ペドロ・ダ・フォンセカSJ (ラテン語: Petrus Fonsecae ; 1528 年、プロエンサ・ア・ノヴァ在住 – 1599 年 11 月 4 日、リスボン) は、ポルトガルのイエズス会の哲学者、神学者でした。論理と形而上学に関する彼の研究により、当時彼はポルトガルのアリストテレスとして知られていました。彼はマヌエル・デ・ゴイスらによって実現された「Cursus Conimbricensis」を投影しました。
ペドロ・ダ・フォンセカは1528年にポルトガルのプロエンサ・ア・ノヴァで生まれ、 1548年にコインブラでイエズス会に入会した。1551年から1555年まで、新設されたエヴォラ大学で学び、教鞭を執った。1555年にコインブラに戻り、1561年までコレージョ・ダス・アルテスで哲学を教えた。1564年から1571年まで再びエヴォラで働き、当初は神学教授、後に大学総長を務めた。 1572年から1582年までローマに住み、学者および教会行政官として活動した。フォンセカの最も重要な学術的業績は、アリストテレスの『形而上学』の注釈書(全4巻、1577~89年)である。論理学においては、彼の思想はスコラ哲学よりも人文主義に近いものであり、主な著作は『弁証法学要綱』(1564年)と『哲学の教え』(1591年)である。
フォンセカは修道会で多くの重要な役職を歴任し、ポルトガルでは総長の補佐、ポルトガル巡察官、リスボンの修道院長を務めた。グレゴリウス13世とフェリペ2世(1580年からポルトガル王)は、彼を極めて繊細かつ重要な事柄に起用した。フォンセカは慈善と学問の振興に賢明に影響力を用いた。リスボンの多くの偉大な機関、特にアイルランド学院は、少なくとも大部分は彼の熱意と敬虔さによって存在していた。彼はまた、イエズス会の『ラティオ・ストゥディオルム』の起草にも大きく貢献したとされている。しかし、彼が永続的な名声を得る最大の理由は、神における中立的知識(scientia media in God)によって、恩寵と自由意志の調和という難問に対する解決策を初めて考案した点にある。しかしながら、この分野における彼の名声は、弟子であるルイス・デ・モリーナの名声によってやや影を潜めてしまった。モリーナは、師の思想を『自由意志と恩寵の調和』という著作でより完全に発展させ、完成させたことで、次第にこの教義の創始者とみなされるようになったのである。