ミモトペ

ミモトープはペプチドであることが多く、エピトープの構造を模倣します。この特性により、エピトープによって引き起こされるものと同様の抗体反応を引き起こします。特定のエピトープ抗原に対する抗体は、そのエピトープを模倣したミモトープを認識します。ミモトープは、通常、バイオパニングによってファージディスプレイライブラリから取得されます。ミモトープを利用したワクチンが開発されています。ミモトープは、ペプチドアプタマーの一種です。

ミモトープという用語が1986年にマリオ・ガイセンによって初めて造られたとき^[1] 、それはエピトープを模倣したペプチドを説明するために使用されました。しかし、この概念は、あらゆる種類の結合部位のペプチド模倣物を指すように拡張されました。結合部位の模倣物として、ミモトープ分析は、エピトープのマッピング、^[2]薬物標的の特定、およびタンパク質相互作用ネットワークの推測に広く使用されています。^{[3] [4]さらに、ミモトープは、新しい診断法[5]} 、治療薬^[6]、およびワクチンの開発においてもその可能性を示しています。^[7]さらに、ミモトープがさまざまな半導体やその他の材料に媒介する特別な親和性は、新素材および新エネルギーの研究において非常に有望な可能性を示しています。^[8]したがって、ミモトープに関する情報を特別なデータベースに収集することは価値があります。 2010年に、MimoDBデータベースバージョン1.0がリリースされました。^[9] 10716個のペプチドが1229セットにグループ化されていました。これらのペプチドは、571 本の論文で報告されたファージディスプレイランダムペプチドライブラリのバイオパニング結果から抽出されました。MimoDB データベースはごく最近、現在のバージョン 2.0 に更新されました。^[10]バージョン 2.0 では、849 本の論文から収集され、1818 セットにグループ化された 15633 個のペプチドが含まれています。パニング実験とその結果に関するコアデータに加えて、ターゲット、テンプレート、ライブラリ、構造に関する広範な背景情報が含まれています。バイオインフォマティクス担当者が新しいモデル、アルゴリズム、プログラムを開発および評価できるように、付随するベンチマークもコンパイルされています。さらに、MimoDB データベースは、シンプルおよび高度な検索、構造の視覚化、BLAST、アライメントビューをオンザフライで表示するツールを提供します。実験生物学者は、ターゲットに関係のない可能性のあるペプチドを除外するための仮想コントロールとしてデータベースを簡単に使用できます。MimoDB データベース^[11]は無料で利用できます。