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 Arabidopsis thaliana SOBER1の結晶構造、PDB コード 6avv。アルファ ヘリックスは赤、ベータ ストランドは金色、触媒部位残基は黒で示されています。 | |
| 識別子 | |
|---|---|
| シンボル | ソバー1 |
| インタープロ | 著作権 |
| キャス | 6avv |
| SCOP2 | 6avv / スコープ / SUPFAM |
SOBER1は、脱アセチル化の生化学反応を触媒する酵素である。[1] SOBER（S uppressor of Avr B sT- elicited r esistance）1タンパク質は植物に保存されており、YopJファミリーの特定の病原性エフェクタータンパク質による感染に対する植物の過敏反応を実行する能力を抑制します。[2] SOBER1は、 α/β加水分解酵素のタンパク質スーパーファミリーに属し、脱アセチル化反応を実行するための標準的なセリン/ヒスチジン/アスパラギン酸触媒トライアドを持っています。SOBER1の潜在的なホスホリパーゼ活性については矛盾した報告があり、ある研究ではタンパク質のホスホリパーゼA 2活性を主張し[3]、別の研究ではこの結果を再現できませんでした。[1]
アシルタンパク質チオエステラーゼとの関係
SOBER1ファミリーのメンバーは、タンパク質構造から判断すると、アシルタンパク質チオエステラーゼと密接に関連していると考えられています。[2]しかし、アミノ酸配列の変化により、SOBER1の生化学的特性は脱アセチル化酵素になります。特に、アシルタンパク質チオエステラーゼに見られる疎水性トンネルは、SOBER1の蓋構造の追加アミノ酸によって損なわれ、アセチル基が結合するための新しい表面が作成されます。[1]
ターゲット
これまでに、SOBER1 のターゲットとして以下のタンパク質が特定されています: AvrBsT、ACIP1。
参照
参考文献
- ^ abc Bürger M、Willige BC 、 Chory J (2017年12月)。「疎水性アンカー機構がYopJエフェクターに対する宿主応答を抑制する脱アセチル化酵素ファミリーを定義する」。Nature Communications。8 ( 1): 2201。Bibcode : 2017NatCo...8.2201B。doi : 10.1038 / s41467-017-02347 - w。PMC 5736716。PMID 29259199。
- ^ ab Cunnac S、Wilson A、Nuwer J、Kirik A、Baranage G、Mudgett MB (2007 年 2 月)。「保存されたカルボキシルエステラーゼは、シロイヌナズナにおける AVRBST 誘導抵抗性の抑制因子である」。The Plant Cell。19 ( 2 ): 688–705。doi :10.1105 / tpc.106.048710。PMC 1867326。PMID 17293566。
- ^ Kirik A 、 Mudgett MB (2009 年 12 月)。「SOBER1 ホスホリパーゼ活性は、細菌エフェクター AvrBsT に反応してホスファチジン酸の蓄積と植物免疫を抑制する」。 米国科学アカデミー紀要。106 (48): 20532–7。Bibcode :2009PNAS..10620532K。doi : 10.1073 / pnas.0903859106。PMC 2787154。PMID 19918071。