| アラビドプシス | |
|---|---|
| シロイヌナズナ( Arabidopsis thaliana ) | |
| 科学的分類 | |
| 王国: | 植物界 |
| クレード: | 維管束植物 |
| クレード: | 被子植物 |
| クレード: | 真正双子 |
| クレード: | ロシド |
| 注文: | アブラナ科 |
| 家族: | アブラナ科 |
| 属: | Arabidopsis Heynh. (Holl & Heynh. 著) |
| タイプ種 | |
| シロイヌナズナ L.
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| 種 | |
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テキストを参照 | |
| 同義語 | |
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カルダミノプシス(CAMey.) ハイエク | |
シロイヌナズナ(ロッククレス) は、アブラナ科の属です。キャベツやカラシナと同系の小さな花を咲かせる植物です。この属は、植物生物学の研究に使用されるモデル生物の 1 つであり、ゲノム全体の配列が決定された最初の植物であるシロイヌナズナ( Arabidopsis thaliana )を含むため、非常に興味深いものです。シロイヌナズナの変化は簡単に観察できるため、非常に便利なモデルとなっています。
状態
現在、シロイヌナズナ属には9つの種とさらに8つの亜種が認められています。この区分はごく最近行われたもので、O'KaneとAl-Shehbaz [1] [2]らによる形態学的および分子的系統発生に基づいています。
彼らの研究結果は、以前Arabidopsisに含まれていた種が同属を多系統にしたことを裏付けている。最新の再分類では、以前CardaminopsisとHylandraに分類されていた 2 種とArabis属の 3 種がArabidopsisに移されたが、 Beringia 、Crucihimalaya、Ianhedgea、Olimarabidopsis、Pseudoarabidopsisという新しい属に移された 50 種は除外されている。
アラビドプシス属の種はすべてヨーロッパ原産ですが、2 種は北米やアジアにも広く分布しています。
過去20年間、シロイヌナズナは植物生物学のさまざまな側面に関する研究のための モデル生物として科学界から大きな関心を集めてきました。The Arabidopsis thaliana Information Resource (TAIR) [3]は、シロイヌナズナの遺伝学および分子生物学研究のための厳選されたオンライン情報源であり、The Arabidopsis Book [4]は、シロイヌナズナの生物学に関する招待された章をオンラインで編集したものです。(2013年現在、これ以上の章は出版されません。) ヨーロッパでは、シロイヌナズナの 遺伝資源、バイオインフォマティクス、および分子生物学リソース(GeneChipsを含む)のモデル生物リソースセンターはノッティンガムシロイヌナズナストックセンター(NASC)であり、北米では、オハイオ州立大学を拠点とするシロイヌナズナ生物リソースセンター(ABRC)が遺伝資源サービスを提供しています。 ABRC の注文システムは 2001 年 6 月に TAIR データベースに組み込まれましたが、NASC は常に (1991 年以来) 独自の注文システムとゲノム ブラウザーをホストしてきました。
1982年、ソ連の サリュート7号宇宙ステーションの乗組員がシロイヌナズナを栽培し、宇宙で開花し種子を生成した最初の植物となった。その寿命は40日であった。[5] シロイヌナズナの種子は、学生の実験の一環として、2019年に嫦娥4号着陸船で月へ運ばれた。2022年5月現在、シロイヌナズナは月の土壌サンプルで栽培することに成功している。[6]
アラビドプシスはボエケラ属と非常によく似ています。
種と亜種の一覧
- シロイヌナズナ アレニコラ (リチャードソン元フック) アルシェバズ、エルフ、DF マレー & SI ワーウィック—ホッキョクロックレス(グリーンランド、ラブラドール、ヌナブト準州、ケベック、オンタリオ、マニトバ、サスカチュワン)
- シロイヌナズナ (L.)ラワルリー—サンドロッククレス
- A. arenosa subsp. arenosa (ヨーロッパ: オーストリア、ベラルーシ、ボスニア・ヘルツェゴビナ、ブルガリア、クロアチア、チェコ共和国、フランス北東部、ドイツ、ハンガリー、イタリア北部、ラトビア、リトアニア、マケドニア、ポーランド、ルーマニア、スロバキア、スロベニア、スイス、ウクライナ原産。ベルギー、デンマーク、エストニア、フィンランド、オランダ、ノルウェー、ロシア、西シベリア、スウェーデンに帰化。アルバニア、ギリシャ、イタリア中部、南部、トルコには生息せず)
- A. arenosa subsp. borbasii (ベルギー東部、チェコ共和国、フランス北東部、ドイツ、ハンガリー、ポーランド、ルーマニア、スロバキア、スイス、ウクライナ、デンマークにも生息かは疑わしい)
- Arabidopsis cebennensis ( DC. ) (フランス南東部)
- シロイヌナズナ ( Schott ) (ボスニア、クロアチア)
- シロイヌナズナ (L.)
- A. halleri subsp. halleri (オーストリア、クロアチア、チェコ共和国、ドイツ、イタリア北部および中部、ポーランド、ルーマニア、スロバキア、スロベニア、スイス、および南ウクライナ。おそらく北フランスに導入され、ベルギーでは絶滅した)
- A.ハレリ亜種オビレンシス (Wulfen) (アルバニア、オーストリア、イタリア北東部、ルーマニア、スロバキア、スロベニア、ウクライナ南西部、ユーゴスラビア)
- A. halleri subsp. gemmifera ( Matsumura ) (ロシア極東、中国北東部、韓国、日本、台湾)
- Arabidopsis lyrata (L.) O'Kane & Al-Shehbaz —サンドクレソン
- A. lyrata subsp. lyrata (北東ヨーロッパロシア、アラスカ、カナダ (オンタリオ州から西はブリティッシュコロンビア州)、および米国南東部および中央部 (バーモント州から南はジョージア州北部、ミシシッピ州から北はミズーリ州およびミネソタ州))
- A. lyrata subsp. petraea (Linnaeus) O'Kane & Al-Shehbaz (オーストリア、チェコ共和国、イングランド、ドイツ、ハンガリー、アイスランド、アイルランド、北イタリア、ノルウェー、ロシア (北西ロシア、シベリア、極東)、スコットランド、スウェーデン、ウクライナ、北アメリカ北方 (アラスカ、ユーコン準州)。ポーランドでは絶滅したと思われる)
- A. lyrata subsp. kamchatica (Fischer ex DC) O'Kane & Al-Shehbaz (北半球アラスカ、カナダ (ユーコン準州、マッケンジー地区、ブリティッシュコロンビア州、サスカチュワン州北部)、アリューシャン列島、東シベリア、ロシア極東、韓国、中国北部、日本、台湾)
- Arabidopsis neglecta ( Schult. ) (カルパティア山脈(ポーランド、ルーマニア、スロバキア、および隣接するウクライナ))
- Arabidopsis pedemontana ( Boiss. ) (イタリア北西部、隣接するスイス南西部では絶滅したと推定される)
- Arabidopsis suecica ( Fries ) Norrlin (フェノスカンジナビアおよびバルト海地域)
- Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. —シロイヌナズナ(原産地はほぼヨーロッパ全域から中央アジア、現在は世界中に帰化している)
再分類された種
以前Arabidopsisに分類されていた以下の種は、現在ではこの属の一部とは見なされていません。
- A.バクトリアナ→ディエルシオカリス・バクトリアナ
- A. brevicaulis →クルシヒマラヤヒマラヤ
- A. bursifolia → Beringia bursifolia
- A. campestris →クルシヒマラヤ ワリチイ
- A. dentata → Murbeckiella pinnatifida
- A. ドラシアナ→
- A. erysimoides → Erysimum hedgeanum
- A. eseptata → Olimarabidopsis umbrosa
- A.ガモセパラ→ネオトルラリア・ガモセパラ
- A. glauca →テルンギエラ・サルギネア
- A. griffithiana → Olimarabidopsis pumila
- A. himalaica →クルシヒマラヤヒマラヤ
- A. huetii → Murbeckiella huetii
- A. kneuckeri →クルシヒマラヤ kneuckeri
- A. korshinskyi → Olimarabidopsis cabulica
- A. lasiocarpa → Crucihimalaya lasiocarpa
- A. minutiflora → Ianhedgea minutiflora
- A. モリス→ Beringia bursifolia
- A. mollissima → Crucihimalaya mollissima
- A. monachorum → Crucihimalaya lasiocarpa
- A.モンゴリカ→クルシヒマラヤモンゴリカ
- A. multicaulis → Arabis tibetica
- A. novae-anglicae → Neotorularia humilis
- A. nuda → Drabopsis nuda
- A. ovczinnikovii → Crucihimalaya mollissima
- A. parvula → Thellungiella parvula
- A.ピンナティフィダ→ムルベッキエラ・ピンナティフィダ
- A. pumila → Olimarabidopsis pumila
- A.キラニカ→ Sisymbriopsis mollipila
- A. richardsonii → Neotorularia humilis
- A. russeliana →クルシヒマラヤ ワリチイ
- A. salsugineum →エウトレマ・サルスギネウム
- A. sarbalica → Crucihimalaya wallichii
- A. schimperi →ロベスキア・シンペリ
- A. stenocarpa → Beringia bursifolia
- A. stewartiana → Olimarabidopsis pumila]]
- A. stricta → Crucihimalaya stricta]]
- A. taraxacifolia →クルシヒマラヤ ワリチイ
- A. tenuisiliqua → Arabis tenuisiliqua
- A. チベチカ→クルシヒマラヤ ヒマライカ
- A. チベチカ→アラビス・チベチカ
- A. toxophylla → Pseudoarabidopsis toxophylla
- A. trichocarpa → Neotorularia humilis
- A. trichopoda → Beringia bursifolia
- A. tschuktschorum → Beringia bursifolia
- A. tuemurnica → Neotorularia humilis
- A. verna → Drabopsis nuda
- A. virgata → Beringia bursifolia
- A. wallichii →クルシヒマラヤ wallichii
- A. ヤドゥンゲンシス→
細胞遺伝学
細胞遺伝学的解析により、半数体 染色体数(n)は可変であり、属内の種によって異なることが示されている: [7]
A. thalianaはn=5 [8]であり、この種のDNA配列は2001年に完了した。A . lyrataはn=8であるが、いくつかの亜種または個体群は四倍体である。[9]様々な亜種A. arenosa はn=8であるが、2n(二倍体)または4n(四倍体)のいずれかである。[10] A. suecica はn=13(5+8)であり、 A. thalianaと二倍体A. arenosaの交雑によって生じた両二倍体種である。[11]
A. neglectaはn=8であり、 A. halleriの様々な亜種も同様である。[10]
2005 年現在、A. cebennensis、A. croatica、A. pedemontana は細胞学的に調査されていません。
参照
参考文献
- ^ オケイン、スティーブ L.;アル・シェバズ、イフサン・A. (1997)。 「シロイヌナズナ(アブラナ科)の概要」。ノボン。7 (3): 323.土井:10.2307/3391949。JSTOR 3391949。
- ^ O'Kane, Steve L.; Al-Shehbaz, Ihsan A. (2003). 「核リボソームDNA配列に基づくアラビドプシス(アブラナ科)の系統学的位置と属の限界」Annals of the Missouri Botanical Garden . 90 (4): 603. doi :10.2307/3298545. JSTOR 3298545. S2CID 85316468.
- ^ アラビドプシス情報リソース
- ^ 「The Arabidopsis Book」.アメリカ植物生物学会. 2019-04-13 . 2021-08-14閲覧。
- ^ 「宇宙で開花した最初の植物種」ギネス世界記録。 2017年3月10日閲覧。
- ^ Keeter, Bill (2022-05-12). 「科学者が月の土壌で植物を育てる」NASA . 2022-05-13閲覧。
- ^ Al-Shehbaz, Ihsan A.; O'Kane Jr, Steve L. (2002). 「シロイヌナズナ(アブラナ科)の分類と系統学」。シロイヌナズナの本。第 1 巻。第 1 巻 。アメリカ植物生物学会。pp. e0001。doi :10.1199/ tab.0001。PMC 3243115。PMID 22303187。
{{cite book}}:|journal=無視されました (ヘルプ) - ^ Lysak, M. A; Berr, A; Pecinka, A; Schmidt, R; McBreen, K; Schubert, I (2006). 「Arabidopsis thaliana および関連する Brassicaceae 種における染色体数減少のメカニズム」Proceedings of the National Academy of Sciences . 103 (13): 5224–5229. Bibcode :2006PNAS..103.5224L. doi : 10.1073/pnas.0510791103 . PMC 1458822 . PMID 16549785.
- ^ Dart, Sara; Kron, Paul; Mable, Barbara K (2004). 「染色体数とフローサイトメトリーを用いたArabidopsis lyrataの倍数性の特徴づけ」. Canadian Journal of Botany . 82 (2): 185. doi :10.1139/b03-134.
- ^ ab Joly, Simon; Schmickl, Roswitha; Paule, Juraj; Klein, Johannes; Marhold, Karol; Koch, Marcus A. (2012). 「シロイヌナズナ属アレンオサ複合体の進化史:多様な四倍体は西カルパチア山脈の種と遺伝的多様性の中心を隠す」PLOS ONE . 7 (8): e42691. Bibcode :2012PLoSO...742691S. doi : 10.1371/journal.pone.0042691 . ISSN 1932-6203. PMC 3411824 . PMID 22880083.
- ^ ヤコブソン、マティアス;ハーゲンブラッド、ジェニー。タバレ、サイモン。セール、トールビョルン。ハルデン、クリスター。リンド・ハルデン、クリスティーナ。ノードボーグ、マグナス (2006)。 「異四倍体種シロイヌナズナの最近のユニークな起源: 核 DNA マーカーからの証拠」。分子生物学と進化。23 (6): 1217–31。土井: 10.1093/molbev/msk006。PMID 16549398。
さらに読む
- Al-Shehbaz, IA, O'Kane, Steve L. (2002). Arabidopsis (Brassicaceae) の分類と系統学。The Arabidopsis Book : 1-22。
- チェッカート、ルカ。マシエロ、シモーナ。シンハ・ロイ、ドーラ。ベンシベンガ、ステファノ。ロイグ・ビラノバ、イルマ。ディテングー、フランク・アニセット。パルメ、クラウス。サイモン、リュディガー。コロンボ、ルシア (2013-06-17)。カイツブリ、マルクス (編)。 「シロイヌナズナの雌配偶体発育にはPIN1の母性制御が必要である」。PLoS ONE。8 (6): e66148。土井:10.1371/journal.pone.0066148。ISSN 1932-6203。PMC 3684594。PMID 23799075 。
- オケイン・ジュニア、SL、アイオワ州アル・シェバズ(1997)。シロイヌナズナ (アブラナ科) の概要: Novon 7: 323–327。
- O'Kane Jr, SL, i Al-Shehbaz, IA (2003). 核リボソームDNAの配列に基づくアラビドプシス(アブラナ科)の系統学的位置と属の限界:ミズーリ植物園紀要90(4):603–612。
- 「アラビドプシスブック」。アメリカ植物生物学会。2019年4月13日。 2021年8月14日閲覧。(2013 年に ASPB は新しい章の出版を停止することを決定したことに注意してください。)
