40Sリボソームタンパク質S27

RP27 ...
利用可能な構造
電子データ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	4UG0、4V6X、5A2Q、5AJ0、4KZY、3J7R、4D61、4KZX、4D5L、5FLX、4UJD、3J7P、4KZZ、4UJE、4UJC
識別子
エイリアス	RPS27、MPS-1、MPS1、S27、リボソームタンパク質S27、DBA17
外部ID	オミム：603702; MGI : 1915191;ホモロジーン: 803;ジーンカード：RPS27; OMA :RPS27 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体1（ヒト）
終わり	153,992,155 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	9番染色体（マウス）
終わり	66,856,798 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	神経節隆起; ; 顆粒球; ; 左卵巣; ; 右卵巣; ; 子宮頸管; ; リンパ節; ; アキレス腱; ; 心室帯; ; 子宮管; ; 脳梁;
	トップの表現
	胚; ; 心内膜クッション; ; 胚; ; 耳下腺; ; 右腎臓; ; 精嚢; ; 涙腺; ; 胚葉上層; ; 卵黄嚢; ; 受精卵;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合; リボソームの構造構成要素; 亜鉛イオン結合; 金属イオン結合; タンパク質結合; RNA結合;
細胞成分	細胞質; リボソーム; 細胞内解剖構造; 核; 核質; 細胞質小リボソームサブユニット; シナプス後密度; シナプス前; グルタミン酸シナプス; GABA作動性シナプス;
生物学的プロセス	ウイルス転写; SRP依存性共翻訳タンパク質の膜への標的化; 翻訳開始; リボソーム小サブユニットアセンブリ; 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解; 細胞集団の増殖; タンパク質生合成; 姉妹染色分体凝集; rRNA処理;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	6232
	67941
	ENSG00000177954
	ENSMUSG00000036781
	P42677
	翻訳
	NM_001030 ; NM_001349946 ; NM_001349947
	NM_026467 ; NM_001311101 ; NM_001361106
	NP_001021 ; NP_001336875 ; NP_001336876
	NP_001298030 ; NP_080743 ; NP_001348035
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

40Sリボソームタンパク質S27は、メタロパンスティミュリン1またはMPS-1としても知られ、ヒトではRPS27遺伝子によってコードされるタンパク質です。^[5]^[6]^{[7]メタロパンスティミュリンは、}DNA修復と腫瘍形成に関与することが提案されているジンクフィンガータンパク質です。^[8]

関数

リボソームは、タンパク質合成を触媒する細胞小器官で、小さな 40S サブユニットと大きな 60S サブユニットから構成されています。これらのサブユニットは、4種類のRNAと約 80 種類の構造的に異なるタンパク質で構成されています。この遺伝子は、40S サブユニットの構成要素であるリボソームタンパク質をコードしています。このタンパク質は、リボソームタンパク質の S27E ファミリーに属しています。亜鉛に結合できるC4 型ジンクフィンガードメインが含まれています。コードされているタンパク質は、核酸に結合できることが示されています。リボソーム成分として細胞質にありますが、核でも検出されています。ラットの研究では、リボソームタンパク質 S27 は 40S サブユニットのリボソームタンパク質 S18 の近くに位置し、翻訳開始因子eIF3に共有結合していることが示されています。リボソームタンパク質をコードする遺伝子では一般的ですが、この遺伝子の複数の処理された疑似遺伝子がゲノム全体に分散しています。^[7]

臨床的意義

その発現はいくつかの種類の悪性腫瘍で増加しており、一部の癌の治療によりMPSレベルが低下することが報告されています。また、MPSのジンクフィンガーモチーフから亜鉛をキレート化して不活性にすることを目的としたいくつかの化学療法のターゲットとしても使用されています。これらの治療法は、実験室実験やいくつかの限定的な臨床試験で癌治療に有望であることが示されています。このタンパク質を過剰発現するようにトランスフェクトされた頭頸部癌では、成長が抑制されることが実証されています。^[8]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000177954 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000036781 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Tsui SK、Lee SM、Fung KP、Waye MM、Lee CY (1996年10月)。「ヒトリボソームタンパク質L39およびS27の一次構造と配列分析」。生化学および分子生物学国際誌。40 (3 ) : 611–6。doi : 10.1080 / 15216549600201203。PMID 8908372。S2CID 7909023 。
^ Fernandez-Pol JA、 Klos DJ、Hamilton PD (1993年10月)。「成長因子誘導遺伝子は、ジンクフィンガー構造を持つ新規核タンパク質をコードする」。The Journal of Biological Chemistry。268 ( 28): 21198–204。doi : 10.1016/S0021-9258(19)36910-8。PMID 8407955。
^ ab 「Entrez Gene: RPS27 リボソームタンパク質 S27 (メタロパンスティミュリン 1)」。
^ ab Fernandez - Pol JA (1996). 「さまざまなタイプの一般的な癌患者の血清中の新しい腫瘍マーカーとしてのメタロパンスティミュリン：予防と治療への影響」。抗癌研究。16 (4B): 2177–85。PMID 8694540。

さらに読む

Scurry WC 、 Stack BC (2007年12 月)。「頭頸部扁平上皮癌の臨床管理における金属タンパク質の役割」。Head & Neck。29 ( 12 ): 1144–55。CiteSeerX 10.1.1.610.1189。doi :10.1002/hed.20655。PMID 17657798。S2CID 11534394。
Stack BC、Hollenbeak CS、Lee CM、Dunphy FR、Lowe VJ、Hamilton PD (2004 年 12 月)。「頭頸部癌のマーカーとしてのメタロパンスティミュリン」。World Journal of Surgical Oncology。2 : 45。doi : 10.1186 / 1477-7819-2-45。PMC 544581。PMID 15598348。
Lee WJ、Keefer K、Hollenbeak CS、Stack BC (2004 年 10 月)。「腫瘍マーカーメタロパンスティミュリンを使用した頭頸部扁平上皮癌のスクリーニングのための新しい検査」。耳鼻咽喉科 ・頭頸部外科。131 (4): 466–71。doi :10.1016/ j.otohns.2004.03.011。PMID 15467619。S2CID 22629299 。
Wool IG、 Chan YL、Glück A (1996)。「哺乳類リボソームタンパク質の構造と進化」。生化学と細胞生物学。73 ( 11–12): 933–47。doi :10.1139/o95-101。PMID 8722009 。
Fernandez-Pol JA、Klos DJ、Hamilton PD (1994 年 8 月)。「バキュロウイルス発現システムで生成されるメタロパンスティミュリン遺伝子産物は、DNA に結合する核リンタンパク質である」。細胞成長と分化。5 (8): 811–25。PMID 7986747。
Vladimirov SN、Ivanov AV、Karpova GG、Musolyamov AK、Egorov TA、Thiede B、Wittmann-Liebold B、Otto A (1996 年 7 月)。「N 末端および内部配列決定と質量分析によるヒト小リボソームサブユニットタンパク質の特性評価」。European Journal of Biochemistry。239 ( 1): 144–9。doi : 10.1111 / j.1432-1033.1996.0144u.x。PMID 8706699。
Kenmochi N、Kawaguchi T、Rozen S、Davis E 、 Goodman N、Hudson TJ、Tanaka T、Page DC (1998 年 5 月)。「75 個のヒトリボソームタンパク質遺伝子のマップ」。ゲノム研究。8 (5): 509–23。doi : 10.1101/ gr.8.5.509。PMID 9582194 。
Yoshihama M, Uechi T, Asakawa S, Kawasaki K, Kato S, Higa S, Maeda N, Minoshima S, Tanaka T, Shimizu N, Kenmochi N (2002 年 3 月). 「ヒトリボソームタンパク質遺伝子: 73 遺伝子の配列決定と比較分析」. Genome Research . 12 (3): 379–90. doi :10.1101/gr.214202. PMC 155282. PMID 11875025 .
Atsuta Y, Aoki N, Sato K, Oikawa K, Nochi H, Miyokawa N, Hirata S, Kimura S, Sasajima T, Katagiri M (2002年8月)。「乳がん患者における腫瘍関連抗原のメンバーとしてのメタロパンスティミュリン-1の同定」。Cancer Letters。182 ( 1 ): 101–7。doi : 10.1016 /S0304-3835(02)00068-X。PMID 12175529 。
Martin- Lluesma S、Stucke VM、Nigg EA (2002 年 9 月)。「スピンドルチェックポイントシグナル伝達と Mad1/Mad2 のキネトコアリクルートメントにおける Hec1 の役割」。Science。297 ( 5590 ): 2267–70。Bibcode : 2002Sci ... 297.2267M。doi : 10.1126/science.1075596。PMID 12351790。S2CID 7879023 。
Liu ST、Chan GK、Hittle JC、Fujii G、Lees E、Yen TJ (2003 年 4 月)。「ヒト MPS1 キナーゼは、キネトコアからの CENP-E の消失によって誘導される有糸分裂停止に必要である」。細胞の分子生物学。14 ( 4): 1638–51。doi : 10.1091 /mbc.02-05-0074。PMC 153128。PMID 12686615。
ボウメースター T、バウハ A、ラフナー H、アングランド PO、ベルガミニ G、クロートン K、クルシア C、エバーハルト D、ガグヌール J、ギデリ S、ホップ C、ヒューセ B、マンガーノ R、ミション AM、シルル M、シュレーグル J、シュワブ M 、スタイン MA、バウアー A、カサリ G、ドリューズ G、ギャビン AC、ジャクソン DB、ジョバティG、ノイバウアー G、リック J、クスター B、スーパーティフルガ G (2004 年 2 月)。「ヒト TNF-α/NF-κ B シグナル伝達経路の物理的および機能的マップ」。自然の細胞生物学。6 (2): 97-105。土井：10.1038/ncb1086。PMID 14743216。S2CID 11683986 。
Andersen JS、Lam YW、Leung AK、Ong SE、Lyon CE、Lamond AI、Mann M (2005 年 1 月)。「核小体プロテオームダイナミクス」。Nature . 433 ( 7021 ) : 77–83。Bibcode :2005Natur.433...77A。doi : 10.1038/nature03207。PMID 15635413。S2CID 4344740。
Yu Y、Ji H、 Doudna JA、Leary JA (2005年6 月)。「ヒト 40S リボソームサブユニットの質量分析: ネイティブおよび HCV IRES 結合複合体」。タンパク質科学。14 ( 6): 1438–46。doi :10.1110/ps.041293005。PMC 2253395。PMID 15883184。
ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセットスタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月）。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Bhonde MR、Hanski ML、Budczies J、Cao M、Gillissen B、Moorthy D、Simonetta F、Scherübl H、Truss M、Hagemeier C、Mewes HW、Daniel PT、Zeitz M、Hanski C (2006 年 3 月)。「DNA 損傷誘導性の p53 発現は有糸分裂チェックポイントキナーゼ hMps1 を抑制する: p53MUT 細胞におけるこの抑制の欠如はアポトーシスに寄与する」。The Journal of Biological Chemistry。281 ( 13): 8675–85。doi : 10.1074/jbc.M511333200。PMID 16446370。
Wang YW、Qu Y、Li JF、Chen XH、Liu BY、Gu QL、Zhu ZG (2006 年 8 月)。「胃癌の進行と腫瘍形成におけるメタロパンスティミュリン-1 の in vitro および in vivo での証拠」。臨床癌研究。12 ( 16): 4965–73。doi : 10.1158/1078-0432.CCR-05-2316。PMID 16914586。
Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006 年 11 月)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 ( 3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000177954 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000036781 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid8908372-5] Tsui SK、Lee SM、Fung KP、Waye MM、Lee CY (1996年10月)。「ヒトリボソームタンパク質L39およびS27の一次構造と配列分析」。生化学および分子生物学国際誌。40 (3 ) : 611–6。doi : 10.1080 / 15216549600201203。PMID 8908372。S2CID 7909023 。

[pmid8407955-6] ^ Fernandez-Pol JA、 Klos DJ、Hamilton PD (1993年10月)。「成長因子誘導遺伝子は、ジンクフィンガー構造を持つ新規核タンパク質をコードする」。The Journal of Biological Chemistry。268 ( 28): 21198–204。doi : 10.1016/S0021-9258(19)36910-8。PMID 8407955。

[entrez-7] 「Entrez Gene: RPS27 リボソームタンパク質 S27 (メタロパンスティミュリン 1)」。

[Fernandez-Pol_1996-8] Fernandez - Pol JA (1996). 「さまざまなタイプの一般的な癌患者の血清中の新しい腫瘍マーカーとしてのメタロパンスティミュリン：予防と治療への影響」。抗癌研究。16 (4B): 2177–85。PMID 8694540。