ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| スタッグ1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | STAG1、SA1、SCC3A、間質抗原1、MRD47 |
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| 外部ID | オミム: 604358; MGI : 1098658;ホモロジーン: 21191;ジーンカード:STAG1; OMA :STAG1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 9番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 9|9 E3.3- E4 | 始める | 100,479,851 bp [2] |
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| 終わり | 100,841,428 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - アキレス腱
- 耳下腺
- 腓骨神経
- 心室帯
- 滑膜関節
- 腹直筋の骨格筋組織
- 精巣上体の尾
- 神経節隆起
- 心膜
- 浅側頭動脈
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| | トップの表現 | - 胎児の尾
- 性器結節
- 尿管
- 心室帯
- 生殖腺隆起
- 内側神経節隆起
- 積雲細胞
- 精母細胞
- 腹壁
- 上顎突出
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- クロマチン結合
- タンパク質結合
| | 細胞成分 |
- 染色体
- 細胞質
- クロマチン
- 染色体、セントロメア領域
- 核
- 核質
- 核体
- コヒーシン複合体
- 核マトリックス
- 有糸分裂紡錘体極
| | 生物学的プロセス |
- 染色体分離
- 細胞分裂
- 細胞周期
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- 有糸分裂紡錘体の組み立ての調節
- 姉妹染色分体凝集
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_009282 NM_001357264 NM_001357265 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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NP_033308 NP_001344193 NP_001344194 |
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| 場所 (UCSC) | 3 章: 136.34 – 136.75 Mb | 9 章: 100.48 – 100.84 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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コヒーシンサブユニットSA-1(SA1)は、ヒトではSTAG1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] SA1は、姉妹染色分体接着、相同組み換え、DNAループ形成を媒介するコヒーシン複合体のサブユニットである。体細胞では、コヒーシンはSMC3、SMC1、RAD21、およびSA1またはSA2のいずれかから形成されるのに対し、減数分裂では、コヒーシンはSMC3、SMC1B、REC8、およびSA3から形成される。www.stag1gene.orgには、STAG1遺伝子変異を持つ人々のための非営利コミュニティがある。
構造
SA2(青)とRAD21(緑)の構造(PDB 4PK7)
SA1 は、コヒーシン複合体のコアサブユニットである酵母タンパク質 Scc3 の 3 つのヒト相同遺伝子の 1 つです (3 つのヒト相同遺伝子は SA1、SA2、SA3)。SA1 と SA2 は体細胞で発現しますが、減数分裂細胞では SA3 が主な SA 相同遺伝子です。ヒトでは SA2 が SA1 よりも豊富であることが示されていますが、他の細胞型では SA1 が優勢です。[7]
SA1はRAD21サブユニットを介してコヒーシンに安定的に結合し、他の調節サブユニットのプラットフォームとして機能する。SA1とSA2の配列は75%保存されており、N末端領域とC末端領域の違いを示している。[8] SA1はN末端領域に明らかなATフックを有する。 [9]
関数
SA1はコヒーシンのロードと放出の両方を制御する役割を果たしている。[6] SA1はテロメアの凝集に特異的に機能する。 [10]
マウスでは、SA1は胚発生に必要であり、発現しないと致命的になることが示されている。[11]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000118007 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000037286 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Carramolino L、Lee BC、Zaballos A、Peled A、Barthelemy I、Shav-Tal Y、他 (1997 年 8 月)。「SA-1、新規遺伝子ファミリーの 1 つのメンバーによってコードされる核タンパク質: 分子クローニングと造血器官での検出」。Gene . 195 ( 2): 151–159。doi : 10.1016 /S0378-1119(97)00121-2。PMID 9305759 。
- ^ ab 「Entrez Gene: STAG1 間質抗原 1」。
- ^ Cuadrado A、Losada A(2020年 4月)。「3DゲノムアーキテクチャにおけるコヒーシンSTAG1とSTAG2の特殊な機能」。Current Opinion in Genetics & Development。ゲノムアーキテクチャと発現。61 :9–16。doi :10.1016 /j.gde.2020.02.024。PMID 32294612。S2CID 215792991。
- ^ Arruda NL、Carico ZM、Justice M、Liu YF、Zhou J、Stefan HC、Dowen JM(2020年8月)。「胚性幹細胞におけるコヒーシンの局在と遺伝子発現におけるSTAG1とSTAG2の異なる重複した役割」。 エピジェネティクス&クロマチン。13 (1):32。doi :10.1186 / s13072-020-00353-9。PMC 7418333。PMID 32778134。
- ^ Lin J、Countryman P、Chen H、Pan H、Fan Y、Jiang Y 、 et al. (2016年7月)。「テロメアDNA結合およびDNA-DNAペアリングにおけるSA1とTRF1の機能的相互作用」。核酸研究。44 ( 13):6363–6376。doi :10.1093 / nar/gkw518。PMC 5291270。PMID 27298259 。
- ^ Canudas S、Smith S (2009年10月)。「ヒト細胞におけるScc3ホモログSA1とSA2によるテロメアとセントロメアの凝集の異なる制御」。The Journal of Cell Biology。187 ( 2): 165–173。doi : 10.1083 /jcb.200903096。PMC 2768842。PMID 19822671。
- ^ レメセイロ S、クアドラード A、ゴメスロペス G、ピサーノ DG、ロサダ A (2012 年 5 月)。 「遺伝子調節と発生におけるコヒーシンSA1の独特の役割」。EMBO ジャーナル。31 (9): 2090 ~ 2102 年。土井:10.1038/emboj.2012.60。PMC 3343463。PMID 22415368。
外部リンク