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| DPANN | |
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| パルバルカエウム・アシディフィラム | |
科学的分類 
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| ドメイン： | 古細菌 |
| 上門: | DPANN リンケら 2013 [1] |
| 門[2] | |
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| 同義語 | |
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DPANNは2013年に初めて提唱された古細菌の上門です。 [1]多くのメンバーは、他の生命領域からの水平遺伝子伝播の新たな兆候を示しています。[1]これらは、他の古細菌と比較してサイズが小さい（ナノメートル）ため、ナノ古細菌または超小型古細菌として知られています。
DPANNは、最初に発見された5つのグループ、 Diapherotrites、Parvarchaeota、Aenigmarchaeota、Nanoarchaeota、Nanohaloarchaeotaの頭文字から形成された頭字語です。 その後、 WoesearchaeotaとPacearchaeotaが発見され、DPANN大門内で提案されました。[4] 2017年には、別の門である Altiarchaeota がこの大門に配置されました。[5] DPANNの単系統性は、含まれる門の突然変異率が高いため、まだ確立されているとは考えられていません。これは、系統が系統樹の基底で基底的にまたは人工的にグループ化され、関連性がない可能性がある長枝吸引(LBA) のアーティファクトにつながる可能性があります。 [6] [7]これらの分析は、代わりにDPANNがEuryarchaeotaに属しているか、 Euryarchaeota内のさまざまな位置を占める多系統であることを示唆しています。[6] [7] [8]
DPANNは、ナノアーキオータなどの共生好熱性、パルヴァルキオータなどの好酸性、エニグマルキオータやジアフェロトライトなどの非極限環境性生物など、環境分布や代謝の多様な異なる門をグループ化しています。DPANNは硝酸塩を多く含む地下水でも検出されましたが、水面下では検出されず、これらの分類群の発見は依然として非常に困難であることが示されています。[9]
ICNPによる王国の地位の承認以来、このグループの提案された名前はナノブデラティ王国である。[10]
特徴
他の古細菌に比べてサイズが小さい（ナノメートルサイズ）のが特徴で、その小さなゲノムに合わせて、限られたが自由な生活を送るのに十分な分解能力を持っていますが、多くは他の生物との共生または寄生関係に依存する共生細菌であると考えられています。その特徴の多くは、超小型細菌（CPRグループ）の特徴と類似または類似しています。 [4]
限られた代謝能力はゲノムの小ささの産物であり、ヌクレオチド、アミノ酸、脂質の中心的な生合成経路を欠いていることが多いという事実に反映されています。そのため、 ARMAN古細菌などのほとんどのDPANN古細菌は、生物学的要件を満たすために他の微生物に依存しています。しかし、自由に生きる可能性があるのは、発酵性および好気性従属栄養生物です。[4]
これらはほとんど嫌気性で、養殖されていない。好熱性、超好酸性、超好塩性、金属耐性などの極端な環境、または海洋や湖の堆積物の温帯環境に生息する。地上や外洋で見つかることはまれである。[4]
分類
- ジアフェロトライト。米国で放棄された金鉱山の地下水ろ過装置から回収されたゲノムの系統解析によって発見された。[11] [12]
- パルヴァルカオータとミクラカオータ。2006年に米国の鉱山の酸性鉱山排水から発見されました。 [13] [14] [15]これらは非常に小さく、暫定的にARMAN（リッチモンド鉱山古細菌好酸性ナノ生物）と呼ばれています。
- WoesearchaeotaとPacearchaeota 。これらは堆積物と帯水層や湖の表層水の両方で確認されており、特に塩分濃度の高い条件で豊富に存在します。[4] [16]
- アエニグマルケオータ。鉱山の廃水や温泉の堆積物中に生息する。[17]
- ナノハラルカオータ。塩分濃度の高い環境に分布する。[18]
- ナノアーキオタ。アイスランド沿岸の熱水源で初めて発見された（2002年）。他の古細菌と共生して生息している。[19] [20]
系統発生
分類
現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）[24]と国立生物工学情報センター（NCBI） [25]に基づいています。
超門「DPANN」 Rinke et al. 2013年（キングダム・ナノブデラティ）
- ミクロカルドタ門Sakai et al. 2023
- ミクロカルディア綱Sakai et al. 2023
- 注文?Microcaldales Sakai et al. 2023
- ミクロカルディア綱Sakai et al. 2023
- 門「ウンディナーキオータ」Dombrowski et al. 2020
- クラス「ウンディナーカエイア」Dombrowski et al. 2020
- 目「Undinarchaeales」Dombrowski et al. 2020
- クラス「ウンディナーカエイア」Dombrowski et al. 2020
- 「フーベラキオータ門」Probst et al. 2019年
- クラス「Huberarchaeia」訂正。Probst et al. 2019
- 「Huberarchaeales」を注文するRinke et al. 2020年
- クラス「Huberarchaeia」訂正。Probst et al. 2019
- 門「Aenigmatarchaeota」corrig。リンケら。 2013 (DSEG、DUSEL2)
- クラス「エニグマタルカエア」コリッグ。リンケら。 2020年
- 「Aenigmatarchaeales」のコリッグを注文します。リンケら。 2020年
- クラス「エニグマタルカエア」コリッグ。リンケら。 2020年
- 門「ナノハラキエオタ」コリグ。リンケら。 2013年
- クラス「ナノハロビア」corrig.La Cono et al。 2020年
- 「ナノハロビア目」ラ・コノらを注文する。 2020年
- クラス「ナノハラルカエア」訂正。Narasingarao 他 2012
- 目：「ナノハラルカ目」
- オーダー?「ナノヒドロサーマル」Xie et al. 2022年
- 目：「ヌクレオチドイソステラル目」Xie et al. 2022
- クラス「ナノハロビア」corrig.La Cono et al。 2020年
- Altarchaeota 門Probst et al. 2018年（SM1）
- クラス「アルタルケイア」コリッグ。プロブストら。 2014年
- 「Altarchaeales」コリッグを注文。プロブストら。 2014年
- クラス「アルタルケイア」コリッグ。プロブストら。 2014年
- 門「イアイナルキエオタ」コルグ。リンケら。 2013 [「ディアフェロトライト」Rinke et al. 2013 ] (DUSEL-3)
- クラス「イアナーカエイア」リンケ他 2020
- 「Forterreales」Probst & Banfield 2017を注文する
- 「Iainarchaeales」Rinke et al. を注文します。 2020年
- クラス「イアナーカエイア」リンケ他 2020
- 門「ミクラカオータ」ベイカー＆ディック 2013
- クラス「ミクラクアエ」Vazquez-Campos et al. 2021
- 「Anstonellales」バスケス・カンポスらを注文する。 2021 (LFWA-IIIc)
- 「Burarchaeales」バスケス・カンポスらを注文する。 2021 (LFWA-IIIb)
- 目「Fermentimicrarchaeals」Kadnikov et al. 2020
- 「Gugararchaeales」を注文するVazquez-Campos et al. 2021 (LFWA-IIIa)
- 「Micrarchaeales」バスケス・カンポスらを注文する。 2021年
- 「ノロンガラガリナ目」を注文バスケス・カンポスら。 2021 (LFWA-II)
- クラス「ミクラクアエ」Vazquez-Campos et al. 2021
- ナノデロタ 門Huber et al. 2023
- ナノブデリアクラス加藤 他 2022
- JAPDLS01を注文する
- 「Jingweiarchaeales」を注文するRao et al. 2023年[DTBS01]
- Nanobdellales 加藤らを注文します。 2022年
- オーダー「Pacearchaeales」（DHVE-5、DUSEL-1）
- 「Parvarchaeales」を注文してください。Rinke et al. 2020 (アルマン 4 & 5)
- 目「ティダリカルカエアルス」Vazquez-Campos et al. 2021 (LFW-252_1)
- 目「Woesearchaeales」（DHVE-6）
- ナノブデリアクラス加藤 他 2022
- 門「ママキオータ門」
- 目：「ウィナマッタルカエアレス」
参照
参考文献
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外部リンク
WikispeciesのDPANNグループに関連するデータ