ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| FNBP1L |
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| 識別子 |
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| エイリアス | FNBP1L、C1orf39、TOCA1、フォルミン結合タンパク質1いいね |
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| 外部ID | オミム:608848; MGI : 1925642;ホモロジーン:133802;ジーンカード:FNBP1L; OMA :FNBP1L - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体3(マウス)[2] |
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| | バンド | 3|3 G1 | 始める | 122,332,368 bp [2] |
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| 終わり | 122,413,364 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 神経節隆起
- 羊水
- 心室帯
- 糸球体
- 後腎糸球体
- 腎髄質
- 耳下腺
- 小腸粘膜
- 臓側胸膜
- 毛包
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| | トップの表現 | - 手
- 上頸神経節
- 三叉神経節
- 内側神経節隆起
- 耳小胞
- 一次卵母細胞
- 髄質集合管
- 二次卵母細胞
- 窩
- 腎小体
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- 脂質結合
- GTPase結合
- カドヘリン結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 膜
- 細胞膜
- 細胞皮質
- 細胞骨格
- 細胞質小胞
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- エンドサイトーシス
- 小胞組織
- 膜陥入
- 細胞膜管状構造
- オートファジー
- クラスリン依存性エンドサイトーシス
- 膜から小胞が出てくる
- アクチンフィラメントに沿った小胞輸送
- 糸状仮足形成の正の調節
- 繊毛アセンブリ
- 膜組織
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001024948 NM_001164473 NM_017737 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001020119 NP_001157945 NP_060207 |
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| 場所 (UCSC) | 1 章: 93.45 – 93.55 Mb | 3 章: 122.33 – 122.41 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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フォルミン結合タンパク質1様タンパク質は、ヒトではFNBP1L遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、CDC42とN-WASPの両方に結合します。このタンパク質は、N-WASP-WIP複合体を活性化することにより、CDC42誘導性アクチン重合を促進し、したがって、細胞表面シグナルをアクチン細胞骨格にリンクする経路に関与しています。選択的スプライシングにより、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが生成されます。[6]
臨床的意義
FNBP1L 遺伝子多型、特にrs236330SNPは、成人[7]および小児[8]における正常な知能の差異と関連している。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000137942 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000039735 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Katoh M, Katoh M (2003年12月). 「in silicoにおけるヒトFNBP1L遺伝子の同定と特徴付け」. Int J Mol Med . 13 (1): 157–62. doi :10.3892/ijmm.13.1.157. PMID 14654988.
- ^ ab 「Entrez Gene: FNBP1L フォルミン結合タンパク質 1 様」。
- ^ Davies G、Tenesa A、Payton A、Yang J、Harris SE、Liewald D、Ke X、Le Hellard S、Christoforou A、Luciano M、McGhee K、Lopez L、Gow AJ、Corley J、Redmond P、Fox HC、Haggarty P、Whalley LJ、McNeill G、Goddard ME、Espeseth T、Lundervold AJ、Reinvang I、Pickles A、Steen VM、Ollier W、Porteous DJ、Horan M、Starr JM、Pendleton N、Visscher PM、Deary IJ (2011 年 10 月)。「ゲノムワイド関連研究により、人間の知能は遺伝性が高く、多遺伝子性であることが立証された」。Mol . Psychiatry . 16 (10): 996–1005. doi :10.1038/mp.2011.85。PMC 3182557。PMID 21826061。
- ^ ベンヤミン B、ポーカン B、デイビス OS、デイビス G、ハンセル NK、ブリオン MJ、カークパトリック RM、セント RA、フラニッチ S、ミラー MB、ハワース CM、ミーバーン E、プライス TS、エヴァンス DM、ティンプソン N、ケンプ J、リングS、マクアードル W、メッドランド SE、ヤン J、ハリス SE、リーヴァルト DC、シート P、シャオ X、ハジアク JJ、デ ジェウス EJ、ジャドー VW、スター JM、フェルフルスト FC、ペンネル C、ティマイヤー H、イアコノ WG、パーマー LJ 、モンゴメリー GW、マーティン NG、ブームスマ DI、ポストシューマ D、マクグ M、ライト MJ、デイビー スミス G、ディアリー IJ、プロミン R、ヴィッシャー PM (2013 年 1 月)。 「小児知能は遺伝性があり、高度に多遺伝子性で、FNBP1Lと関連している」。Mol . Psychiatry . 19 (2): 253–8. doi :10.1038/mp.2012.184. PMC 3935975. PMID 23358156 。
さらに読む
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Ho HY、Rohatgi R、Lebensohn AM、et al. (2004)。「Toca-1 は N-WASP-WIP 複合体を活性化することにより Cdc42 依存性アクチン核形成を仲介する」。Cell . 118 ( 2): 203–16. doi : 10.1016/j.cell.2004.06.027 . PMID 15260990. S2CID 15516629.
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Stelzl U、Worm U、Lalowski M 、et al. (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワーク:プロテオーム注釈リソース」。Cell . 122 (6): 957–68. doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070. S2CID 8235923.
- Itoh T, Erdmann KS, Roux A, et al. (2006). 「ダイナミンとアクチン細胞骨格は、BAR および F-BAR タンパク質による細胞膜陥入を協調的に制御する」。Dev . Cell . 9 (6): 791–804. doi : 10.1016/j.devcel.2005.11.005 . PMID 16326391。
- Tsujita K, Suetsugu S, Sasaki N, et al. (2006). 「PCH タンパク質の新規膜管状ドメインによるアクチン細胞骨格と膜変形の調整はエンドサイトーシスに関与している」J. Cell Biol . 172 (2): 269–79. doi :10.1083/jcb.200508091. PMC 2063556. PMID 16418535 .
- Aspenström P、Richnau N、Johansson AS (2006)。「diaphanous 関連フォルミン DAAM1 は、Rho GTPase RhoA および Cdc42、CIP4、および Src と連携して、細胞形態形成とアクチンダイナミクスを制御します」。Exp . Cell Res . 312 (12): 2180–94. doi :10.1016/j.yexcr.2006.03.013. PMID 16630611。
- Gregory SG、 Barlow KF、 McLay KE、他 (2006)。「ヒト染色体 1 の DNA 配列と生物学的注釈」。Nature . 441 ( 7091 ): 315–21。Bibcode :2006Natur.441..315G。doi : 10.1038/nature04727。PMID 16710414。
- Kovacs EM、Makar RS、 Gertler FB (2006)。「Tuba は細胞内 N-WASP 依存性アクチンアセンブリを刺激する」。J . Cell Sci . 119 (Pt 13): 2715–26。doi : 10.1242/jcs.03005。PMID 16757518。
- 柿本 剛志、加藤 秀、根岸 正之 (2006)。「細胞膜陥入を誘導する F-BAR/EFC タンパク質 Toca-1 による神経形態の制御」。J . Biol. Chem . 281 (39): 29042–53. doi : 10.1074/jbc.M604025200 . PMID 16885158。