骨形成タンパク質1

BMP1
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	3EDG、3EDH
識別子
エイリアス	BMP1、骨形成タンパク質1、OI13、PCOLC、PCP、PCP2、TLD
外部ID	オミム: 112264; MGI : 88176;ホモロジーン: 55955;ジーンカード：BMP1; OMA :BMP1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体8（ヒト）
終わり	22,212,326 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	14番染色体（マウス）
終わり	70,520,234 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	子宮内膜間質細胞; ; 左子宮管; ; 右副腎皮質; ; 左冠動脈; ; 子宮頸管; ; 子宮頸管; ; 左副腎皮質; ; 右冠動脈; ; 子宮体部; ; 胃粘膜;
	トップの表現
	原腸胚; ; 小脳皮質; ; 骨髄間質; ; リップ; ; 脱落膜; ; 大腿骨体; ; 外頸動脈; ; 内頸動脈; ; 頭蓋冠; ; 臼歯;
	参照表現データの詳細
	; ; ; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	カルシウムイオン結合; 亜鉛イオン結合; 金属イオン結合; ペプチダーゼ活性; タンパク質結合; メタロエンドペプチダーゼ活性; 成長因子活性; 加水分解酵素活性; メタロペプチダーゼ活性; セリン型エンドペプチダーゼ活性; サイトカイン活性; 同一のタンパク質結合;
細胞成分	ゴルジ体; 細胞外領域; 小胞; 細胞外空間;
生物学的プロセス	骨格系の発達; 細胞分化; 骨化; 細胞外マトリックスの分解; タンパク質分解; 多細胞生物の発達; 軟骨の発達; 軟骨の発達の積極的な調節; 軟骨凝縮; 高密度リポタンパク質粒子アセンブリ; シグナル伝達受容体の活性の調節; シグナル伝達;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	649
	12153
	ENSG00000168487
	ENSMUSG00000022098
	P13497
	P98063
NM_001199 ; NM_006128 ; NM_006129 ; NM_006130 ; NM_006131;
	NM_006132
	NM_009755 ; NM_001360021
	NP_001190 ; NP_006120
	NP_033885 ; NP_001346950
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

骨形成タンパク質1 （BMP1とも呼ばれる）は、ヒトではBMP1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]選択的スプライシングによって生成されるこのタンパク質には7つのアイソフォームがある。

関数

BMP1 は骨形成タンパク質(BMP)のペプチダーゼ M12A ファミリーに属します。骨と軟骨の発達を誘導します。他の BMP とは異なり、 TGFβスーパーファミリーには属しません。当初は他の BMP と同様に骨と軟骨の発達を誘導する働きがあることが発見されました。ただし、プロコラーゲン I、II、IIIのC 末端を切断するメタロプロテアーゼです。アスタシン様プロテアーゼドメインを持っています。

これはラミニン 5 を切断することが示されており、牛の皮膚の基底上皮層に局在しています。

BMP1 遺伝子座は、生体内で軟骨の形成を誘導できるタンパク質をコードします。他の骨形成タンパク質は TGF-β スーパーファミリーのメンバーですが、BMP1 は他の既知の成長因子と密接に関連していないタンパク質をコードします。BMP1 タンパク質とプロコラーゲン C プロテイナーゼ (PCP) は、カルシウムを必要とし、軟骨と骨の形成に必要な分泌メタロプロテアーゼであり、同一です。PCP または BMP1 タンパク質は、プロコラーゲン I、II、III の C 末端プロペプチドを切断し、その活性はプロコラーゲン C エンドペプチダーゼエンハンサータンパク質によって増加します。BMP1 遺伝子は、N 末端プロテアーゼドメインを共有するが、C 末端領域が異なる選択的スプライシングバリアントとして発現します^[5]

構造

BMP1の部分構造は、1.27Åの分解能を持つX線回折によって決定されました。 ^[7] 結晶化実験は、pH 7.5で蒸気拡散によって行われました。これは、BMP1が体内に存在する人体のpHに近いため重要です。このBMP1フラグメントは202残基の長さです。その二次構造は、30％のヘリックス、つまり10ヘリックス、61残基の長さと、15％のベータシート、つまり11ストランド、32残基の長さで構成されています。アセチル基と亜鉛イオンのリガンドが含まれています。

BMP1 のラマチャンドランプロットが作成されました。^[8] このプロットは、BMP1 が (-60°、-45°) と (-60°、140°) 付近の Phi および Psi 角度 (Phi、Psi) を最も好むことを示しています。これらの好ましい角度は、ラマチャンドランプロットの最もクラスター化されたデータの推定値です。好ましい領域の範囲ははるかに広くなっています。残基の 97% が好ましい領域にあり、残基の 100% が許容領域にあり、外れ値はありませんでした。

参考文献

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さらに読む

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外部リンク

米国国立医学図書館の医学主題標目表(MeSH)の bone+morphogenetic+protein+1
UCSC ゲノムブラウザのヒト BMP1 ゲノムの位置と BMP1 遺伝子の詳細ページ。
UCSC ゲノムブラウザのヒト PCP2 ゲノムの位置と PCP2 遺伝子の詳細ページ。
ペプチダーゼとその阻害剤に関する MEROPS オンラインデータベース: M12.005 [^{永久リンク切れ‍ ]}

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000168487 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022098 – Ensembl、2017 年 5 月

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[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

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[pmid18824173-7] PDB : 3EDG ; Mac Sweeney A, Gil-Parrado S, Vinzenz D, Bernardi A, Hein A, Bodendorf U, Erbel P, Logel C, Gerhartz B (2008年12月). 「骨形成タンパク質1/トロイド様メタロプロテアーゼの基質特異性の構造的基礎」J. Mol. Biol . 384 (1): 228–39. doi :10.1016/j.jmb.2008.09.029. PMID 18824173.

[urlwww.rcsb.org-8] 「MolProbity Ramachandran による 3EDG モデル 1 の分析」(PDF)。www.rcsb.org。2012 年 10 月 12 日のオリジナル(PDF)からアーカイブ。