ハプログループ L0

ハプログループ L0
ハプログループ L0
起源の可能性のある時期	130〜200ka
起源地の可能性	南アフリカまたは南東アフリカ
祖先	L（ミトコンドリア・イブ）
子孫	いいぞ、いいぞ
突然変異の定義	263!、1048、3516A、5442、6185、9042、9347、10589、12007、12720

ハプログループ L0 は、ヒトのミトコンドリア DNA (mtDNA) ハプログループです。

起源

ティシュコフがミトコンドリアの多様性が最も高いと発見したアフリカの地域（緑）と、ベハールらが人類の最も古い分裂が始まったと仮定した地域（薄茶色）

L0 は、共通の人間の母系系統の最も最近の共通祖先(MRCA) からの 2 つの分岐のうちの 1 つです。ハプログループは 5 つの主要な分岐 (L0a、L0b、L0d、L0f、L0k) で構成されています。そのうちの 4 つは、もともと L1 サブクレード (L1a、L1d、L1f、L1k) に分類されていました。

2014年、南アフリカで2,330年前の男性狩猟採集民の骨格の古代DNA分析が行われ、標本がL0d2c1c mtDNAサブクレードに属することが判明した。この母系ハプログループは現在、先住民サン族のサブグループであるジュ族と最も密接に関連しており、この地域の人口の連続性を示している。^[4] 2016年には、ボツワナ北部のトゥリ地域から出土した後期鉄器時代の乾燥ミイラもハプログループL0に属することが判明した。^[5]

分布

L0はサハラ以南のアフリカで最も多く見られます。コイサン族では平均73%で最も高い頻度で見られます。^[6]最も頻度が高い国には次のような国があります: ^[7] ナミビア( !Xun ) 79%、南アフリカ( Khwe /!Xun) 83%、ボツワナ( !Kung ) 100%。

ハプログループL0dは南アフリカのコイサン族に見られ、コイッド側に近い（L0kに続いて）が、主にコイサン全体に限定されている。^[7]^[8]^[9]^{[10] L0dは南アフリカの}カラード人口の一部にもよく見られ、頻度は60％^[11]から71％の範囲である。^[10] これは、南アフリカのカラード人口の一部に対するコイサン人の母系の影響が非常に大きいことを示している。

ハプログループ L0kは、コイサン族の中で 2 番目に多いハプログループで、サニド族に近い (L0d に次いで) が、主にコイサン族全体に限定されている。^[7]^[8]^[9]^[10]コイサン族に関連する L0d ハプログループは、南アフリカのカラード人口の一部で高頻度に発見されたが、L0k はカラードの大規模な集団を対象とした 2 つの研究では観察されなかった。^[10]^[11]

ハプログループ L0fは、東アフリカのタンザニアのサンダウェ族の間で比較的低い頻度で存在します。

ハプログループL0aは、南東アフリカの人口に最も多く見られます（モザンビークでは25% ）。^[6]ギニア人の間では、頻度は1%から5%で、バランタ族では約11%の増加頻度を示しています。ハプログループL0aは約33,000年前の旧石器時代のもので、10,000年から4,000年前にギニアに到達したと考えられます。また、ムブティ族やビアカ族のピグミーにもよく見られます。L0aはハドラマウト（イエメン）でほぼ25%の頻度で見られます。^[12]

ハプログループ L0bはエチオピアに存在します。

薬物と病気の相互作用

HIV治療薬スタブジンを投与された患者では、ハプログループL0a2は副作用として末梢神経障害が発生する可能性が高いことが示されています。 ^[13]

サブクラス

木

このハプログループL0サブクレードの系統樹は、マンニス・ヴァン・オーブンとマンフレッド・カイザーによる論文「ヒトミトコンドリアDNA変異の包括的系統樹の更新」^[3]とその後の発表された研究に基づいています。

最も最近の共通祖先 (MRCA)
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    - L0d1'2
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        L0d2c1c ^[14]
  - 愛してる
    - 見て
      - 見る1
      - 見る2
    - ラブ
      - いいえ
        いいえ
        
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      - ロアブ
        ロア
        L0a1
        L0a1a
        Ｌ０ａ１ａ２
        
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        L0a1b1a
        
        Ｌ０ａ１ｂ２
        
        低濃度
        
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        L0a2
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        Ｌ０ａ２ａ１
        L0a2a1a
        L0a2a1a1
        
        L0a2a1a2
        
        Ｌ０ａ２ａ２
        ロア2ア2ア
        
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        ロア2バ
        
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        Ｌ０ａ３
        
        L0a4
        
        ロブ

参照

参考文献

^ 推定値 168.5 ka (136.3–201.1 ka 95% CI ) 、Heinz, Tanja; et al. (2017)による。「アフリカ人のミトコンドリア DNA ツリーの更新: 法医学および集団遺伝学への関連性」。Forensic Science International: Genetics . 27 : 156–159. doi :10.1016/j.fsigen.2016.12.016. PMID 28086175。(表 2)。150 ka は、Soares, Pedro、Ermini, Luca、Thomson, Noel、Mormina, Maru、Rito, Teresa、Röhl, Arne、Salas, Antonio、Oppenheimer, Stephen、MacAulay, Vincent (2009) で提案されています。「浄化選択の補正: 改良されたヒトミトコンドリア分子時計」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。84 (6): 740–59。doi :10.1016/ j.ajhg.2009.05.001。PMC 2694979。PMID 19500773 。。
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^ 南アフリカの先牧畜民から初めて古代ミトコンドリアヒトゲノムが発見された

外部リンク

一般的な
- イアン・ローガンのミトコンドリアDNAサイト
- マニス・ヴァン・オーヴェンのフィロツリー
ハプログループ L0
- YFull MTree のハプログループ L0
- MITOMAPのハプログループL0
- Rosa, Alexandra; Brehm, Antonio; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Villems, Richard (2004). 「西アフリカギニア人の MtDNA プロファイル: セネガンビア地域の理解を深めるために」Annals of Human Genetics . 68 (4): 340–52. doi :10.1046/j.1529-8817.2004.00100.x. hdl : 10400.13/3044 . PMID 15225159. S2CID 15391342.アフリカの完全な配列に関するこれまでの知識に基づいて、側系統群 L1 は、以前に定義された L1a および L1d 系統を捕捉する 2 つの単系統群 L0 と、L1b および L1c 系統を含む L1 系統に分割されます…
- Pavesi, A. (2005). 「先史時代まで遡る人類の移動パターンの追跡における JC ポリオーマウイルスの有用性」。一般ウイルス学ジャーナル。86 (5): 1315–26。doi : 10.1099/vir.0.80650-0。PMID 15831942。一方、mtDNA の最初の軸は、祖先ハプログループ L0 を左端に配置します。これは、 L0 が 1 つの系統を生み出したためです…
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[1] 推定値 168.5 ka (136.3–201.1 ka 95% CI ) 、Heinz, Tanja; et al. (2017)による。「アフリカ人のミトコンドリア DNA ツリーの更新: 法医学および集団遺伝学への関連性」。Forensic Science International: Genetics . 27 : 156–159. doi :10.1016/j.fsigen.2016.12.016. PMID 28086175。(表 2)。150 ka は、Soares, Pedro、Ermini, Luca、Thomson, Noel、Mormina, Maru、Rito, Teresa、Röhl, Arne、Salas, Antonio、Oppenheimer, Stephen、MacAulay, Vincent (2009) で提案されています。「浄化選択の補正: 改良されたヒトミトコンドリア分子時計」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。84 (6): 740–59。doi :10.1016/ j.ajhg.2009.05.001。PMC 2694979。PMID 19500773 。。

[2] 年齢推定値 (ka、角括弧内は95% CI): ML 全mtDNA 年齢推定値: 128.2 [95% CI: 107.9-148.9]、ρ 全mtDNA 年齢推定値: 121.3 [99.2;143.7]、ρ 同義年齢推定値 (ka): 131.0 [97.8;164.2]: Rito T、Richards MB、Fernandes V、Alshamali F、Cerny V、Pereira L、Soares P.、「The first modern human dispersals across Africa」、PLoS One 2013 年 11 月 13 日、8(11):e80031。doi: 10.1371/journal.pone.0080031。

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[5] Frank J. Rühli、Maryna Steyn、Morongwa N. Mosothwane、Lena Öhrström、Molebogeng K. Bodiba、Abigail Bouwman (2016年1月～2月)。「ボツワナ、トゥリブロックで発見された後期鉄器時代のミイラの放射線学的および遺伝学的分析」(PDF)。South African Journal of Science。112 ( 1/2)。 2016年6月21日時点のオリジナル(PDF)からアーカイブ。 2016年4月26日閲覧。

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[Tishkoff-7] Tishkoff, SA; Gonder, MK; Henn, BM; Mortensen, H.; Knight, A.; Gignoux, C.; Fernandopulle, N.; Lema, G.; Nyambo, TB (2007). 「mtDNA と Y 染色体の遺伝的変異から推定されるアフリカのクリック語話者集団の歴史」.分子生物学と進化. 24 (10): 2180–95. doi : 10.1093/molbev/msm155 . PMID 17656633.

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[14] 南アフリカの先牧畜民から初めて古代ミトコンドリアヒトゲノムが発見された

起源

分布

薬物と病気の相互作用

サブクラス

木

参照

参考文献

外部リンク

関連するトピック

南アフリカ

南東アフリカ

L

ミトコンドリア・イブ