ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
タダ3 識別子 エイリアス TADA3 、ADA3、NGG1、STAF54、TADA3L、hADA3、転写アダプター3 外部ID オミム ：602945; MGI : 1915724; ホモロジーン : 4633; ジーンカード ：TADA3; OMA :TADA3 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体6（マウス） [1] バンド 6|6 E3 始める 113,342,986 bp [1] 終わり 113,354,844 bp [1]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 右副腎 左副腎 子宮内膜間質細胞 前頭前皮質 右冠動脈 扁桃体 下垂体前葉 帯状回 胸部大動脈 上行大動脈
トップの表現 受精卵 性器結節 二次卵母細胞 精細管 胎児の尾 顆粒球 胚盤胞 心室帯 神経管 一次卵母細胞
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質ドメイン特異的結合 DNA結合転写因子活性 転写活性化因子活性 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性 タンパク質結合 核受容体結合 核受容体コアクチベーター活性 チオール依存性脱ユビキチン化酵素 細胞成分
転写因子 TFTC 複合体 細胞内解剖構造 有糸分裂紡錘体 SAGAコンプレックス 核質 核 生物学的プロセス
タンパク質リン酸化の調節 転写の調節、DNAテンプレート タンパク質の安定性の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 ヒストン脱アセチル化の調節 転写、DNAテンプレート 転写の正の制御、DNAテンプレート チューブリン脱アセチル化の調節 遺伝子発現の正の調節 ヒストンH3のアセチル化 細胞内エストロゲン受容体シグナル伝達経路 タンパク質の脱ユビキチン化 ヒストンH4のアセチル化 有糸分裂細胞周期 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001278270 NM_006354 NM_133480 NM_133481
NM_133932 NM_001372392 NM_001372393
RefSeq (タンパク質) NP_001265199 NP_006345 NP_597814
NP_598693 NP_001359321 NP_001359322
場所 (UCSC) 該当なし 6 章: 113.34 – 113.35 Mb PubMed 検索 [2] [3]
ウィキデータ
転写アダプター3様 タンパク質 は 、ヒトでは TADA3 遺伝子 によってコードされている。 [4] [5] [6] 細胞遺伝学的位置：3p25.3 [7]
関数 多くの DNA 結合 転写活性化 タンパク質は 、基本プロモーターに結合した一般的な転写機構と機能的に相互作用することにより、 RNA ポリメラーゼ II を介した 遺伝子転写 の開始速度を高めます。この活性化には通常、アダプタータンパク質が必要であり、おそらく ヌクレオソームを アセチル化し て不安定化し 、それによってプロモーターでの クロマチン制約を緩和します。この遺伝子によってコードされるタンパク質は転写活性化アダプターであり、 PCAF ヒストンアセチル化酵素複合体の一部であることがわかっています 。さらに、腫瘍抑制タンパク質 p53と関連し、p53 の完全な活性と p53 を介した アポトーシス に必要です 。この遺伝子には少なくとも 4 つの 選択的スプライシング 変異体が見つかっていますが、一部の変異体の全長は決定されていません。 [6]
インタラクション TADA3L は以下と相互作用する ことが示されています :
参考文献
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000048930 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Ogryzko VV, Kotani T, Zhang X, Schiltz RL, Howard T, Yang XJ, Howard BH, Qin J, Nakatani Y (1998年7月). 「PCAFヒストンアセチル化酵素複合体内のヒストン様TAF」. Cell . 94 (1): 35–44. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81219-2 . PMID 9674425. S2CID 18942972. ^ ab Wang T, Kobayashi T, Takimoto R, Denes AE, Snyder EL, el-Deiry WS, Brachmann RK (2001年11月). 「hADA3はp53活性に必要」. The EMBO Journal . 20 (22): 6404–13. doi :10.1093/emboj/20.22.6404. PMC 125723. PMID 11707411 . ^ ab "Entrez Gene: TADA3L 転写アダプター 3 (NGG1 ホモログ、酵母) 様". ^ スリモワ G、クツェンコ A、ラフマナリエフ E、ウディナ I、コンパニツェフ A、プロトポポフ A、モイシャク E、クリモフ E、ムラヴェンコ O、ゼレーニン A、ブラガ E、カシューバ V、ザバロフスキー E、キセレフ L (2002)。 「ヒト染色体 3: 60 個の Not I クローンを物理的および遺伝子マップに統合」。 細胞遺伝学およびゲノム研究 。 98 (2-3): 177-183。 土井 ：10.1159/000069814。 PMID 12698000。S2CID 41010053 。 ^ ab Zeng M, Kumar A, Meng G, Gao Q, Dimri G, Wazer D, Band H, Band V (2002 年 11 月). 「ヒトパピローマウイルス 16 E6 オンコプロテインはヒト ADA3 コアクチベーターを標的としてレチノイン酸 X 受容体を介したトランス活性化を阻害する」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (47): 45611–8. doi : 10.1074/jbc.M208447200 . PMID 12235159. ^ ab ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルシュタイン S、ローゼンバーグ J 、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リムJ、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダルM (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。 自然 。 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. ^ ab Martinez E、Palhan VB、Tjernberg A、Lymar ES、Gamper AM、Kundu TK、Chait BT、Roeder RG (2001 年 10 月)。「ヒト STAGA 複合体は、生体内で pre-mRNA スプライシングおよび DNA 損傷結合因子と相互作用するクロマチンアセチル化転写コアクチベーターです」。 分子 細胞 生物学 。21 (20): 6782–95。doi : 10.1128/ MCB.21.20.6782-6795.2001。PMC 99856。PMID 11564863 。
さらに読む
Struhl K, Moqtaderi Z (1998年7月). 「HATのTAF」. Cell . 94 (1): 1–4. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81213-1 . PMID 9674419. S2CID 14869072. Brand M、Yamamoto K、Staub A、Tora L (1999 年 6 月)。 「 TATA 結合タンパク質を含まない TAFII 含有複合サブユニットの同定は、ヌクレオソームのアセチル化とシグナル伝達における役割を示唆している」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 26): 18285–9。doi : 10.1074/ jbc.274.26.18285。PMID 10373431 。 Hartley JL、Temple GF、 Brasch MA (2000 年 11 月)。「in vitro 部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。 ゲノム 研究 。10 ( 11): 1788–95。doi :10.1101/gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863 。 ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ベッヒャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルーム H、ラウバー J、デュスターヘフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、メーヴェス HW、オッテンヴェルダー B 、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブット R、コーン B、クライン M、プストカ A (2001 年 3 月)。 「ヒトの遺伝子とタンパク質のカタログを目指して: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」。 ゲノム研究 。 11 (3): 422-35。 土井 ：10.1101/gr.GR1547R。 PMC 311072 。 PMID 11230166。 Simpson JC、Wellenreuther R、 Poustka A、Pepperkok R 、Wiemann S (2000 年 9 月)。「大規模 cDNA シーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO レポート 。1 ( 3 ): 287–92。doi :10.1093/embo-reports/kvd058。PMC 1083732。PMID 11256614 。 Brand M、Moggs JG、Oulad-Abdelghani M、Lejeune F、Dilworth FJ、Stevenin J、Almouzni G、Tora L (2001 年 6 月)。「TFTC 複合体の UV 損傷 DNA 結合タンパク質は DNA 損傷認識とヌクレオソームのアセチル化を結び付ける」。EMBO ジャーナル 。20 ( 12 ): 3187–96。doi : 10.1093/ emboj /20.12.3187。PMC 150203。PMID 11406595 。 Martinez E、Palhan VB、Tjernberg A、Lymar ES、Gamper AM、Kundu TK、Chait BT、Roeder RG (2001 年 10 月)。「ヒト STAGA 複合体は、生体内で pre-mRNA スプライシングおよび DNA 損傷結合因子と相互作用するクロマチンアセチル化転写コアクチベーターです」。 分子 細胞生物学 。21 (20): 6782–95。doi : 10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001。PMC 99856。PMID 11564863 。 Benecke A、Gaudon C、Garnier JM、vom Baur E、Chambon P、Losson R (2002 年 6 月)。「ADA3 含有複合体はエストロゲン受容体アルファと関連している」。 核酸 研究 。30 ( 11 ): 2508–14。doi :10.1093 / nar/30.11.2508。PMC 117179。PMID 12034840 。 Kumar A、Zhao Y、Meng G、Zeng M、Srinivasan S、Delmolino LM、Gao Q、Dimri G、Weber GF、Wazer DE、Band H、Band V (2002 年 8 月)。 「ヒトパピローマウイルス腫瘍タンパク質E6は、転写コアクチベーターであるヒトADA3を不活化する」。 分子および細胞生物学 。 22 (16): 5801–12。 土井 ：10.1128/MCB.22.16.5801-5812.2002。 PMC 133989 。 PMID 12138191。 Zeng M、Kumar A、Meng G、Gao Q、Dimri G、Wazer D、Band H、Band V (2002 年 11 月)。「ヒトパピローマウイルス 16 E6 オンコプロテインは、ヒト ADA3 コアクチベーターを標的として、レチノイン酸 X 受容体を介したトランス活性化を阻害する」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 47 ): 45611–8。doi : 10.1074/jbc.M208447200。PMID 12235159 。 Goehler H、Lalowski M、Stelzl U、Waelter S、Stroedicke M、Worm U、Droege A、リンデンバーグ KS、Knoblich M、Haenig C、Herbst M、Suopanki J、Scherzinger E、Abraham C、Bauer B、Hasenbank R、Fritzsche A 、ルーデヴィヒ AH、ビュソウ K、ビュソウ K、コールマン SH、グテクンスト CA、 ラントヴェーマイヤー BG 、レーラッハ H、ワンカー EE (2004 年 9 月)。 「タンパク質相互作用ネットワークは、ハンチンチン凝集のエンハンサーである GIT1 とハンチントン病を結びつけます。」 分子細胞 。 15 (6): 853–65。 土井 ： 10.1016/j.molcel.2004.09.016 。 PMID 15383276。 Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、Schleeger S、Mehrle A、Bechtel S、Sauermann M、Korf U、Pepperkok R、Sültmann H、Poustka A (2004 年 10 月)。 「ORFeome から生物学へ: 機能的ゲノミクス パイプライン」。 ゲノム研究 。 14 (10B): 2136–44。 土井 ：10.1101/gr.2576704。 PMC 528930 。 PMID 15489336。 Meng G、Zhao Y、Nag A、Zeng M、Dimri G、Gao Q、Wazer DE、Kumar R、Band H、Band V (2004 年 12 月)。「ヒト ADA3 はエストロゲン受容体 (ER) に結合し、ER を介したトランス活性化のコアクチベーターとして機能する」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 52): 54230–40。doi : 10.1074/ jbc.M404482200。PMID 15496419 。
