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| ミール-200 | |
|---|---|
 miR-200 マイクロRNAの二次構造と配列の保存 | |
| 識別子 | |
| シンボル | ミール-200 |
| Rfam | RF00982 |
| miRBase ファミリー | ＭＩＰＦ０００００１９ |
| NCBI遺伝子 | 406983 |
| HGNC | 31578 |
| オミム | 612090 |
| その他のデータ | |
| RNAタイプ | マイクロRNA |
| ドメイン | 真核生物;脊索動物; |
| PDB構造 | PDBe |
分子生物学では、miR-200マイクロRNAは短いRNA分子です。マイクロRNAは、 mRNAに結合して切断したり、翻訳を阻害したりすることで、他の遺伝子の発現レベルを調節する働きをします。miR-200ファミリーには、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-141、miR-429が含まれます。miR-200マイクロRNAが癌の転移に関与していることを示す証拠が増えています。[1]
ゲノム位置
miR-200の5つのメンバーは2つのクラスターに存在します。ヒトでは、miR-200a、miR-200b、miR-429は1番染色体上にあり、miR-200cとmiR-141は12番染色体上にあります。マウスでは、2つのクラスターは4番染色体と6番染色体上にあります。[1]
発現とエピジェネティック制御
miR-200ファミリーのメンバーは、上皮組織に多く含まれています。[2] miR-200ファミリーは正常な上皮細胞で多く発現していますが、間葉系起源の正常な線維芽細胞では発現していません。間葉系細胞での発現はエピジェネティックマークによって抑制されており、各クラスターは異なるマークによって抑制されています。1番染色体上のクラスターのプロモーターはポリコーム特異的マークH3K27me3によって占有されていますが、12番染色体上のクラスターのプロモーターはDNAメチル化によって抑制されています。[3] mir-200c/mir-141プロモーターのDNAメチル化は、上皮系起源であるが上皮から間葉系への移行を経てmir-200ファミリーがサイレンシングされている特定の悪性癌細胞で異常に発生します。[4]
腫瘍の進行との関連
miR-200 ファミリーは、転移の開始段階である上皮間葉転換 (EMT) を阻害することで、腫瘍抑制に重要な役割を果たすと考えられています( Korpal )。EMT は胚発生の一部として発生し、癌の進行と多くの類似点があります。EMT 中、細胞は接着を失い、運動性が高まります。これは、転移の初期段階でも発生する E カドヘリン発現の抑制によって特徴付けられます。
対照的に、miR-200は転移の最終段階を促進することが示されており、この段階では移動する癌細胞が遠隔組織に定着する際にMETを受ける。一連のマウス乳腺同質癌細胞株では、miR-200ファミリーは転移を形成できる細胞（4T1細胞）でのみ高度に発現しており、定着できない他の細胞（4TO7細胞）では高度に発現していない。転移しない4TO7細胞でmiR-200cを過剰発現すると、METが容易に可能になり、肝臓と肺に定着する。[5]
miR-200はEカドヘリン転写抑制因子ZEB1とZEB2を標的とする。miR-141とmiR-200bのノックダウンはEカドヘリン発現を減少させ、細胞運動性を高めてEMTを誘導することが示されている。[6] [7]これらの知見と一致して、miR-200bの過剰発現は子宮内膜症 細胞の運動性と浸潤性増殖の減少をもたらし、ZEB1とZEB2のダウンレギュレーションとEカドヘリンのアップレギュレーションと関連していた。[8] miR-200のファミリーメンバーはシード領域の違いにより異なる機能を持つ可能性があることに注意する必要がある。miR-200bcは同じシード領域を共有しているが、miR-200aには1つのヌクレオチドの変化がある。[9]
癌
EMT および腫瘍の進行における miR-200 の役割は、以下を含むいくつかの癌と関連付けられています。
- 膀胱がん[10] [11]
- 乳がん[12] [13]
- 悪性黒色腫[14]
- 卵巣がん[15]
- 膵臓がん[16]
- 前立腺がん[17]
- 胃がん[18]
- 肺がん[19]
- 大腸がん：MiR-200aは上皮間葉転換関連遺伝子の発現を制御し、大腸がん患者の予後を決定する。[20]
参考文献
- ^ ab Korpal M, Lee ES, Hu G, Kang Y (2008 年 5 月). 「miR-200 ファミリーは E カドヘリン転写抑制因子 ZEB1 および ZEB2 を直接標的として上皮間葉転換 (EMT) を阻害し、間葉上皮転換 (MET) を促進する」J. Biol. Chem . 283 (22): 14910–4. doi : 10.1074/jbc.C800074200 . PMC 3258899. PMID 18411277 .
- ^ Lu J, Getz G, Miska EA, et al. (2005年6月). 「マイクロRNA発現プロファイルがヒトの癌を分類する」. Nature . 435 (7043): 834–8. Bibcode :2005Natur.435..834L. doi :10.1038/nature03702. PMID 15944708. S2CID 4423938.
- ^ Vrba, L; Garbe, JC; Stampfer, MR; Futscher, BW (2011). 「正常なヒト乳腺細胞型特異的 miRNA のエピジェネティック制御」.ゲノム研究. 21 (12): 2026–37. doi :10.1101/gr.123935.111. PMC 3227093. PMID 21873453 .
- ^ Vrba, L; Jensen, TJ; Garbe, JC; Heimark, RL; Cress, AE; Dickinson, S; Stampfer, MR; Futscher, BW (2010). 「正常細胞と癌細胞における miR-200c および miR-141 発現の調節における DNA メチル化の役割」. PLOS ONE . 5 (1): e8697. Bibcode : 2010PLoSO ...5.8697V. doi : 10.1371/journal.pone.0008697 . PMC 2805718. PMID 20084174.
- ^ Dykxhoorn DM (2010). 「マイクロRNAと転移：小さなRNAが大きな役割を果たす」. Cancer Res . 70 (16): 6401–6406. doi :10.1158/0008-5472.CAN-10-1346. PMC 2922433. PMID 20663901 .
- ^ Gregory PA、Bert AG、Paterson EL、他 (2008 年 5 月)。「miR-200 ファミリーと miR-205 は ZEB1 と SIP1 を標的として上皮細胞から間葉細胞への移行を制御する」Nat. Cell Biol . 10 (5): 593–601. doi : 10.1038/ncb1722 . PMID 18376396。
- ^ Park SM、Gaur AB、Lengyel E、Peter ME (2008 年 4 月)。「miR-200 ファミリーは、E カドヘリン抑制因子 ZEB1 および ZEB2 を標的にして、がん細胞の上皮表現型を決定します」。Genes Dev . 22 (7): 894–907. doi :10.1101/gad.1640608. PMC 2279201 . PMID 18381893。
- ^ Eggers, Julia (2016). 「マイクロRNA miR-200bはZEB1、ZEB2、KLF4を標的として子宮内膜症細胞の増殖、浸潤性、幹細胞性に影響を与える」Reproductive Biomedicine Online . 32 (4): 434–45. doi : 10.1016/j.rbmo.2015.12.013 . PMID 26854065.
- ^ ウールマン、S;チャン、JD。シュヴェーガー、A;マンスペルガー、H;リアザルホセイニ、Y;バーメスター、S;ウォード、A;コーフ、U;ウィーマン、S;シャヒン、O (2010 年 7 月 29 日)。 「乳がんにおいて、miR-200bc/429クラスターはPLCγ1を標的とし、miR-200a/141とは異なる増殖とEGFによる浸潤を調節する。」がん遺伝子。29 (30): 4297–306。土井：10.1038/onc.2010.201。PMID 20514023。
- ^ Adam L、Zhong M、Choi W、他 (2009 年 8 月)。「miR-200 発現は膀胱癌細胞の上皮間葉転換を制御し、上皮成長因子受容体療法に対する抵抗性を逆転させる」。Clin . Cancer Res . 15 (16): 5060–72. doi :10.1158/1078-0432.CCR-08-2245. PMC 5938624. PMID 19671845 。
- ^ Wiklund ED、Bramsen JB、 Hulf T、他 (2010 年 5 月)。「浸潤性膀胱がんにおける miR-200 ファミリーと miR-205 の協調的エピジェネティック抑制」。Int J Cancer。128 ( 6): 1327–34。doi : 10.1002/ ijc.25461。PMID 20473948。
- ^ Tryndyak VP、Beland FA、Pogribny IP（2010年6月）。「エピジェネティックおよびマイクロRNA-200ファミリーの変化によるE-カドヘリン転写ダウンレギュレーションは、ヒト乳がん細胞の間葉系および薬剤耐性表現型に関連している」。Int . J. Cancer。126（11）：2575–83。doi ：10.1002/ijc.24972。PMID 19839049。
- ^ Dykxhoorn DM, Wu Y, Xie H, et al. (2009). Blagosklonny MV (ed.). 「miR-200 はマウス乳がん細胞のコロニー形成を促進し、遠隔転移を形成させる」. PLOS ONE . 4 (9): e7181. Bibcode :2009PLoSO...4.7181D. doi : 10.1371/journal.pone.0007181 . PMC 2749331. PMID 19787069 .
- ^ Elson-Schwab, I; Lorentzen, A; Marshall, CJ (2010). Danen, Erik HJ (ed.). 「MicroRNA-200 ファミリーメンバーは形態学的可塑性と黒色腫細胞浸潤モードを差別的に制御する」. PLOS ONE . 5 (10): e13176. Bibcode :2010PLoSO...513176E. doi : 10.1371/journal.pone.0013176 . PMC 2949394. PMID 20957176 .
- ^ Hu X、Macdonald DM、Huettner PC、Feng Z、El Naqa IM、Schwarz JK、Mutch DG、Grigsby PW、Powell SN、Wang X (2009)。「進行卵巣癌の予後マーカーとしての miR-200 マイクロRNA クラスター」。Gynecol Oncol . 114 (3): 457–64. doi :10.1016/j.ygyno.2009.05.022. PMID 19501389。
- ^ Li Y, VandenBoom TG, Kong D, Wang Z, Ali S, Philip PA, Sarkar FH (2009). 「天然因子による miR-200 および let-7 の上方制御は、ゲムシタビン耐性膵臓癌細胞の上皮間葉転換の逆転につながる」。Cancer Res . 69 (16): 6704–12. doi :10.1158/0008-5472.CAN-09-1298. PMC 2727571. PMID 19654291 .
- ^ Kong D, Li Y, Wang Z, Banerjee S, Ahmad A, Kim HR, Sarkar FH (2009). 「miR-200 は PDGF-D を介した前立腺癌細胞の上皮間葉転換、接着、浸潤を制御する」. Stem Cells . 27 (8): 1712–21. doi :10.1002/stem.101. PMC 3400149. PMID 19544444 .
- ^ Shinozaki A, Sakatani T, Ushiku T, Hino R, Isogai M, Ishikawa S, Uozaki H, Takada K, Fukayama M (2010). 「EBV関連胃癌におけるmicroRNA-200のダウンレギュレーション」Cancer Res . 70 (11): 4719–27. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-09-4620 . PMID 20484038.
- ^ Gibbons DL、Lin W、Creighton CJ、Rizvi ZH、Gregory PA、Goodall GJ、Thilaganathan N、Du L、Zhang Y、Pertsemlidis A、Kurie JM (2009)。「文脈的細胞外キューはmiR-200ファミリー発現を制御することで腫瘍細胞のEMTと転移を促進する」。Genes Dev . 23 (18): 2140–51. doi :10.1101/gad.1820209. PMC 2751985 . PMID 19759262。
- ^ ピヒラー、M;アラバマ州レス。冬、E;シュティーゲルバウアー、V;カービナー、M;シュワルツェンバッハー、D;シャイデラー、M;イワン、C;サウスウェールズ州ジャーン;キースリッヒ、T;ガーガー、A;バウエルンホーファー、T;ジョージア州カリン。ヘフラー、G (2014)。 「MiR-200a は上皮間葉移行関連遺伝子発現を調節し、結腸直腸癌患者の予後を決定します。」英国癌ジャーナル。110 (6): 1614–21。土井：10.1038/bjc.2014.51。PMC 3960623。PMID 24504363。
さらに読む
- Gregory PA、Bert AG、Paterson EL、Barry SC、Tsykin A、Farshid G、Vadas MA、Khew-Goodall Y、Goodall GJ (2008)。「miR-200 ファミリーと miR-205 は ZEB1 と SIP1 を標的として上皮から間葉への移行を制御します」。Nat Cell Biol . 10 (5): 593–601. doi : 10.1038/ncb1722 . PMID 18376396。
- Iliopoulos D、Lindahl-Allen M、Polytarchou C、Hirsch HA、Tsichlis PN、Struhl K (2010)。「Suz12 の miR-200 阻害の消失は、がん幹細胞の形成と維持に必要なポリコーム媒介抑制につながる」。Mol Cell。39 ( 5 ) : 761–72。doi : 10.1016 /j.molcel.2010.08.013。PMC 2938080。PMID 20832727。
- Brabletz S, Brabletz T (2010). 「ZEB/miR-200 フィードバックループ - 発達と癌における細胞可塑性の原動力?」EMBO Rep . 11 (9): 670–7. doi :10.1038/embor.2010.117. PMC 2933868. PMID 20706219 .
- Mongroo PS、Rustgi AK (2010)。「上皮間葉転換における miR-200 ファミリーの役割」。Cancer Biol Ther . 10 (3): 219–22. doi :10.4161/cbt.10.3.12548. PMC 3040834. PMID 20592490 。
- Lin Z、Wang X、Fewell C、Cameron J、Yin Q、Flemington EK (2010)。「上皮細胞およびB細胞におけるmiR-200ファミリーマイクロRNAの差次的発現と、miR-200ファミリーメンバーmiR-429によるエプスタイン・バーウイルス再活性化の調節」。J Virol . 84 (15): 7892–7. doi :10.1128/JVI.00379-10. PMC 2897641. PMID 20484493 。
- テレマンAA (2010)。 「miR-200 de-FOG インスリンシグナル伝達」。セルメタブ。11 (1): 8-9。土井：10.1016/j.cmet.2009.12.004。PMID 20085731。
- Hyun S、Lee JH、Jin H、Nam J、Namkoong B、Lee G、Chung J、Kim VN (2009)。「保存されたマイクロRNA miR-8/miR-200とその標的USH/FOG2はPI3Kを制御することで成長を制御する」。Cell . 139 ( 6): 1096–108. doi : 10.1016/j.cell.2009.11.020 . PMID 20005803。
- Bendoraite A、Knouf EC、Garg KS、Parkin RK、Kroh EM、O'Briant KC、Ventura AP、Godwin AK、Karlan BY、Drescher CW、Urban N、Knudsen BS、Tewari M (2010)。「卵巣がんにおける miR-200 ファミリー microRNA および ZEB 転写因子の調節: 中皮細胞から上皮細胞への移行を裏付ける証拠」。Gynecol Oncol . 116 (1): 117–25. doi :10.1016/j.ygyno.2009.08.009. PMC 2867670. PMID 19854497 。
- Spaderna S、 Brabletz T、Opitz OG (2009)。「miR-200ファミリー：上皮表現型の獲得と喪失の中心的役割」。 消化器病学。136 (5): 1835–7。doi : 10.1053/j.gastro.2009.03.009。PMID 19324106。
- Peter ME (2009). 「Let-7 および miR-200 マイクロ RNA: 多能性と癌の進行に対する守護者」. Cell Cycle . 8 (6): 843–52. doi :10.4161/cc.8.6.7907. PMC 2688687. PMID 19221491 .
- Korpal M, Kang Y (2008). 「上皮間葉転換と癌転移における miR-200 ファミリーのマイクロ RNA の新たな役割」. RNA Biol . 5 (3): 115–9. doi :10.4161/rna.5.3.6558. PMC 3532896. PMID 19182522 .
- Paterson EL、Kolesnikoff N、Gregory PA、Bert AG、Khew-Goodall Y、Goodall GJ (2008)。「マイクロRNA-200ファミリーが上皮細胞から間葉細胞への移行を制御する」 。ScientificWorldJournal。8 : 901–4。doi : 10.1100 / tsw.2008.115。PMC 5848679。PMID 18836656。
- Bracken CP、Gregory PA、Kolesnikoff N、Bert AG、Wang J、Shannon MF、Goodall GJ (2008)。「ZEB1-SIP1 と microRNA-200 ファミリー間の二重負のフィードバックループが上皮間葉転換を制御する」。Cancer Res . 68 (19): 7846–54. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-08-1942 . PMID 18829540。
- Burk U、Schubert J、Wellner U、Schmalhofer O、Vincan E、Spaderna S、Brabletz T (2008)。「ZEB1 と miR-200 ファミリーのメンバー間の相互抑制は、癌細胞における EMT と浸潤を促進する」。EMBO Rep . 9 (6): 582–9. doi :10.1038/embor.2008.74. PMC 2396950. PMID 18483486 。
外部リンク
- Rfamの mir-200 microRNA 前駆体ファミリーのページ