Loading article…
| ハプログループ O-M268 | |
|---|---|
| 起源の可能性のある時期 | 34,100 または 29,200 ybp [1] 33,181 [95% CI 36,879 <-> 24,461] ybp [2] 30,100 [95% CI 27,800 <-> 32,400] ybp [3] |
| 合体年齢 | 31,108 [95% CI 34,893 <-> 22,844] ybp [2] |
| 起源地の可能性 | 東南アジアまたは東アジア[3] |
| 祖先 | O1（O-F265） |
| 子孫 | O1b1 (K18)、O1b2 (P49/https://en.wikipedia.org/wiki/Draft:Haplogroup_O-M176) |
| 突然変異の定義 | P31、M268、L690/F167、F256/M1341、Y9038/FGC19644、L463/F330、M1461、F138、Y9317、FGC55566、F292/M1363、CTS4164、CTS6713/M1396、CTS5785/M1377、F435/M1417、F516、M1455 |
| 最高周波数 | オーストロアジア語族、タイ族、ハイ族、バリ人、ジャワ人、日本人、琉球人、朝鮮人、マダガスカル人 |
人類遺伝学において、ハプログループ O-M268は、 O1b (旧称ハプログループ O2)とも呼ばれ、 Y染色体 DNA ハプログループです。ハプログループ O-M268 は、ハプログループ O-F265 の主要なサブクレードであり、ハプログループ O-F265 自体は、ハプログループ O-M175の主要な子孫です。
起源
2011年に復旦大学に所属する中国の研究者グループが発表した論文では、中国がハプログループO-P31（ハプログループO2-M268と呼ばれる）の拡大の起源であると示唆されている。[4]
分布
ハプログループ O-P31 は、その地理的分布の特殊性で知られています。ハプログループ O-M175 のすべての系統と同様に、ハプログループ O-P31 は現代の東ユーラシア人の男性にのみ見られます。ただし、ハプログループ O-P31 は一般に、インド、バングラデシュ、東南アジアのオーストロアジア人、インド洋のニコバル諸島のニコバル人、韓国人、日本人などの特定の集団にのみ高頻度で見られます。
ハプログループ O1b-P31 は、広範囲かつ不均一に分布していることに加え、ほぼ完全に分離した分布を示す 2 つの主要なサブクレード、O1b1-M1304/K18 と O1b2-M176/P49 に分けられることでも注目に値します。これらのサブクレードの 1 つである O1b1-M1304/K18 (O-F2320 とも呼ばれる) は、主に 2 つのサブクレード、O1b1a1-PK4 (旧称 O2a) と O1b1a2-CTS4040 (旧称 O2*(xM95,M176)) に分けられます。O1b1a1-PK4 は、主に東南アジアの集団とインドの一部の部族集団 (レモ族、ジュアン族、ニコバル族など) に見られますが、中国南部の少数民族にも一般的で、中国全土および日本でも低頻度で見られます。 O1b1a2-CTS4040は比較的稀で、主に東アジア、特に中国に分布しており、中国男性人口の約3.22%を占めています。[5]ハプログループO1b-P31のもう一つの主要なサブクレードであるハプログループO1b2-M176（旧称O2b）は、現代の日本人と韓国人の男性の約3分の1に見られ、中国人男性では低頻度（約0.70% [6]）で見られます。
系統学
系統発生の歴史
2002 年以前、学術文献には Y 染色体系統樹の命名システムが少なくとも 7 つありました。このため、かなりの混乱が生じました。2002 年に、主要な研究グループが集まり、Y 染色体コンソーシアム (YCC) が結成されました。彼らは共同論文を発表し、全員が使用することに同意した単一の新しい系統樹を作成しました。その後、集団遺伝学と遺伝系譜学に関心を持つ市民科学者のグループがワーキング グループを結成し、何よりもタイムリーであることを目指してアマチュア系統樹を作成しました。以下の表は、画期的な 2002 年の YCC 系統樹の時点でこれらの研究をすべてまとめたものです。これにより、以前に発表された文献をレビューする研究者は、命名法間をすばやく移動できます。
オリジナル研究出版物
YCC ツリーの作成には、以下の研究チームがそれぞれの出版物ごとに参加しました。
- α Jobling と Tyler-Smith 2000 および Kaladjieva 2001
- βアンダーヒル2000
- γハマー 2001
- δカラフェット 2001
- εセミノ 2000
- ζス 1999
- ηカペリ 2001
系統樹
このハプログループ O サブクレードの系統樹は、YCC 2008 ツリー (Karafet 2008) とその後の公開された研究に基づいています。
- O-P31 (P31, M268)
- O-K18
- O-CTS4040主に漢民族に見られ、中国（ダイ族）、満州族、タイ（プアン族、タイ元族、タイ族）、ベトナム、フィリピン、西カリマンタン、カタール、ハザラ族、日本、韓国にも時折見られる。
- O-PK4
- O-P49 (M176, SRY465, P49, 022454)日本、[14]韓国、[14]中国、[14]モンゴル、[14]ベトナム、[14]ミクロネシア[14]
- O-P49*(xPage92)日本、韓国
- O-ページ92
- O-Page90日本（広島）、吉林省[3]
- O-CTS9259
- O-CTS562北京（漢）、[3] 韓国、[15]日本（福島）[3]
- O-K10/F1204
- O-K10*日本（東京[3]）
- O-CTS10687日本、[14]モンゴル[14]
- O-K7/CTS11723/47z日本人男性の約24%に見られ、韓国と中国では頻度が低い
- O-BY130355四川省[3]
- O-K2/CTS713
- O-K2*日本 (東京[3]青森[3] )、韓国[3]
- O-CTS203日本 (東京[3]宮城[3] )、河南[3]
- O-K14
- O-K14*山西省[3]
- O-M776日本（東京[3]）
- O-Z24594
- O-Z24594*韓国[3]
- O-CTS56日本（東京、[3]熊本[3]）
- O-Y178266日本（東京[3]）、北京[3]
- O-Z24599
- O-Z24599*日本 (東京[3]山口[3] )
- O-K473日本（東京[3]）
- O-Y181118韓国（釜山[3]）、河北[3]
- O-K4
- O-K3/F940湖南（漢）、江西省、河南（漢）
- O-F940*湖南省[3]江西省[3]
- O-K481湖南語（漢語）[3]
- O-L682韓国の男性の約19%に見られる[16]。日本と中国では頻度が低い。
- O-L682*山西省[3]
- O-K485
- O-K485*日本（東京）[3]
- O-CTS723
- O-CTS723*韓国[3]
- O-A23652
- O-A23652*日本語[3]
- O-A23653
- O-A23653*日本、[3]韓国[3]
- O-A23658
- O-A23658*韓国[3]
- O-Y165475韓国[3]
- O-Y24057
- O-Y24057*山東省[3]
- O-A12448
- O-A12448*韓国（大邱[3]を含む）
- O-PH40北京（漢）、[3]山東省、[3]韓国、[3]日本[14]
- O-MF14220韓国[3]
- O-Y26376/CTS7620日本、[14]韓国[14]
- O-MF14346韓国[3]
- O-Y26377
- O-Y26377*日本 (岡山)、[3] 賀鎮[3]
- O-CTS1175日本（高知、[3]東京[3]）
- O-K3/F940湖南（漢）、江西省、河南（漢）
- O-K18
参照
遺伝学
Y-DNA Oサブクラス
Y-DNAバックボーンツリー
参考文献
- ^ G. David Poznik、Yali Xue、Fernando L. Mendez、他「世界中の1,244のY染色体配列から推定した人間の男性人口統計における断続的なバースト」Nat Genet。 2016年6月; 48(6): 593–599。doi:10.1038/ng.3559。
- ^ ab Monika Karmin、Rodrigo Flores、Lauri Saag、Georgi Hudjashov、Nicolas Brucato、Chelzie Crenna-Darusallam、Maximilian Larena、Phillip L Endicott、Mattias Jakobsson、J Stephen Lansing、Herawati Sudoyo、Matthew Leavesley、Mait Metspalu、François-Xavier Ricaut、およびMurray P Cox、「島嶼東南アジアおよび近海男性系統における多様化と孤立のエピソード」、Molecular Biology and Evolution、第39巻、第3号、2022年3月、msac045、https://doi.org/10.1093/molbev/msac045
- ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab ac ad ae af ag ah ai aja k al am an ao ap aq ar as at au av aw YFull Haplogroup YTree v5.04 at 16 May 2017
- ^ ab Shi Yan、Chuan-Chao Wang、Hui Li、Shi-Lin Li、Li Jin、および The Genographic Consortium、「Y 染色体ハプログループ O の最新系統樹と、変異 P164 および PK4 の系統学的位置の改訂」European Journal of Human Genetics (2011) 19、1013–1015; doi:10.1038/ejhg.2011.64
- ^ 「O-Cts4040单倍群详情」.
- ^ 「O-P49单倍群详情」.
- ^ abc Jean A Trejaut、Estella S Poloni、Ju-Chen Yen、他(2014)、「台湾の Y 染色体 DNA 変異と東南アジア島嶼部との関係」BMC Genetics 2014、15:77。http://www.biomedcentral.com/1471-2156/15/77
- ^ Peter de Barros Damgaard、Nina Marchi、Simon Rasmussen、他(2018)、「ユーラシアの草原全域から発見された137の古代ヒトゲノム」Nature第557巻、369～374ページ (2018)。https://doi.org/10.1038/s41586-018-0094-2
- ^ Wibhu Kutanan、Jatupol Kampuansai、Metawee Srikummool、Andrea Brunelli、Silvia Ghirotto、Leonardo Arias、Enrico Macholdt、Alexander Hübner、Roland Schröder、Mark Stoneking、「タイ人とラオス人の父系と母系の遺伝歴の対比」Mol. Biol. Evol. Advance Access 出版 2019 年 4 月 12 日。doi : 10.1093/molbev/msz083
- ^ Min-Sheng Peng、Jun-Dong He、Long Fan、他(2013)、「GWAS データを使用した Y 染色体ハプログループ ツリーの取得」European Journal of Human Genetics (2013)、1–5。doi:10.1038/ejhg.2013.272
- ^ Wang CC、Wang LX、Shrestha R、Zhang M、Huang XY、他(2014)、「四川省西部回廊に居住する Qiangic 集団の遺伝的構造」PLoS ONE 9(8): e103772. doi:10.1371/journal.pone.0103772
- ^ モニカ・カルミン、ラウリ・サーグ、マリオ・ヴィセンテ、他。 , 「Y染色体の多様性に関する最近のボトルネックは、世界的な文化の変化と一致しています。」ゲノムリサーチ25:1–8; ISSN 1088-9051/15; www.ゲノム.org
- ^ Pille Hallast、Chiara Batini、Daniel Zadik、他(2015)、「Y 染色体ツリーが葉を張り始める: 既知の系統群の大部分をカバーする 13,000 の高信頼性 SNP」Molecular Biology and Evolution 2015 年 3 月;32(3):661-73. doi:10.1093/molbev/msu327
- ^ abcdefghijk Family Tree DNA の Y-DNA ハプロツリー
- ^ Family Tree DNA の Y ハプログループ プロジェクト
- ^ So Yeun Kwon、Hwan Young Lee、Eun Young Lee、Woo Ick Yang、Kyoung-Jin Shin、「C2、O2b、O3a サブハプログループに新たに提案された Y-SNP による Y ハプログループ ツリー トポロジーの確認」Forensic Science International: Genetics 19 (2015) 42–46。https://dx.doi.org/10.1016/j.fsigen.2015.06.003
脚注
引用文献
ジャーナル
- Su, Bing; Xiao, Junhua; Underhill, Peter; Deka, Ranjan; Zhang, Weiling; Akey, Joshua; Huang, Wei; Shen, Di; et al. (1999). 「最終氷期に現代人が東アジアに北上したことのY染色体証拠」アメリカ人類遺伝学ジャーナル. 65 (6): 1718–24. doi :10.1086/302680. PMC 1288383. PMID 10577926 .
ウェブサイト
- 「Y-DNA ハプログループの説明」。2009 年 3 月 19 日にオリジナルからアーカイブされました。
変換表のソース
- Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael PH; 他 (2001 年 2 月)。「島嶼部東南アジアおよびオセアニアのオーストロネシア語族の主に先住民族の父系遺産」。アメリカ 人類遺伝学ジャーナル。68 (2): 432–443。doi :10.1086/318205。PMC 1235276。PMID 11170891。
- Hammer, Michael F.; Karafet, Tatiana M.; Redd , Alan J.; Jarjanazi, Hamdi; et al. (2001 年 7 月 1 日)。「ヒト Y 染色体のグローバル多様性の階層的パターン」。分子生物学 と進化。18 (7): 1189–1203。doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906。PMID 11420360。
- Jobling, Mark A.; Tyler-Smith, Chris (2000)、「新しいハプロタイプの新しい用途」、Trends in Genetics、16 (8): 356–62、doi :10.1016/S0168-9525(00)02057-6、PMID 10904265
- カラジェヴァ、ルバ。カラフェル、フランセスク。ジョブリング、マークA;アンジェリチェワ、ドーラ。他。 (2001 年 2 月)。 「Y染色体とミトコンドリアDNA系統によって明らかにされたVlax Romaの集団間および集団内の遺伝的多様性のパターン」。欧州人類遺伝学ジャーナル。9 (2): 97-104。土井：10.1038/sj.ejhg.5200597。PMID 11313742。S2CID 21432405 。
- Karafet, Tatiana; Xu, Liping; Du, Ruofu; Wang, William; et al. (2001 年 9 月). 「東アジアの父系人口史: 起源、パターン、およびミクロ進化プロセス」.アメリカ人類遺伝学ジャーナル. 69 (3): 615–628. doi :10.1086/323299. PMC 1235490. PMID 11481588 .
- Karafet, TM; Mendez, FL; Meilerman, MB; Underhill, PA; Zegura, SL; Hammer, MF (2008)、「新しいバイナリ多型によりヒト Y 染色体ハプログループ ツリーの形状が変わり、解像度が向上」、Genome Research、18 (5): 830–8、doi :10.1101/gr.7172008、PMC 2336805、PMID 18385274
- Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000)、「現存するヨーロッパ人における旧石器時代のホモ・サピエンス・サピエンスの遺伝的遺産：AY染色体の観点」、Science、290 (5494): 1155–9、Bibcode :2000Sci...290.1155S、doi :10.1126/science.290.5494.1155、PMID 11073453
- Underhill, Peter A.; Shen, Peidong; Lin, Alice A.; Jin, Li; et al. (2000 年 11 月)。「Y 染色体配列の変異と人類集団の歴史」。Nature Genetics . 26 (3): 358–361. doi :10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.
さらに読む
- Firasat, Sadaf; Khaliq, Shagufta; Mohyuddin, Aisha; Papaioannou, Myrto; Tyler-Smith, Chris; Underhill, Peter A; Ayub, Qasim (2006). 「パキスタンのパシュトゥーン人人口に対するギリシャ人の限定的寄与を示すY染色体証拠」。European Journal of Human Genetics . 15 (1): 121–6. doi :10.1038/sj.ejhg.5201726. PMC 2588664. PMID 17047675 .
- フォルナリノ、シモナ。パラ、マリア。バッタリア、ヴィンチェンツァ;マランタ、ラモーナ。アチリ、アレッサンドロ。モディアノ、グイド。トッローニ、アントニオ。セミノ、オルネラ。サンタキアーラ＝ベネレセッティ、シルヴァーナ A (2009)。 「タラス族（ネパール）のミトコンドリアとY染色体の多様性：遺伝的変異の宝庫」。BMC進化生物学。9 (1): 154。ビブコード:2009BMCEE...9..154F。土井: 10.1186/1471-2148-9-154。PMC 2720951。PMID 19573232。
- Hurles, M; Sykes, B; Jobling , M; Forster, P (2005)。「東南アジア島嶼部と東アフリカにおけるマダガスカル人の二重起源：母系と父系の系統からの証拠」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。76 (5): 894–901。doi : 10.1086 /430051。PMC 1199379。PMID 15793703。
- Karafet, Tatiana M.; Lansing, JS; Redd, Alan J.; Watkins, Joseph C.; Surata, SPK; Arthawiguna, WA; Mayer, Laura; Bamshad, Michael; et al. (2005). 「インドネシアの開拓におけるバリ島の Y 染色体の観点: 先新石器時代の狩猟採集民、オーストロネシアの農民、およびインド人商人の遺伝的寄与」. Human Biology . 77 (1): 93–114. doi :10.1353/hub.2005.0030. hdl : 1808/13586 . PMID 16114819. S2CID 7953854.
- Sahoo, Sanghamitra; Kashyap, VK (2006). 「ミトコンドリア DNA と Y 染色体ハプログループの系統地理学は、インド東部の集団における非対称な遺伝子流動を明らかにする」。American Journal of Physical Anthropology。131 ( 1): 84–97。doi :10.1002/ajpa.20399。PMID 16485297 。
- Trivedi, Rajni; Sitalaximi, T.; Banerjee, Jheelam; Singh, Anamika; Sircar, PK; Kashyap, VK (2006). 「ニコバル諸島の減少する個体群、ションペンの起源に関する分子的洞察」Journal of Human Genetics . 51 (3): 217–26. doi : 10.1007/s10038-005-0349-2 . PMID 16453062.