| KLF1 |
|---|
|
| 利用可能な構造物 |
|---|
| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
| PDB IDコード一覧 |
|---|
2L2I、2MBH、2N23 |
|
|
| 識別子 |
|---|
| 別名 | KLF1、CDAN4、EKLF、HBFQTL6、INLU、クルッペル様因子 1 (赤血球)、クルッペル様因子 1、EKLF/KLF1 |
|---|
| 外部ID | オミム: 600599 ; MGI : 1342771 ;ホモロジーン: 4785 ;ジーンカード: KLF1 ; OMA : KLF1 - オルソログ |
|---|
|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| Bgee | | 人間 | マウス(相同体) |
|---|
| トップは | - 海綿骨
- 骨髄
- 血
- 骨髄細胞
- 単球
- 前脛骨筋
- 顆粒球
- 心室帯
- 生殖腺
- 脾臓
|
| | トップは | - 胎児肝臓造血前駆細胞
- 脛骨大腿関節
- ヒト胎児
- 脾臓
- 胚
- 大腿骨体
- 骨髄
- 腹壁
- 尿道
- 女性の尿道
|
| | より多くの参照発現データ |
|
|---|
| バイオGPS | |
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 | - DNA結合転写因子活性
- DNA結合
- シス調節領域配列特異的DNA結合
- 金属イオン結合
- 核酸結合
- タンパク質結合
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域の配列特異的DNA結合
- DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス | - 転写の正の制御、DNAテンプレート
- 赤血球分化
- ペプチドに対する細胞応答
- 転写の調節、DNA鋳型
- 転写、DNA鋳型
- 女性の妊娠に関わる母体のプロセス
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
|
| ウィキデータ |
|
クルッペル様因子1は、ヒトではKLF1遺伝子によってコードされるタンパク質です。KLF1遺伝子は、ヒトでは19番染色体、マウスでは8番染色体上に位置しています。クルッペル様因子1は、赤血球の適切な成熟に不可欠な転写因子です。
関数
マウスを用いた研究により、造血発生におけるKLF1の重要な機能が初めて実証された。KLF1欠損(ノックアウト)マウス胚は致死的な貧血表現型を示し、成体β-グロビンの転写を促進できず、胚発生15日目までに死亡する。[ 6 ] KLF1の過剰発現は、循環血小板数の減少をもたらし、β-グロビン遺伝子の発現開始を早める。[ 7 ]
KLF1は、終末赤血球分化に不可欠な6つの細胞経路の調節を調整する。[ 8 ]
- 細胞膜と細胞骨格
- アポトーシス
- ヘム合成と輸送
- 細胞周期
- 鉄の調達
- グロビンチェーン生産
また、βグロビン遺伝子の転写に不可欠な3つの主要なプロセスにも関連していることが分かっている。
- クロマチンリモデリング
- ガンマ-ベータグロビンスイッチの変調
- 転写活性化
KLF1はβ-グロビン遺伝子プロモーターの「CACCC」モチーフに特異的に結合する。[ 6 ] プロモーターに自然突然変異が生じると、ヒトにβ+サラセミアが発生する可能性がある。サラセミアの有病率(世界中で200万人がこの形質を保有している)から、KLF1は臨床的に重要な意味を持つ。
臨床的意義
次世代シーケンシングの取り組みにより、ヒトKLF1の変異の頻度が驚くほど高いことが明らかになった。[ 9 ]中国南部では、KLF1欠損児が生まれる確率は約1:24,000である。[ 10 ]出生前輸血と骨髄移植により、KLF1なしで生まれることは可能である。[ 11 ] KLF1のほとんどの変異は劣性機能喪失表現型につながるが、[ 10 ]半優性変異がヒト[ 12 ]およびマウス[ 13 ]でまれな遺伝性貧血CDA IV型の原因として同定されている。追加の家族研究および臨床研究[ 14 ]により、HPFH KLF1関連疾患の分子遺伝学が明らかになり、KLF1がHbFの新規量的形質遺伝子座(HBFQTL6)として確立された。[ 15 ] KLF1がいくつかの赤血球抗原の発現に及ぼす影響の許容的な性質は、KLF1の既知の変異体群によって証明されており、これらの変異体は、ルーテル血液型In(Lu)に対する修飾遺伝子効果にちなんで「ルーテル阻害因子」と名付けられている。ホモ接合体の生存しているヒトの例は知られておらず、KLF1ホモ接合体マウスの胚致死性と一致する。そのため、In(Lu)変異体はKLF1機能に対して著しくヘテロ不完全であり、赤血球は形成されるが、その名の由来となったルテラン抗原(基底細胞接着分子)の発現に明らかな優性阻害効果があり、さらに赤血球膜上のColton(アクアポリン1)、Ok(CD147、すなわちEMMPRIN)、Indian(CD44)、Duffy(Duffy抗原/ケモカイン受容体またはFy)、Scianna(ERMAP)、MN(グリコフォリンA)、Diego(バンド3)、P1、i、AnWj(CD44)などの抗原の発現も有意ではあるがやや変動する程度で阻害される[ 16 ] 。これらの抗原の一部は、 CDA IV型を伴う遺伝性胎児ヘモグロビン持続症の原因となるKLF1変異と重複する可能性がある。
参考文献
- 1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000105610 – Ensembl、2017年5月
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000054191 – Ensembl、2017年5月
- ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ Brown RC、Pattison S、van Ree J、Coghill E、Perkins A、Jane SM、Cunningham JM (2002 年 1 月)。「赤血球クルッペル様因子の異なるドメインが、内因性 β-グロビン遺伝子プロモーターにおけるクロマチン リモデリングと転写活性化を調節する」。Molecular and Cellular Biology。22 ( 1 ): 161–70。doi : 10.1128/mcb.22.1.161-170.2002。PMC 134232。PMID 11739731。
- 1 2 Perkins AC、Sharpe AH、Orkin SH (1995年5月)。 「赤血球 CACCC 転写因子 EKLF を欠損するマウスにおける致死性 βサラセミア」。Nature。375 ( 6529 ) : 318–22。Bibcode : 1995Natur.375..318P。doi : 10.1038 / 375318a0。PMID 7753195。S2CID 4300395。
- ↑ Tewari R、Gillemans N、Wijgerde M、Nuez B、von Lindern M、Grosveld F、Philipsen S (1998 年 4 月)。「赤血球クルッペル様因子( EKLF) は原始赤血球および成熟赤血球で活性があり、β-グロビン遺伝子座制御領域の 5'HS3の機能に必要である」。The EMBO Journal。17 ( 8): 2334–41。doi : 10.1093/ emboj / 17.8.2334。PMC 1170576。PMID 9545245。
- ↑ Tallack MR、Perkins AC (2010年12月)。「KLF1は終末赤血球分化のほぼすべての側面を直接調整する」。IUBMB Life。62 ( 12 ) : 886–90。doi : 10.1002 / iub.404。PMID 21190291。S2CID 10762358。
- ↑ Gillinder K、Magor G、Perkins A ( 2018年5月)。「KLF1 変異による血清学的およびその他の表現型の変動」。Transfusion。58 ( 5 ) : 1324–1325。doi : 10.1111 / trf.14529。PMID 29683509。S2CID 5062082。
- 1 2 Perkins A、Xu X、Higgs DR、Patrinos GP、Arnaud L、Bieker JJ、Philipsen S (2016 年 4 月)。「Krüppeling erythropoiesis : KLF1変異によるヒト赤血球疾患の予想外の広範囲スペクトル」。Blood。127 ( 15 ): 1856–62。doi : 10.1182/ blood -2016-01-694331。PMC 4832505。PMID 26903544。
- ↑ Magor GW、Tallack MR、Gillinder KR、Bell CC、McCallum N、Williams B、Perkins AC (2015年4月)。「KLF1欠損新生児は胎児水腫と異常な赤血球トランスクリプトームを示す」。Blood。125 (15): 2405–17。doi : 10.1182 / blood - 2014-08-590968。PMC 4521397。PMID 25724378。
- ↑アルノー L、セゾン C、ヘリアス V、ルシアン N、ステシェンコ D、ジャラターナ MC、プレフ C、フォリゲ B、モントゥー L、ド ブルバーン AG、フランシーナ A、リポシュ P、フェネトー O、ダ コスタ L、ペイラール T、コフラン G、イルム N、ビルゲンス H、タマリー H、イオラスコン A、ドロネー J、チェルニア G、カートロンJP(2010年11月)。「赤血球転写因子 KLF1 をコードする遺伝子の優性変異は、先天性赤血球生成不全性貧血を引き起こします。 」アメリカ人類遺伝学ジャーナル。87 (5): 721– 7.土井: 10.1016/j.ajhg.2010.10.010。PMC 2978953。PMID 21055716。
- ↑ Gillinder KR、Ilsley MD、Nébor D、Sachidanandam R、Lajoie M、Magor GW、Tallack MR、Bailey T、Landsberg MJ、Mackay JP、Parker MW、Miles LA、Graber JH、Peters LL、Bieker JJ、Perkins AC (2017年2月)。「変異型亜鉛フィンガータンパク質の多面的なDNA結合はトランスクリプトームを破壊し、細胞生存率を低下させる」。Nucleic Acids Research。45 ( 3): 1130– 1143。doi : 10.1093/nar/ gkw1014。PMC 5388391。PMID 28180284。
- ↑ボルグ J、パパドプロス P、ゲオルギツィ M、グティエレス L、グレッチ G、ファニス P、フィラクティデス M、フェルケルク AJ、ファン デル スペック PJ、シェリ CA、カッサー W、ガルディス R、ファン アイケン W、オズギュル Z、ギルマンス N、ホウ J、ブジェヤ M、グロスヴェルド FG、フォン リンダーン M、フェリーチェAE、パトリノスGP、フィリップセンS(2010年9月)。「赤血球転写因子KLF1のハプロ不全は、胎児ヘモグロビンの遺伝的持続を引き起こす」。自然遺伝学。42 (9): 801–5 .土井: 10.1038/ng.630。PMC 2930131。PMID 20676099。
- ↑オンラインのヒトにおけるメンデル遺伝(OMIM): HBFQTL6 - 613566
- ↑ダニエルズ、ジェフ( 2013年4月15日)。ヒト血液型(第3版)。ジョン・ワイリー・アンド・サンズ。pp . 267–270。ISBN 978-1-4443-3324-4。