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| ナノハロアーキア | |
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| 科学的分類 | |
| ドメイン： | |
| 上門: | |
| 門: | 「ナノハロアーキオータ」
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| クラス： | 「ナノハロアーキア」 (原文) ナラシンガラオ他 2012
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| 属 | |
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| 同義語 | |
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ナノハロアーキアは、ゲノムが小さく、代謝能力が限られている小型アーキアの系統で、 DPANNアーキアに属します。ナノハロアーキアは、極めて好塩性のハロアーキアと同様に、高塩分の生息地に広く生息しています。
ナノハロアーキアは、メタゲノムデータから、6つの系統群からなる培養されていない好塩性アーキアのクラスとして最初に特定され[1] [2]、その後、ディアフェロトリテス門、パルヴァルカオータ門、アエニグマルカオータ門、ナノアーキオータ門、ナノハロアーキオータ門（DPANN）上門内のナノハロアーキオータ門に分類されました。[3]しかし、ナノハロアーキアの系統学的位置については、ハロアーキアの姉妹系統か、DPANN上門のメンバーかという説もあり、いまだに激しく議論されています。[4] [5] [6]
この系統は、オーストラリアの海洋塩湖、[7]スペインの塩田、[8]ロシアのソーダ塩水、[9]カリフォルニアの塩田、[10]チリの岩塩、[11]エチオピアのダロル熱水システムなど、さまざまな高塩分環境のデータで特定されています。[12]
分類
現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）[13]と国立生物工学情報センター（NCBI） [14]に基づいています。
門「ナノハラキエオタ」コルグ。リンケら。 2013年
- クラス「ナノハラルカエア」訂正。Narasingarao 他 2012
- ナノハラルカ目
- 科「ナノハラルカ科」
- 属 ?「Candidatus Nanohalarchaeum」corrig。ハムら。 2019年
- 「Ca. N. antarcticum」corrig.ハムら。 2019年
- 属 ?「Candidatus Nanohalococcus」Reva et al. 2023年
- 「Ca.N.occultus」Reva et al. 2023年
- 属 ?「Candidatus Nanohalovita」Reva et al. 2023年
- 「Ca.N. haloferacivicina」Reva et al. 2023年
- 属 ?「Candidatus Nanopetraeus」corrig。 Crits-Christoph et al. 2016年[「ナノペトラマス」(原文どおり)]
- 属 ?「Candidatus Nanohalarchaeum」corrig。ハムら。 2019年
- 科「ナノハラルカ科」
- 「ナノヒドロサーマル」を注文Xie et al. 2022年
- 家族「ナノヒドロサーマ科」Xie et al. 2022年
- 属 ?「カンジダトゥスナノヒドロテルムス」Xie et al. 2022年
- 「Ca. N. guaymasensis」Xie et al. 2022年
- 属 ?「カンジダトゥスナノヒドロテルムス」Xie et al. 2022年
- 家族「ナノヒドロサーマ科」Xie et al. 2022年
- 目「ヌクレオチドイソテラレス」Xie et al. 2022
- 家族「ナノサレネカ科」Xie et al. 2022年
- 属 ?「Candidatus Nanosalenecus」Xie et al. 2022年
- 「Ca.N.halilacustris」Xie et al. 2022年
- 属 ?「Candidatus Nanosalenecus」Xie et al. 2022年
- 科「ヌクレオチドイソテラセ科」謝 他 2022
- 属 ?「Candidatus Nucleotidisoter」Xie et al. 2022年
- 「Ca.N.xinjiangensis」Xie et al. 2022年
- 属 ?「Candidatus Nucleotidisoter」Xie et al. 2022年
- 科「ヌクレオチディビンディカ科」謝 他 2022
- 属 ?「Candidatus Nucleotidivindex」Xie et al. 2022年
- 「Ca. N. qijiaojingensis」Xie et al. 2022年
- 属 ?「Candidatus Nucleotidivindex」Xie et al. 2022年
- 家族「ナノサレネカ科」Xie et al. 2022年
- ナノハラルカ目
- クラス「ナノハロビア」コリッグ。ラ・コノら。 2020 [「ナノサリニア」リンケら。 2021年】
- 「ナノハロビア目」ラ・コノらを注文する。 2020 [18] [「ナノサリナ目」Rinke et al. 2020年】
- 科「ナノアナエロサリナ科」Zhao et al. 2022
- 属「Candidatus Nanoanaerosalina」Zhao et al. 2022年
- 「Ca.N.halalkaliphila」Zhao et al. 2022年
- 属「Candidatus Nanoanaerosalina」Zhao et al. 2022年
- 科「ナノハラルアルカリアーキア科」Zhao et al. 2022
- 属「Candidatus Nanohalalkaliarchaeum」Zhao et al. 2022年
- 「Ca.N. halalkaliphilum」Zhao et al. 2022年
- 属「Candidatus Nanohalalkaliarchaeum」Zhao et al. 2022年
- 家族「ナノハロビア科」La Cono et al. 2020 [「ナノサラン科」Rinke et al. 2020年】
- 属 ?「Candidatus Haloredivivus」Ghai et al. 2011年
- 属「Candidatus Nanohalobium」La Cono et al. 2020年
- 「Ca.N.constans」La Cono et al. 2020年
- 属「Candidatus Nanosalina」Narasingarao et al. 2012年
- カンジダトゥス・ナノサリニコラ属（ Ｃｏｒｒｉｇ）。ナラシンガラオら。 2012 [「ナノサリナルム」(原文どおり)]
- 科「ナノアナエロサリナ科」Zhao et al. 2022
- 「ナノハロビア目」ラ・コノらを注文する。 2020 [18] [「ナノサリナ目」Rinke et al. 2020年】
参考文献
- ^ Narasingarao; et al. (2011). 「de novoメタゲノムアセンブリにより、高塩分微生物群集における古細菌の豊富な新規主要系統が明らかに」ISME J. 6 ( 1): 81–93. doi :10.1038/ismej.2011.78. PMC 3246234. PMID 21716304 .
- ^ Ghai, Rohit; Lejla Pašić; Ana Beatriz Fernandez; Ana-Belen Martin-Cuadrado; et al. (2011 年 10 月 10 日). 「水生高塩分環境における新たな微生物群」. Scientific Reports . 1 : 135. Bibcode :2011NatSR...1..135G. doi :10.1038/srep00135. PMC 3216616. PMID 22355652.
- ^ Rinke C, Schwientek P, Sczyrba A, Ivanova NN, Anderson IJ, Cheng JF, Darling A, Malfatti S, Swan BK, Gies EA, Dodsworth JA, Hedlund BP, Tsiamis G, Sievert SM, Liu WT, Eisen JA, Hallam SJ, Kyrpides NC, Stepanauskas R, Rubin EM, Hugenholtz P, Woyke T (2013 年 7 月 25 日)。「微生物暗黒物質の系統発生とコーディングの可能性に関する洞察」。Nature . 499 , 431–437 (2013) (7459): 431–437。Bibcode :2013Natur.499..431R。doi : 10.1038 /nature12352。hdl : 10453/27467 . PMID 23851394.
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- ^ Sayers; et al. 「Nanohaloarchaea」。国立生物工学情報センター(NCBI) 分類データベース。2011年 6 月 5 日閲覧。
- ^ 「GTDBリリース09-RS220」。ゲノム分類データベース。 2024年5月10日閲覧。
- ^ "ar53_r220.sp_label".ゲノム分類データベース. 2024年5月10日閲覧。
- ^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2024年5月10日閲覧。
- ^ La Cono; et al. (2020). 「ナノハロアーキアとハロアーキアの共生は、異なる多糖類の利用に基づく」Proc Natl Acad Sci USA . 117 (33): 20223–20234. Bibcode :2020PNAS..11720223L. doi : 10.1073/pnas.2007232117 . PMC 7443923 . PMID 32759215.
さらに読む
- Ghai; et al. (2011 ) . 「水中の高塩分環境における新たな豊富な微生物群」。Scientific Reports . 1 (135): 135. Bibcode :2011NatSR...1E.135G. doi :10.1038/srep00135. PMC 3216616. PMID 22355652.
- Narasingarao; et al. (2012). 「de novo メタゲノムアセンブリにより、高塩分微生物群集における古細菌の豊富な新規主要系統が明らかに」ISME J. 6 ( 1): 81–93. Bibcode : 2012ISMEJ ...6...81N. doi :10.1038/ismej.2011.78. PMC 3246234. PMID 21716304.