ジョーイ）の妹である静香（セレニティ）に片思いしており、デューク（竜司）とはライバル関係にあり、しばしばセレニティの愛情を巡って彼と競い合っている。
声の出演：柏倉勉（1998年）、沼田祐介（ゲーム）、井上洋（2000年～2001年）、松本梨香（2001年～現在）（日本語）。テッド・ルイス(4Kids) (英語)
獏良了（ばくらりょう）は、転校生で、グループと仲良くなり、ゲーム、特にモンスター・ワールド（モンスター・ワールド）のようなテーブルトークRPGに興味を持っている。彼は千年リング（せんねんりゅう）の持ち主であり、遊戯や闇遊戯と同様に、体内に闇の精霊が宿っている。物語に登場する以前、獏良の母と姉のあまねは交通事故で亡くなり、闇獏良の罰ゲームによって友人の魂がRPGのミニチュアフィギュアに閉じ込められ、昏睡状態に陥ったため、彼は転校を繰り返して孤立していた。遊戯とその仲間たちの助けを借りて、彼らはモンスター・ワールドの闇ゲームで闇獏良を倒し、その後、彼は仲間になる。危険をはらんでいるにもかかわらず、獏良は千年リングの歴史に興味を持っているため、それを手放さない。彼の人を信じやすく純粋な性格も相まって、時として衝突を引き起こし、ダークバクラが彼の知らないうちに彼に憑依し続けることを許してしまう。
東映アニメでは、美穂は彼に片思いしている。デュエルモンスターズアニメでは、ダークバクラに操られていることが多く、グループに同行する機会が少ないため、漫画に比べて彼の役割は縮小されている。デュエリストキングダム編では、学校の知り合いとして登場し、テーブルトークRPGやオカルトデッキ作りへの愛着は控えめに描かれている。
4Kids版では、彼の声はイギリス英語のアクセントで話されている。
声：緑川光（1998年 - 1999年）、津田健次郎（2000年 - 現在、十代）、矢崎聖美（2000年 - 2004年、子供）（日本語）。エリック・スチュアート(4Kids) (英語)
海馬瀬人（かいば せと）は、遊戯のライバルであり、海馬コーポレーションの現社長兼CEOである。天才的な才能を持ち、冷酷なゲーマーとして登場し、目的のためなら手段を選ばないが、養父の五座半郎のせいで辛い幼少期を過ごした。双六が「青眼の白龍」のカードを持っていることを知った海馬は、遊戯からそのカードを盗み、闇遊戯とデュエルするが、敗北し、「死の経験」というペナルティゲームを課せられる。敗北後、海馬は自分が経験したペナルティゲームを忘れられず、デスTを使って復讐し、闇遊戯を殺そうと企てる。再び闇遊戯とデュエルするが敗北し、「精神崩壊」というペナルティゲームを受け、一時的に心が砕かれ、邪悪なものが浄化され、約1年間昏睡状態に陥る。改心したにもかかわらず、海馬は傲慢さと闇遊戯へのライバル意識を持ち続けている。彼はバトルシティ編以降は物語から姿を消しますが、アニメでは主要キャラクターであり、『遊☆戯☆王GX』ではデュエルアカデミーの創設者です。
漫画では、海馬はデス・Tの出来事の最中にソリッド・ビジョンを創造し、これは漫画『トランセンド・ゲーム』と映画『ダークサイド・オブ・ディメンションズ』でさらに詳しく描かれている。後者では、海馬はアテムを復活させて決着をつけようとする。海馬は「ブルーアイズ」デッキを使用し、エースモンスターは「ブルーアイズ・ホワイト・ドラゴン」である。
声優：三輪克恵（1998年）、野田順子（ゲーム）、竹内順子（2000年～現在）（日本語）； タラ・サンズ[ 1 ]（4Kids、2001年～2005年、2017年）、キャリー・ケラネン[ 1 ] [ 2 ]（4Kids、2005年～2006年）（英語）
海馬モクバ（かいばもくば）は、海馬瀬人の弟で、カプセルモンスターチェスの名手である。漫画では、モクバはわがままなガキとして描かれており、海馬を倒した遊戯に復讐しようと、よく遊戯を騙そうとする。海馬より先に遊戯を倒そうとし、勝ったら遊戯の指を切断すると脅迫したり、城之内を毒殺してから、城之内と遊戯に死の料理・ロシアンルーレットを挑んだりする。アニメ『遊戯王デュエルモンスターズ』では、モクバは海馬に忠実で、海馬の敗北の復讐に執着していないため、暴力的な面は少なく、遊戯の仲間に救出された後、遊戯のグループと仲良くなる。
声優：ゆかな
野坂ミホ（のさか みほ）は、漫画では一話限りの脇役だが、東映アニメでは主要キャラクターとして登場する。[3] 漫画では、遊戯とその仲間たちのクラスメイトで、ドミノシティ高校の生徒司書である。本田は彼女に片思いしており、ジグソーパズルの形をしたラブレターを渡そうとする。蝶野先生がメモを横取りすると、闇遊戯が本田を恥ずかしめようとする蝶野先生の企みを阻止する。本田がミホに直接尋ねると、彼女は彼を断る。それでも、本田は遊戯と友達になり、グループに加わる。東映アニメでは、三人称で自己紹介するミホは、遊戯と杏子の友達で、明るく親切で、友達と可愛いものが大好きである。シリーズを通して多くの男性キャストメンバーに片思いしているが、本田が彼女に恋しているにもかかわらず、彼女は友達として以外には本田に興味がない。頑固で策略家な一面もあるが、仲間を守るためなら躊躇しない。例えば、ワラシベが杏子、本田、城之内を毒殺しようとした時や、本田が死んだと思い込んだ後に彼のために戦うことを決意した時などが挙げられる。本田が生きていることを知った後、彼女は城之内と手を組み、海馬の命令で本田と双六を捕らえている不破龍一とアイリーン・ラオに立ち向かう。
美穂はデュエルモンスターズのアニメには登場しません。[ 4 ]しかし、スピンオフ/続編の遊☆戯☆王GXでは、彼女の名前はトルーマンの犠牲者の1人として挙げられており、遊城十代によって解放されるまで闇の世界に連れて行かれていました。
声の出演：柏倉務（1998年）、井上洋（2000年 - 2001年）、松本梨香（2001年 - 2004年、2016年）（日本語）。 テッド・ルイス(4Kids) (英語)
闇獏良（やみバクラ）は、このシリーズの主要な敵役である。彼は千年リングに宿る闇の精霊であり、闇の扉を開いて邪悪な力を得るために千年アイテムを求めており、自身に肉体がないためバクラの肉体を乗っ取っている。ペナルティゲームで友人の魂をフィギュアに閉じ込めたため、彼は転校を繰り返すことになったが、東映アニメでは遊戯たちの助けを借りて、モンスターワールドのラスボスであるダークマスターゾーク（ダーク・マスターゾーク）を倒し、一時的に闇獏良のバクラへの影響を浄化した。しかし、デュエリストキングダムの地下にある迷宮に閉じ込められたとき、闇獏良は心変わりしたと主張してバクラに再び千年リングを装着するように説得する。バクラの仲間たちがこのことを知らない間に、ダークバクラは迷宮兄弟の策略を出し抜くために考案されたゲームでダーク遊戯を助け、彼らは地上に戻る。
彼はグループを助け、彼らの信頼を得ようとし、バクラが彼の体をより自由に操れるようにしているように見えるが、彼らには知られていないが、彼はペガサスの眼窩から千年眼を引き抜いて殺害し、それを自分のものにした。彼の真の姿はダンジョンダイスモンスター編で明らかになる。竜司とのゲームで遊戯をサポートし、砕け散った千年パズルの破片を集めるのを手伝った後、彼は密かに自分の魂の一部を破片の一つに入れ、内部から真の扉を解き放とうとする。彼は、闇の扉を開き、パズルに封印された闇を解き放つことを目的として、闇ロールプレイングゲーム / ダークRPG (闇・Р・Р・гロール・プレイング・ゲーム、Yami Ā Pī Jī (Yami Rōru Pureingu Gēmu) )の準備のために千年アイテムが集まるまで出来事を操ろうとしている。バクラは知らなかったが、漫画の後半で、彼は自分の目的をさらに推し進める機会を得た際に、バクラの体を乗っ取る。
最終章では、クル・エルナ虐殺の唯一の生存者であり、千年アイテムを盗もうとしてエジプトへの復讐を企てた盗賊王バクラの魂が、千年リングに封印されたゾーク・ネクロファデスの破片と融合してダークバクラが誕生したことが明らかになる。ダークバクラは、ダーク遊戯が光の創造主ホラクシーを召喚してゾークを破壊した際に死亡する。アニメでは、ゾークの一部であり、最終決戦でゾークと融合したために死亡するが、漫画では、ゾークとブルーアイズの光によって破壊されたアケナデンに生命が繋がっていたために死亡する。
声優：高杉次郎（日本語）、ダレン・ダンスタン（4Kids）（英語）
ペガサス・J・クロフォード / マクシミリオン・ペガサス（ペガサス・Ｊ・クロフォード、ペガサス・ジェイ・クロフォード）は、インダストリアル・イリュージョンズの風変わりなアメリカ人会長であり、ゲーム「デュエルモンスターズ」 （デュエルモンスターズ、デュエルモンスターズ）（元々はマジック＆ウィザーズ（Ｍ＆Ｗ（マジック＆ウィザーズ）、マジックアンドウィザーズ））の作者です。彼はミレニアムアイ（千年眼、ミレニアムアイ、センネンガン、ミレニアムアイ）の持ち主です。彼は英語の漫画では「Maximillion J. Pegasus」として知られています。
漫画では、シャディとの出会いや、ミレニアムアイテムの「邪悪な知性」とされるものについての彼の話が、闇遊戯が自身の出自を探求するきっかけとなる。遊戯との最後の闇のゲームで、彼は王家の谷を旅した際に古代エジプトの闇のゲームを発見したことを遊戯に語り、それがデュエルモンスターズやカードゲーム全般の創造のインスピレーションとなったと述べる。アニメ『遊戯王デュエルモンスターズ』では、デュエルモンスターズの創造者であり、その古代エジプトのルーツを発見した人物として、ゲームとその起源に関する知識を持ち、重要な役割を担っている。
ペガサスは漫画では4番目の主要な敵であり、デュエルモンスターズアニメでは最初の主要な敵である。アニメでは、彼は遊戯にシャドウゲームを挑み、自分のトーナメント「デュエリストキングダム」に来させて自分と戦わせようとする。そのために、時間制限のある試合に負けた罰ゲームとして、双六の魂を奪い、ソウルプリズンデュエルモンスターズカードに閉じ込める。また、海馬をキングダムに誘い込むためにモクバを誘拐し、後に彼らの魂を奪う。回想シーンでは、ペガサスには恋人のシンディア（英語版アニメではセシリア）がいたことが明らかになる。シンディアは17歳の誕生日後、またはアニメでの結婚後に亡くなり、ペガサスは彼女を蘇らせようとしていた。この章の最後で、遊戯と闇遊戯はデュエルモンスターズの最終戦で彼を倒し、彼は奪った魂を解放する。その後まもなく、ダークバクラが彼を殺害し、千年眼を奪い取る。漫画版では、彼は死後の世界でセシリアと再会するが、アニメ版『遊☆戯☆王デュエルモンスターズ』では病に倒れる。決闘者の王国
彼は「トゥーン」デッキを使用しており、トゥーンワールドを使って自身のモンスターのトゥーンバージョンを作り出します。彼の切り札モンスターは「リリンキッシュ」です。
ミスタークラウン（MR・クラウン / 御伽父、Misutā Kuraun / Otogi-chichi）は、ビデオゲーム『ダンジョンダイスモンスターズ』ではシンディン・ザ・クラウンとして知られる、漫画に登場する敵キャラクターです。彼は、すごろくのカメゲームショップの向かいにあるゲームショップ「ブラック・クラウン」のオーナーです。かつて、すごろくは彼を弟子として迎え入れ、やがて二人は「悪魔のボードゲーム」と呼ばれるシャドウゲームで千年パズルの所有権をかけて対決しました。ゲームに敗れた後、罰ゲームによって一晩で50歳も年を取ってしまい、息子の竜司を通して復讐を企てました。彼は、漫画のストーリーラインに沿った映画『ダークサイド・オブ・ディメンションズ』にも登場し、ブラック・クラウンが焼失した後、竜司と共にカフェを開店します。
声優：岩永哲也（ティーンエイジャー）、木村明子（子供）（日本語）、ジョナサン・トッド・ロス（4Kids）（英語）
マリク・イシュタール（Marik Ishtar ）は、墓守の一族の跡継ぎであり、イシズ・イシュタールの弟である。ファラオへの憎しみから、義務を放棄して犯罪に手を染めた。幼い頃、墓守の入会儀式で熱した短剣で体に傷をつけられたことと、孤独な生い立ちが原因で、二重人格を発症した。一族の掟を破ったことで、彼の暗黒面が顕現し、父親を殺害した。しかし、養兄のリシドが彼の暗黒面を封印したため、彼は自分の行動の記憶を失い、父親の死はファラオのせいだと信じ込むようになった。父親の仇を討ち、一族の苦しみを終わらせるために、ファラオを殺すことに執着するようになった。この目的のために、彼は希少なデュエルモンスターズカードを盗み集める盗賊団「レアハンターズ」を創設し、千年ロッドを使って人々の精神を操る。幼い頃は純粋で優しかったが、次第に残酷で冷酷になり、自分の期待に応えられなかった部下を殺害したり、他人を傷つけることに喜びを見出すようになった。
声優：岩永哲也（日本語）、ジョナサン・トッド・ロス（4Kids）（英語）
闇マリク（Dark Marik / Yami Marik）は、マリクの内なる闇の人格であり、彼の苦痛と苦悩によって生み出され、バトルシティトーナメント編の主要な敵役を務める。闇マリクの出現を防ぐため、リシドは自分の顔に印を刻んだ。しかし、マリクの父が、マリクと妹のイシズが一族の掟を破ることを許した罰としてリシドを拷問した際、闇マリクが出現し、彼を殺害した（4Kids版ではシャドウレルムに送った）。これが、マリクのファラオへの復讐の旅の始まりとなった。
ダークマリクは暴力と他者の苦しみを楽しみ、自身の生存のみを気にかけ、通常のマリクの精神を破壊してその肉体を独占しようと企む。彼は千年ロッドと繋がっているが、ダーク遊戯やダークバクラとは異なり、マリクとは独立して存在している。バトルシティトーナメント準決勝で、リシドが城之内とのデュエル中にラーの力を制御する資格がないとして意識を失った後、ダークマリクが再び現れ、マリクの肉体を乗っ取る。マリクが遊戯に降伏した後、ダークマリクは消滅する。
天馬夜行（てんま やこ）は、『遊☆戯☆王R』に登場するキャラクター。マキシミリアン・ペガサスの弟子であり養子で、彼の死の復讐を企てている。
声優：美風仁志（#201～212）、石井浩司（#213～214）（日本語）、オリバー・ワイマン（4Kids）（英語）
神官アクナディン（Shinkan Akunadin）は、千年眼の守護者であり、アクネムカネン王の弟である。幼い頃から、兄がファラオの地位に就いていることに密かに嫉妬していた。千年魔術書（Sennen Majutsu Sho）に記された影の錬金術を用いて、クル・エルナ村の虐殺を密かに命じ、血と死体を溶かして金に変え、兄の王国を守るための千年アイテムを作り出した。復讐を企む者たちから家族を守るため、妻と息子セトを捨てた。セトはファラオ・アテムの宮廷の神官となったが、アクナディンは二人の関係を秘密にしていた。セトが捨てられた後に成功を収めたのを見て、アクナディンはセトが権力を握ることを目論むようになった。盗賊王バクラが自分の魂の一部を注ぎ込んだことで目覚めた千年眼の中にあるゾークの影響により、彼はファラオを殺さなければならないと確信し、ゾークと契約して闇の大神官（やみのだいしんかん）となる。
漫画では、アケナデンの魂は、アテムと共に千年パズルに封印された後、ゾークと融合し、最終章で解放された。彼のミイラは、闇バクラ側のシャドウRPGの2人目のプレイヤーとして使用され、アテムがゲームに勝利して彼の魂が滅ぼされる前の出来事をゲームが再現する過程で、彼自身の駒に影響を与えている。敗北すると、彼のミイラの頭蓋骨は真っ二つに割れる。デュエルモンスターズのアニメでは、闇バクラが彼の魂の一部を千年眼に入れた後、彼の精神は汚染され、千年アイテムを集めた後、ゾークから力を与えられ、闇の最高司祭に変身する。その後、セトが彼を物理的に殺害し、キサラが白龍の姿でセトの精神に入り込み、ファラオを殺害した際に、キサラが彼を完全に殺す。浄化された彼の魂（千年眼を初めて使用した瞬間の年齢に戻った）は、後にアテムが死後の世界への扉をくぐる際に、その扉の向こう側で彼の兄弟と共にいるのが目撃される。
声優：海藤義孝（日本語）、マイク・ポロック（4Kids）（英語）
ゾーク・ネクロファデス（大邪神 ゾーク・ネクロファデス）は、人間の心の闇から生まれた世界の破壊者であり、英語吹き替え版ではシャドウレルムの創造者です。彼は千年アイテムの力でアケナデンによって召喚され、王国を攻撃し、アテムの顧問を殺害しました。彼はメモリーワールドのラスボスであり、そこで遊戯とその仲間たちの助けを借りてアテムが彼を倒し、彼の復活を阻止し、その過程でバクラを千年リングから解放します。ダークバクラはゾークと盗賊王バクラの魂が融合して生まれ、漫画では、彼らの魂でできた存在で、自らを闇の大司祭ゾーク・ネクロファデスと名乗る存在が現れます。
レーザー タグ アサシンは、シューティング スターダスト (シューティング スターダスト) ゲームで遊戯とその友人たちを殺すために海馬が雇った 3人のプロの傭兵です。
プレイヤーキラー/エリミネーター（プレイヤーキラー、Pureiyaā Kirā）は、ペガサスがデュエリストキングダムトーナメント中に雇うデュエリストで、出場者にデュエルを挑み、スターチップを奪い、出場者が決勝に進出できないようにし、ペガサスが世界ナンバーワンのデュエリストとなり、海馬コーポレーションの新しいCEOにふさわしい人物となることを目的としている。
グールズ（Ghoulzu ）は、マリクに仕えるカード泥棒集団で、闇遊戯と海馬は彼らを「ゲーム界のグール」と呼んでいる。彼らはデュエリストからレアカードを盗んで売ることで、マリクに手下、レアカード、そして金銭を提供している。
ビッグファイブは元々海馬コーポレーションの幹部だったが、海馬の側に寝返った。海馬が勝利した後、彼はビッグファイブの工場を閉鎖し、海馬コーポレーションをゲーム会社として再建した。これにビッグファイブは憤慨し、ペガサスと手を組み、ペガサスが海馬コーポレーションの支配権を握れるように画策した。漫画版では、ペガサスの敗北後、ビッグファイブは解雇される。
アニメでは、海馬は仮想現実ゲームという形で和平の申し出をした彼らを解雇する。ゲームに閉じ込められたモクバは、遊戯たちに助けを求める。ビッグファイブは、五頭龍を召喚する儀式のために海馬を生贄に捧げるようウィッティ・ファントムをプログラムする。海馬が救出され、猿渡が仮想現実ポッドを停止させるために派遣された後、ビッグファイブはゲームを再プログラムして五頭龍が現れ、ドラゴンシールを起動してドラゴンモンスターだけが戦えるようにする。城之内、舞、モクバが敗北した後、遊戯と海馬はブラック・マジシャン・ソルジャーとブルーアイズ・アルティメット・ドラゴンを合体させてドラゴンマスターナイトを形成し、五頭龍を破壊する。遊戯、城之内、モクバがゲームから脱出した後、猿渡とその部下は海馬より先にビッグファイブにたどり着くために去る。
「バーチャルワールド」編では、ビッグファイブの精神は肉体から分離され、ノア・カイバに発見されるまで海馬コーポレーションのサイバースペースに閉じ込められていた。ノアは彼らに新たな肉体を得る機会を与え、彼らは遊戯たちに挑むが敗北し、消滅してしまう。英語版では、彼らはバーチャルワールドの様々な場所に閉じ込められ、後にそれらの場所は破壊される。
オリハルコンを使って世界征服を企てた組織。
ミレニアムワールドのストーリーアークでは、ダーク遊戯は失われた記憶の中を旅し、ダークバクラのテーブルトークRPG「闇のRPG」（闇のR・P・G、Yami no Ā Pī Jī）の中で、古代エジプトの旧知の人物たちとNPCとして出会う。このRPGは過去を舞台にしたキャンペーンである。
六神官は、七つの千年アイテムを命をかけて守り、ファラオのアテムに永遠の忠誠を誓う。アテムは、現代におけるアテムの魂である闇遊戯のプレイヤーキャラクターである。彼らは、3000年前（英語アニメでは5000年前）の古代エジプトにおけるアテムの治世中に彼に仕えた。シャドウゲームが人の運命を決めるために使われていた時代、神官たちは千年アイテムと魔術を使って、モンスタースピリットの形をとった犯罪者の魂（カ）を石板に引き抜いて封印し、戦わせた。RPGでは、キャラクターの体力と魔力はバゲージで表されていた。