ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
タダ2A 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス TADA2A 、ADA2、ADA2A、TADA2L、hADA2、KL04P、転写アダプター 2A 外部ID オミム ：602276; MGI : 2144471; ホモロジーン : 38834; ジーンカード ：TADA2A; OMA :TADA2A - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 11番染色体（マウス） [2] バンド 11|11 世紀 始める 83,969,746 bp [2] 終わり 84,020,426 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 睾丸 アキレス腱 脳梁 心室帯 神経節隆起 右精巣 左精巣 骨髄細胞 骨格筋組織 子宮内膜
トップの表現 耳小胞 球形嚢 網膜の神経層 胚葉上層 腎小体 心室帯 耳板 二次卵母細胞 一次卵母細胞 髄質集合管
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質結合 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性 DNA結合転写因子活性 DNA結合 クロマチン結合 転写共調節活性 転写活性化因子活性 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 生物学的プロセス
ヒストンのアセチル化の正の制御 ヒストンH3のアセチル化 転写の調節、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写 RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 転写、DNAテンプレート クロマチンリモデリング ヒストンのアセチル化の調節 核酸テンプレート転写の正の制御 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ENSG00000276234 ENSG00000277104
ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001166105 NM_001291918 NM_001488 NM_133439
RefSeq (タンパク質) NP_001159577 NP_001278847 NP_001479 NP_597683
場所 (UCSC) 17章: 37.41 – 37.48 Mb 11 章: 83.97 – 84.02 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
転写アダプター2-αは、ヒトでは TADA2A 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
関数 多くの DNA 結合転写活性化タンパク質は、基本プロモーターに結合した一般的な転写機構と機能的に相互作用することで、RNA ポリメラーゼ II を介した遺伝子転写の開始速度を高めます。この活性化には通常、アダプタータンパク質が必要であり、おそらくヌクレオソームをアセチル化して不安定化し、プロモーターでのクロマチン制約を緩和します。この遺伝子によってコードされるタンパク質は転写活性化アダプターであり、PCAF ヒストンアセチル化酵素複合体の一部であることがわかっています。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする 2 つの転写バリアントが特定されています。 [6]
インタラクション TADA2LはGCN5L2 [7] [8]、 TADA3L [ 9] [10] 、 Myc [11] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
^ abc ENSG00000277104 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000276234, ENSG00000277104 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000018651 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Candau R、Moore PA、Wang L、Barlev N 、 Ying CY、Rosen CA、Berger SL (1996 年 2 月)。「酵母推定アダプター ADA2 および GCN5 で機能的に保存されているヒトタンパク質の同定」。 分子 細胞 生物学 。16 (2): 593–602。doi :10.1128/ mcb.16.2.593。PMC 231038。PMID 8552087 。 ^ ab "Entrez Gene: TADA2L 転写アダプター 2 (ADA2 ホモログ、酵母) 様". ^ Barlev NA、Poltoratsky V、Owen-Hughes T、Ying C、Liu L、Workman JL、Berger SL (1998 年 3 月)。「Ku-DNA 依存性タンパク質キナーゼ複合体によるブロモドメイン介在結合およびリン酸化を介した GCN5 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性の抑制」。 分子 細胞 生物学 。18 (3): 1349–58。doi : 10.1128/ mcb.18.3.1349。PMC 108848。PMID 9488450 。 ^ Wang L、Mizzen C、Ying C、Candau R、Barlev N、Brownell J、Allis CD、Berger SL (1997 年 1 月)。「ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性は酵母とヒトの GCN5 間で保存されており、成長と転写活性化の補完に必要である」。 分子 細胞生物学 。17 ( 1): 519–27。doi : 10.1128/ mcb.17.1.519。PMC 231776。PMID 8972232 。 ^ ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ・グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルシュタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、 ゾグビ HY 、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月）。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。 自然 。 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. ^ Wang T、Kobayashi T、Takimoto R、Denes AE、Snyder EL、el-Deiry WS、Brachmann RK (2001 年 11 月)。「hADA3 は p53 活性に必要」。The EMBO Journal。20 ( 22 ): 6404–13。doi : 10.1093 / emboj/20.22.6404。PMC 125723。PMID 11707411 。 ^ Liu X、Tesfai J、Evrard YA、Dent SY、Martinez E (2003 年 5 月)。「c-Myc 形質転換ドメインはヒト STAGA 複合体をリクルートし、転写活性化には TRRAP および GCN5 アセチラーゼ活性を必要とする」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 22 ): 20405–12。doi : 10.1074/ jbc.M211795200。PMC 4031917。PMID 12660246 。
さらに読む
Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Wang L、Mizzen C、Ying C、Candau R、Barlev N、Brownell J、Allis CD、Berger SL (1997 年 1 月)。「ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性は酵母とヒトの GCN5 間で保存されており、成長と転写活性化の補完に必要である」。 分子 細胞 生物学 。17 (1): 519–27。doi : 10.1128/ mcb.17.1.519。PMC 231776。PMID 8972232 。 Carter KC、Wang L、Shell BK、Zamir I、Berger SL、Moore PA (1997 年 3 月)。「ヒト転写アダプター遺伝子 TADA2L と GCN5L2 は染色体 17q12-q21 に共存し、類似した組織発現パターンを示す」。Genomics . 40 ( 3): 497–500. doi :10.1006/geno.1996.4605. PMID 9073520。 Henriksson A、Almlöf T、Ford J、McEwan IJ、Gustafsson JA、Wright AP (1997 年 6 月)。「グルココルチコイド受容体による遺伝子活性化における Ada アダプター複合体の役割」。 分子 細胞 生物 学 。17 (6): 3065–73。doi :10.1128/ mcb.17.6.3065。PMC 232159。PMID 9154805 。 Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Ogryzko VV、Kotani T、Zhang X 、Schiltz RL、Howard T、Yang XJ、Howard BH、Qin J、Nakatani Y (1998 年 7 月)。「PCAF ヒストンアセチル化酵素複合体内のヒストン様 TAF」。Cell . 94 (1): 35–44. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81219-2 . PMID 9674425. S2CID 18942972. ヴァシレフ A、山内 J、小谷 T、プリベス C、アヴァンタジャーティ ML、秦 J、中谷 Y (1998 年 12 月)。 「PCAF ヒストン アセチラーゼ複合体の 400 kDa サブユニットは、ATM スーパーファミリーに属します。」 分子細胞 。 2 (6): 869–75。 土井 : 10.1016/S1097-2765(00)80301-9 。 PMID 9885574。 Wang T、Kobayashi T、 Takimoto R、Denes AE、Snyder EL、el-Deiry WS、Brachmann RK (2001 年 11 月)。「hADA3 は p53 活性に必要」。The EMBO Journal。20 ( 22): 6404–13。doi :10.1093 / emboj/20.22.6404。PMC 125723。PMID 11707411 。 Barlev NA、Emelyanov AV、Castagnino P、Zegerman P、Bannister AJ、Sepulveda MA、Robert F、Tora L、Kouzarides T、Birshtein BK、Berger SL (2003 年 10 月)。「新規ヒト Ada2 ホモログは Gcn5 または Brg1 と連携して転写を共活性化する」。 分子 細胞 生物 学 。23 ( 19): 6944–57。doi :10.1128/MCB.23.19.6944-6957.2003。PMC 193946。PMID 12972612 。 ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月）。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。 自然 。 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. Qian C、Zhang Q、Li S、Zeng L、Walsh MJ、Zhou MM (2005 年 12 月)。「SWIRM ドメインの構造と染色体 DNA 結合」。Nature Structural & Molecular Biology。12 ( 12): 1078–85。doi :10.1038/nsmb1022。PMID 16299514。S2CID 23215862 。
