ヒトのタンパク質コード遺伝子
| MRPS33 |
|---|
|
| 利用可能な構造 |
|---|
| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | MRPS33、MRP-S33、PTD003、S33mt、CGI-139、ミトコンドリアリボソームタンパク質S33 |
|---|
| 外部ID | オミム:611993; MGI : 1338046;ホモロジーン: 7729;ジーンカード:MRPS33; OMA :MRPS33 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 染色体6(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 6 B1|6 | 始める | 39,778,738 bp [2] |
|---|
| 終わり | 39,787,922 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 横行結腸粘膜
- 太ももの筋肉
- 上腕三頭筋
- 直腸
- 胸郭横隔膜
- 左心室
- ランゲルハンス島
- 上腕二頭筋
- 腓腹筋
- 右耳介
|
| | トップの表現 | - 一次卵母細胞
- 神経軸の線条体
- 二次卵母細胞
- 心室帯
- 神経節隆起
- レンズ
- 白色脂肪組織
- 受精卵
- 神経管
- 副腎
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- ミトコンドリア内膜
- リボソーム
- ミトコンドリア
- ミトコンドリア小リボソームサブユニット
| | 生物学的プロセス |
- ミトコンドリアの翻訳伸長
- ミトコンドリアの翻訳終結
- タンパク質生合成
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
|
| ウィキデータ |
|
28Sリボソームタンパク質S33(ミトコンドリア)は、ヒトではMRPS33遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
哺乳類のミトコンドリアリボソームタンパク質は核遺伝子によってコード化され、ミトコンドリア内でのタンパク質合成を助ける。ミトコンドリアリボソーム(ミトリボソーム)は、小さな28Sサブユニットと大きな 39S サブユニットからなる。ミトコンドリアリボソームのタンパク質とrRNAの比率は、原核生物リボソームの約75% と推定され、この比率は原核生物リボソームで逆転している。哺乳類のミトリボソームと原核生物リボソームのもう 1 つの違いは、原核生物リボソームには5S rRNA が含まれていることである。種が異なれば、ミトリボソームを構成するタンパク質の配列は大きく異なり、生化学的特性が異なる場合もあり、配列相同性による容易な認識を妨げている。哺乳類のミトリボソームの 28S サブユニットは、翻訳開始において極めて重要かつ特徴的な役割を果たす可能性がある。この遺伝子は、哺乳類、ショウジョウバエ、線虫の間で最も高度に保存されているミトコンドリアリボソームタンパク質の1つである28Sサブユニットタンパク質をコードしています。この遺伝子には、5' UTRが異なるスプライスバリアントが見つかっていますが、すべてのバリアントは同じタンパク質をコードしています。この遺伝子に対応する偽遺伝子は、染色体1q、4p、4q、および20qに見られます[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000090263 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029918 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Cavdar Koc E、Burkhart W、Blackburn K、Moseley A、Spremulli LL (2001 年 5 月)。「哺乳類ミトコンドリアリボソームの小サブユニット。存在するリボソームタンパク質の完全な補完の同定」。J Biol Chem . 276 (22) : 19363–74。doi : 10.1074/ jbc.M100727200。PMID 11279123。
- ^ Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (2000 年 8 月). 「比較プロテオミクスによる Caenorhabditis elegans で進化的に保存されている新規ヒト遺伝子の同定」Genome Res . 10 (5): 703–13. doi :10.1101/gr.10.5.703. PMC 310876 . PMID 10810093.
- ^ ab 「Entrez Gene: MRPS33 ミトコンドリアリボソームタンパク質 S33」。
さらに読む
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Hillier LW 、 Fulton RS、Fulton LA、他 (2003)。「ヒト染色体7のDNA配列」。Nature 424 ( 6945 ) : 157–64。Bibcode : 2003Natur.424..157H。doi : 10.1038/nature01782。PMID 12853948。
- Zhang Z、Gerstein M (2003)。「ヒトゲノムにおける100を超えるミトコンドリアリボソームタンパク質擬似遺伝子の同定と特徴付け」。ゲノミクス。81 (5): 468–80。doi : 10.1016 /S0888-7543 ( 03)00004-1。PMID 12706105 。
- Scherer SW、Cheung J、 MacDonald JR、他 (2003)。「ヒト染色体7: DNA配列と生物学」。サイエンス。300 (5620): 767–72。Bibcode : 2003Sci ...300..767S。doi : 10.1126 /science.1083423。PMC 2882961。PMID 12690205。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- サンガーセンター、ワシントン大学ゲノムシークエンシングセンター (1999)。「完全なヒトゲノム配列に向けて」。 ゲノム研究8 ( 11): 1097–108。doi : 10.1101/gr.8.11.1097。PMID 9847074。