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| ＰＲＤＭ９ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | PRDM9、MEISETZ、MSBP3、PFM6、PRMD9、ZNF899、PRドメイン9、PR/SETドメイン9、KMT8B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：609760; MGI : 2384854;ホモロジーン: 104139;ジーンカード：PRDM9; OMA :PRDM9 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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PRドメイン[注 1]ジンクフィンガータンパク質9は、ヒトではPRDM9遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] PRDM9は、そのジンクフィンガードメインにコードされているDNA配列モチーフに結合することにより、減数分裂中に組換えホットスポットを配置する役割を果たす。 [6] PRDM9は、哺乳類でこれまでに発見された唯一の種分化遺伝子であり、ゲノムの中で最も急速に進化している遺伝子の1つである。[7] [8]
ドメインアーキテクチャ
PRDM9には、 KRABドメイン、SSXRD、PR/SETドメイン（H3K4およびH3K36トリメチルトランスフェラーゼ）、およびC2H2ジンクフィンガードメイン（DNA結合）の配列を含む複数のドメインがあります。 [9]
歴史
1974年にJiri ForejtとP. Ivanyiは雑種不妊を制御する遺伝子座を特定し、Hst1と名付けた。[10]
1982年に組換え率を制御するハプロタイプwm7が同定され[11]、後にPRDM9として同定されました[12] 。
1991年にミニサテライトコンセンサス配列5′-CCACCTGCCCACCTCT-3′に結合するタンパク質が検出され、部分的に精製されました（Msbp3 - ミニサテライト結合タンパク質3と命名されました）。[13]これは後に独立して同定されたPRDM9タンパク質と同じものであることが判明しました。[14]
2005年に、減数分裂前期の進行に必要なH3K4メチルトランスフェラーゼ活性を持つ遺伝子（Meisetzと命名）が特定されました。[15]
2009年にJiri Forejtとその同僚はHst1をMeisetz/PRDM9として特定しました。これは哺乳類における最初の、そして今のところ唯一の種分化遺伝子です。[16]
2009年後半、PRDM9はゲノム内で最も急速に進化する遺伝子の一つとして特定されました。[9] [17]
2010年に3つのグループが独立してPRDM9がヒトとマウスの組み換えホットスポットの位置を制御していることを特定した。[6] [18] [19] [20] [21]
2012年には、ほぼすべてのホットスポットがPRDM9によって配置され、PRDM9が存在しない場合にはホットスポットがプロモーターの近くに形成されることが示されました。[22]
2014年にはPRDM9 SETドメインが試験管内でH3K36をトリメチル化できることが報告され[23] 、 2016年には生体内でも確認された[24]。
2016年には、PRDM9によって引き起こされる雑種不妊症は回復可能であり、不妊症は非対称二本鎖切断によって引き起こされることが示されました。[25] [26]
組み換えにおける機能
PRDM9は相同組み換えの部位を指示することによって減数分裂の過程を媒介する。[27]ヒトおよびマウスでは、組み換えはゲノム全体で均一に起こるのではなく、組み換えホットスポットと呼ばれる染色体上の特定の部位で起こる。ホットスポットは長さ約1～2kbのDNA領域である。 [28]ヒトゲノム 内には約30,000～50,000のホットスポットがあり、平均して50～100kbのDNAごとに1つに相当する。[28] ヒトでは、ホットスポットあたりの交差組み換えイベントの平均数は1,300回の減数分裂につき1回であり、最も極端なホットスポットでは交差頻度は110回の減数分裂につき1回である。[28] これらのホットスポットは、PRDM9ジンクフィンガーアレイの結合部位である。[29] DNAに結合すると、PRDM9はヒストン3のリジン4とリジン36のトリメチル化を触媒します。 [30]その結果、局所的なヌクレオソームが再編成され、未知のメカニズムを通じて組換え機構がリクルートされ、二本鎖切断が形成されます。
注記
- ^ 正の制御ドメイン
参考文献
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さらに読む
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外部リンク
- 米国国立医学図書館の医学主題標目表(MeSH)における PRDM9+タンパク質、+ヒト
- UCSC ゲノムウィキ - PRDM9: 減数分裂と組み換え
この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。