人間の体内に存在するタンパク質
ＣＡＣＮＡ１Ａ 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス CACNA1A 、APCA、BI、CACNL1A4、CAV2.1、EA2、FHM、HPCA、MHP、MHP1、SCA6、Cav2.1、カルシウム電位依存性チャネルサブユニットα1A、EIEE42、DEE42 外部ID オミム ：601011; MGI : 109482; ホモロジーン : 56383; ジーンカード ：CACNA1A; OMA :CACNA1A - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体8（マウス） [2] バンド 8 C2- C3|8 40.95 cM 始める 85,065,268 bp [2] 終わり 85,366,875 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 小脳半球 小脳の右半球 ブロードマン領域23 中心後回 橋 一次視覚野 上前頭回 内皮細胞 中側頭回 頬粘膜細胞
トップの表現 小脳皮質 上前頭回 小脳葉 小脳虫部 一次視覚野 海馬歯状回顆粒細胞 吻側回遊流 下丘 一次運動野 網膜の神経層
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
金属イオン結合 イオンチャネル活性 電位依存性イオンチャネル活性 シンタキシン結合 タンパク質結合 電位依存性カルシウムチャネル活性 カルシウムチャネル活性 高電位依存性カルシウムチャネル活性 アミロイドβ結合 細胞成分
細胞質 電位依存性カルシウムチャネル複合体 細胞投影 核 膜 膜の不可欠な構成要素 細胞膜 ソーマ 生物学的プロセス
カルシウムイオン輸送 細胞死 膜輸送 活動電位中の膜の脱分極 イオン膜輸送の調節 イオン輸送 輸送 インスリン分泌の調節 カルシウムイオン膜輸送 細胞質カルシウムイオン濃度の正の調節 膜の脱分極 化学シナプス伝達 化学シナプス伝達の調節 カルシウムイオンの輸入 アミロイドβに対する反応 アミロイドβに対する細胞反応 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_023035 NM_000068 NM_001127221 NM_001127222 NM_001174080
NM_001252059 NM_001252060 NM_001252061 NM_007578
RefSeq (タンパク質) NP_000059 NP_001120693 NP_001120694 NP_001167551 NP_075461
NP_001238988 NP_001238989 NP_001238990 NP_031604
場所 (UCSC) 19章: 13.21 – 13.63 Mb 8 章: 85.07 – 85.37 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
Ca v 2.1は P / Q 電位依存性カルシウムチャネル とも呼ばれ、主に 脳 に存在するカルシウムチャネルである 。 [5] 具体的には、脳と 小脳の ニューロン のシナプス前終末に見られる 。 [5] Ca v 2.1は、ニューロン間の 神経伝達物質 の放出を制御する上で重要な役割を果たしている。 [5] これは、α1、β、α2/δ、γサブユニットを含む複数のサブユニットから構成される。 [6] α1サブユニットは孔形成サブユニットであり、カルシウムイオンが通過することを意味する。 [6] 異なる種類のカルシウムチャネルには、異なる α1サブユニットの アイソフォーム（バージョン）がある。Ca v 2.1にはα1Aサブユニットがあり、 [6]これは CACNA1A 遺伝子によってコードされている 。 [a] [5] CACNA1A の変異は、 家族性片麻痺性片頭痛 、 発作性運動失調症 2型、 脊髄小脳失調症6型 など、様々な神経疾患と関連していることが報告されている 。 [5]
関数 「電圧依存性カルシウムチャネルは、興奮性細胞へのカルシウムイオンの流入を媒介し、筋収縮、ホルモンまたは神経伝達物質の放出、遺伝子発現など、さまざまなカルシウム依存性プロセスにも関与しています。カルシウムチャネルは、α-1、β、α-2/δ、γサブユニットからなるマルチサブユニット複合体です。チャネルの活動は、孔を形成するα-1サブユニットによって制御され、他のサブユニットは、この活動を制御する補助サブユニットとして機能します。カルシウムチャネルの種類の特徴的な特性は、主に、α-1A、B、C、D、E、Sというさまざまなα-1アイソフォームの発現に関連しています。この遺伝子は、主に神経組織で発現するα-1Aサブユニットをコードしています。」 [6]
臨床的意義 CACNA1A 遺伝子の変異は、 家族性片麻痺性片頭痛、 発作性 運動失調症などの運動障害 、 複数の発作型を伴う てんかん など、多くの神経疾患と関連している。 [8]
「この遺伝子は、(CAG)n-リピートによる多型性変異も示す。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが見つかっている。転写バリアントの1セットでは、(CAG)n-リピートは3' UTRに発生し、いかなる疾患とも関連しない。しかし、別のセットのバリアントでは、挿入によりコーディング領域が拡張され、 ポリグルタミントラクト をコードする(CAG)n-リピートが含まれる。コーディング領域における(CAG)n-リピートの通常の4-16から21-28への拡張は、脊髄小脳失調症6と関連している。」 [6]
インタラクション Cav2.1はCACNB4 と 相互作用する ことが示されている 。 [9] [10]
注記
^ 「 CACNA1Aは 遺伝子の正式名称である CA lcium 電位依存性 C ha N elサブユニット A Ipha 1A の略称であり、遺伝子によってコードされるタンパク質の説明である。」 [7]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000141837 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000034656 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ abcde Sutherland HG、Albury CL、Griffiths LR（2019年6月21日）。「片頭痛の遺伝学の進歩」。 頭痛と痛み の ジャーナル 。20 （1）：72。doi ： 10.1186 / s10194-019-1017-9。PMC 6734342。PMID 31226929 。 ^ abcde "CACNA1A". 遺伝子 . 国立生物工学情報センター . 2021年3月16日. 2021年 3月28日 閲覧 。 ^ 「CACNA1Aの科学」 CACNA1A財団。 2021年 3月28日 閲覧 。 ^ Papandreou A、Danti FR、 Spaull R、Leuzzi V、Mctague A、Kurian MA（2020年2月）。「遺伝性てんかんにおける運動障害の拡大スペクトル」。 発達医学と小児神経学 。62 （2 ） ：178–191。doi ：10.1111/ dmcn.14407。PMID 31784983。S2CID 208498567 。 ^ Walker D、Bichet D、Campbell KP、De Waard M (1998 年 1 月)。「電圧依存性 Ca2+ チャネル α 1A サブユニットのカルボキシル末端領域における β 4 アイソフォーム特異的相互作用部位」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 4): 2361–7。doi : 10.1074/ jbc.273.4.2361。PMID 9442082 。 ^ Walker D, Bichet D, Geib S, Mori E, Cornet V, Snutch TP, et al. (1999年4月). 「α1Aサブユニットにおける新しいβサブタイプ特異的相互作用がP/Q型Ca2+チャネルの活性化を制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 274 (18): 12383–90. doi : 10.1074/jbc.274.18.12383 . PMID 10212211.
さらに読む
ターウィント G、コース E、ハーン J、フェルミューレン F、ヴァン デン マーグデンベルグ A、フランツ R、フェラーリ M (2002 年 6 月)。 「散発性片麻痺性片頭痛患者 27 名における CACNA1A カルシウム チャネル サブユニット遺伝子の変異分析」。 神経学のアーカイブ 。 59 (6): 1016–8。 土井 ： 10.1001/archneur.59.6.1016 。 PMID 12056940。 Catterall WA、Perez-Reyes E、Snutch TP、Striessnig J (2005 年 12 月)。「国際薬理学連合。XLVIII。電位依存性カルシウムチャネルの命名法と構造機能関係」。 薬理 学 レビュー 。57 ( 4): 411–25。doi :10.1124/pr.57.4.5。PMID 16382099。S2CID 10386627 。 Perez-Reyes E、Castellano A、Kim HS、Bertrand P、Baggstrom E、Lacerda AE、他 (1992 年 1 月)。「L 型カルシウム チャネルの心臓/脳ベータ サブユニットのクローニングと発現」。The Journal of Biological Chemistry。267 (3): 1792–7。doi: 10.1016 / S0021-9258 ( 18 ) 46015-2。PMID 1370480 。 Barry EL、Viglione MP、Kim YI 、 Froehner SC (1995 年 1 月)。「ヒト小細胞肺癌細胞における P 型カルシウムチャネルの発現と抗体阻害」。The Journal of Neuroscience。15 ( 1 Pt 1): 274–83。doi : 10.1523 / JNEUROSCI.15-01-00274.1995。PMC 6578292。PMID 7823133 。 Joutel A、Bousser MG、Biousse V、 Labauge P、Chabriat H、Nibbio A、他 (1993 年 9 月)。「家族性片麻痺片頭痛の遺伝子は 19 番染色体に位置する」。Nature Genetics。5 ( 1 ) : 40–5。doi :10.1038/ng0993-40。PMID 8220421。S2CID 6493091 。 Margolis RL、Breschel TS、Li SH、Kidwai AS、Antonarakis SE、McInnis MG、Ross CA (1995 年 7 月)。「ヒト脳由来の CCA トリヌクレオチド反復配列を含む cDNA クローンの特性」。 体 細胞 および 分子遺伝学 。21 (4): 279–84。doi :10.1007/BF02255782。PMID 8525433。S2CID 22174220 。 Rettig J、Sheng ZH、Kim DK、Hodson CD、Snutch TP、Catterall WA (1996 年 7 月)。「脳 Ca2+ チャネルの alpha1A サブユニットとシナプス前タンパク質シンタキシンおよび SNAP-25 とのアイソフォーム特異的相互作用」。 米国 科学 アカデミー紀要 。93 ( 14): 7363–8。Bibcode :1996PNAS... 93.7363R。doi : 10.1073 / pnas.93.14.7363。PMC 38990。PMID 8692999 。 Diriong S、Lory P、Williams ME、Ellis SB、Harpold MM、Taviaux S (1995 年 12 月)。「α 1A、α 1B、α 1E 電圧依存性 Ca2+ チャネルサブユニットのヒト遺伝子の染色体局在」。Genomics。30 ( 3 ) : 605–9。doi :10.1006/geno.1995.1284。PMID 8825650 。 Ophoff RA、Terwindt GM、Vergouwe MN、van Eijk R、Oefner PJ、Hoffman SM、他 (1996 年 11 月)。「家族性片麻痺性片頭痛および発作性運動失調症 2 型は、Ca2+ チャネル遺伝子 CACNL1A4 の変異によって引き起こされる」。Cell . 87 (3): 543–52. doi :10.1016/S0092-8674 ( 00)81373-2. hdl : 1765/57576 . PMID 8898206. S2CID 16840573. Zhuchenko O、Bailey J、Bonnen P、Ashizawa T、Stockton DW、Amos C、他 (1997 年 1 月)。「α 1A 電圧依存性カルシウム チャネルの小さなポリグルタミン拡張を伴う常染色体優性小脳失調症 (SCA6)」。 Nature Genetics。15 ( 1 ) : 62–9。doi :10.1038/ng0197-62。PMID 8988170。S2CID 9116828 。 De Waard M、Liu H、Walker D、Scott VE、 Gurnett CA 、Campbell KP (1997 年 1 月)。「G タンパク質ベータガンマ複合体の電圧依存性カルシウムチャネルへの直接結合」。Nature。385 ( 6615 ) : 446–50。Bibcode : 1997Natur.385..446W。doi :10.1038/385446a0。PMID 9009193。S2CID 4287544。 Qin N、Platano D、Olcese R、Stefani E、Birnbaumer L (1997 年 8 月)。「Ca2+ チャネル α1 サブユニットの C 末端 gbetagamma 結合ドメインと gbetagamma の直接相互作用が、G タンパク質結合受容体によるチャネル阻害の原因である」。 米国科学アカデミー紀要。94 ( 16 ) : 8866–71。doi : 10.1073 / pnas.94.16.8866。PMC 23172。PMID 9238069 。 Riess O、Schöls L、Bottger H、Nolte D、Vieira-Saecker AM、Schimming C、他 (1997 年 8 月)。「SCA6 は、α1A 電圧依存性カルシウム チャネル遺伝子の中程度の CAG 拡張によって引き起こされます」。 ヒト 分子遺伝学。6 ( 8 ) : 1289–93。doi : 10.1093/hmg/6.8.1289。PMID 9259275 。 ジョディス C、マントゥアーノ E、ヴェネツィアーノ L、トレッテル F、サッバディーニ G、カランドリエッロ L、他(1997 年 10 月)。 「染色体 19p 上の CACNA1A 遺伝子における CAG リピート拡大によるエピソード性運動失調 2 型 (EA2) および脊髄小脳失調 6 型 (SCA6)」。 ヒト分子遺伝学 。 6 (11): 1973 ～ 8 年。 土井 ： 10.1093/hmg/6.11.1973 。 hdl : 2108/35797 。 PMID 9302278。 Charvin N、L'evêque C、Walker D、Berton F、Raymond C、Kataoka M、他 (1997 年 8 月)。「カルシウムセンサータンパク質シナプトタグミン I と P/Q 型カルシウムチャネルの alpha1A サブユニットの細胞質ドメインとの直接的な相互作用」。The EMBO Journal。16 ( 15 ) : 4591–6。doi :10.1093/ emboj /16.15.4591。PMC 1170085。PMID 9303303 。 石川 健、田中 秀、斎藤 正之、大越 暢、藤田 孝、吉澤 功、他 (1997 年 8 月)。「常染色体優性純粋小脳性運動失調症の日本人家族は染色体 19p13.1-p13.2 にマッピングされ、染色体 19p13.1 の脊髄小脳性運動失調症タイプ 6 遺伝子の軽度 CAG 拡大と強く関連している」。American Journal of Human Genetics。61 ( 2 ): 336–46。doi :10.1086/514867。PMC 1715894。PMID 9311738 。 Walker D、Bichet D、Campbell KP、De Waard M (1998 年 1 月)。「電圧依存性 Ca2+ チャネル α 1A サブユニットのカルボキシル末端領域における β 4 アイソフォーム特異的相互作用部位」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 4): 2361–7。doi : 10.1074/ jbc.273.4.2361。PMID 9442082 。 Yue Q、Jen JC、Thwe MM、Nelson SF、Baloh RW (1998 年 5 月)。「CACNA1A の de novo 変異がアセタゾラミド反応性エピソード性運動失調症を引き起こす」。American Journal of Medical Genetics。77 ( 4): 298–301。doi : 10.1002 /(SICI)1096-8628(19980526)77:4<298::AID-AJMG9>3.0.CO;2-J。PMID 9600739 。 Hans M、Urrutia A、Deal C、Brust PF、Stauderman K、Ellis SB、他 (1999 年 3 月)。「ヒト α1A 含有高電圧活性化カルシウム チャネルの生物物理学的および薬理学的特性に影響を与えるドメイン IV の構造要素」。Biophysical Journal。76 ( 3 ) : 1384–400。Bibcode : 1999BpJ .... 76.1384H。doi : 10.1016/S0006-3495(99)77300-5。PMC 1300117。PMID 10049321 。 Walker D、Bichet D、Geib S、Mori E、Cornet V、Snutch TP、他 (1999 年 4 月)。「α1A サブユニットにおける新しいβサブタイプ特異的相互作用が P/Q 型 Ca2+ チャネルの活性化を制御する」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 18): 12383–90。doi : 10.1074/ jbc.274.18.12383。PMID 10212211 。
Nikonishyna, Yuliia V.; et al. (2022). 「新規 CACNA1A 変異体 p.Cys256Phe がジスルフィド結合を破壊し、脊髄小脳失調症を引き起こす」。 運動 障害 。37 (2)。運動障害：運動障害学会公式ジャーナル：401–404。doi ： 10.1002 / mds.28835。PMID 34647648。S2CID 238859984 。
さらに読む
Jen JC (2015 年 5 月) [1993]。「家族性片麻痺性片頭痛」。Pagon RA、Bird TD、Dolan CR、他 (編)。GeneReviews。シアトル WA: ワシントン大学、シアトル。PMID 20301295。NBK1388 。 Spacey, Sian (2011 年 12 月)。「エピソード性運動失調症 2 型 – 廃止された章、歴史的参照のみ」。エピソード性運動失調症 2 型。ワシントン大学、シアトル。PMID 20301674。NBK1501 。 GeneReviewsで Gomez, Christopher M (2013 年 7 月)。脊髄小脳失調症 6 型。ワシントン大学、シアトル。PMID 20301319。NBK1140 。 GeneReviewsで
CACNA1A+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館 医学件名表 (MeSH)
