ホロミコタ

ホロミコタ^{[ 3 ]}またはヌクレトミセアは、ホロゾアの姉妹群として基底的なオピストコントクレード。これは、ヌクレアリ科とも呼ばれるクリスティディスコイデアと菌界から構成されています。ヌクレアリ科は単細胞の自由生活性食作用性アメーバ^{であり[ 4 ]}、ホロミコタの最も初期の系統と考えられています。これは、動物と菌類が共通の単細胞祖先から独立して複雑な多細胞性を獲得し、浸透栄養性生活様式（菌類の特徴の1つ）がこの真核生物系統の分岐の後に生じたことを示唆しています。オピストスポリディアは、最近提案された分類群であり、アフェリド^{[ 5 ]}、ミクロスポリディア、クリプトミコタの3つの内部寄生虫のグループを含みます^{[ 6 ]}。

Rozella ( Cryptomycota ) は、少なくとも生活環のいくつかの段階でキチンが観察されている最も初期に分岐した真菌属^{です。 [ 6 ]}ただし、キチン質の細胞壁(真菌のもう 1 つの特徴) と浸透栄養は、遊走子段階で鞭毛などの祖先の特徴をまだ保持しているBlastocladiomycotaとChytridiomycotaの共通祖先に由​​来しています。 ^{[ 7 ]}特徴的な菌糸成長を持つ真菌のグループ、 Zoopagomycota、 Mucoromycotina、およびDikarya は、約 7 億年前に共通祖先から派生しました。 ^{[ 7 ]} Zoopagomycota は主に動物または他の真菌の病原体であり、Mucoromycotina は寄生生物、腐生生物、または外生菌根を含むより多様なグループです。 ^{[ 6 ]}ディカリヤは子嚢菌類と担子菌類を含むグループであり、記載されている菌類種の約98%を占めています。 ^{[ 7 ]}この多様性の豊かさから、ディカリヤには菌糸や単細胞酵母（モデル生物であるサッカロミセス・セレビシエなど）から、キノコとしてよく知られている複雑な多細胞菌類まで、形態的に大きく異なるグループが含まれています。 ^{[ 7 ]}複雑な多細胞性を持つ動物や陸上植物とは対照的に、推測される系統関係は、菌類が子嚢菌類と担子菌類の進化の過程で複数回多細胞性を獲得し、失ったことを示しています。 ^{[ 8 ]}

系統樹は、Philippe Silar ^{[ 9 ]}および「菌類：基礎および応用研究のための実験システムとしての菌類に関する包括的な論文」^{[ 10 ] [ 11 ]の研究に基づいて、菌類と他の生物との近縁関係を示しています。ホロミコタの系統樹は、Tedersoo ら[ 12 ] [ 13 ] [ 14 ]}に従っています。