Loading article…
| ＳＭＣ６ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | SMC6、SMC-6、SMC6L1、染色体6の構造維持 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：609387; MGI : 1914491;ホモロジーン: 41575;ジーンカード：SMC6; OMA :SMC6 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
染色体構造維持タンパク質6は、ヒトではSMC6遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
構造
SMC6は分裂酵母でRAD18（SMC6）として初めて発見されました。これはSpr18（SMC5）タンパク質とヘテロ二量体複合体を形成します。[7] [8]酵母では、SMC5/6複合体はSMC5、SMC6、および6つの染色体非構造維持（NSE）タンパク質からなるサブユニットを持っています。Nse1-Nse3-Nse4サブユニットはSmc5ヘッドSmc6を橋渡しし、DNAの結合を可能にします。[9] [10] [11]
これは、テロメアの代替延長による癌のメカニズムに関与している可能性がある。[12]
Nseサブユニット
Nse1-Nse3-Nse4 サブユニットは Smc5 および Smc6 タンパク質の頭部を橋渡しし、複合体が DNA に結合できるようにします。Nse5 と Nse6 はサブ複合体を形成し、出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeでは SMC5/6 複合体の頭部に、分裂酵母Schizosaccharomyces pombeでは SMC5/6 複合体のヒンジに局在します。Nse5/6 サブ複合体はS. cerevisiaeの複製に必要ですが、 S. pombeでは必須とは特定されていません。Nse5-Nse6 の相同タンパク質は他の真核生物にも存在し、具体的にはArabidopsis thalianaの ASAP1-SNI1とヒトの SLF1-SLF2 があり、Nse の対応するタンパク質と同様の機能を持つと考えられています。ヒトSMC5/6複合体におけるSLF1とSLF2の局在は不明である。[13] [14]
ローカリゼーション
Smc5/6複合体の局在方法は、あまり保存されていない。ヒトでは、複合体はSMC5/6局在因子1および2（SLF1およびSLF2）を使用してウイルスDNA配列に局在し、ウイルス耐性に寄与する。[15]植物A. thalianaでは、このヘテロ二量体は、 SWI/SNF経路のSWI3B複合体を使用して相同組換えのために二本鎖切断に局在することができる。[16] DNAに局在すると、SCM5/6複合体は約20のDNA塩基対に非特異的に結合する。[17]
組換えと減数分裂における役割
Smc6およびSmc5タンパク質はヘテロ二量体のリング状構造を形成し、他の非SMC要素とともにSMC-5/6複合体を形成する。線虫Caenorhabditis elegansでは、この複合体はHIM-6(BLM)ヘリカーゼと相互作用して、減数分裂組換え中間処理および染色体成熟を促進する。 [18]マウス卵母細胞 中のSMC-5/6複合体は、減数分裂中の分離能のある二価染色体の形成に不可欠である。[19] 酵母Saccharomyces cerevisiaeでは、SMC6はDNA損傷に対する抵抗性、ならびに損傷誘発性の染色体間および姉妹染色分体組換えに必要である。[20] ヒトでは、幼少期の重度の肺疾患を特徴とする染色体切断症候群は、SMC-5/6複合体の成分の変異と関連している。[21] 患者の細胞には染色体再編成、微小核、 DNA損傷に対する感受性、相同組換えの欠陥が見られる。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000163029 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000020608 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ボッチャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルム H、ラウバー J、ダスターホフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、メーヴェス HW、オッテンヴァルダーB、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブット R、コーン B、クラインM、プウストカ A (2001 年 3 月)。 「ヒトの遺伝子とタンパク質のカタログを目指して: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」。ゲノム解析11 (3): 422-35。土井：10.1101/gr.GR1547R。PMC 311072。PMID 11230166。
- ^ 「Entrez Gene: 染色体6のSMC6構造維持」。
- ^ Fousteri MI, Lehmann AR (2000 年 4 月). 「Schizosaccharomyces pombe の新しい SMC タンパク質複合体には Rad18 DNA 修復タンパク質が含まれている」. The EMBO Journal . 19 (7): 1691–702. doi :10.1093 / emboj/19.7.1691. PMC 310237. PMID 10747036.
- ^ Lehmann AR、Walicka M、Griffiths DJ、Murray JM、Watts FZ、McCready S、Carr AM (1995 年 12 月)。「Schizosaccharomyces pombe の rad18 遺伝子は、DNA 修復に関与する SMC スーパーファミリーの新しいサブグループを定義します」。 分子細胞生物学。15 ( 12): 7067–80。doi :10.1128/mcb.15.12.7067。PMC 230962。PMID 8524274。
- ^ Palecek J、Vidot S、Feng M、Doherty AJ、Lehmann AR (2006 年 12 月)。「Smc5-Smc6 DNA 修復複合体: KLEISIN、Nse4、および非 Kleisin サブユニットによる Smc5-Smc6 ヘッドのブリッジング」。The Journal of Biological Chemistry。281 ( 48): 36952–36959。doi : 10.1074/ jbc.M608004200。PMID 17005570。
- ^ Zabrady K, Adamus M, Vondrova L, Liao C, Skoupilova H, Novakova M, Jurcisinova L, Alt A, Oliver AW, Lehmann AR, Palecek JJ (2016 年 2 月). 「SMC5/6 複合体のクロマチン結合は、その NSE3 サブユニットの DNA への結合に依存する」. Nucleic Acids Research . 44 (3): 1064–1079. doi :10.1093/nar/gkv1021. PMC 4756808. PMID 26446992.
- ^ Vondrova L、Kolesar P、Adamus M、Nociar M、Oliver AW、Palecek JJ (2020 年 6 月)。 「SMC5/6 の ATPase サイクルにおける Nse4 クライシンおよび Nse1/Nse3 KITE サブユニットの役割」。科学的報告書。10 (1): 9694。ビブコード:2020NatSR..10.9694V。土井：10.1038/s41598-020-66647-w。PMC 7297730。PMID 32546830。
- ^ Potts PR, Yu H (2007). 「SMC5/6複合体はテロメア結合タンパク質のSUMO化を介してALT癌細胞のテロメア長を維持する」Nat. Struct. Mol. Biol . 14 (7): 581–90. doi :10.1038/nsmb1259. PMID 17589526. S2CID 7915836.
- ^ Yan, Shunping; Wang, Wei; Marqués, Jorge; Mohan, Rajinikanth; Saleh, Abdelaty; Durrant, Wendy E.; Song, Junqi; Dong, Xinnian (2013-11-21). 「サリチル酸はDNA損傷反応を活性化し、植物の免疫力を増強する」。分子細胞。52 ( 4 ) : 602–610。doi :10.1016/ j.molcel.2013.09.019。ISSN 1097-2765。PMC 3863363。PMID 24207055。
- ^ Diaz, Mariana; Pecinka, Ales (2018-01-12). 「修復のための足場：SMC5/6複合体の分子機能の理解」.遺伝子. 9 (1): 36. doi : 10.3390/genes9010036 . ISSN 2073-4425. PMC 5793187. PMID 29329249 .
- ^ Oravcová, Martina; Nie, Minghua; Zilio, Nicola; Maeda, Shintaro; Jami-Alahmadi, Yasaman; Lazzerini-Denchi, Eros; Wohlschlegel, James A; Ulrich, Helle D; Otomo, Takanori; Boddy, Michael N (2022-11-14). Chiolo, Irene E; Tyler, Jessica K (eds.). 「Nse5/6のようなSIMC1-SLF2複合体はSMC5/6をウイルス複製中心に局在させる」. eLife . 11 : e79676. doi : 10.7554/eLife.79676 . ISSN 2050-084X. PMC 9708086 . PMID 36373674.
- ^ Jiang, Jieming; Mao, Ning; Hu, Huan; Tang, Jiahang; Han, Danlu; Liu, Song; Wu, Qian; Liu, Yiyang; Peng, Changlian; Lai, Jianbin; Yang, Chengwei (2019-07-23). 「SWI/SNFサブユニットは植物細胞におけるDNA修復中に構造維持複合体5の染色体解離を制御する」米国科学アカデミー紀要. 116 (30): 15288–15296. Bibcode :2019PNAS..11615288J. doi : 10.1073/pnas.1900308116 . ISSN 0027-8424. PMC 6660752. PMID 31285327 .
- ^ Yu, You; Li, Shibai; Ser, Zheng; Kuang, Huihui; Than, Thane; Guan, Danying; Zhao, Xiaolan; Patel, Dinshaw J. (2022-06-07). 「DNA結合Smc5/6のCryo-EM構造は、マルチサブユニット構造変化によって可能になるDNAクランプを明らかにする」米国科学アカデミー紀要. 119 (23): e2202799119. Bibcode :2022PNAS..11902799Y. doi : 10.1073/pnas.2202799119 . ISSN 0027-8424. PMC 9191643. PMID 35648833 .
- ^ Hong Y、Sonneville R、Agostinho A、Meier B、Wang B、Blow JJ、Gartner A (2016)。「SMC-5/6複合体とHIM-6（BLM）ヘリカーゼは、Caenorhabditis elegansの減数分裂中の減数分裂組換え中間体処理と染色体成熟を相乗的に促進する」。PLOS Genet。12 （3 ）：e1005872。doi：10.1371 / journal.pgen.1005872。PMC 4807058。PMID 27010650 。
- ^ Hwang G、Sun F、O'Brien M 、 Eppig JJ、Handel MA、Jordan PW (2017)。「マウス卵母細胞における減数分裂I中の分離能のある二価染色体の形成にはSMC5/6が必要である」。開発 。144 ( 9 ): 1648–1660。doi : 10.1242 /dev.145607。PMC 5450844。PMID 28302748。
- ^ Onoda F, Takeda M, Seki M, Maeda D, Tajima J, Ui A, Yagi H, Enomoto T (2004). 「SMC6 は、Saccharomyces cerevisiae における MMS 誘導性染色体間および姉妹染色分体組換えに必要である」。DNA 修復 (Amst.) . 3 (4): 429–39. doi :10.1016/j.dnarep.2003.12.007. PMID 15010319。
- ^ ファン・デル・クラッベン SN、ヘヌス MP、マクレガー GA、リッター DI、ナガマニ SC、ウェルズ OS、ハラカロバ M、チン IK、アルト A、フォンドロヴァ L、ホックステンバッハ R、ファン モンフラン JM、テルヘッゲン ラグロ SW、ファン リーシャウト S、ヴァンロスマーレン MJ、レンケンス I、デュラン K、ナイジマン IJ、クルースターマン WP、ヘネカム E、オレンジ JS、ファン ハッセルト PM、ウィーラー DA、パレチェック JJ、リーマン AR、オリバー AW、パール LH、プロン SE、マレー JM、ファン ハーフテン G (2016)。 「不安定化したSMC5/6複合体は、重度の肺疾患を伴う染色体切断症候群を引き起こす」。Ｊ．クリン．投資する。126 (8): 2881–92。doi :10.1172/JCI82890. PMC 4966312. PMID 27427983 .
さらに読む
- Hartley JL、Temple GF、Brasch MA (2001)。「in vitro 部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 。
- Simpson JC、Wellenreuther R、Poustka A、et al. (2001)。「大規模cDNAシーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 。
- Taylor EM、Moghraby JS、Lees JH、他 (2001)。「Schizosaccharomyces pombe Rad18/Spr18 複合体と相同性のある新規ヒト SMC ヘテロダイマーの特性」。Mol . Biol. Cell . 12 (6): 1583–94. doi :10.1091/mbc.12.6.1583. PMC 37326. PMID 11408570 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336 .
- Hillier LW、Graves TA 、 Fulton RS、他 (2005)。「ヒト染色体 2 および 4 の DNA 配列の生成と注釈」。Nature . 434 ( 7034): 724–31。Bibcode :2005Natur.434..724H。doi : 10.1038/ nature03466。PMID 15815621。
- Potts PR, Yu H (2005). 「ヒトMMS21/NSE2はDNA修復に必要なSUMOリガーゼである」。Mol . Cell. Biol . 25 (16): 7021–32. doi :10.1128/MCB.25.16.7021-7032.2005. PMC 1190242. PMID 16055714 .
- Mehrle A、Rosenfelder H、 Schupp I 、他 (2006)。「2006 年の LIFEdb データベース」。Nucleic Acids Res . 34 (データベース号): D415–8。doi : 10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。
- Potts PR、Porteus MH 、Yu H (2006)。「ヒトSMC5/6複合体は、SMC1/3コヒーシン複合体を二本鎖切断部位に誘導することで、姉妹染色分体相同組換えを促進する」。EMBO J. 25 (14): 3377–88. doi :10.1038/sj.emboj.7601218. PMC 1523187. PMID 16810316 。