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| ビタミンKエポキシド還元酵素（ワルファリン感受性） | |||||||||
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 反応 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 1.17.4.4 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | BRENDAエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZyme ビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイク | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | アミゴー / クイックゴー | ||||||||
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| ビタミンKエポキシド還元酵素 | |||||||||
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 細菌の VKOR の構造。膜は線で示されています ( PDB : 3KP9 )。 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | ヴコル | ||||||||
| パム | PF07884 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| キャス | 3kp9 | ||||||||
| TCDB | 9.B.265 | ||||||||
| OPMスーパーファミリー | 18 | ||||||||
| OPMタンパク質 | 3kp9 | ||||||||
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ビタミン K エポキシド還元酵素( VKOR ) は、血液凝固酵素中のグルタミン酸残基のカルボキシル化で酸化されたビタミン Kを還元する酵素( EC 1.17.4.4)です。VKOR は、脊椎動物、ショウジョウバエ、植物、細菌、古細菌に存在すると予測される酵素の大きなファミリーのメンバーです。[1]一部の植物および細菌のホモログでは、VKORドメインがチオレドキシンファミリーの酸化還元酵素のドメインと融合しています。[1]
4 つのシステイン残基と、セリンまたはスレオニンのいずれかである 1 つの残基が、活性部位残基である可能性が高いことが特定されています。[1]細菌の VKOR 構造が解明されたことで、触媒メカニズムに関するさらなる洞察が可能になりました。すべての VKOR は、触媒コアに少なくとも 3 つの TM ヘリックスを持つ膜貫通タンパク質です。還元されるキノンは、DsbB活性部位と同様に、C 末端ヘリックス内の酸化還元活性 CXXC モチーフによって結合されています。N 末端の他の 2 つのシステインは、膜貫通領域の外側のループに位置しており、酸化還元タンパク質 (または細菌ホモログの場合は、独自の融合ドメイン) と電子を中継します。[2] [3]
VKORのヒト遺伝子はVKORC1 （VKOR複合体サブユニット1）と呼ばれています。これは抗凝固薬 ワルファリンの標的です。そのパートナーは未知の正体を持つ酸化還元タンパク質であり、[4] [5]おそらくTMX1などのER腔に位置するチオレドキシン様タンパク質です。[6]
類似の遺伝子としてVKORC1L1も存在する。この遺伝子が形成するVKORL1複合体はエポキシドの還元効率ははるかに低いが、ビタミンKのキノン型をジオール型（KH 2 ）に還元する能力がある。EC 1.17.4.4では、両方のパラログが両方の活性を持つと記載されているが、 in vitroでの正確な分担については議論がある。[7]
参考文献
- ^ abc Goodstadt L、Ponting CP (2004 年6 月)。「ビタミン K エポキシド還元酵素: 相同性、活性部位、触媒メカニズム」。生化学科学の動向。29 (6): 289–92。doi :10.1016/ j.tibs.2004.04.004。PMID 15276181 。
- ^ Li W, Schulman S, Dutton RJ, Boyd D, Beckwith J, Rapoport TA (2010 年 1 月). 「ビタミン K エポキシド還元酵素の細菌ホモログの構造」. Nature . 463 (7280): 507–12. Bibcode :2010Natur.463..507L. doi :10.1038/nature08720. PMC 2919313. PMID 20110994 .
- ^ Rishavy MA、Usubalieva A、Hallgren KW、Berkner KL (2011 年 3 月)。「ビタミン K 酸化還元酵素 (VKOR) のメカニズムに関する新たな知見: Cys43 と Cys51 を介した電子リレーにより VKOR が還元され、ビタミン K の還元とビタミン K 依存性タンパク質カルボキシル化の促進が可能になる」。The Journal of Biological Chemistry。286 ( 9 ): 7267–78。doi : 10.1074/ jbc.M110.172213。PMC 3044983。PMID 20978134。
- ^ Li T、Chang CY 、Jin DY、 Lin PJ、Khvorova A、Stafford DW (2004 年 2 月)。「ビタミン K エポキシド還元酵素遺伝子の同定」。Nature 427 ( 6974 ): 541–4。Bibcode :2004Natur.427..541L。doi : 10.1038 /nature02254。PMID 14765195。S2CID 4424554。
- ^ Rost S, Fregin A, Ivaskevicius V, Conzelmann E, Hörtnagel K, Pelz HJ, Lappegard K, Seifried E, Scharrer I, Tuddenham EG, Müller CR, Strom TM, Oldenburg J (2004 年 2 月). 「VKORC1 の変異がワルファリン耐性と多凝固因子欠損症 2 型を引き起こす」. Nature . 427 (6974): 537–41. Bibcode :2004Natur.427..537R. doi :10.1038/nature02214. PMID 14765194. S2CID 4424197.
- ^ Schulman, Sol; Wang, Belinda; Li, Weikai; Rapoport, Tom A. (2010 年 8 月 24 日). 「ビタミン K エポキシド還元酵素は ER 膜に固定されたチオレドキシン様の酸化還元パートナーを好む」. Proceedings of the National Academy of Sciences . 107 (34): 15027–15032. Bibcode :2010PNAS..10715027S. doi : 10.1073/pnas.1009972107 . PMC 2930587 . PMID 20696932.
- ^ Shearer MJ、Newman P (2014 年 3 月)。「ビタミン K の代謝と細胞生物学における最近の傾向、特にビタミン K サイクリングと MK-4 生合成について」。Journal of Lipid Research。55 ( 3 ) : 345–362。doi : 10.1194/ jlr.R045559。PMC 3934721。PMID 24489112。
