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| ＨＭＧＡ１ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| エイリアス | HMGA1、HMG-R、HMGA1A、HMGIY、高機動性グループ AT フック 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：600701; MGI : 96160;ホモロジーン: 128226;ジーンカード：HMGA1; OMA :HMGA1 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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高移動度群タンパク質HMG-I/HMG-Yは、ヒトではHMGA1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
この遺伝子は、誘導性遺伝子転写、DNA複製、ヘテロクロマチン構成、 レトロウイルスの染色体への統合、癌細胞の転移進行 の調節など、多くの細胞プロセスに関与する非ヒストンクロマチンタンパク質をコードします。
HMGA1 タンパク質は非常に小さく (約 10-12 kDa)、基本的な分子であり、RGRP (Arg-Gly-Arg-Pro) コア モチーフを持つ 3 つのAT フック、2 番目と 3 番目の AT フックの間に位置する新しい架橋ドメイン、およびHMGA、HMGB、および HMGN タンパク質を含むHMGファミリーに特徴的なC 末端酸性テールで構成されています。
HMGA1-GFP 融合タンパク質は、生体内で非常に動的です ( FRAP分析を使用して決定)。一方、生体外では AT に富む DNA に対してナノモルレベルの親和性を示します (生化学的に決定)。これは、生体内での広範な転写後修飾によるものと説明できます。HMGA1 は、AT フックを使用して、二本鎖 DNA 内の AT に富む領域の副溝に優先的に結合します。溶液中では二次構造がほとんどありませんが、DNA や他のタンパク質などの基質に結合すると、明確な立体構造をとります。HMGA1 タンパク質は、多様な翻訳後修飾を大量に受けており、主に核、特にヘテロクロマチンに存在しますが、ミトコンドリアや細胞質にも存在します。
最近、HMGA1タンパク質、HMGA1aとHMGA1bは、試験管内でDNA繊維を架橋し、生体内でクロマチンのクラスタリングを誘導できることが示され、ヘテロクロマチン組織化におけるHMGA1タンパク質の構造的役割を示唆している。[7]
この遺伝子には、2つの異なるアイソフォーム（HMGA1a、HMGA1b）をコードする少なくとも7つの転写変異体が見つかっています。[8] 2つのATフックのみを持ち、酸性テールを持たないスプライス変異体HMGA1cは、HMGAファミリーの真のメンバーであるかどうか議論されています。
HMGA1の変異体を欠損したマウス、すなわちHmga1-/-マウスは糖尿病を発症し、心臓肥大を示し、インスリン受容体の発現レベルが低い。[9]
インタラクション
HMGA1はCEBPB [10]およびSp1転写因子[10]と相互作用することが示されている。
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000137309 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000046711 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Friedmann M, Holth LT, Zoghbi HY, Reeves R (1993年9月). 「ヒトHMG-I(Y)非ヒストンタンパク質遺伝子の構成、誘導発現および染色体局在」. Nucleic Acids Research . 21 (18): 4259–67. doi :10.1093/nar/21.18.4259. PMC 310059. PMID 8414980 .
- ^ Reeves R、Beckerbauer L (2001 年5 月)。「HMGI/Y タンパク質: 転写とクロマチン構造の柔軟な調節因子」。Biochimica et Biophysica Acta ( BBA ) - 遺伝子構造と発現。1519 (1–2): 13–29。doi :10.1016/S0167-4781(01)00215-9。PMID 11406267 。
- ^ Vogel B、Löschberger A、Sauer M 、Hock R (2011 年 9 月)。「HMGA1 を介した DNA の架橋は DNA の足場を示唆する」。核酸研究。39 (16): 7124–33。doi : 10.1093/nar/ gkr396。PMC 3167630。PMID 21596776。
- ^ 「Entrez Gene: HMGA1 高移動度グループ AT-hook 1」。
- ^ Semple RK (2009). 「DNAの曲げから糖尿病へ：HMGA1の興味深い事例」Journal of Biology . 8 (7): 64. doi : 10.1186 /jbiol164 . PMC 2736670. PMID 19664187.
- ^ ab Foti D, Iuliano R, Chiefari E, Brunetti A (2003年4月). 「Sp1、C/EBPベータ、HMGI-Yを含む核タンパク質複合体がヒトインスリン受容体遺伝子の転写を制御する」.分子細胞生物学. 23 (8): 2720–32. doi :10.1128/MCB.23.8.2720-2732.2003. PMC 152545. PMID 12665574 .
さらに読む
- Hui H、Perfetti R (2002 年 2 月)。「膵臓十二指腸ホメオボックス 1は、胚発生中の膵臓の発達と成人期の膵島細胞の機能を制御する」。European Journal of Endocrinology。146 (2): 129–41。doi : 10.1530/ eje.0.1460129。PMID 11834421 。
- Van Maele B、Debyser Z (2005)。「HIV- 1の統合: HIV-1 インテグラーゼ、細胞およびウイルスタンパク質の相互作用」。AIDS レビュー。7 (1): 26–43。PMID 15875659 。
- Van Maele B、Busschots K、Vandekerckhove L、Christ F、Debyser Z (2006 年 2 月)。「HIV- 1統合の細胞補因子」。生化学科学の動向。31 (2): 98–105。doi : 10.1016 /j.tibs.2005.12.002。PMID 16403635 。
- Reeves R、Nissen MS (1990年5 月)。「哺乳類の高移動度グループ I 染色体タンパク質の AT-DNA 結合ドメイン。DNA 構造を認識するための新しいペプチド モチーフ」。The Journal of Biological Chemistry。265 ( 15): 8573–82。doi : 10.1016 / S0021-9258 (19)38926-4。PMID 1692833。
- Nissen MS、Langan TA、Reeves R (1991 年 10 月)。「cdc2 キナーゼによるリン酸化は、高移動度グループ I 非ヒストンクロマチンタンパク質の DNA 結合活性を調節する」。The Journal of Biological Chemistry。266 ( 30): 19945–52。doi : 10.1016 / S0021-9258 (18)54874-2。PMID 1939057。
- Eckner R 、 Birnstiel ML (1989 年 8 月)。「ヒト HMG I および HMG Y タンパク質をコードする cDNA のクローニング:両方ともオクタマー配列モチーフに結合できる」。核酸研究。17 (15): 5947–59。doi :10.1093/nar/17.15.5947。PMC 318252。PMID 2505228 。
- Johnson KR、Lehn DA 、 Reeves R (1989 年 5 月)。「哺乳類染色体高移動度グループタンパク質 HMG-I および HMG-Y をコードする mRNA の代替処理」。分子細胞 生物学。9 (5): 2114–23。doi :10.1128/mcb.9.5.2114。PMC 363005。PMID 2701943。
- Palvimo J、Linnala-Kankkunen A (1989年10月)。「カゼインキナーゼIIによってリン酸化される染色体タンパク質HMG-I上の部位の同定」。FEBS Letters。257 (1):101–4。Bibcode:1989FEBSL.257..101P。doi: 10.1016 / 0014-5793 ( 89 ) 81796- X。PMID 2806554。S2CID 7960951 。
- Karlson JR、Mørk E、Holtlund J、Laland SG、Lund T (1989 年 2 月)。「染色体タンパク質 HMG-Y のアミノ酸配列、HMG-I との関係、およびタンパク質が AT 塩基対の領域に優先的に結合する可能性のあるドメイン」。生化学および生物物理学的研究通信。158 (3): 646–51。doi :10.1016/0006-291X(89)92770-8。PMID 2920035 。
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- Chiappetta G、Tallini G、De Biasio MC、Manfioletti G、Martinez-Tello FJ、Pentimalli F、de Nigris F、Mastro A、Botti G、Fedele M、Berger N、Santoro M、Giancotti V、Fusco A (1998 年 9 月)。「甲状腺腫瘍の診断における高移動度グループ I HMGI(Y) タンパク質の検出: HMGI(Y) 発現は癌の潜在的な診断指標となる」。Cancer Research。58 ( 18 ) : 4193–8。PMID 9751634。
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