ホモサピエンスで発見された哺乳類タンパク質
| ABCG1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ABCG1、ABC8、WHITE1、ATP結合カセットサブファミリーGメンバー1 |
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| 外部ID | オミム:603076; MGI : 107704;ホモロジーン: 21022;ジーンカード:ABCG1; OMA :ABCG1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 17番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 17|17 A3.3 | 始める | 31,276,649 bp [2] |
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| 終わり | 31,336,962 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 右副腎
- 左副腎
- 右副腎皮質
- 小腸粘膜
- 左副腎皮質
- 脾臓
- 腹直筋の骨格筋組織
- 肺の下葉
- 羊水
- 内淡蒼球
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| | トップの表現 | - 淡蒼球
- 右肺葉
- 嗅結節
- 血管条
- 背側線条体
- 内側背核
- 中央隆起
- 弓状核
- 嗅上皮
- 外側膝状体
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヌクレオチド結合
- タンパク質二量体化活性
- タンパク質ホモ二量体化活性
- ADP結合
- リン脂質トランスポーター活性
- ABC型ステロールトランスポーター活性
- コレステロール結合
- ATPase活性
- 毒素膜輸送活性
- タンパク質結合
- タンパク質ヘテロ二量体形成活性
- リン脂質結合
- ATP結合
- コレステロール転移活性
- ATPase結合膜輸送体の活性
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- リサイクルエンドソーム
- エンドソーム
- ゴルジ体
- 小胞体膜
- 膜
- ゴルジ膜
- 細胞膜
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 小胞体
- ミトコンドリア
- 細胞膜の外側
| | 生物学的プロセス |
- リン脂質の恒常性
- 脂質輸送
- 転写の調節、DNAテンプレート
- ホルモン刺激の検出
- リン脂質の流出
- 糖タンパク質輸送
- コレステロール輸送
- コレステロール代謝プロセス
- 有機物に対する反応
- コレステロール貯蔵の負の調節
- 脂質に対する反応
- 細胞内コレステロール輸送
- 低密度リポタンパク質粒子のリモデリング
- コレステロール排出の積極的な調節
- 膜輸送
- コレステロールの流出
- コレステロール生合成プロセスの正の調節
- 脂質貯蔵の負の調節
- コレステロール恒常性
- コレステロールエステル化の調節
- マクロファージ由来泡状細胞分化の負の制御
- アミロイド前駆体タンパク質の分解プロセス
- コレステロール逆輸送
- 毒素輸送
- 高密度リポタンパク質粒子のリモデリング
- 輸送
- 高密度リポタンパク質粒子刺激に対する細胞反応
- タンパク質分泌の正の調節
- アミロイドβ形成の正の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_004915 NM_016818 NM_207174 NM_207627 NM_207628
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NM_207629 NM_207630 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_004906 NP_058198 NP_997057 NP_997510 NP_997511
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NP_997512 |
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| 場所 (UCSC) | 21章: 42.2 – 42.3 Mb | 17章: 31.28 – 31.34 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ATP結合カセットサブファミリーGメンバー1は、ヒトではABCG1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]これはよく知られているショウジョウバエ遺伝子whiteの相同遺伝子である。
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、ATP結合カセット(ABC)トランスポーターのスーパーファミリーのメンバーです。ABCタンパク質は、細胞外膜と細胞内膜を介してさまざまな分子を輸送します。ABC遺伝子は7つの異なるサブファミリー(ABC1、MDR / TAP、MRP、ALD、OABP、GCN20、White)に分けられます。このタンパク質はWhiteサブファミリー(サブファミリーG )のメンバーです。マクロファージの コレステロールとリン脂質の輸送に関与し、他の細胞タイプの細胞脂質恒常性を調節している可能性があります。いくつかの選択的スプライスバリアントが特定されています。[7]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000160179 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024030 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Chen H、Rossier C、Lalioti MD、Lynn A、Chakravarti A、Perrin G、Antonarakis SE (1996 年 7 月)。「ショウジョウバエの白色遺伝子のヒト相同遺伝子の cDNA のクローニングと染色体 21q22.3 へのマッピング」。American Journal of Human Genetics。59 ( 1): 66–75。PMC 1915121。PMID 8659545 。
- ^ Engel T、Bode G、Lueken A、Knop M、Kannenberg F、Nofer JR、Assmann G、Seedorf U (2006 年 8 月)。「ABCG1 スプライスバリアント ABCG1(666) の発現と機能特性」。FEBS Letters。580 ( 18 ) : 4551–9。doi : 10.1016/ j.febslet.2006.07.006。PMID 16870176。S2CID 22947257 。
- ^ ab "Entrez Gene: ABCG1 ATP結合カセット、サブファミリーG (WHITE)、メンバー1"。
さらに読む
- Schmitz G、Langmann T、Heimerl S (2001 年 10 月)。 「脂質代謝における ABCG1 とその他の ABCG ファミリー メンバーの役割」。Journal of Lipid Research。42 ( 10): 1513–20。doi : 10.1016 / S0022-2275 (20)32205-7。PMID 11590207。
- Andersson B、 Wentland MA、Ricafrente JY、Liu W 、 Gibbs RA (1996 年 4 月)。「改良されたショットガン ライブラリ構築のための「ダブル アダプター」法」。Analytical Biochemistry。236 ( 1): 107–13。doi :10.1006/abio.1996.0138。PMID 8619474 。
- Savary S、Denizot F、 Luciani M、Mattei M、Chimini G (1996 年 9 月)。「ショウジョウバエの白色遺伝子に相同な哺乳類 ABC トランスポーターの分子クローニング」。哺乳類 ゲノム。7 ( 9): 673–6。doi :10.1007/s003359900203。PMID 8703120。S2CID 1077887 。
- Croop JM、Tiller GE、Fletcher JA、Lux ML、Raab E、Goldenson D、Son D、Arciniegas S、Wu RL (1997 年 1 月)。「ショウジョウバエの白色遺伝子の哺乳類ホモログの分離と特徴付け」。遺伝子185 ( 1 ): 77–85。doi :10.1016/S0378-1119(96)00633-6。PMID 9034316 。
- Yu W、Andersson B、Worley KC、Muzny DM、Ding Y、Liu W、Ricafrente JY、Wentland MA、Lennon G、Gibbs RA (1997 年 4 月)。「大規模連結 cDNA シーケンシング」。ゲノム研究。7 ( 4 ): 353–8。doi :10.1101/ gr.7.4.353。PMC 139146。PMID 9110174 。
- Klucken J、Büchler C、Orsó E、Kaminski WE、Porsch-Ozcürümez M、Liebisch G、Kapinsky M、Diederich W、Drobnik W、Dean M、Allikmets R、Schmitz G (2000 年 1 月)。「ショウジョウバエの白色遺伝子のヒト相同遺伝子である ABCG1 (ABC8) は、マクロファージのコレステロールおよびリン脂質輸送の調節因子である」。米国 科学アカデミー紀要。97 ( 2 ): 817–22。Bibcode : 2000PNAS ...97..817K。doi : 10.1073 / pnas.97.2.817。PMC 15414。PMID 10639163。
- Venkateswaran A、Repa JJ、Lobaccaro JM、Bronson A、Mangelsdorf DJ、Edwards PA (2000 年 5 月)。「脂質負荷マクロファージでは、ヒト白血球/マウス ABC8 mRNA レベルが著しく誘導される。特定のオキシステロールの転写役割」。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 19): 14700–7。doi : 10.1074/ jbc.275.19.14700。PMID 10799558 。
- Berry A、Scott HS、Kudoh J、Talior I、Korostishevsky M、Wattenhofer M、Guipponi M、Barras C、Rossier C、Shibuya K、Wang J、Kawasaki K、Asakawa S、Minoshima S、Shimizu N、Antonarakis S、Bonné-Tamir B (2000 年 8 月)。「34 個の新規マイクロサテライトマーカー、ゲノム構造、および領域内の 6 つの既知遺伝子の除外を使用した常染色体劣性非症候性難聴 DFNB10 遺伝子座の精密な位置特定」。Genomics。68 ( 1 ) : 22–9。doi : 10.1006 /geno.2000.6253。PMID 10950923 。
- Langmann T、Porsch-Ozcürümez M、Unkelbach U、Klucken J、Schmitz G (2000 年 11 月)。「ヒト ATP 結合カセットトランスポーター G1 (ABCG1) 遺伝子のプロモーターのゲノム構成と特性」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 遺伝子構造と発現。1494 (1–2): 175–80。doi : 10.1016/s0167-4781(00) 00215-3。PMID 11072082。
- Lorkowski S、Rust S、Engel T、Jung E、Tegelkamp K、Galinski EA、Assmann G、Cullen P (2001 年 1 月)。「ヒト ABCG1 (ABC8) 遺伝子のゲノム配列と構造」。生化学および生物物理学的研究通信。280 (1): 121–31。doi :10.1006/ bbrc.2000.4089。PMID 11162488 。
- Porsch-Ozcurumez M、Langmann T、Heimerl S、Borsukova H、Kaminski WE、Drobnik W、Honer C、Schumacher C、Schmitz G (2001 年 4 月)。「ジンクフィンガータンパク質 202 (ZNF202) は、ATP 結合カセットトランスポーター A1 (ABCA1) および ABCG1 遺伝子発現の転写抑制因子であり、細胞脂質流出の調節因子である」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 15): 12427–33。doi : 10.1074/jbc.M100218200。PMID 11279031。
- Lorkowski S、Kratz M、Wenner C、Schmidt R、Weitkamp B、Fobker M、Reinhardt J、Rauterberg J、Galinski EA、Cullen P (2001 年 5 月)。「タンジール病における ATP 結合カセットトランスポーター遺伝子 ABCG1 (ABC8) の発現」。生化学および生物物理学的研究通信。283 (4): 821–30。doi : 10.1006 /bbrc.2001.4863。PMID 11350058 。
- Kennedy MA、Venkateswaran A、Tarr PT、Xenarios I、Kudoh J、Shimizu N、Edwards PA (2001 年 10 月)。「ヒト ABCG1 遺伝子の特性: 肝臓 X 受容体は、タンパク質の代替形態をコードする新しい転写産物を生成する内部プロモーターを活性化します」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 42): 39438–47。doi : 10.1074/jbc.M105863200。PMID 11500512。
- Kaplan R、Gan X、Menke JG、Wright SD、Cai TQ (2002 年 6 月)。「細菌性リポ多糖は LXR 非依存経路を介して ABCA1 の発現を誘導するが、ABCG1 の発現は誘導しない」。Journal of Lipid Research。43 ( 6): 952–9。doi : 10.1016 /S0022-2275(20)30470-3。PMID 12032171。
- Cserepes J、Szentpétery Z、Seres L、Ozvegy-Laczka C、Langmann T、Schmitz G、Glavinas H、Klein I、Homolya L、Váradi A、Sarkadi B、Elkind NB (2004 年 7 月)。「ヒト ABCG1 および ABCG4 タンパク質の機能的発現と特性: ヘテロ二量体化の兆候」。生化学および生物物理学的研究通信。320 (3): 860–7。doi :10.1016/ j.bbrc.2004.06.037。PMID 15240127 。
外部リンク
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。