人間の体内に存在するタンパク質
| TGIF1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TGIF1、HPE4、TGIF、TGFB誘導因子ホメオボックス1 |
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| 外部ID | オミム:602630; MGI : 1194497;ホモロジーン: 7574;ジーンカード:TGIF1; OMA :TGIF1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 17番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 17|17 E1.3 | 始める | 71,151,200 bp [2] |
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| 終わり | 71,160,541 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 子宮内膜間質細胞
- 胆嚢
- 心室帯
- 精巣上体
- 直腸
- 胃粘膜
- 右子宮管
- 左子宮管
- 軟骨組織
- 腹部の皮膚
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| | トップの表現 | - 胎児の尾
- 性器結節
- 球形嚢
- 胚
- 外胚葉
- 耳小胞
- 耳板
- 胚葉上層
- リップ
- 原始的な線
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合
- タンパク質結合
- DNA結合転写因子活性
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的
- 転写コリプレッサー活性
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- 共SMAD結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 転写の調節、DNAテンプレート
- 遺伝子発現の負の調節
- 多細胞生物の発達
- 成長因子刺激に対する細胞反応
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- 転写、DNAテンプレート
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001278682 NM_001278684 NM_001278686 NM_003244 NM_170695
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NM_173207 NM_173208 NM_173209 NM_173210 NM_173211 NM_174886 NM_001374396 NM_001374397 |
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NM_001164074 NM_001164075 NM_001164076 NM_001164077 NM_009372 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001265611 NP_001265613 NP_001265615 NP_003235 NP_733796
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NP_775299 NP_775300 NP_775301 NP_775302 NP_775303 NP_777480 NP_001361325 NP_001361326 |
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NP_001157546 NP_001157547 NP_001157548 NP_001157549 NP_033398 |
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| 場所 (UCSC) | 18章: 3.41 – 3.46 Mb | 17章: 71.15 – 71.16 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ホメオボックスタンパク質TGIF1は、ヒトではTGIF1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]この遺伝子座では選択的スプライシングが観察されており、4つの異なるアイソフォームをコードする8つの変異体が記載されている。
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、非定型ホメオドメインの 3 アミノ酸ループ拡張 (TALE) スーパークラスのメンバーです。TALEホメオボックスタンパク質は、高度に保存された転写制御因子です。この特定のホメオドメインは、細胞レチノール結合タンパク質 II プロモーターから、以前に特徴付けられたレチノイド X 受容体応答要素に結合します。レチノイン酸応答要素の 9-cis-レチノイン酸依存性 RXR アルファ転写活性化を阻害する役割に加えて、このタンパク質はSMAD2の活性転写コリプレッサーであり、発達中および成人における核シグナルの伝達に関与している可能性があります。
臨床的意義
この遺伝子の変異は、脳の構造異常である全前脳症4型と関連している。 [7] また、中耳炎(中耳の炎症)のリスクとも関連している
。
インタラクション
ホメオボックスタンパク質 TGIF1 は、以下と相互作用することが示されています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000177426 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000047407 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Bertolino E、Reimund B、Wildt-Perinic D、Clerc RG (1996 年 2 月)。「TGT コアを認識し、レチノイド応答モチーフを機能的に妨害する新規ホメオボックスタンパク質」。J Biol Chem . 270 (52): 31178–88。doi : 10.1074/ jbc.270.52.31178。PMID 8537382 。
- ^ Gripp KW、Wotton D、Edwards MC、Roessler E、Ades L、Meinecke P、Richieri-Costa A、Zackai EH、Massagué J、Muenke M、Elledge SJ (2000 年 6 月)。「TGIF の変異が全前脳症を引き起こし、NODAL シグナル伝達をヒトの神経軸決定に結び付ける」Nat Genet . 25 (2): 205–8. doi :10.1038/76074. PMID 10835638. S2CID 24723063.
- ^ ab 「Entrez Gene: TGIF1 TGFB誘導因子ホメオボックス1」。
- ^ ab Pessah M, Prunier C, Marais J, Ferrand N, Mazars A, Lallemand F, Gauthier JM, Atfi A (2001 年 5 月). 「c-Jun はコリプレッサー TG 相互作用因子 (TGIF) と相互作用して Smad2 転写活性を抑制する」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (11): 6198–203. Bibcode :2001PNAS...98.6198P. doi : 10.1073/pnas.101579798 . PMC 33445 . PMID 11371641.
- ^ ab Melhuish TA、Wotton D (2000 年 12 月)。「カルボキシル末端結合タンパク質と Smad コリプレッサー TGIF の相互作用は、TGIF のホロプロセンセファリー変異によって阻害される」。J . Biol. Chem . 275 (50): 39762–6. doi : 10.1074/jbc.C000416200 . PMID 10995736。
- ^ Melhuish TA、Gallo CM、Wotton D (2001 年 8 月)。「TGIF2 はヒストン脱アセチル化酵素 1 と相互作用し、転写を抑制する」。J . Biol. Chem . 276 (34): 32109–14. doi : 10.1074/jbc.M103377200 . PMID 11427533。
- ^ Wotton D, Lo RS, Lee S, Massagué J (1999年4月). 「Smad転写コリプレッサー」. Cell . 97 (1): 29–39. doi : 10.1016/s0092-8674(00)80712-6 . PMID 10199400. S2CID 6907878.
さらに読む
- El-Jaick KB、Powers SE、Bartholin L、Myers KR、Hahn J、Orioli IM、Ouspenskaia M、Lacbawan F、Roessler E、Wotton D、Muenke M (2007)。「全前脳症に関連するTGIFの変異の機能解析」。Mol . Genet. Metab . 90 (1): 97–111. doi :10.1016/j.ymgme.2006.07.011. PMC 1820763. PMID 16962354 。
- Münke M、Page DC、Brown LG、Armson BA、Zackai EH、Mennuti MT、Emanuel BS (1989)。「45,X の全前脳症男性における Yp/18 転座の分子検出」。Hum . Genet . 80 (3): 219–23. doi :10.1007/BF01790089. PMID 3192211. S2CID 15442879.
- Overhauser J、Mitchell HF、Zackai EH、Tick DB、Rojas K、Muenke M (1995)。「18p11.3 における全前脳症の重要な領域の物理的マッピング」。Am . J. Hum. Genet . 57 (5): 1080–5. PMC 1801375 . PMID 7485158。
- Wotton D, Lo RS, Lee S, Massagué J (1999). 「Smad転写コリプレッサー」. Cell . 97 (1): 29–39. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80712-6 . PMID 10199400. S2CID 6907878.
- Yang Y、Hwang CK、D'Souza UM、Lee SH、Junn E、Mouradian MM (2000)。「3アミノ酸拡張ループホメオドメインタンパク質Meis2とTGIFは転写を異なる方法で制御する」。J . Biol. Chem . 275 (27): 20734–41. doi : 10.1074/jbc.M908382199 . PMID 10764806。
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- Pessah M、Prunier C、Marais J、Ferrand N、Mazars A、Lallemand F、Gauthier JM、Atfi A (2001)。「c-Jun はコリプレッサー TG 相互作用因子 (TGIF) と相互作用して Smad2 転写活性を抑制する」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 98 (11): 6198–203。Bibcode : 2001PNAS ...98.6198P。doi : 10.1073/pnas.101579798 . PMC 33445 . PMID 11371641。
- Yu X、Li P、Roeder RG、Wang Z (2001)。「スプリットアミノ末端エンハンサーによるアンドロゲン受容体介在転写の阻害」。Mol . Cell. Biol . 21 (14): 4614–25. doi :10.1128/MCB.21.14.4614-4625.2001. PMC 87125. PMID 11416139 。
- Wotton D、 Knoepfler PS、Laherty CD、Eisenman RN、Massagué J (2001) 。「Smad 転写コリプレッサー TGIF が mSin3 をリクルートする」。Cell Growth Differ。12 ( 9): 457–63。PMID 11571228。
- Sharma M、Sun Z (2002)。「5'TG3'相互作用因子はSin3Aと相互作用し、AR媒介転写を抑制する」。Mol . Endocrinol . 15 (11): 1918–28. doi : 10.1210/mend.15.11.0732 . PMID 11682623。
- Dintilhac A, Bernués J (2002). 「HMGB1 は短いアミノ酸配列を認識することで、一見無関係と思われる多くのタンパク質と相互作用する」J. Biol. Chem . 277 (9): 7021–8. doi : 10.1074/jbc.M108417200 . hdl : 10261/112516 . PMID 11748221.
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- Chen F, Ogawa K, Nagarajan RP, Zhang M, Kuang C, Chen Y (2003). 「TG相互作用因子のトランスフォーミング成長因子ベータによる調節」. Biochem. J. 371 ( Pt 2): 257–63. doi :10.1042/BJ20030095. PMC 1223316. PMID 12593671 .
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- Dubourg C、Lazaro L、Pasquier L、Bendavid C、Blayau M、Le Duff F、Duruo MR、Odent S、David V (2004)。「全前脳症スペクトラムの特徴を持つ患者における SHH、ZIC2、SIX3、および TGIF 遺伝子の分子スクリーニング: 変異レビューと遺伝子型と表現型の相関関係」。Hum . Mutat . 24 (1): 43–51. doi :10.1002/humu.20056. PMID 15221788. S2CID 34076824。