
抗miRNAオリゴヌクレオチド( AMOとも呼ばれる)は、細胞力学において多くの用途がある。これらの合成的に設計された分子は、細胞内でのマイクロRNA(miRNA)の機能を中和して、望ましい応答を得るために使用される。miRNAは、RNAの切断または翻訳の抑制に関与するmRNAの相補配列(約22 bp)である。[ 1 ]細胞内でmRNAを調節するmiRNAを制御することにより、AMOは、さらなる調節や特定の細胞疾患の治療に使用できる。この調節は、立体障害メカニズムとmiRNAとのハイブリダイゼーションによって起こる可能性がある。 [ 2 ]体内でのmiRNAとAMO間のこれらの相互作用は、過剰発現または低発現が起こる疾患、あるいはmiRNAの異常がコーディングの問題につながる疾患の治療に使用できる。ヒトで見られるmiRNA関連疾患には、癌、筋疾患、自己免疫疾患、ウイルスなどがある。特定のAMOの機能性を判断するには、AMO/miRNA結合発現(転写産物濃度)を単離したmiRNAの発現と比較して測定する必要があります。遺伝子発現レベルの違いを直接検出することで、AMOとmiRNAの関係を明らかにすることができます。これは、ルシフェラーゼ活性(標的酵素活性に応答した生物発光)によって検出できます。これらの疾患に関与するmiRNA配列を理解することで、抗miRNAオリゴヌクレオチドを用いて、これらの疾患の症状を引き起こす可能性のある細胞タンパク質の過剰発現または過剰発現につながる経路を阻害することが可能になります。
抗miRNAオリゴヌクレオチドの設計においては、結合親和性を最適化し、ヌクレアーゼ耐性を向上させ、生体内送達を可能にするために必要な改変を考慮する必要がある。[ 3 ]高い結合親和性と高い特異性を持つAMOを開発する試みで、いくつかの世代の設計が行われてきた。第一世代では、エキソヌクレアーゼの攻撃を防ぐために、両端にホスホロチオエートインターヌクレオチド結合を有する2'-O-メチルRNAヌクレオチドが利用された。最近の研究では、結合親和性を向上させ、エキソヌクレアーゼによる分解を阻害する化合物、N,N-ジエチル-4-(4-ニトロナフタレン-1-イルアゾ)-フェニルアミン(ZEN)が発見された。[ 4 ]この方法は第一世代の設計と組み合わされ、効果が向上した新世代のZEN-AMOが作られた。
AMOのさまざまな構成要素を操作することで、AMOの結合親和性と効力に影響を与えることができます。AMOの2'-糖は、フッ素やさまざまなメチル基で置換するように修飾することができ、ほとんどの場合、結合親和性が向上します。しかし、これらの修飾された2'-糖AMOの中には、細胞増殖に悪影響を及ぼすものもありました。5'-3'ホスホジエステル骨格結合をホスホロチオレート(PS)骨格結合に修飾すると、標的親和性にも影響があることが示されています。PS変異を使用すると、オリゴヌクレオチドのTmが低下し、標的親和性が低下することが示されています。AMOの最後の要件は、ミスマッチ特異性と長さの制限です。同じファミリーのmiRNAは「シード」(共有)配列を共有し、追加のヌクレオチドが数個異なるだけなので、1つのAMOが複数のmiRNA配列を標的にできる可能性があります。しかし、単一ヌクレオチドのミスマッチで活性が失われるため、これは難しいことが研究で示唆されています。 3つ以上のミスマッチは活性の完全な喪失を示す。AMOの長さの変化ははるかに許容され、1つのヌクレオチドと2つのヌクレオチドの変化は活性のわずかな喪失をもたらし、3つ以上の変化は活性の完全な喪失をもたらした。3'末端から1つのヌクレオチドを切り詰めると、AMO活性がわずかに向上した。[ 5 ]
アンタゴミア(アンチmiRとも呼ばれる)は、内因性マイクロRNAをサイレンシングするように設計された、化学的に設計されたアンチmiRNAオリゴヌクレオチドの一種である。[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]その構造は、分解に対する耐性を高めるために修飾されている。これには、リボース糖上の2'-メトキシ基、ホスホロチオエート結合を持つ骨格、および3'末端のコレステロール結合が含まれる。[ 9 ]
ブロックミルは同様に設計された分子ですが、その一方で、マイクロRNAによって標的とされるmRNA配列に相補的な配列を持つように設計されています。ブロックミルはmRNAの非翻訳領域に結合すると、立体的にマイクロRNAが同じ部位に結合するのを阻害します。ブロックミルは個々のmRNAに結合し、miRNAには結合しないため、その活性はアンタゴミアよりも予測しやすく、オフターゲット効果を引き起こす可能性が低くなります。[ 10 ]

AMOの送達には、標的細胞へのin vitroトランスフェクションが必要です。現在、従来のトランスフェクション法には、送達効率が低いという問題があります。AMO送達の有効性を高めるために、2011年の論文では、機能化された金ナノ粒子の使用が提案されました。金ナノ粒子は、相補性を使用してAMOにアニーリングするカーゴDNAと結合することで、送達効率を高めます。カーゴDNAはナノ粒子の表面に付着します。[ 11 ]多くのDNAおよびRNAの変異体はin vivo条件下で不安定であるため、ヌクレアーゼによる分解から保護するために、ナノ粒子などのキャリアが必要です。これらのナノ粒子は、細胞への取り込みを促進し、遺伝情報を核に伝達するのに役立ちます。[ 12 ]マウスでの結果によって裏付けられた別のin vivo送達方法は、AMOの静脈内注射です。マウスの尾静脈へのAMOの注射は有効であることが示されました。このシステムが有用となるためには、AMOは細胞膜を介した細胞内への取り込みを増やすためにコレステロールと結合され、AMOの分解を防ぐために2′-OMeホスホラミダイトによって化学的に修飾された。[ 13 ]
AMOの存在と機能を検出するために、研究者はmiRNAの標的酵素またはタンパク質の相対活性を観察することができる。この方法は、複数のmiRNAを標的とする単一のAMOの研究で使用され、HEK293細胞における相対ルシフェラーゼ活性がモニタリングされた。相対ルシフェラーゼ活性レベルを決定するために、miRNAが存在しないコントロールが含まれた。阻害性miRNAとともに機能的なAMOが存在すると、酵素の活性を抑制するmiRNAの不活性化により、ルシフェラーゼ活性が増加する。[ 14 ]
多くのヒト疾患において、miRNAの発現の変化や異常が認められています。miRNAは、癌、ウイルス遺伝子、代謝経路[ 15 ]、および筋疾患(特に心血管系関連)[ 16 ]に関連すると考えられる多くの重要な制御経路に関与していることがわかっています。miRNAの発現異常を起こしている細胞を標的とすることで、AMOを用いて発現の正常なバランスを回復させることができます。AMOを用いて過剰発現を最小限に抑え、低発現を増加させることで、これらの遺伝性疾患の一部は回避できるか、少なくとも症状を最小限に抑えることができます。これは、特定の遺伝子の発現に関与するmiRNA配列にAMOをハイブリダイズさせることによって行われます。問題は、AMOが十分な濃度でその機能を正常に果たしつつ、同時にベクターやAMO自体の毒性を回避できるほど低い濃度にする方法を見つけることです。
アンタゴミアは、疾患に関連する特定のmiRNAの活性を恒常的に阻害する方法として使用されます。たとえば、miR-21に対するアンタゴミアは、心臓[ 17 ]および肺[ 18 ]の線維化を阻害するために成功裏に使用されています。
すべてのがんは、異常な細胞増殖を引き起こすゲノムの変異です。この過剰な増殖に寄与または制御する因子を特定することで、がんの予防的治療につながる可能性があります。たとえば、慢性リンパ性白血病では、このがんの発現において、miRNA(mir-15およびmir-16)の領域がゲノムから欠落していることが示されています。一方、バーキットリンパ腫などの他のがんでは、miRNA配列の発現が増幅されています。[ 15 ]このことから、多くのmiRNAががんに関与する制御配列を持っていることが示唆されます。これらの制御が、おそらくAMOを介してより適切に制御されれば、がんの発症と進行を制御できる可能性があります。
さまざまな癌タイプの540個の腫瘍サンプルを研究した結果、15個のmiRNAが上方制御され、12個が下方制御されていることがわかった。[ 19 ]この研究から、これらのmiRNA配列が細胞内の細胞増殖とアポトーシスに影響を与えていることが結論付けられた。AMOは、癌に関与するmiRNAのこの制御因子として方程式に関与している。単一の影響を受けたmiRNA部位に結合した場合、その効果は最小限であるように見える。しかし、これらの暗黙のmiRNAすべてに結合する抗miRNAオリゴヌクレオチドの配列を作成することにより、癌細胞内の細胞死が増加した。[ 16 ]抗miRNAオリゴヌクレオチドの別のバリエーションであるアンタゴミアを使用した1つの研究は、マウスの誘導腫瘍の減少に焦点を当てた。2週間の治療後、腫瘍の増殖は抑制され、30%の症例で退縮が示された。[ 20 ]これは、AMOがmiRNAを介して癌を効果的に抑制するために使用できることを示している。この阻害は、miRNAが直接的に遺伝子発現を抑制することで、がん細胞内でタンパク質を生成するmRNA配列に結合すること、およびがんの細胞プロセスに対する制御が強化されることによって引き起こされる。
胚の組織発達において、miRNAは特定の筋肉発達のアップレギュレーションまたはダウンレギュレーションに役割を果たすことがある。miRNA-1は心筋前駆細胞と骨格筋前駆細胞間の筋分化に役割を果たしている。[ 21 ]発生において、前駆細胞のレベルが適切に制御されない場合、筋低形成を引き起こす可能性がある。筋肉生成に関与するこれらの既知のmiRNAのAMOを作成することにより、作成したAMOを使用してmiRNAをオフにすることで、筋肉生成のプロセス全体を通してmiRNAの特定のメカニズムを追跡することが可能となる。これにより、ミオゲニン(筋形成に関与する転写因子)の産生が停止する。次に、標準的な非阻害筋形成と比較してミオゲニンの変化を測定することにより、miRNAの機能がミオゲニンの合成をアップレギュレーションするかダウンレギュレーションするかを決定できる。[ 22 ]特定のmiRNA配列が筋肉の発達をどのように制御するかをさらに理解することで、AMOは、筋形成に関わる遺伝的エラーが検出された生物において、ミオゲニンの正常な産生レベルを促進するために利用できる。
AMOは、高濃度の過酸化水素が存在する状況下で心臓のアポトーシス(臓器低形成)を予防するためにも使用できます。過酸化水素は酸化ストレスを介してアポトーシスを誘発する可能性があります。これは、 Hによって引き起こされる酸化ストレスが2 O2はmiRNA-1の活性増加を誘導する。このmiRNA-1活性の増加はBcl-2の活性を抑制しHに対する反応は2 O2 が減少することで、心臓の酸化ストレスに対する抵抗力が生まれます。このため、心臓病では過酸化水素誘発性心筋細胞アポトーシスの量が減少します。 [ 23 ]抗miRNA-1オリゴヌクレオチドによる酸化ストレス条件下での心筋細胞死の減少により、miRNA 調節によって、心臓の発達や低酸素条件下での心筋の生存をより深く理解することができます。
自己免疫疾患とは、体が自分自身に対して免疫反応を起こし、体内で炎症反応を引き起こす状態です。自己免疫疾患は免疫系の細胞(B細胞、T細胞など)の異常を伴うため、脾臓やリンパ節など、これらのT細胞やB細胞の成熟に関わる体の部位でmiRNAが強く発現していると推測できます。[ 24 ] miRNAの異常、または転写後過程におけるmiRNAの機能の異常は、リンパ球の感受性の増加につながる可能性があります。感受性の増加により、これらのリンパ球は以前は結合できなかった抗原を標的にできるようになり、これらの抗原が体内の細胞に自然に存在する場合、リンパ球が自分自身を攻撃する可能性があります。[ 25 ]
その一例が関節リウマチで、この病気では体が自身の関節を破壊します。この破壊は、特定のmiRNAクラスターの過剰発現によって引き起こされます。これらのクラスターは滑膜線維芽細胞の増加を引き起こします。この線維芽細胞の増加により、特定のプロテアーゼの濃度が増加し、関節の軟骨の破壊を引き起こします。[ 24 ]この病気の発現に関与するmiRNAクラスターを標的にすることで、AMOを患部に添加すると、この疾患によって引き起こされる炎症を軽減することができます。
全身性エリテマトーデスは、身体に長期的な臓器障害を引き起こします。環境要因と遺伝的要因によって進行します。SLEでAMOを伴う影響を受けた臓器において発現が低下しているマイクロRNA(miR-184、miR-196a、miR-198、miR-21)[ 26 ]を標的とすることで、これらの遺伝子の正常な発現を回復させることができます。
細胞性miRNAはウイルス遺伝子発現を阻害すると考えられている。HIV -1の研究では、抗miRNA阻害剤を用いて、ウイルス遺伝子発現を阻害する2つのmiRNA、has-miR-29aと29bを不活性化した。has-miR-29aと29bを標的とする抗miRNAを導入すると、ウイルス遺伝子発現が増加することが示された。これは、miRNA阻害剤がHIV-1ウイルス中のhas-miR-29aと29bの阻害効果を直接標的にして逆転させることができることを示した。[ 27 ] AMOを作成することで、HIVの特定のゲノム配列をより深く研究することが可能になった。特定のウイルスのゲノムの働き方をさらに理解することで、科学者はこれらのウイルスに対する予防策を考案することができる。
エプスタイン・バーウイルス(EBV)の場合の抗miRNA制御のメカニズムは、HIV-1などの他のウイルスの場合とは少し異なります。EBVは、ヒトに感染する他の多くのウイルスとは異なり、miRNAを発現する能力を持つ、さまざまな癌に関連するヘルペスウイルスです。miRNAの効果を実証するためのノックダウンツールとして抗miRNAを使用する他の研究とは異なり、EBVの研究者は、ウイルスによって産生されるmiRNAを阻害するために抗miRNAを使用しました。EBVのmiRNAであるmiR-BART5は、タンパク質であるp53U p調節アポトーシス調節因子(PUMA)を制御します。抗miRNAである抗miR -BART5を使用してウイルスのmiR-BART5を枯渇させると、細胞のアポトーシスが誘発され、感染していると特定された細胞を死滅させることで疾患の制御につながりました。[ 28 ]
マイクロRNAによって媒介される宿主とウイルスの相互作用のもう1つの特異な例は、C型肝炎ウイルス(HCV)で起こります。肝臓の急性感染症を引き起こし、しばしば検出されずに慢性化するHCVは、ヒトmiRNA miR-122を使用して、RNAゲノムのキャップされていない5'末端にArgonaute2タンパク質をリクルートし、それによって細胞の抗ウイルス応答からそれを覆い隠し、安定化させます。この相互作用により、肝細胞からウイルスを除去するためにmiR-122を標的とするAMOが開発されました。[ 29 ]これらの化合物の中で最も進んでいるのは、ロックド核酸-DNAミックスマーであるミラビルセンで、現在臨床試験中です。[ 30 ] [ 31 ] ミラビルセンの興味深い点は、成熟したmiR-122を阻害するだけでなく、マイクロRNA前駆体分子のステムループ構造にも侵入し、生化学的アッセイや細胞培養においてmiR-122の生合成を阻害する能力が報告されていることです。[ 32 ]
マイクロRNA技術を用いてC型肝炎ウイルス(HCV)を標的とする主な方法は、肝臓特異的マイクロRNAをノックアウトすることです。miRNA -122はHCVのmRNA鎖の5'非翻訳領域に結合し、mRNAを抑制するというmiRNAの通常の機能とは逆に、C型肝炎ウイルスの発現を実際に上方制御します。したがって、このような場合の治療目標は、miRNA-122がHCV mRNAに結合しないようにして、このmRNAの発現を阻止することです。しかし、miRNA-122はコレステロール(HDL )や腫瘍抑制遺伝子(癌遺伝子)の活性も調節します。つまり、miRNA-122をノックアウトするとHCV感染が減少するだけでなく、腫瘍抑制遺伝子の活性も低下し、肝臓癌につながる可能性があります。 HCV mRNAを特異的に標的とするため(miRNA-122全体ではなく)、Blockmir技術が開発され、HCV mRNAのみを標的とすることで、癌遺伝子発現へのいかなる干渉も回避できるようになった。これは、シード1に適合するBlockmirを設計することで実現できる可能性がある。
マウスにおけるマイクロRNA-33a/bの阻害は、血中高密度リポタンパク質(HDL)レベルの上昇につながる。Abca1は肝細胞におけるHDL前駆体の産生に不可欠である。マクロファージにおいて、Abca1は酸化コレステロールを運ぶリポタンパク質からコレステロールを排出し、動脈硬化性プラークの形成を抑制する。このことから、マイクロRNA-33はAbca1の調節を介してHDLに影響を与えるという仮説が立てられる。したがって、Abca1の調節を標的とするために、Abca1 mRNA分子に特異的に結合し、そのmiRNA結合部位をブロックして発現を上方制御するブロックmiRを開発することができる。このようなブロックmiR技術の応用により、HDLレベル全体の上昇につながる可能性がある。
マウスにおけるマイクロRNA-103/107阻害はインスリン感受性とシグナル伝達の増加につながる[ 33 ]。カベオリン-1欠損マウスはインスリン抵抗性を示すことが以前に示されている。カベオリン-1欠損マウスにおけるマイクロRNA-103/107阻害はインスリン感受性とシグナル伝達に影響を与えなかった。したがって、マイクロRNA-103/107はカベオリン-1を標的とすることでインスリン感受性に影響を与える可能性がある。 [ 34 ]
ブロックmiR CD5-2は、 miR-27とVE-カドヘリンの相互作用を阻害し、マウスの虚血性損傷からの回復を促進することが示されている。 [ 35 ]また、この薬剤は、膵臓癌のマウスモデルにおいて免疫療法と併用することでT細胞浸潤を促進することも示されている。[ 36 ]
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