リチャード・E・レンスキー | |
|---|---|
2016 年 5 月 26 日、長期保存用フラスコとインキュベーターを持つリチャード レンスキー氏 | |
| 母校 | ノースカロライナ大学チャペルヒル校 オバリン大学 |
| 知られている | 大腸菌の長期進化実験 |
| 受賞歴 | NCSEフレンド・オブ・ダーウィン賞(2017年)[1] スウォール・ライト賞 (2012年) マッカーサーフェローシップ (1996年) グッゲンハイムフェローシップ (1991年)[2] |
| 科学者としてのキャリア | |
| フィールド | 進化生物学 実験進化 微生物学 |
| 機関 | ミシガン州立大学 カリフォルニア大学アーバイン校 |
| 論文 | 競争と撹乱がオサムシの個体群に与える影響 (1982年) |
| 博士課程の指導教員 | ネルソン・ヘアストン |
| その他の学術アドバイザー | ブルース・レビン(ポスドク指導員) |
| 博士課程の学生 | ポール・E・ターナー ザカリー・ブラント マイケル ・トラヴィサーノ |
| Webサイト | レンズキ.mmg.msu.edu
Telliamedrevisited.wordpress.com ltee.org より |
リチャード・E・レンスキー(1956年生まれ)はアメリカの進化生物学者であり、[3]ミシガン州立大学微生物生態学のジョン・A・ハンナ特別教授。米国科学アカデミー会員であり、マッカーサーフェローでもある。レンスキーは、現在も継続中の36年にわたる大腸菌の長期進化実験は、突然変異率[4] 、[クローン干渉] 、[5]、[ 抗生物質耐性]、[6]、新しい形質の進化、[ 7]、種分化[8]など、進化の中核プロセスの理解に役立ってきました。また、 Avidaと呼ばれる自己複製生物を 使用してデジタルで進化を研究した先駆的な研究でもよく知られています。
若いころ
リチャード・レンスキーは、社会学者 ゲルハルト・レンスキーと詩人ジャン・レンスキーの息子である。 [9]彼はまた、児童文学作家ロイス・レンスキーの甥であり、ルーテル派の評論家リチャード・C・レンスキーの曾孫でもある。彼は1976年にオバリン大学で学士号を取得し、1982年にノースカロライナ大学で博士号を取得した。 [10]
科学者としてのキャリア
レンスキーは博士号を取得後、マサチューセッツ大学アマースト校のブルース・レビン研究室でポスドク研究を行い、微生物学の研究を始めた。1985年、レンスキーはカリフォルニア大学アーバイン校の生態学および進化生物学部の教授となり、1988年に准教授に昇進した。[11] 1991年、レンスキーは研究室をミシガン州立大学に移し、NSFの微生物生態学科学技術センターに加わった。レンスキーはオックスフォード大学で長期研究を行い、ロバート・メイと共に働いた[12]ほか、イザベル・オリヴィエリの招きでモンペリエ大学にも滞在した。
研究
大腸菌実験

大腸菌長期進化実験は、リチャード・レンスキーが率いる実験進化の進行中の研究で、 1988年2月24日以来、無性生殖を行う大腸菌の当初は同一であった12の集団における遺伝的変化を追跡してきた。 [13]集団は2022年に75,000世代という節目に到達した。[14]
実験開始以来、レンスキーと彼の同僚は、さまざまな遺伝的変化を報告してきた。進化的適応の中には、12の集団すべてで発生したものもあれば、1つまたは少数の集団にのみ発生したものもあった。特に注目すべき適応の1つは、好気性環境でクエン酸を炭素源として利用できる大腸菌株の進化であった。[ 15 ]大腸菌の特徴は、有酸素条件下ではクエン酸をエネルギー源として利用できないことである。[16]
Avidaシミュレーション
リチャード・レンスキーは、チャールズ・オフリア、クリス・アダミ、その他と共同で、複雑なシステムの進化を詳細に分析できる人工生命コンピュータプログラムを使った研究を行っている。このシステムでは、ユーザーがランダムな突然変異の速度を設定できる一方、仮想世界内で自然淘汰が働き、有益な形質をもたらす突然変異が促進される(有害な突然変異は排除される)。このプログラムは Avida と名付けられ、人工ペトリ皿から始まり、生物が繁殖し、数学的計算を実行して、複製のためのコンピュータ時間の増加という形で報酬を得る。このプログラムは人工生物のコピーにランダムに突然変異を追加し、その後、人工生物は自然淘汰を受ける。人工生命が繁殖するにつれ、さまざまな系統が環境に応じて適応し進化する。このプログラムは、高度に抽象化された形で、はるかに速い速度で生物の進化と並行することを目指している。[17] [18] [19] [20]
メディア
2013年8月、タイタス・ブラウンによる科学におけるソーシャルメディアの役割に関するプレゼンテーションに触発され、レンスキーはTelliamed Revisitedでブログを書き始め、@RELenskiとしてツイートし始めた。 [21]
レンスキーの研究は、カール・ジンマーの大腸菌に関する著書『Microcosm』やリチャード・ドーキンスの進化論の証拠に関する著書『The Greatest Show on Earth 』の中で長々と議論されるなど、かなりの注目を集めている。ドーキンスの議論には、レンスキーが2008年にコンサバペディアの創設者アンドリュー・シュラフリーと交わした対話の説明も含まれていた。この対話は、長期進化実験の集団の1つにおける好気性クエン酸の使用の進化に関するレンスキーの説明に関する報告に対する反応としてシュラフリーが始めたものだった。この同じ発見は、後に創造論者の ケン・ハムによってビル・ナイとの進化論に関する議論で引用された。レンスキーは、ハムによる自分の研究の引用とハムがそこから引き出した結論を強く批判した。[22]
2021年、レンスキーはデレク・ミュラーによる長期進化実験についてヴェリタシウムのビデオでインタビューを受け、そのビデオは600万回以上視聴されている。[23]
栄誉
レンスキーは1991年にグッゲンハイムフェローシップ、 1996年にマッカーサーフェローシップを受賞し、2006年には米国科学アカデミーに選出された。[24]
レンスキーはアメリカ微生物学会[25]とアメリカ芸術科学アカデミー[ 26]の会員であり、ミシガン州立大学の微生物生態学のジョン・A・ハンナ特別教授の称号を保持している。[27]
2010 年 2 月 17 日、彼はBEACON センターとして知られる NSF 科学技術進化研究センターを共同設立しました。
彼は2018年にアメリカ哲学協会に選出された。[28]
レンスキーは進化学会から2021年生涯功労賞を受賞した。[29]
選りすぐりの作品
- Lenski, RE、および M. Travisano。1994。「適応と多様化のダイナミクス:細菌集団による 10,000 世代実験」 米国科学アカデミー紀要、 91: 6808-6814。
- Lenski, RE、RM 1994 年 5 月。「寄生虫と病原体の毒性の進化: 2 つの競合する仮説の調和」 Journal of Theoretical Biology 169: 253-265。
- Bohannan, BJM、および RE Lenski。2000。「遺伝的変化とコミュニティの進化の関連:細菌とバクテリオファージの研究からの洞察」 エコロジーレター3: 362-377。
- Lenski, RE, C. Ofria, RT Pennock, C. Adami. 2003. 複雑な特徴の進化的起源。Nature 423: 139-144。
- Blount, ZD, JE Barrick, CJ Davidson、および RE Lenski。2012。実験的大腸菌集団における重要な革新のゲノム解析。Nature 489 : 513-518。
- Wiser, MJ, N. Ribeck, RE Lenski. 2013. 無性生殖個体群における適応の長期的ダイナミクス。Science 342: 1364-1367。
- テナイヨン、O.、JE バリック、N. リベック、DE デザーレイジ、JL ブランチャード、A. ダスグプタ、GC ウー、S. ウィエルゴス、S. クルヴェイラー、C. メディグ、D. シュナイダー、RE レンスキ。2016 年。50,000 世代実験におけるゲノム進化のテンポとモード。 ネイチャー536: 165-170。[DOI: 10.1038/nature18959]
- Losos, JB、および RE Lenski 編、2016 年。『進化が私たちの生活を形作る: 生物学と社会に関するエッセイ』。プリンストン大学出版局、プリンストン、ニュージャージー州。
- ブラント、ZD、RE レンスキ、JB ロソス。2018。進化における偶然性と決定論:生命のテープを再生する。 サイエンス362: eaam5979。[DOI: 10.1126/science.aam5979]
参考文献
- ^ 「ミシガン州立大学のリチャード・レンスキー氏が2017年フレンド・オブ・ダーウィン賞を受賞」
- ^ 「ジョン・サイモン・グッゲンハイム財団 | リチャード・E・レンスキー」。
- ^ 「Richard Lenski」ミシガン州立大学。2008年。2008年9月17日閲覧。
- ^ テナイヨン、オリヴィエ;バリック、ジェフリー E.リベック、ノア。デセラジ、ダニエル E.ブランチャード、ジェフリー L.ダスグプタ、アウルコ。ウー、ガブリエル C.ヴィエルゴス、セバスチャン。クルヴェイエ、ステファン (2016-08-11)。 「50,000世代実験におけるゲノム進化のテンポとモード」。自然。536 (7615): 165–170。Bibcode :2016Natur.536..165T。土井:10.1038/nature18959. ISSN 0028-0836。PMC 4988878。PMID 27479321。
- ^ Maddamsetti, Rohan; Lenski, Richard E.; Barrick, Jeffrey E. (2015-06-01). 「大腸菌を用いた長期進化実験における適応、クローン干渉、および周波数依存相互作用」.遺伝学. 200 (2): 619–631. doi :10.1534/genetics.115.176677. ISSN 0016-6731. PMC 4492384. PMID 25911659 .
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- ^ Richard Lenski [@relenski] (2014年8月17日). 「父親の90歳の誕生日にリチャード・レンスキーとゲルハルト・レンスキーが撮った写真」(ツイート) . 2014年8月18日閲覧– Twitter経由。
- ^ キャンベル、ニール A.; リース、ジェーン B. (2005).生物学(第 7 版). ピアソン、ベンジャミン カミングス. pp. 538–539. ISBN 978-0-8053-7146-8。
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- ^ Lenski, Richard E.; May, Robert M. (1994-08-07). 「寄生虫と病原体の毒性の進化: 2 つの競合する仮説の調和」. Journal of Theoretical Biology . 169 (3): 253–265. doi :10.1006/jtbi.1994.1146. ISSN 0022-5193.
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- ^ Lenski, Richard (2023年2月15日). 「大腸菌を用いた長期進化実験の設計の再検討」. Journal of Molecular Evolution . 91 (1): 241–253. Bibcode :2023JMolE..91..241L. doi :10.1007/s00239-023-10095-3. PMID 36790511. S2CID 256869639.
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- ^ ブラント、ザカリー; ボーランド、クリスティーナ; レンスキー、リチャード (2008 年 6 月 10 日)。「大腸菌の実験的集団における歴史的偶然性と重要なイノベーションの進化」。PNAS。105 ( 23 ) : 7899–7906。Bibcode : 2008PNAS..105.7899B。doi : 10.1073 / pnas.0803151105。PMC 2430337。PMID 18524956。
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- ^ 「デジタル生物を用いた進化過程の確認」アメリカ科学振興協会。 2011年3月21日閲覧。
- ^ 「人工生命実験は複雑な機能がどのように進化するかを示している」アメリカ科学振興協会。2011年3月21日閲覧。
- ^ Richard E. Lenski、Charles Ofria、Claus O. Wilke、Jia Lan Wang、Christoph Adami (2001-07-19)。「高突然変異率でのデジタル生物の進化は、最も平坦なものの生存につながる」( PDF ) 。Nature。412 ( 6844 ) : 331–3。Bibcode :2001Natur.412..331W。doi : 10.1038/35085569。PMID 11460163。S2CID 1482925 。
- ^ Richard Lenski (2013年8月19日). 「Welcome to Telliamed Revisited」.
- ^ https://telliamedrevisited.wordpress.com/2014/02/05/ham-on-nye-debate-follow-up-1/、https://telliamedrevisited.wordpress.com/2014/02/06/ham- on-nye-debate-follow-up-2/, https://telliamedrevisited.wordpress.com/2014/02/07/zachary-blount-on-ham-on-nye-debate-follow-up-3/
- ^ Veritasium (2021-06-16). 最も長く続いている進化実験。2024-08-23に取得– YouTube経由。
- ^ 米国科学アカデミー会員リスト、「会員ディレクトリ」、リチャード・E・レンスキー、2006年
- ^ 「アメリカ微生物学アカデミー」ASM.org . 2024年8月23日閲覧。
- ^ “Richard E. Lenski | American Academy of Arts and Sciences”. www.amacad.org . 2024-08-23 . 2024-08-23閲覧。
- ^ 「Richard Lenski | 名誉教授 | ミシガン州立大学」msu.edu . 2024年8月23日閲覧。
- ^ 「2018年春季会議における新会員の選出」
- ^ 「進化学会」www.evolutionsociety.org . 2021年7月4日閲覧。
外部リンク
- Google Scholar の出版物リスト
- 大腸菌長期実験進化サイト 2017-07-27 にWayback Machineでアーカイブ
- ビーコン進化研究センターの活動
- ミシガン州立大学からのニュースリリース
- 織機:進化の新たな一歩
