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| スペクトリンリピート | |||||||||
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 スペクトリンリピートの構造：左巻きの反平行三重らせんコイルドコイル。[1] | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | スペクトリン | ||||||||
| パム | PF00435 | ||||||||
| ファム一族 | CL0743 | ||||||||
| エコド | 604.1.1 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| プロサイト | PDOC50083 | ||||||||
| SCOP2 | 1aj3 / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| 医療機器 | cd00176 | ||||||||
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スペクトリンリピート[2]は、細胞骨格構造に関与するいくつかのタンパク質に見られます。これらには、スペクトリン、α-アクチニン、ジストロフィン、そして最近ではプラキンファミリーが含まれます。スペクトリンリピートは3つのらせん束を形成します。これらは、ヘプタドリピートのルールに従います。スペクトリンリピートは線状タンパク質を生み出します。ただし、これは線状で硬い構造の方が結晶化しやすいというサンプルの偏りによるものである可能性があります。ただし、スペクトリンリピートを持つ一部のタンパク質は柔軟性もある可能性があるというヒントがあります。これは、特別に進化した機能目的によるものである可能性が高いです。
このドメインを含むヒトタンパク質
ACTN1 ; ACTN2 ; ACTN3 ; ACTN4 ; AKAP6 ; SYNE3 ; CATX-15; DMD ; DRP2; DST ; KALRN ; MACF1 ; MCF2L ; SPTA1 ; SPTAN1 ; SPTB ; SPTBN1 ; SPTBN2 ; SPTBN4 ; SPTBN5 ; SYNE1 ; SYNE2 ; TRIO; UTRN ;
参考文献
- ^ Pascual J、Pfuhl M、Walther D、Saraste M、Nilges M (1997 年 10 月)。「スペクトリン反復配列の解構造: 左巻きの反平行三重らせんコイルドコイル」。J. Mol. Biol . 273 (3): 740–51. doi :10.1006/jmbi.1997.1344. PMID 9356261。
- ^ Harrison SC、Yan Y、Winograd E、Viel A、Cronin T、 Branton D (1993)。「スペクトリンの反復セグメントの結晶構造」。サイエンス。262 ( 5142 ) : 2027–2030。doi :10.1126/science.8266097。PMID 8266097。
- Jefferson, JJ; Ciatto, C; Shapiro, L; Liem, RK (2007)。「水疱性類天疱瘡抗原 1 (BPAG1) のプラキンドメインの構造解析により、プラキンはスペクトリンスーパーファミリーのメンバーであることが示唆される」。Journal of Molecular Biology。366 ( 1 ) : 244–57。doi :10.1016/j.jmb.2006.11.036。PMC 1850962。PMID 17161423。
- Grum, VL; Li, D; MacDonald, RI; Mondragón, A (1999). 「スペクトリンの2つの繰り返し構造は柔軟性のモデルを示唆する」. Cell . 98 (4): 523–35. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81980-7 . PMID 10481916. S2CID 1710820.
さらに読む
- Djinovic-Carugo K、Gautel M、Ylänne J、Young P (2002 年 2 月)。「スペクトリンリピート: 細胞骨格タンパク質アセンブリの構造プラットフォーム」。FEBS Lett . 513 (1): 119–23. doi : 10.1016/S0014-5793(01)03304-X . PMID 11911890. S2CID 10581541.
- Pascual J、Castresana J、 Saraste M (1997 年 9 月)。「スペクトリンリピートの進化」。BioEssays。19 ( 9 ) : 811–7。doi :10.1002/bies.950190911。PMID 9297972。S2CID 42145758。
- Al-Jassar, C; Knowles, T; Jeeves, M; Kami, K; Behr, E; Bikker, H; Overduin, M; Chidgey, M (2011 年 7 月 2 日)。「デスモプラキン プラキン ドメインの非線形構造と心筋症関連変異の影響」。Journal of Molecular Biology。411 ( 5): 1049–61。doi :10.1016/ j.jmb.2011.06.047。PMID 21756917 。