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| ナノアーキオタ | |
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| ナノアーキオタムNanopusillus acidilobiがAcidilobusに付着している。 | |
科学的分類 
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| ドメイン： | 古細菌 |
| 上門: | DPANN |
| 門: | ナノアーキオタ |
| クラス： | ナノブデリア 加藤他 2022 |
| 注文 | |
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| 同義語 | |
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ナノアーキオータ（ギリシャ語で「矮小な、または小さな古代のもの」）は、古細菌ドメイン[1]内の提案された門（Candidatus Nanoarchaeota）であり、現在のところ、海底熱水噴出孔で発見され、2002年に初めて記述されたナノアーキオータ（Nanoarchaeum equitans）が1つだけ存在します。 [2]
分類
ナノアーキオタのメンバーは、異なる宿主生物や環境条件と関連している。[3]ナノアーキオタのメンバーは、サイズが小さく、ゲノムが小さく、呼吸が限られているにもかかわらず、珍しい代謝特性を持っている。例えば、N.エクイタンスは複雑で高度に発達した細胞間コミュニケーションシステムを持っている。[4]
ナノアーキオータの系統発生は、唯一の培養された代表であるナノアーキウム・エクイタンスによって支えられており、これは他の古細菌とは別の進化グループに属しているが、[5] [6]最近再分類された。さらなる分析により、16S rRNA配列によって示されるように、 N.エクイタンスは古細菌の進化の初期に分岐したことが明らかになった。これは、このグループ内で深く分岐した位置を占めていることを示唆している。[7]
現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）[8]と国立生物工学情報センター（NCBI） [9]に基づいています。
- クラスナノブデリア 加藤ら。 2022 [13] [「ナノ古細菌」Huber et al. 2011年; [14]「ナノアーキア」バスケス・カンポスら。 2021年[15 ]
- Nanobdellales 加藤らを注文します。 2022 [13] [ナノ古細菌類Huber et al. 2011 [14] ]
- 科「ナノアーキア科」Huber et al. 2011 [14]
- 属「ナノアーキウム」Huber et al. 2002年[2]
- 「N. equitans」Huber et al. 2002年[2]
- 属「ナノアーキウム」Huber et al. 2002年[2]
- ナノブデラ科Ｋａｔｏ ｅｔ ａｌ． 2022 [13] [「Nanopusillaceae」Huber et al. 2011 [14] ]
- ナノブデラ属 加藤ら。 2022年[13]
- N. aerobiophila 加藤ら 2022 [13]
- 属「Candidatus Nanoclepta」St. John et al. 2019年[16]
- 「Ca. N. minuta」St. John et al. 2019年[16]
- 「Candidatus Nanopusillus」属Wurch et al. 2016年[17]
- 「Ca.N.acidilobi」Wurch et al. 2016年[17]
- ?「Ca.N.massiliensis」ハッサニら。 2022年
- ?「Ca. N. phoceensis」ハッサニら。 2024年
- 「Ca.N. stetteri」（Castelle et al. 2015）Rinke et al. 2020年[18]
- ナノブデラ属 加藤ら。 2022年[13]
- 科「ナノアーキア科」Huber et al. 2011 [14]
- 「Tiddalikarchaeales」を注文する Vazquez-Campos et al. 2021年[15]
- 家族「Tiddalikarchaeaceae」Vazquez-Campos et al. 2021年[15]
- 属「Candidatus Tiddalikarchaeum」Vazquez-Campos et al. 2021年[15]
- 「Ca. T. anstoanum」Vazquez-Campos et al. 2021年[15]
- 属「Candidatus Tiddalikarchaeum」Vazquez-Campos et al. 2021年[15]
- 家族「Tiddalikarchaeaceae」Vazquez-Campos et al. 2021年[15]
- 「Jingweiarchaeales」を注文する Rao et al. 2023年
- 科「Jingweiarchaeaceae」Rao et al. 2023
- 属「Candidatus Jingweiarchaeum」Rao et al. 2023年
- 「Ca. J. tengchongense」Rao et al. 2023年
- 属「Candidatus Jingweiarchaeum」Rao et al. 2023年
- 科「Jingweiarchaeaceae」Rao et al. 2023
- JAPDLS01を注文する
- 科「ハイヤナーカエ科」ラオら 2023
- 属「Candidatus Haiyanarchaeum」Rao et al. 2023年
- 「Ca. H. thermophilum」ラオら 2023
- 属「Candidatus Haiyanarchaeum」Rao et al. 2023年
- 科「ハイヤナーカエ科」ラオら 2023
- 「Parvarchaeales」を注文してください 。Rinke et al. 2020年[18]
- 家族「ヤシ科」Rinke et al. 2020 [18] [「Acidifodinimicrobiaceae」Luo et al. 2020年[19 ]
- 属「Candidatus Rehaiarchaeum」Rao et al. 2023年
- 「Ca. R. fermentans」Rao et al. 2023年
- 属「Candidatus Acidifodinimicrobium」Luo et al. 2020年[19]
- 「Ca.A.mancum」Luo et al. 2020年[19]
- 「Candidatus Parvarchaeum」属Baker et al. 2010年[20]
- 「Ca.P.acidiphilum」Baker et al. 2010年 [20]
- 「Ｃａ．Ｐ．パラシディフィラム」ｃｏｒｒｉｇ．ベイカーら。 2010年 [20]
- 「Ca. P. tengchongense」Rao et al. 2023年
- 属「Candidatus Rehaiarchaeum」Rao et al. 2023年
- 家族「ヤシ科」Rinke et al. 2020 [18] [「Acidifodinimicrobiaceae」Luo et al. 2020年[19 ]
- Nanobdellales 加藤らを注文します。 2022 [13] [ナノ古細菌類Huber et al. 2011 [14] ]
特徴
N. equitansの細胞は直径約 400 nmの球形で[2]、非常に短くコンパクトな DNA 配列を持ち、ゲノム全体ではわずか 490,885塩基対しか含まれていません[6]。処理と修復を実行するための遺伝コードを持っていますが、脂質、アミノ酸、補因子、ヌクレオチド合成などの特定の生合成および代謝プロセスを実行することはできません。[6]機械が限られているため、古細菌で知られている唯一の絶対寄生虫です。[6] ss rRNA 配列が異常であるため、標準的なポリメラーゼ連鎖反応法では検出が困難です。[21] N. equitansの細胞には、15 nm の格子定数で 6 回対称性の通常の S 層が含まれています。[21]
ゲノム構造
ナノアーキオットは、直径100～400 nmの小さな細胞と、0.491～0.606 Mbpの高度に流線型のゲノムを持つのが特徴である。[22]記載されているナノアーキオットのゲノムは、さまざまな程度の縮小を示しており、これは宿主依存型の生活様式と一致する。[23]一部のナノアーキオットには、CRISPR-Casシステム、古細菌の鞭毛、糖新生経路の遺伝子が残っている。[24]
生息地
ナノアーキオットは、イグニコッカスとして知られる古細菌宿主に付着して成長する絶対共生生物である。[25]陸上の温泉と海中の熱水噴出孔の両方で、ナノアーキオット属の分離株が得られた。[26]しかし、ナノアーキオットは海洋熱水噴出孔以外のさまざまな生息地に生息しているという証拠がある。[3] ナノアーキオットのメンバーの遺伝的証拠は、ナノアーキオットス・エクイタンスの16S rRNA遺伝子の配列に基づいて作成されたプライマーを使用して、陸上の温泉と中温の高塩分生息地に広く分布していることが発見された。[3]さらに、熱水噴出孔から離れた場所で採取された光合成層の水サンプルでリボソーム配列が発見されたことで、ナノアーキオータは、さまざまな温度や地球化学的環境の生息地に生息できる、普遍的で多様なアーキアのグループである可能性が浮上しました。[3]
代謝
ナノアーキオタの代謝の多くは不明であるが、その宿主は電子受容体としての元素硫黄と電子供与体としてのH2で成長する独立栄養生物である。[26]アミノ酸、ヌクレオチド、補酵素などのモノマーの生成など、認識されている代謝プロセスの大部分は、この生物には認識可能な遺伝子が欠けている。[26]
参照
参考文献
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さらに読む
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