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Rsa RNAは、黄色ブドウ球菌に見られる非コードRNAです。共通の名前は発見に由来しており、相同性を意味するものではありません。バイオインフォマティクススキャンにより、RsaA-KおよびRsaOA-OGと名付けられた16のRsa RNAファミリーが特定されました。[1] [2]その他のRsaOH-OXは、RNomicアプローチにより発見されました。[3] RNAはさまざまな発現パターンを示しましたが、新たに発見されたRNAの多くはHfq非依存であることが示され、ほとんどがCリッチモチーフ（UCCC）を持っていました。[1]
ルサA
転写調節因子MgrAのmRNAに結合してその翻訳を抑制し、バイオフィルム形成を促進し、細菌の毒性を低下させます。[4]他のmRNA：ペプチドグリカン代謝に関与するSsaA様酵素や分泌型抗炎症性FLIPrタンパク質など、RsaAの直接的な標的として検証されました。[5]
RsaE
RsaEは、 Staphylococcus epidermidisやStaphylococcus saprophyticusなどのブドウ球菌属の他のメンバーにも見られ、この属以外ではMacrococcus caseolyticusやBacillusに見られる唯一のRsa RNAです。Bacillus subtilisでは、RsaEは以前にncr22として特定されていました。[8] [9] RsaEはまた、オリゴエンドペプチダーゼFをコードするPepFの下流に一貫して見られます。RsaEの機能は、遺伝子ノックアウト解析と遺伝子過剰発現を使用して発見されました。mRNAのアンチセンス結合を介して代謝に関与するいくつかの酵素の発現を制御することがわかりました。[1] [3]
RsaEは一酸化窒素（NO）の存在によって制御されることが示されました。 枯草菌では、酸化ストレスと酸化還元反応に関連する機能を持つ遺伝子の発現を制御しており、RoxS（酸化ストレスに関連する）と改名されました。[10]
ルサF
S.aureus種では、RsaFはRsaEと同じ遺伝子間領域に位置し、RsaEの3'末端と約20bp重複しています。RsaEとは対照的に、RsaFとその上流遺伝子はS.aureus種でのみ同定されています。[1]
ルサK
RsaKはグルコース特異的ホスホトランスフェラーゼ系に関与する酵素をコードするglcA mRNAのリーダー配列に存在します。RsaKにはGclTタンパク質によって認識される保存されたリボ核酸抗終結システムも含まれています。 [11]
RsaI
RsaOG [2]はRsaI [1]とも呼ばれ、トランス作用機構を介してS. aureusの毒素または侵入機構の調節を微調整すると考えられています。その二次構造には、2つの高度に保存された不対配列の間に形成された擬似結び目が含まれています。 [6]
表現パターン
RsaD、EH、IはS. aureusで高度に発現していることが判明した。他のRsa RNAの発現レベルは様々な環境条件下で変化し、例えばRsaCは低温ショックによって誘導され、RsaAは浸透圧ストレスに反応して誘導される。[1] [2] [3]
RsaE遺伝子とRsaF遺伝子はS.aureus種で重複しているが、逆の発現パターンを示しているようである。[1] σA認識モチーフと潜在的なσB結合部位の重複による転写干渉が、2つの転写産物の異なる発現を引き起こすメカニズムとして提案されている[1] [12]
参照
参考文献
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さらに読む
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