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| ヤコバ | |
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| 溝と鞭毛が見えるヤコブシ科の4種: Jakoba libera (腹面図)、Stygiella incarcerata (腹面図)、Reclinomonas americana (背面図)、およびHistiona aroides (腹面図) | |
| 科学的分類 | |
| ドメイン： | |
| (ランク外): | |
| クラス： | |
| 注文： | |
| 家族： | パターソン 1990
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| 属: | ヤコバ パターソン 1990
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| タイプ種 | |
| ジャコバ・リベラ （ルイネン 1938）パターソン 1990
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| 種 | |
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ヤコバは、 Excavata分類群の属であり、 [1] [2]現在記載されている種は1つだけで、1990年にパターソンによって記載されたJakoba liberaであり、 [3]オランダの植物学者（藻類学、筋学、地衣類学）Jakoba Ruinenにちなんで命名されました。 [4]（以前記載されていたJakoba incarcerataはAndalucia incarcerataに改名され、 Jakoba bahamensis / Jakoba bahamiensisは正式に記載されていません。） [5]
外観と特徴
ヤコバは、海洋[6]や高塩分環境[5]に生息する小型の細菌食性動物鞭毛藻類 (ヤコビド類) です。2本の鞭毛を持つ自由遊泳性の栄養細胞で、長さは5～10マイクロメートルです。細胞は縦軸に沿って回転し、破片の圧縮による変形や「もがき」が起こらない限り、直線で遊泳することができます[6] 。摂食中、細菌は後部鞭毛によって生じる水流によって水柱から除去されます。この水流により、細菌は細胞の右腹側にある溝[7]に集まり、摂取と食胞 の形成を助けます[7]。
超微細構造
ヤコバの細胞成分は特に独特ではない。鞭毛基部近くに核が1 つ、ゴルジ体が1 つあり、ミトコンドリアクリステは平らで、他のプラティクリステ分類群との関連を示唆している。ヤコバのミトコンドリアは、細菌に似たミトコンドリアゲノムを持つため、進化論的に特に興味深い。ヤコバのミトコンドリアゲノムには他の真核生物群よりもかなり多くの機能遺伝子が含まれていることがわかっており、他のすべてのミトコンドリア真核生物ではウイルス型ポリメラーゼに置き換えられている祖先の真正細菌RNA ポリメラーゼを保持しているようだ。全体として、ヤコバのミトコンドリアゲノムは、他のどのミトコンドリアよりもプロテオバクテリアの祖先に似ているという点で、原始的に複雑である。[8]
ライフサイクル
ヤコバは二分裂により無性生殖する。有性生殖や嚢胞形成は観察されていない。[6]
分子配列データ
「 Jakoba libera株 ATCC 50422の環状ミトコンドリアゲノムは96.6 kbp の大きさです。配列決定はほぼ完了しています。現在、77 個の遺伝子が特定されていますが、イントロンは含まれていません。遺伝子間領域はゲノムの約 30% を占め、単位長が約 20 bp のタンデムリピートのクラスターが含まれています。転写された遺伝子は両方の DNA 鎖にあります。翻訳には標準遺伝コードが使用されます。コード化された遺伝子には、タンパク質コード化遺伝子 nad1、2、3、4、4L、5、6、cob、cox1、2、3、および atp6、8、9 を含むmtDNAによく見られる遺伝子、および大サブユニット (rnl) および小サブユニット (rns) rRNA 遺伝子と >22 tRNA遺伝子が含まれます。また、原生生物には典型的だが動物や真菌のmtDNAにはないタンパク質遺伝子も多数存在します。これらには、nad7、9、11、atp1、rpl2、5、6、14、16、rps2-4、11-14、19 が含まれます。また、J. libera のmtDNAによってコードされる固有の ORF も多数あります。」「J. libera のミトコンドリア遺伝子の多くは、他のミトコンドリアゲノムではまれであるか存在しませんが、細菌には存在します。これらのまれまたは固有のmtDNAによってコードされる遺伝子には、dpo、rpoB、C、rrn5、rnpB、tufA、yejU-W、およびいくつかのリボソームタンパク質遺伝子があります。」 「 J. liberaのmtDNAの遺伝子順序の比較は…」細菌には見られないが、細菌系統から原ミトコンドリアが分岐した後のミトコンドリアゲノムの進化の過程で明らかに現れたクラスターを示している。例としては、sdh3からnad5までのクラスター（5つの遺伝子を含む）、atp8-[trn]-rps4-atp9、nad11-nad1-cox11-cox3-tufAなどがある。」[9]
文化
現在、培養可能なヤコバ・リベラ菌株は3種類ある。無菌培養はできないが、細菌（クレブシエラ・アエロゲネス）を加えた最小培地で簡単に増殖できる[6]
類似の属
マラウィモナス属: 記載された種 1 種
カルペディエモナス様生物:
- カルペディエモナス
- ディスネクテス
- ヒカノネクテス
- エルゴビバムス
- キプフェリア
参考文献
- ^ Rodriquez-Ezpeleta, Naiara; Henner Brinkmann; Gertraud Burger; Andrew J. Roger; Michael W. Gray; Herve Philippe; B. Franz Lang (2007 年 8 月). 「真核生物樹の解明に向けて: ヤコブ類とケルコゾア類の系統学的位置」Current Biology . 17 (16): 1420–1425. doi : 10.1016/j.cub.2007.07.036 . PMID 17689961.
- ^ Simpson, AGB & Patterson, DJ 2001. コアヤコビドと発掘分類群について: Jakoba incarcerata の超微細構造。J. Euk. Microbial., 48: 480-492. https://doi.org/10.1111/j.1550-7408.2001.tb00183.x
- ^ パターソン、DJ 1990。深海堆積物由来の従属栄養性鞭毛虫 Jakoba libera (Ruinen、1938)。英国海洋生物学会誌 70: 381-393
- ^ ブルクハルト、ロッテ (2022). Eine Enzyklopädie zu eponymischen Pflanzennamen [同名植物名の百科事典] (pdf) (ドイツ語)。ベルリン: ベルリン自由大学植物園および植物博物館。土井：10.3372/epolist2022。ISBN 978-3-946292-41-8. 2022年1月27日閲覧。
- ^ ab "Jakoba libera". The Tree of Life Web Project. 2011年9月27日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年4月3日閲覧。
- ^ abcdef "Jakoba". 原生生物画像データベース。2006年9月22日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年4月3日閲覧。
- ^ ab 「Jakoba libera」。Encyclopedia of Life 。2012年4月3日閲覧。
- ^ 「Jakobida」。生命の樹ウェブプロジェクト。2019年11月29日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年4月13日閲覧。
- ^ 「Jakoba libera ミトコンドリアゲノム構成、遺伝子含有量、遺伝コード」 。 2012年4月3日閲覧。
- ^ 「ヤコビッド鞭毛藻類の紹介」。原生生物画像データベース。 2012年4月12日閲覧。