ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| アサ1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ASAH1、AC、ACDase、ASAH、PHP、PHP32、SMAPME、N-アシルスフィンゴシンアミドヒドロラーゼ(酸性セラミダーゼ)1、N-アシルスフィンゴシンアミドヒドロラーゼ1 |
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| 外部ID | オミム:613468; MGI : 1277124;ホモロジーン: 10504;ジーンカード:ASAH1; OMA :ASAH1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体8(マウス)[2] |
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| | バンド | 8|8 A4 | 始める | 41,793,234 bp [2] |
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| 終わり | 41,827,810 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 右心室
- 臓側胸膜
- 膵管細胞
- 網膜色素上皮
- 心筋
- 壁側胸膜
- 鼻上皮
- 単球
- 腎髄質
- 左心室
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| | トップの表現 | - 球形嚢
- 骨髄間質
- リンパ管の内皮細胞
- 耳板
- 虹彩
- 頭蓋冠
- 毛様体
- 耳下腺
- 脈絡叢上皮
- 胃の上皮
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- N-アシルスフィンゴシンアミドヒドロラーゼ活性
- 触媒活性
- 加水分解酵素活性
- 加水分解酵素活性、炭素-窒素結合(ペプチド結合ではない)に作用する
- セラミダーゼ活性
- 直鎖アミド中の炭素-窒素(ペプチドではない)結合に作用する加水分解酵素活性
| | 細胞成分 |
- リソソーム
- リソソーム腔
- 細胞外エクソソーム
- 細胞外領域
- 細胞外空間
- 三次顆粒腔
- フィコリン-1を多く含む顆粒腔
- 初期エンドソーム
- 小胞体
- 核
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- スフィンゴ糖脂質代謝プロセス
- セラミド代謝プロセス
- 脂質代謝
- 好中球脱顆粒
- スフィンゴシン生合成過程
- セラミドの生合成過程
- セラミド分解プロセス
- ケラチノサイトの分化
- ステロイド生合成過程の調節
- プログラムされた壊死性細胞死の調節
- 腫瘍壊死因子に対する細胞反応
- スフィンゴ脂質代謝プロセス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001127505 NM_004315 NM_177924 NM_001363743 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001120977 NP_004306 NP_808592 NP_001350672 |
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| 場所 (UCSC) | 8 章: 18.06 – 18.08 Mb | 8 章: 41.79 – 41.83 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ASAH1遺伝子はヒトにおいて酸性セラミダーゼ酵素をコードする。 [ 5 ] [ 6 ] [7]
関数
この遺伝子は、翻訳後に成熟酵素に切断される非グリコシル化αサブユニットとグリコシル化βサブユニットからなるヘテロ二量体タンパク質をコードします。コードされたタンパク質は、セラミドのスフィンゴシンと脂肪酸への合成と分解を触媒します。この遺伝子の変異は、ファーバー病として知られるリソソーム蓄積症と、最近では進行性ミオクロニーてんかんを伴う脊髄性筋萎縮症として知られるまれな神経変性疾患と関連付けられています。[8]この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが特定されています。[7]メラノサイト細胞では、 ASAH1遺伝子の発現はMITFによって制御されている可能性があります。[9]
神経膠芽腫の薬剤ターゲットとして
ASAH1の発現は放射線照射後に上昇し、神経膠芽腫に対する放射線抵抗性の付与と再発性神経膠芽腫の発症に役割を果たしていることを示唆している。 [10]複数の国で大腸がんの臨床治療に承認されている薬剤であるカルモフールでASAH1の活性を阻害すると、かなりの細胞死につながるため、神経膠芽腫の治療における薬剤標的として提案されている。[11]また、小児脳腫瘍に対する新しい薬剤標的であることも示唆されている。[12]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000104763 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031591 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Koch J、Gärtner S、Li CM、Quintern LE、Bernardo K、Levran O、Schnabel D、Desnick RJ、Schuchman EH、Sandhoff K (1996 年 12 月)。「ヒト酸性セラミダーゼをコードする完全長相補 DNA の分子クローニングと特性評価。ファーバー病を引き起こす最初の分子病変の特定」。The Journal of Biological Chemistry。271 ( 51): 33110– 5。doi : 10.1074 /jbc.271.51.33110。PMID 8955159 。
- ^ Li CM、Park JH、He X、Levy B、Chen F、Arai K、Adler DA、Disteche CM、Koch J、Sandhoff K、Schuchman EH (1999 年 12 月)。「ヒト酸性セラミダーゼ遺伝子 (ASAH): 構造、染色体位置、変異分析、および発現」。Genomics . 62 ( 2): 223– 31. doi :10.1006/geno.1999.5940. PMID 10610716。
- ^ ab "Entrez 遺伝子: ASAH1 N-アシルスフィンゴシンアミドヒドロラーゼ (酸性セラミダーゼ) 1".
- ^ チョウ・J、トーク・M、ティツィアーノ・FD、ヴェイレット・J、ベイズ・M、ノレント・F、ガルシア・V、セルビデイ・S、ベルティーニ・E、カストロ・ジナー・F、レンダ・Y、カーペンティエ・S、アンドリュー・アバディ・N、ガット・I、レヴァデ・T、トパログル H、メルキ J (2012 年 7 月)。 「進行性ミオクロニーてんかんに伴う脊髄性筋萎縮症は、ASAH1の変異によって引き起こされる」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。91 (1): 5–14 .土井:10.1016/j.ajhg.2012.05.001。PMC 3397266。PMID 22703880。
- ^ Hoek KS、Schlegel NC、Eichhoff OM、Widmer DS、Praetorius C、Einarsson SO、Valgeirsdottir S、Bergsteinsdottir K、Schepsky A、Dummer R、Steingrimsson E (2008 年 12 月)。「2 段階 DNA マイクロアレイ戦略を使用して特定された新しい MITF ターゲット」。Pigment Cell & Melanoma Research。21 ( 6 ): 665– 76。doi : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x。PMID 19067971。S2CID 24698373 。
- ^ Doan NB、Nguyen HS、Al-Gizawiy MM、Mueller WM、Sabbadini RA、Rand SD、Connelly JM、Chitambar CR、Schmainda KM、Mirza SP (2017 年 10 月)。「酸性セラミダーゼは神経膠芽腫細胞に放射線耐性を付与する」。腫瘍学レポート 。38 ( 4 ): 1932– 40。doi :10.3892/or.2017.5855。PMC 5652937。PMID 28765947。
- ^ Doan NB、Alhajala H、Al-Gizawiy MM、Mueller WM、Rand SD、Connelly JM、Cochran EJ、Chitambar CR、Clark P、Kuo J、Schmainda KM、Mirza SP (2017 年 12 月)。「酸性セラミダーゼとその阻害剤: 新規薬物ターゲットと、高効率で神経膠芽腫癌幹細胞を殺すための新しいクラスの薬物」。Oncotarget。8 ( 68 ) : 112662– 74。doi : 10.18632 / oncotarget.22637。PMC 5762539。PMID 29348854。
- ^ Doan NB、Nguyen HS、Montoure A、Al-Gizawiy MM、Mueller WM、Kurpad S、Rand SD、Connelly JM、Chitambar CR、Schmainda KM、Mirza SP (2017 年 4 月)。「酸性セラミダーゼは小児脳腫瘍の新たな薬剤ターゲットです」。Oncotarget。8 ( 15 ) : 24753– 61。doi : 10.18632 / oncotarget.15800。PMC 5421885。PMID 28445970。
外部リンク
さらに読む
- Perry DK、 Hannun YA(1998年12月)。「細胞シグナル伝達におけるセラミドの役割」。Biochimica et Biophysica Acta(BBA) - 脂質の分子および細胞生物学。1436 (1-2):233-43。doi:10.1016/S0005-2760(98)00145-3。PMID 9838138 。
- Bernardo K、Hurwitz R、Zenk T、Desnick RJ、Ferlinz K、Schuchman EH、Sandhoff K (1995 年 5 月)。「ヒト酸性セラミダーゼの精製、特性評価、および生合成」。The Journal of Biological Chemistry。270 ( 19 ): 11098– 102。doi : 10.1074/jbc.270.19.11098。PMID 7744740 。
- Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Seelan RS、Qian C、Yokomizo A 、 Bostwick DG、Smith DI、Liu W (2000 年 10 月)。「ヒト酸性セラミダーゼは前立腺癌で過剰発現しているが変異していない」。遺伝子、染色体、癌。29 (2): 137– 46。doi :10.1002/1098-2264(2000)9999:9999 < ::AID-GCC1018>3.0.CO;2- E。PMID 10959093。S2CID 21766341 。
- Strelow A、Bernardo K、Adam-Klages S、Linke T、Sandhoff K、Krönke M、Adam D (2000 年 9 月)。「酸性セラミダーゼの過剰発現は腫瘍壊死因子誘導性細胞死から保護する」。実験医学 ジャーナル。192 ( 5): 601– 12。doi :10.1084/ jem.192.5.601。PMC 2193270。PMID 10974027。
- Bär J、Linke T、Ferlinz K、Neumann U、Schuchman EH、Sandhoff K (2001 年 3 月)。「ファーバー病患者における酸性セラミダーゼ欠損の分子解析」。Human Mutation。17 ( 3 ) : 199– 209。doi : 10.1002 / humu.5。PMID 11241842。S2CID 39656479 。
- Ferlinz K、Kopal G、Bernardo K、Linke T、Bar J、Breiden B、Neumann U、Lang F、Schuchman EH、Sandhoff K (2001 年 9 月)。「ヒト酸性セラミダーゼ: 処理、グリコシル化、およびリソソーム標的化」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 38): 35352– 60。doi : 10.1074/ jbc.M103066200。PMID 11451951。
- 村松 孝文、坂井 暢、柳原 郁、山田 正之、西垣 孝文、國部 千恵子、塚本 秀、伊藤 正之、乾 功(2002 年 11 月)。「ファーバー病の日本人患者における酸性セラミダーゼ遺伝子の変異解析」遺伝 性代謝疾患ジャーナル。25 (7): 585– 92。doi : 10.1023 / A : 1022047408477。PMID 12638942。S2CID 26208268。
- Zhang H、Li XJ、Martin DB、Aebersold R (2003 年 6 月)。「ヒドラジド化学、安定同位体標識、質量分析法による N 結合型糖タンパク質の同定と定量」。Nature Biotechnology 21 ( 6): 660–6 . doi :10.1038/nbt827. PMID 12754519. S2CID 581283.
- Okino N, He X, Gatt S, Sandhoff K, Ito M, Schuchman EH (2003 年 8 月)。「ヒト酸性セラミダーゼの逆活性」。The Journal of Biological Chemistry . 278 (32): 29948– 53. doi : 10.1074/jbc.M303310200 . PMID 12764132。
- He X、Okino N、Dhami R、Dagan A、Gatt S、Schulze H、Sandhoff K、Schuchman EH (2003 年 8 月)。「組み換え型ヒト酸性セラミダーゼの精製と特性評価。酸性スフィンゴミエリナーゼとの触媒反応と相互作用」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 35): 32978– 86。doi : 10.1074/jbc.M301936200。PMID 12815059。
- Hara S, Nakashima S, Kiyono T, Sawada M, Yoshimura S, Iwama T, Banno Y, Shinoda J, Sakai N (2004 年 8 月)。「ガンマ線誘導アポトーシス中のヒト神経膠腫細胞における p53 非依存性セラミド形成」。細胞 死と分化。11 (8): 853– 61。doi : 10.1038/ sj.cdd.4401428。PMID 15088070。
- Lewandrowski U、Moebius J、Walter U、 Sickmann A (2006 年 2 月)。「ヒト血小板タンパク質の N グリコシル化部位の解明: グリコプロテオミクスアプローチ」。分子および細胞プロテオミクス。5 (2): 226– 33。doi : 10.1074/ mcp.M500324 -MCP200。PMID 16263699。