歴史
1998年~現在:商業的にサポートされている製品システムの利用者数の増加に伴い、ZIBがソフトウェアの配布とサポートに割ける能力が限界に達し始めた。ZIBの主な使命はアルゴリズム研究であったためである。そこで、ハンス=クリスティアン・ヘーゲ、デトレフ・スタリング、マルテ・ウェスターホフによって、スピンオフ企業であるIndeed – Visual Concepts GmbHが設立された。
1998年2月、HyperPlanソフトウェアは、アプリケーションに依存しない新しい名称「Amira 」に変更されました。この名称は頭字語ではなく、様々な言語で発音しやすく、 ラテン語の 動詞「admirare」(賞賛する)から「見る」「驚嘆する」といった適切な意味合いを持つように選ばれました。これは、データ視覚化における基本的な状況を反映しています。
デトレフ・スタリングとマルテ・ウェスターホフは、このソフトウェアを商用的にサポート可能な製品にし、SGI以外のコンピュータでも利用できるようにするために、大幅な再設計を行った。1999年3月、商用版Amiraの最初のバージョンが、ドイツのハノーバーで開催された CeBIT 見本市で、SGI IRIX およびヒューレット・パッカードUniX(HP-UX)の ブースで展示された。Linux版 とMicrosoft Windows 版は、その後12か月以内にリリースされた。後にMac OS Xのサポートも追加された。実際、Visual Concepts GmbHは、フランスのボルドー と米国のサンディエゴ に拠点を置くTGS, Inc.をAmiraの世界的な販売代理店に選び、その後4年間で5つのメジャーリリース(バージョン3.1まで)を完了した。
2003年、Indeed – Visual Concepts GmbHとTGS, Inc.はともにマサチューセッツ州に拠点を置くMercury Computer Systems, Inc.(NASDAQ:MRCY)に買収され、Mercuryの新設ライフサイエンス 事業部門の一部となり、後にVisage Imagingとブランド名が付けられました。2009年、Mercury Computer Systems, Inc.はVisage Imagingを再びスピンオフし、オーストラリアのメルボルン に拠点を置く放射線情報システムおよび医療ITソリューションの大手プロバイダーであるPromedicus Ltd(ASX:PME)に売却しました。この間、Amiraはドイツのベルリン で、Amiraのオリジナル開発者が率いるZIBと緊密に協力しながら開発が続けられました。フランスのボルドーに拠点を置くTGSは、Mercury Computer Systemsによってフランスの投資家に売却され、Visualization Sciences Group(VSG)と改名されました。VSGは、同じソースコードをベースに材料科学向けにカスタマイズされたAvizo という補完的な製品の開発を続けました。
2012年8月、当時Amira最大のOEM販売代理店であったFEIは 、PromedicusからVSGとAmira事業を買収しました。これにより、姉妹ソフトウェアであるAmiraとAvizoが再びFEIの傘下に入りました。2013年8月、Visualization Sciences Group(VSG)はFEIの事業部門となりました。2016年、FEIはThermo Fisher Scientific に買収され、2017年初頭に同社の材料・構造解析部門の一部となりました。
AmiraとAvizoは、現在もライフサイエンス向けAmiraと材料科学向けAvizoという2つの異なる製品として販売されていますが、開発体制は再び統合されました。現在までに、Amira/Avizoソフトウェアを使用した科学論文数は1万件に達しています。
アミラオプション
顕微鏡オプション 顕微鏡データ専用の読み取り装置 画像デコンボリューション ほぼあらゆる顕微鏡から得られる3D画像の探索 顕微鏡画像からのフィラメントネットワークの抽出と編集
DICOMリーダー DICOM形式での臨床データおよび前臨床データのインポート
メッシュオプション セグメント化された画像データからの3D有限要素(FE)メッシュの生成 多くの最先端の有限要素ソルバー形式をサポート スカラー、ベクトル、テンソル場表示モジュールを使用して、シミュレーションメッシュベースの結果を高品質で可視化します。
骨格化オプション 神経および血管ネットワークの再構築と解析 骨格化ネットワークの可視化 ネットワークセグメントの長さと直径の定量化 ツリーグラフにおけるセグメントの順序付け 非常に大きな画像スタックの骨格化
分子オプション 分子モデルを可視化するための高度なツール ハードウェアアクセラレーションによるボリュームレンダリング 強力な分子エディター 複雑な分子可視化のための専用ツール
開発者向けオプション 視覚化またはデータ処理のための新しいカスタムコンポーネントの作成 新しいファイルリーダーまたはライターの実装 C++プログラミング言語 すぐに始められる開発ウィザード
ニューロオプション DTIおよび脳灌流の医用画像解析 複数のストリームラインベースのアルゴリズムをサポートするファイバー追跡 ユーザー定義の送信元および宛先領域に基づいて、ファイバーをファイバーバンドルに分離する。 テンソル場、拡散強調マップの計算 テンソル場の固有値分解 平均通過時間、脳血流量 、および脳血流量の計算
VRオプション 大型タイルディスプレイや没入型仮想現実(VR)環境におけるデータの可視化 3Dナビゲーションデバイスのサポート 高速マルチスレッド分散レンダリング
非常に大きなデータオプション 利用可能なメインメモリ容量を超える画像データの可視化を、効率的なアウトオブコアデータ管理を用いてサポートします。 直交スライス、斜めスライス、ボリュームレンダリング、等値面レンダリングなど、多くの標準モジュールを拡張し、アウトオブコアデータに対応できるようにしました。
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