立体構造エピトープ

免疫学において、高次構造エピトープとは、免疫系の受容体と直接接触する抗原を構成するサブユニット（通常はアミノ酸）の配列を指します。

抗原とは、免疫系が異物として認識できる物質です。抗原は通常、全体としてはどの受容体にも結合できないほど大きいタンパク質であるため、抗原を形成する特定のセグメントのみが特定の受容体と結合します。このようなセグメントはエピトープと呼ばれます。同様に、エピトープと接触するのは受容体の パラトープのみです。

タンパク質は、アミノ酸と呼ばれる窒素含有サブユニットの繰り返しで構成されており、自然界では直鎖ではなく、複雑なループを持つ折り畳まれた渦巻きとして存在します。後者はタンパク質の三次構造として知られています。そのため、受容体が未消化の抗原と相互作用するときはいつでも、タンパク質がほどけている場合は、接触する表面アミノ酸は互いに連続していない可能性があります。3次元構造で一緒になり、受容体のパラトープと相互作用するこのような不連続なアミノ酸は、コンフォメーションエピトープと呼ばれます。対照的に、抗原が消化されると、ペプチドと呼ばれる小さなセグメントが形成され、これが主要組織適合性複合体分子と結合し、その後、一直線に連続したアミノ酸を介してT細胞受容体と結合します。これらは線状エピトープとして知られています。^[1]

• 抗原
• 線状エピトープ
• エピトープマッピング、抗原タンパク質上で特定の抗体のエピトープを見つけること

• 抗体-タンパク質相互作用: ベンチマークデータセットと予測ツールの評価
• EpiSearch、ファージディスプレイペプチド配列を使用して立体構造エピトープを予測する新しい方法